Modeling of optical spectra of the light-harvesting CP29 antenna complex of photosystem II - Part II

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 117, Issue 22, 2013, Pages 6593-6602

  Feng, Ximao ^a   Kell, Adam ^a   Pieper, Jörg ^b   Jankowiak, Ryszard ^a,c  

^a KANSAS STATE UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF TARTU   (Estonia)

^c GDANSK UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Poland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTENNAS; BLUE SHIFT; DICHROISM; ELECTRONIC STRUCTURE; ENERGY TRANSFER; PROTEINS; TEMPERATURE;

ANTENNA COMPLEXES; CIRCULAR DICHROISM SPECTRA; LIGHT-HARVESTING; LOW TEMPERATURES; LOW-ENERGY STATE; LOWEST ENERGY STATE; PIGMENT COMPOSITION; SEQUENCE HOMOLOGY;

X RAYS;

EID: 84879133636     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp4004278     Document Type: Article

References (41)

1. Dekker, J. P.; Boekema, E. J. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1706, 12-39
2. Caffarri, S.; Kouril, R.; Kereiche, S.; Boekema, E. J.; Croce, R. EMBO J. 2009, 28, 3052
3. Caffarri, S.; Croce, R.; Cattivelli, L.; Bassi, R. Biochemistry 2004, 43, 9467-9476
4. Liu, Z.; Yan, H.; Wang, K.; Kuang, T.; Zhang, J.; Gui, L.; An, X.; Chang, W. Nature 2004, 428, 287-292
5. Standfuss, J.; van Scheltinga, A. C. T.; Lamborghini, M.; Kühlbrandt, W. EMBO J. 2005, 24, 919-928
6. Pan, X.; Li, M.; Wan, T.; Wang, L.; Jia, C.; Hou, Z.; Zhao, X.; Zhang, J.; Chang, W. Nat. Struct. Mol. Biol. 2011, 18, 309-315
7. Dainese, P.; Bassi, R. J. Biol. Chem. 1991, 266, 8136-8142
8. Bassi, R.; Croce, R.; Cugini, D.; Sandona, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 10056-10061
9. Caffarri, S.; Passarini, F.; Bassi, R.; Croce, R. FEBS Lett. 2007, 581, 4704-4710
10. Gastaldelli, M.; Canino, G.; Croce, R.; Bassi, R. J. Biol. Chem. 2003, 278, 19190-19198
11. Giuffra, E.; Zucchelli, G.; Sandona, D.; Croce, R.; Cugini, D.; Garlaschi, F. M.; Bassi, R.; Jennings, R. C. Biochemistry 1997, 36, 12984-12993
12. Raszewski, G.; Renger, T. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4431-4446
13. Müh, F.; Renger, T.; Zouni, A. Plant Physiol. Biochem. 2008, 46, 238-264
14. Ahn, T. K.; Avenson, T. J.; Ballottari, M.; Cheng, Y.-C.; Niyogi, K. K.; Bassi, R.; Fleming, G. R. Science 2008, 320, 794-797
15. Betterle, N.; Ballottari, M.; Zorzan, S.; de Bianchi, S.; Cazzaniga, S.; Dall'Osto, L.; Morosinoto, T.; Bassi, R. J. Biol. Chem. 2009, 284, 15255-15266
16. Mozzo, M.; Passarini, F.; Bassi, R.; van Amerongen, H.; Croce, R. Biochim. Biophys. Acta 2008, 1777, 1263-1267
17. Pieper, J.; Rätsep, M.; Irrgang, K.-D.; Freiberg, A. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 10870-10880
18. Pieper, J.; Irrgang, K.-D.; Rätsep, M.; Voigt, J.; Renger, G.; Small, G. J. Photochem. Photobiol. 2000, 71, 574-581
19. Ruban, A. V.; Berera, R.; Ilioaia, C.; van Stokkum, I. H. M.; Kennis, J. T. M.; Pascal, A. A.; van Amerongen, H.; Robert, B.; Horton, P.; van Grondelle, R. Nature 2007, 450, 575-578
20. Remelli, R.; Varotto, C.; Sandonà, D.; Croce, R.; Bassi, R. J. Biol. Chem. 1999, 274, 33510-33521
21. Rogl, H.; Schödel, R.; Lokstein, H.; Kühlbrandt, W.; Schubert, A. Biochemistry 2002, 41, 2281-2287
22. Novoderezhkin, V. I.; Palacios, M. A.; van Amerongen, H.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10493-10504
23. Madjet, M. E.; Abdurahman, A.; Renger, T. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 17268-17281
24. Reppert, M.; Zazubovich, V.; Dang, N. C.; Seibert, M.; Jankowiak, R. J. Phys. Chem. Lett. 2008, 112, 9934-9947
25. Renger, T.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 2002, 116, 9997-10019
26. Reppert, M. J. Phys. Chem. Lett. 2011, 2, 2716-2721
27. Redfield, A. G. IBM J. Res. Dev. 1957, 1, 19-31
28. Redfield, A. G. Adv. Magn. Reson. 1965, 1, 1-32
29. Rätsep, M.; Peiper, J.; Irrgang, K.-D.; Freiberg, A. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 110-118
30. Renger, T.; Trostmann, I.; Theiss, C.; Madjet, M. E.; Richter, M.; Paulsen, H.; Eichler, H. J.; Knorr, A.; Renger, G. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 10487-10501
31. Kell, A.; Feng, X.; Reppert, M.; Jankowiak, R. J. Phys. Chem. B, submitted for publication, 2013.
32. Förster, T. Ann. Phys. 1948, 437, 55-75
33. Förster, T. In Modern Quantum Chemistry Part III; Sinanoğlu, O., Ed.; Academic: New York, 1965; pp 93-137.
34. Pascal, A.; Gradinaru, C.; Wacker, U.; Peterman, E.; Calkoen, F.; Irrgang, K.-D.; Horton, P.; Renger, G.; van Grondelle, R.; Robert, B.; van Amerongen, H. Eur. J. Biochem. 1999, 262, 817-823
35. Reppert, M.; Naibo, V.; Jankowiak, R. J. Chem. Phys. 2009, 131, 234104
36. Müh, F.; Madjet, M. E.-A.; Renger, T. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 13517-13535
37. Schlau-Cohen, G. S.; Calhoun, T. R.; Ginsberg, N. S.; Read, E. L.; Ballottari, M.; Bassi, R.; van Grondelle, R.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 15352-15363
38. van Grondelle, R.; Novoderezhkin, V. I. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 793-807
39. Kühlbrandt, W.; Wang, D.-N.; Fujiyoshi, Y. Nature 1994, 367, 614-621
40. Belgio, E.; Casazza, A. P.; Zucchelli, G.; Garlaschi, F. M.; Jennings, R. C. Biochemistry 2010, 49, 882-892
41. Duffy, C. D. P.; Chmielov, J.; Macernis, M.; Sulskus, J.; Valkunas, L.; Ruban, A. V. J. Phys. Chem. B [Online early access]. DOI: 10.1021/jp3110997. Published Online: Dec 11, 2012. http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp3110997 (accessed Dec 11, 2012).