Systematic analysis of embryonic stem cell differentiation in hydrodynamic environments with controlled embryoid body size

Integrative Biology (United Kingdom)

Volumn 4, Issue 6, 2012, Pages 641-650

  Kinney, Melissa A ^a   Saeed, Rabbia ^a   McDevitt, Todd C ^a  

^a GEORGIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARTICLE; BIOPROCESS; CELL DIFFERENTIATION; EMBRYOID BODY; EMBRYONIC STEM CELL; GENE EXPRESSION; HYDRODYNAMICS; MORPHOGENESIS; PHENOTYPE; PRIORITY JOURNAL; ANIMAL; CHEMISTRY; CYTOLOGY; FLOW CYTOMETRY; GENE EXPRESSION PROFILING; GENETICS; IMMUNOHISTOCHEMISTRY; MOUSE; PHASE CONTRAST MICROSCOPY; PHYSIOLOGY; REAL TIME POLYMERASE CHAIN REACTION;

RNA;

ANIMALS; CELL DIFFERENTIATION; EMBRYOID BODIES; FLOW CYTOMETRY; GENE EXPRESSION PROFILING; HYDRODYNAMICS; IMMUNOHISTOCHEMISTRY; MICE; MICROSCOPY, PHASE-CONTRAST; MORPHOGENESIS; REAL-TIME POLYMERASE CHAIN REACTION; RNA;

EID: 84874417846     PISSN: 17579694     EISSN: 17579708     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2ib00165a     Document Type: Article

References (61)

