A microfluidic chip integrating DNA extraction and real-time PCR for the detection of bacteria in saliva

Lab on a Chip

Volumn 13, Issue 7, 2013, Pages 1325-1332

  Oblath, Emily A ^a   Henley, W Hampton ^a   Alarie, Jean Pierre ^a   Ramsey, J Michael ^a  

^a University of North Carolina at Chapel Hill   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALUMINUM OXIDE; GENOMIC DNA; PRIMER DNA;

ARTICLE; BACTERIAL STRAIN; BACTERIUM DETECTION; DNA EXTRACTION; GENE AMPLIFICATION; METHICILLIN RESISTANT STAPHYLOCOCCUS AUREUS; METHICILLIN SUSCEPTIBLE STAPHYLOCOCCUS AUREUS; MICROFLUIDICS; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; REAL TIME POLYMERASE CHAIN REACTION; SALIVA; STREPTOCOCCUS MUTANS;

EID: 84874887290     PISSN: 14730197     EISSN: 14730189     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3lc40961a     Document Type: Article

References (50)

1. J. Mairhofer K. Roppert P. Ertl Sensors 2009 9 4804 4823
2. Henry's Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods, ed., R. A. McPherson, and, M. R. Pincus, Saunders Elsevier, Philadelphia, 2007
3. K.-Y. Lien C.-J. Liu P.-L. Kuo G.-B. Lee Anal. Chem. 2009 81 4502 4509
4. A. F. Sauer-Budge P. Mirer A. Chatterjee C. M. Klapperich D. Chargin A. Sharon Lab Chip 2009 9 2803 2810
5. Y. W. Tang G. W. Procop D. H. Persing Clin. Chem. 1997 43 2021 2038
6. G. Doring K. Unertl A. Heininger Clin. Chem. Lab. Med. 2008 46 909 918
7. S.-W. Yeung T. M.-H. Lee H. Cai I. M. Hsing Nucleic Acids Res. 2006 34 e118
8. C. S. Zhang D. Xing Nucleic Acids Res. 2007 35 4223 4237
9. J. Heo S. Z. Hua Sensors 2009 9 4483 4502
10. C. S. Zhang J. L. Xu W. L. Ma W. L. Zheng Biotechnol. Adv. 2006 24 243 284
11. P. Liu R. A. Mathies Trends Biotechnol. 2009 27 572 581
12. R. Mariella Biomed. Microdevices 2008 10 777 784
13. N. Thaitrong N. M. Toriello N. Del Bueno R. A. Mathies Anal. Chem. 2009 81 1371 1377
14. D. Chen M. Mauk X. Qiu C. Liu J. Kim S. Ramprasad S. Ongagna W. Abrams D. Malamud P. Corstjens H. Bau Biomed. Microdevices 2010 12 705 719
15. C. J. Easley J. M. Karlinsey J. M. Bienvenue L. A. Legendre M. G. Roper S. H. Feldman M. A. Hughes E. L. Hewlett T. J. Merkel J. P. Ferrance J. P. Landers Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 19272 19277
16. S. Dames L. K. Bromley M. Herrmann M. Elgort M. Erali R. Smith K. V. Voelkerding J. Mol. Diagn. 2006 8 16 21
17. J. Kim B. K. Gale Lab Chip 2008 8 1516 1523
18. J. Kim M. Johnson P. Hill B. K. Gale Integr. Biol. 2009 1 574 586
19. J. Wen L. A. Legendre J. M. Bienvenue J. P. Landers Anal. Chem. 2008 80 6472 6479
20. I. Pjescic N. Crews Lab Chip 2012 12 2514 2519
21. R. H. Liu J. Yang R. Lenigk J. Bonanno P. Grodzinski Anal. Chem. 2004 76 1824 1831
22. N. Ramalingam H. B. Liu C. C. Dai Y. Jiang H. Wang Q. H. Wang K. M. Hui H. Q. Gong Biomed. Microdevices 2009 11 1007 1020
