Discovery of hepatitis C virus NS3 helicase inhibitors by a multiplexed, high-throughput helicase activity assay based on graphene oxide

Angewandte Chemie - International Edition

Volumn 52, Issue 8, 2013, Pages 2340-2344

  Jang, Hongje ^c   Ryoo, Soo Ryoon ^a   Kim, Young Kwan ^a   Yoon, Soojin ^b   Kim, Henna ^c   Han, Sang Woo ^c   Choi, Byong Seok ^c   Kim, Dong Eun ^b   Min, Dal Hee ^a  

^a Seoul National University   (South Korea)

^b Konkuk University   (South Korea)

^c Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)   (South Korea)

Author keywords

biosensors; graphene oxide; helicases; high throughput screening; multiplex assays

Indexed keywords

GRAPHENE OXIDES; HELICASE ACTIVITIES; HELICASES; HEPATITIS C VIRUS; HIGH-THROUGHPUT; HIGH-THROUGHPUT SCREENING; MULTIPLEX ASSAYS; SELECTIVE INHIBITORS; SEVERE ACUTE RESPIRATORY SYNDROME CORONAVIRUS; SINGLE SCREEN;

ASSAYS; BIOSENSORS; MULTIPLEXING; VIRUSES;

DISEASES;

GRAPHITE; NS3 PROTEIN, HEPATITIS C VIRUS; OXIDE; PROTEINASE INHIBITOR; VIRUS PROTEIN;

ARTICLE; BIOASSAY; CELL CULTURE; CHEMISTRY; DRUG ANTAGONISM; DRUG DEVELOPMENT; HEPATITIS C VIRUS; HUMAN; IC 50; METHODOLOGY;

BIOLOGICAL ASSAY; CELLS, CULTURED; DRUG DISCOVERY; GRAPHITE; HEPACIVIRUS; HUMANS; INHIBITORY CONCENTRATION 50; OXIDES; PROTEASE INHIBITORS; VIRAL NONSTRUCTURAL PROTEINS;

EID: 84873923411     PISSN: 14337851     EISSN: 15213773     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/anie.201209222     Document Type: Article

References (41)