1. M. J. Evans M. H. Kaufman Nature 1981 292 154 156
2. G. R. Martin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1981 78 7634 7638
3. J. A. Thomson J. Itskovitz-Eldor S. S. Shapiro M. A. Waknitz J. J. Swiergiel V. S. Marshall J. M. Jones Science 1998 282 1145 1147
4. L. T. Lock E. S. Tzanakakis Tissue Eng. 2007 13 1399 1412
5. D. Jing A. Parikh J. M. Canty E. S. Tzanakakis Tissue Eng., Part B: Rev. 2008 14 393 406
6. E. S. Tzanakakis D. J. Hess T. D. Sielaff W. S. Hu Annu. Rev. Biomed. Eng. 2000 2 607 632
7. D. C. Kirouac P. W. Zandstra Cell Stem Cell 2008 3 369 381
8. V. Fox P. J. Gokhale J. R. Walsh M. Matin M. Jones P. W. Andrews Stem Cells 2008 26 715 723
9. A. Krtolica O. Genbacev C. Escobedo T. Zdravkovic A. Nordstrom D. Vabuena A. Nath C. Simon K. Mostov S. J. Fisher Stem Cells 2007 25 2215 2223
10. X. Li Y. Chen S. Schéele E. Arman R. Haffner-Krausz P. Ekblom P. Lonai J. Cell Biol. 2001 153 811 822
11. S. C. Desbordes D. G. Placantonakis A. Ciro N. D. Socci G. Lee H. Djaballah L. Studer Cell Stem Cell 2008 2 602 612
12. M. C. Nostro X. Cheng G. M. Keller P. Gadue Cell Stem Cell 2008 2 60 71
13. C. J. Flaim S. Chien S. N. Bhatia Nat. Methods 2005 2 119 125
14. D. Anderson S. Levenberg R. Langer Nat. Biotechnol. 2004 22 863 866
15. J. Fu Y.-K. Wang M. T. Yang R. A. Desai X. Yu Z. Liu C. S. Chen Nat. Methods 2010 7 733 736
16. A. J. Engler S. Sen H. L. Sweeney D. E. Discher Cell 2006 126 677 689
17. L. Adamo O. Naveiras P. L. Wenzel S. McKinney-Freeman P. J. Mack J. Gracia-Sancho A. Suchy-Dicey M. Yoshimoto M. W. Lensch M. C. Yoder G. García-Cardeña G. Q. Daley Nature 2009 459 1131 1135
18. T. E. North W. Goessling M. Peeters P. Li C. Ceol A. M. Lord G. J. Weber J. Harris C. C. Cutting P. Huang E. Dzierzak L. I. Zon Cell 2009 137 736 748
19. J. R. Hove R. W. Köster A. S. Forouhar G. Acevedo-Bolton S. E. Fraser M. Gharib Nature 2003 421 172 177
20. T. Masumura K. Yamamoto N. Shimizu S. Obi J. Ando Arterioscler., Thromb., Vasc. Biol. 2009
21. L. Zeng Q. Xiao A. Margariti Z. Zhang A. Zampetaki S. Patel M. C. Capogrossi Y. Hu Q. Xu J. Cell Biol. 2006 174 1059 1069
22. H. Wang G. M. Riha S. Yan M. Li H. Chai H. Yang Q. Yao C. Chen Arterioscler., Thromb., Vasc. Biol. 2005 25 1817 1823
23. K. Yamamoto T. Sokabe T. Watabe K. Miyazono J. K. Yamashita S. Obi N. Ohura A. Matsushita A. Kamiya J. Ando Am. J. Physiol.: Heart Circ. Physiol. 2004 288 H1915 1924
24. T. Ahsan R. M. Nerem Tissue Eng., Part A 2010
25. M. A. Kinney C. Y. Sargent T. C. McDevitt Tissue Eng., Part B: Rev. 2011
26. E. Y. L. Fok P. W. Zandstra Stem Cells 2005 23 1333 1342
27. C. M. Cameron W.-S. Hu D. S. Kaufman Biotechnol. Bioeng. 2006 94 938 948
28. G. Yirme M. Amit I. Laevsky S. Osenberg J. Itskovitz-Eldor Stem Cells Dev. 2008 17 1227 1241
29. S. Gerecht-Nir S. Cohen J. Itskovitz-Eldor Biotechnol. Bioeng. 2004 86 493 502
30. C. Sargent G. Berguig T. McDevitt Tissue Eng. A 2009 15 331 342
31. C. Y. Sargent G. Y. Berguig M. A. Kinney L. A. Hiatt R. L. Carpenedo R. E. Berson T. C. McDevitt Biotechnol. Bioeng. 2010 105 611 626
32. H. Liu J. Lin K. Roy Biomaterials 2006 27 5978 5989
33. K. M. Fridley I. Fernandez M.-T. Li R. B. Kettlewell K. Roy Tissue Eng., Part A 2010
34. R. L. Carpenedo C. Y. Sargent T. C. McDevitt Stem Cells 2007 25 2224 2234
35. J. C. Mohr J. Zhang S. M. Azarin A. G. Soerens J. J. De Pablo J. A. Thomson G. E. Lyons S. P. Palecek T. J. Kamp Biomaterials 2010 31 1885 1893
36. Y.-S. Hwang B. G. Chung D. Ortmann N. Hattori H.-C. Moeller A. Khademhosseini Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 16978 16983
37. C. L. Bauwens R. Peerani S. Niebruegge K. A. Woodhouse E. Kumacheva M. Husain P. W. Zandstra Stem Cells 2008 26 2300 2310
38. C. L. Bauwens H. Song N. Thavandiran M. Ungrin S. Massé K. Nanthakumar C. Seguin P. W. Zandstra Tissue Eng., Part A 2011
39. S. Ueno G. Weidinger T. Osugi A. D. Kohn J. L. Golob L. Pabon H. Reinecke R. T. Moon C. E. Murry Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 9685 9690
40. D. ten Berge W. Koole C. Fuerer M. Fish E. Eroglu R. Nusse Cell Stem Cell 2008 3 508 518
41. J. Park C. H. Cho N. Parashurama Y. Li F. Berthiaume M. Toner A. W. Tilles M. L. Yarmush Lab Chip 2007 7 1018 1028
42. J. C. Mohr J. J. De Pablo S. P. Palecek Biomaterials 2006 27 6032 6042
43. M. D. Ungrin C. Joshi A. Nica C. Bauwens P. W. Zandstra PLoS One 2008 3 e1565
44. M. F. Pera J. Andrade S. Houssami B. Reubinoff A. Trounson E. G. Stanley D. Ward-van Oostwaard C. Mummery J. Cell Sci. 2004 117 1269 1280
45. N. Smyth H. S. Vatansever P. Murray M. Meyer C. Frie M. Paulsson D. Edgar J. Cell Biol. 1999 144 151 160
46. J.-C. D. Heng B. Feng J. Han J. Jiang P. Kraus J.-H. Ng Y. L. Orlov M. Huss L. Yang T. Lufkin B. Lim H.-H. Ng Cell Stem Cell 2010 6 167 174
47. Y. Toyooka N. Tsunekawa R. Akasu T. Noce Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 11457 11462
48. E. Sahai C. J. Marshall Nat. Cell Biol. 2002 4 408 415
49. C. Mummery D. Ward-van Oostwaard P. Doevendans R. Spijker S. van den Brink R. Hassink M. van der Heyden T. Opthof M. Pera A. de la Riviere R. Passier L. Tertoolen Circulation 2003 107 2733 2740
50. S. Niebruegge C. L. Bauwens R. Peerani N. Thavandiran S. Masse E. Sevaptisidis K. Nanthakumar K. Woodhouse M. Husain E. Kumacheva P. W. Zandstra Biotechnol. Bioeng. 2009 102 493 507
51. S. A. Ruiz C. S. Chen Stem Cells 2008 26 2921 2927
52. M. D. Treiser E. H. Yang S. Gordonov D. M. Cohen I. P. Androulakis J. Kohn C. S. Chen P. V. Moghe Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 107 610 615
53. J. T. Cormier N. I. zur Nieden D. E. Rancourt M. S. Kallos Tissue Eng. 2006 12 3233 3245
54. M. Schroeder S. Niebruegge A. Werner E. Willbold M. Burg M. Ruediger L. J. Field J. Lehmann R. Zweigerdt Biotechnol. Bioeng. 2005 92 920 933
55. R. P. Franke M. Gräfe H. Schnittler D. Seiffge C. Mittermayer D. Drenckhahn Nature 1984 307 648 649
56. M. J. Levesque R. M. Nerem J. Biomech. Eng. 1985 107 341 347
57. A. Sen M. Kallos L. Behie Ind. Eng. Chem. Res. 2001 40 5350 5357
58. M. C. Simon B. Keith Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008 9 285 296
59. J. Mazumdar W. T. O'Brien R. S. Johnson J. C. LaManna J. C. Chavez P. S. Klein M. C. Simon Nat. Cell Biol. 2010 12 1007 1013
60. M. W. Pfaffl Nucleic Acids Res. 2001 29 45e
61. J. Vandesompele K. De Preter F. Pattyn B. Poppe N. Van Roy A. De Paepe F. Speleman Genome Biol. 2002 3