Reliable structural, thermodynamic, and spectroscopic properties of organic molecules adsorbed on silicon surfaces from computational modeling: The case of glycine@Si(100)

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 37, 2011, Pages 16713-16727

  Carnimeo, Ivan ^a,b   Biczysko, Malgorzata ^a,c   Bloino, Julien ^a   Barone, Vincenzo ^a,b  

^a SCUOLA NORMALE SUPERIORE   (Italy)

^b INFN SEZIONE DI PISA   (Italy)

^c UNIVERSITY OF NAPLES FEDERICO II   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GLYCINE; SILICON;

ADSORPTION; ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ELECTRON ENERGY LOSS SPECTROSCOPY; QUANTUM THEORY; SURFACE PROPERTY; THERMODYNAMICS;

ADSORPTION; GLYCINE; MOLECULAR STRUCTURE; QUANTUM THEORY; SILICON; SPECTROSCOPY, ELECTRON ENERGY-LOSS; SURFACE PROPERTIES; THERMODYNAMICS;

EID: 80052536569     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1cp21636h     Document Type: Article

References (63)

1. J. Yoshinobu Prog. Surf. Sci. 2004 77 37
2. H. N. Waltenburg J. T. Yates, Jr. Chem. Rev. 1995 95 1589
3. A. Radi M. Ebrahimi K. T. Leung Surf. Sci. 2010 604 1073
4. A. Lopez T. Heller T. Bitzer N. V. Richardson Chem. Phys. 2002 277 1
5. D. Shemesh J. Mullin M. S. Gordon R. B. Gerber Chem. Phys. 2008 347 218
6. Y. Q. Qu Y. Wang J. Li K. L. Han Surf. Sci. 2004 569 12
7. X. Luo G. Qian C. Sagui C. Roland J. Phys. Chem. C 2008 112 2640
8. A. Chatterjee L. Zhang K. T. Leung Chem. Phys. Lett 2011 508 219
9. V. Barone J. Phys. Chem. A 2004 108 4146
10. V. Barone Chem. Phys. Lett. 2004 383 528
11. V. Barone J. Chem. Phys. 2005 122 014108
12. V. Barone, M. Biczysko, J. Bloino, M. Borkowska-Panek, I. Carnimeo and P. Panek, Int. J. Quantum Chem, 2011, in press
13. O. Christiansen Phys. Chem. Chem. Phys. 2007 9 2942
14. P. Carbonniere A. Dargelos C. Pouchan Theor. Chem. Acc. 2010 125 543
15. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648
16. V. Barone C. Adamo F. Lelj J. Chem. Phys. 1995 102 364
17. V. Barone P. Cimino E. Stendardo J. Chem. Theory Comput. 2008 4 751
18. V. Barone P. Cimino Chem. Phys. Lett. 2008 454 139
19. V. Barone P. Cimino J. Chem. Theory Comput. 2009 5 192
20. C. H. Hu M. Shen H. F. Schaefer J. Am. Chem. Soc. 1993 115 2923
21. S. G. Stepanian I. D. Reva E. D. Radchenko M. T. S. Rosado M. L. T. S. Duarte R. Fausto L. Adamowicz J. Phys. Chem. A 1998 102 1041
22. K. Fukui Acc. Chem. Res. 1981 14 363
23. H. P. Hratchian H. B. Schlegel J. Chem. Phys. 2004 120 9918
24. J. M. L. Martin T. J. Lee P. R. Taylor J. P. Francois J. Chem. Phys. 1995 103 2589
25. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr, J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, Ö. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski and D. J. Fox, GAUSSIAN 09 (Revision B.01), Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009
26. C. Espinoza J. Szczepanski M. Vala N. C. Polfer J. Phys. Chem. A 2010 114 5919
27. K. Iijima K. Tanaka S. Onuma J. Mol. Struct. 1991 246 257
28. J. H. Jensen M. S. Gordon J. Am. Chem. Soc. 1991 113 7917
29. A. G. Csaszar J. Am. Chem. Soc. 1992 114 9569
