Probing micro-solvation in "numbers": The case of neutral dipeptides in water

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 15, Issue 19, 2013, Pages 7354-7362

  Takis, Panteleimon G ^a   Papavasileiou, Konstantinos D ^a   Peristeras, Loukas D ^b   Melissas, Vasilios S ^a   Troganis, Anastassios N ^a  

^a UNIVERSITY OF IOANNINA   (Greece)

^b Scienomics GmbH   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALANINE; DIPEPTIDE; WATER;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; METHODOLOGY; MOLECULAR DYNAMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY;

ALANINE; DIPEPTIDES; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; WATER;

EID: 84876894091     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3cp44606a     Document Type: Article

References (44)

1. V. J. Hilser Nature 2011 469 166 167
2. P. Ball Nature 2011 478 467 468
3. B. M. Messer C. D. Cappa J. D. Smith W. S. Drisdell C. P. Schwartz R. C. Cohen R. J. Saykally J. Phys. Chem. B 2005 109 21640 21646
4. M. P. Bhate J. C. Woodard M. A. Mehta J. Am. Chem. Soc. 2009 131 9579 9589
5. K. Mazur I. A. Heisler S. R. Meech J. Phys. Chem. B 2010 114 10684 10691
6. A. Kamariotis O. V. Boyarkin S. R. Mercier R. D. Beck M. F. Bush E. R. Williams T. R. Rizzo J. Am. Chem. Soc. 2006 128 905 916
7. F. Sterpone G. Stirnemann J. T. Hynes D. Laage J. Phys. Chem. B 2010 114 2083 2089
8. B. Gao T. Wyttenbach M. T. Bowers J. Phys. Chem. B 2009 113 9995 10000
9. Y. Yao D. Chen S. Zhang Y. Li P. Tu B. Liu M. Dong J. Phys. Chem. B 2011 115 6213 6221
10. B. Hernández F. Pflüger M. Nsangou M. Ghomi J. Phys. Chem. B 2009 113 3169 3178
11. H. Cui M. J. Webber S. I. Stupp Biopolymers 2010 94 1 18
12. S. Zhang Nat. Biotechnol. 2004 22 151 152
13. M. Reches E. Gazit Science 2003 300 625 627
14. L. Liu K. Busuttil S. Zhang Y. Yang C. Wang F. Besenbacher M. Dong Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 17435 17444
15. P. J. Rossky M. Karplus J. Am. Chem. Soc. 1979 101 1913 1937
16. T. Liang T. R. Walsh Mol. Simul. 2007 33 337 342
17. M. S. Santosh A. P. Lyubartsev A. A. Mirzoev D. K. Bhat J. Phys. Chem. B 2010 114 16632 16640
18. B. Yogeswari R. Kanakaraju S. Boopathi P. Kolandaivel J. Mol. Graphics Modell. 2012 35 11 20
19. N. V. Nucci M. S. Pometun A. J. Wand Nat. Struct. Mol. Biol. 2011 18 245 249
20. J. Qvist E. Persson C. Mattea B. Halle Faraday Discuss. 2009 141 131 144
21. D. E. Woessner Concepts Magn. Reson. 1996 8 397 421
22. A. N. Troganis C. Tsanaktsidis I. P. Gerothanassis J. Magn. Reson., Ser. B 2003 164 294 303
23. T. I. Igumenova K. K. Frederick A. J. Wand Chem. Rev. 2006 106 1672 1699
24. G. Lipari A. Szabo J. Am. Chem. Soc. 1982 104 4546 4559
25. J. Kowalewski and L. Mäler, Nuclear Spin Relaxation in Liquids: Theory, Experiments and Applications, Taylor & Francis, New York, 2006
26. P. G. Takis V. S. Melissas A. N. Troganis New J. Chem. 2012 36 1866 1878
27. A. Gierer K. Wirtz Z. Naturforsch., A: Astrophys. Phys. Phys. Chem. 1953 8 532 538
28. J. Tritt-Goc D. Fiat Magn. Reson. Chem. 1991 29 156 163
29. A. K. Rai X. Xu Z. Lin D. K. Rai Vib. Spectrosc. 2011 56 74 81
30. K. R. Harris J. Chem. Phys. 2009 131 054503
31. J. Ramos L. D. Peristeras D. N. Theodorou Macromolecules 2007 40 9640 9650
32. J. Wang P. Cieplak P. A. Kollman J. Comput. Chem. 2000 21 1049 1074
33. S. Plimpton J. Comput. Phys. 1995 117 1 19
34. S. Nosé Mol. Phys. 1984 52 255 268
35. W. G. Hoover Phys. Rev. A 1985 31 1695 1697
36. B. A. Luty W. F. Van Gunsteren J. Phys. Chem. 1996 100 2581 2587
37. R. Hockney and J. Eastwood, Computer simulation using particles, McGraw-Hill, New York, 1981
38. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery Jr, T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, GAUSSIAN 03 (Revision E.01), Gaussian, Inc, Wallingford, CT, 2004
39. X. Xu W. A. Goddard III Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 2673 2677
40. T. H. Dunning Jr J. Chem. Phys. 1989 90 1007 1023
41. L. Rao H. Ke G. Fu X. Xu Y. Yan J. Chem. Theory Comput. 2009 5 86 96
42. E. Cancès B. Mennucci J. Tomasi J. Chem. Phys. 1997 107 3032 3041
43. W. Sang-Aroon V. Ruangpornvisuti Int. J. Quantum Chem. 2008 108 1181 1188
44. A. Panuszko M. Śmiechowski J. Stangret J. Chem. Phys. 2011 134 115104