23. M. G. Elgort M. G. Herrmann M. Erali J. D. Durtschi K. V. Voelkerding R. E. Smith Clin. Chem. 2004 50 1817 1819
24. J. Kim, K. V. Voelkerding and B. K. Gale, in IEEE/EMBS Special Topic Conference on Microtechnology in Medicine and Biology, Institute of Electrical and Electronics Engineers, Kahuku, HI, United States, 2005, pp. 5-7
25. J. Kim K. V. Voelkerding B. K. Gale J. Micromech. Microeng. 2006 16 33 39
26. J. Kim M. Mauk D. F. Chen X. B. Qiu J. Kim B. Gale H. H. Bau Analyst 2010 135 2408 2414
27. J. A. Aas B. J. Paster L. N. Stokes I. Olsen F. E. Dewhirst J. Clin. Microbiol. 2005 43 5721 5732
28. O. Deutsch Y. Fleissig B. Zaks G. Krief D. J. Aframian A. Palmon Electrophoresis 2008 29 4150 4157
29. O. Greiner P. J. R. Day P. P. Bosshard F. Imeri M. Altwegg D. Nadal J. Clin. Microbiol. 2001 39 3129 3134
30. K. L. Helton K. E. Nelson E. Fu P. Yager Lab Chip 2008 8 1847 1851
31. L. F. Hofman J. Nutr. 2001 131 1621S 1625S
32. S. B. Roth J. Jalava O. Ruuskanen A. Ruohola S. Nikkari J. Clin. Microbiol. 2004 42 4268 4274
33. J. J. Farrell L. Zhang H. Zhou D. Chia D. Elashoff D. Akin B. J. Paster K. Joshipura D. T. W. Wong Gut 2012 61 582 588
34. S. Petti R. Pezzi M. S. Cattaruzza J. F. Osborn A. S. Darca J. Dent. 1997 25 257 262
35. N. Lucas S. Demming A. Jordan P. Sichler S. Büttgenbach J. Micromech. Microeng. 2008 18 075037
36. S. K. Sia G. M. Whitesides Electrophoresis 2003 24 3563 3576
37. B. A. Ashcroft T. Oosterkamp Rev. Sci. Instrum. 2010 81 4
38. A. Edelstein, N. Amodaj, K. Hoover, R. Vale and N. Stuurman, in Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., 2001
39. D. S. Holmes M. Quigley Anal. Biochem. 1981 114 193 197
40. J. Membrillo-Hernández A. Núñez-de la Mora T. del Rio-Albrechtsen R. Camacho-Carranza M. C. Gomez-Eichelmann J. Basic Microbiol. 1995 35 41 46
41. W. S. Rasband, ImageJ, U.S. National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA, http://imagej.nih.gov/ij/, 1997-2011
42. K. Kolari R. Satokari K. Kataja J. Stenman A. Hokkanen Sens. Actuators, B 2008 128 442 449
43. I. G. Wilson Appl. Environ. Microbiol. 1997 63 3741 3751
44. S. P. van Tongeren J. E. Degener H. J. M. Harmsen Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2011 30 1053 1061
45. J. SantaLucia, Jr., in PCR Primer Design, ed., A. Yuryev, Humana Press, Totowa, NJ, 2007, pp. 3-33
46. Q. Y. Huang L. L. Zheng Y. M. Zhu J. F. Zhang H. X. Wen J. W. Huang J. J. Niu X. L. Zhao Q. G. Li PLoS One 2011 6 e16033
47. F. Ahmad S. A. Hashsham Anal. Chim. Acta 2012 733 1 15
48. A. R. Prakash C. De La Rosa J. D. Fox K. Kaler Microfluid. Nanofluid. 2008 4 451 456
49. C.-H. Wang K.-Y. Lien L.-Y. Hung H.-Y. Lei G.-B. Lee Microfluid. Nanofluid. 2012 13 113 123
50. Y. Yu B. Li C. A. Baker X. Zhang M. G. Roper Anal. Chem. 2012 84 2825 2829