30. G. M. Chaban J. O. Jung R. B. Gerber J. Phys. Chem. A 2000 104 10035
31. V. Kasalova W. D. Allen H. F. Schaefer III E. Czinki A. G. Csaszar J. Comput. Chem. 2007 28 1373
32. P. D. Godfrey R. D. Brown J. Am. Chem. Soc. 1995 117 2019
33. F. Huisken O. Werhahn A. Y. Ivanov S. A. Krasnokutski J. Chem. Phys. 1999 111 7 2978
34. R. D. Suenram F. J. Lovas J. Am. Chem. Soc. 1980 102 24 7180
35. L. Shaefer H. L. Sellers F. J. Lovas R. D. Suenram J. Am. Chem. Soc. 1980 102 21 6566
36. O. Bludsky J. Chocholousova J. Vacek F. Huisken P. Hobza J. Chem. Phys. 2000 113 11 4629
37. V. Barone J. Bloino M. Biczysko Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 1092
38. V. Barone, M. Biczysko and P. Cimino, in Carbon-Centered Free Radicals and Radical Cations, ed., M. D. E. Forbes, John Wiley & Sons, Inc., New York, 2010, Chapter: Interplay of stereo electronic vibrational and environmental effects in tuning physico-chemical properties of carbon centered radicals, pp. 105-139
39. C. Puzzarini M. Biczysko V. Barone J. Chem. Theory Comput. 2010 6 3 828
40. G. M. Chaban R. B. Gerber Theor. Chem. Acc. 2008 120 273
41. M. Kabelac P. Hobza V. Spirko Phys. Chem. Chem. Phys. 2009 11 3921
42. A. Pedone M. Biczysko V. Barone ChemPhysChem 2010 11 1812
43. M. Biczysko P. Panek G. Scalmani J. Bloino V. Barone J. Chem. Theory Comput. 2010 6 2115
44. A. Ramstad G. Brocks P. J. Kelly Phys. Rev. B: Condens. Matter 1995 51 20 14504
45. N. A. Besley A. J. Blundy J. Phys. Chem. B 2006 110 1701
46. J. E. Northrup Phys. Rev. B: Condens. Matter 1993 47 15 10032
47. D. J. Chadi Phys. Rev. Lett. 1979 43 1 43
48. I. Borriello G. Cantele D. Ninno G. Iandonisi M. Cossi V. Barone Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 2007 76 035430
49. G. Festa M. Cossi V. Barone G. Cantele D. Ninno G. Iandonisi J. Chem. Phys. 2005 122 184714
50. M. A. Filler S. F. Bent Prog. Surf. Sci. 2003 73 1
51. S. Manzhos T. Carrington, Jr. K. Yamashita Surf. Sci. 2011 605 616
52. E. Salli V. Hanninen L. Halonen J. Phys. Chem. C 2010 114 4550
53. T. Kurten M. Biczysko T. Rajamaki K. Laasonen L. Halonen J. Phys. Chem. B 2005 109 8954
54. Y. S. Jung Y. H. Shao M. S. Gordon D. J. Doren M. Head-Gordon J. Chem. Phys. 2003 119 10917
55. Y. S. Jung Y. Akinaga K. D. Jordan M. S. Gordon Theor. Chem. Acc. 2003 109 268
56. R. M. Olson M. S. Gordon J. Chem. Phys. 2006 124 081105
57. M. T. Swihart S. L. Girshick Chem. Phys. Lett. 1999 307 527
58. D. Shemesh R. Baer T. Seideman R. B. Gerber J. Chem. Phys. 2005 122 184704
59. A. Ghysels D. Van Neck V. Van Speybroeck T. Verstraelen M. Waroquier J. Chem. Phys. 2007 126 224102
60. A. Ghysels V. Van Speybroeck E. Pauwels S. Catak B. R. Brooks D. Van Neck M. Waroquier J. Comput. Chem. 2010 31 994
61. B. Brauer G. M. Chaban R. B. Gerber Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 2543
62. A. Lafosse M. Bertin A. Domaracka D. Plizska E. Illenberger R. Azria Phys. Chem. Chem. Phys. 2006 8 5564
63. W. Widdra C. Huang G. A. D. Briggs W. H. Weinberg J. Electron Spectrosc. Relat. Phenom. 1993 64-5 129