1. J. F. Perz, G. L. Armstrong, L. A. Farrington, Y. J. F. Hutin, B. P. Bell, J. Hepatol. 2006, 45, 529
2. Q. L. Choo, G. Kuo, A. J. Weiner, L. R. Overby, D. W. Bradley, M. Houghton, Science 1989, 244, 359
3. R. De Francesco, G. Migliaccio, Nature 2005, 436, 953.
4. T. Poynard, P. Bedossa, P. Opolon, Lancet 1997, 349, 825
5. R. Planas, B. Balleste, M. A. Alvarez, M. Rivera, S. Montoliu, J. A. Galeras, J. Santos, S. Coll, R. M. Morillas, R. Sola, J. Hepatol. 2004, 40, 823.
6. M. Schaefer, F. Schmidt, C. Folwaczny, R. Lorenz, G. Martin, N. Schindlbeck, W. Heldwein, M. Soyka, H. Grunze, A. Koenig, K. Loeschke, Hepatology 2003, 37, 443
7. K. V. Kowdley, J. Clin. Gastroenterol. 2005, 39, S 3.
8. E. Meylan, J. Curran, K. Hofmann, D. Moradpour, M. Binder, R. Bartenschlager, J. Tschopp, Nature 2005, 437, 1167
9. U. Koch, F. Narjes, Infect. Disord.: Drug Targets 2006, 6, 31
10. P. L. Beaulieu, Curr. Opin. Invest. Drugs 2007, 8, 614.
11. K. E. Sherman, S. L. Flamm, N. H. Afdhal, D. R. Nelson, M. S. Sulkowski, G. T. Everson, M. W. Fried, M. Adler, H. W. Reesink, M. Martin, A. J. Sankoh, N. Adda, R. S. Kauffman, S. George, C. I. Wright, F. Poordad, N. Engl. J. Med. 2011, 365, 1014
12. B. R. Bacon, S. C. Gordon, E. Lawitz, P. Marcellin, J. M. Vierling, S. Zeuzem, F. Poordad, Z. D. Goodman, H. L. Sings, N. Boparai, M. Burroughs, C. A. Brass, J. K. Albrecht, R. Esteban, N. Engl. J. Med. 2011, 364, 1207
13. F. Poordad, J. McCone, Jr., B. R. Bacon, S. Bruno, M. P. Manns, M. S. Sulkowski, I. M. Jacobson, K. R. Reddy, Z. D. Goodman, N. Boparai, M. J. DiNubile, V. Sniukiene, C. A. Brass, J. K. Albrecht, J. P. Bronowicki, N. Engl. J. Med. 2011, 364, 1195.
14. C. Hézode, N. Forestier, G. Dusheiko, P. Ferenci, S. Pol, T. Goeser, J. P. Bronowicki, M. Bourliere, S. Gharakhanian, L. Bengtsson, L. McNair, S. George, T. Kieffer, A. Kwong, R. S. Kauffman, J. Alam, J. M. Pawlotsky, S. Zeuzem, N. Engl. J. Med. 2009, 360, 1839
15. J. G. McHutchison, M. P. Manns, A. J. Muir, N. A. Terrault, I. M. Jacobson, N. H. Afdhal, E. J. Heathcote, S. Zeuzem, H. W. Reesink, J. Garg, M. Bsharat, S. George, R. S. Kauffman, N. Adda, A. M. Di Bisceglie, N. Engl. J. Med. 2010, 362, 1292.
16. S. Dumont, W. Cheng, V. Serebrov, R. K. Beran, I. Tinoco, Jr., A. M. Pyle, C. Bustamante, Nature 2006, 439, 105
17. S. S. Velankar, P. Soultanas, M. S. Dillingham, H. S. Subramanya, D. B. Wigley, Cell 1999, 97, 75
18. D.-E. Kim, M. Narayan, S. S. Patel, J. Mol. Biol. 2002, 321, 807
19. M. R. Singleton, M. R. Sawaya, T. Ellenberger, D. B. Wigley, Cell 2002, 101, 589.
20. D. N. Frick, Curr. Issues Mol. Biol. 2007, 9, 1
21. P. Borowski, A. Niebuhr, H. Schmitz, R. S. Hosmane, M. Bretner, M. A. Siwecka, T. Kulikowski, Acta. Biochim. Pol. 2002, 49, 597
22. C. A. Belon, D. N. Frick, Future Virol. 2009, 4, 277.
23. S. Mukherjee, A. M. Hanson, W. R. Shadrick, J. Ndjomou, N. L. Sweeney, J. J. Hernandez, D. Bartczak, K. Li, K. J. Frankowski, J. A. Heck, L. A. Arnold, F. J. Schoenen, D. N. Frick, Nucleic Acids Res. 2012, 40, 8611
24. K. Li, K. J. Frankowski, C. A. Belon, B. Neuenswander, J. Ndjomou, A. M. Hanson, M. A. Shanahan, F. J. Schoenen, B. S. J. Blagg, J. Aube, D. N. Frick, J. Med. Chem. 2012, 55, 3319.
25. H. Jang, Y.-K. Kim, H.-M. Kwon, W.-S. Yeo, D.-E. Kim, D.-H. Min, Angew. Chem. 2010, 122, 5839
26. Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 5703.
27. C. H. Lu, H. H. Yang, C. L. Zhu, X. Chen, G. N. Chen, Angew. Chem. 2009, 121, 4879
28. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 4785
29. J. Lee, Y.-K. Kim, D.-H. Min, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 14714
30. H. Wang, Q. Zhang, X. Chu, T. Chen, J. Ge, R. Yu, Angew. Chem. 2011, 123, 7203
31. Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 7065.
32. W. S. Hummers, R. E. Offeman, J. Am. Chem. Soc. 1958, 80, 1339.
33. K. J. Jang, N.-R. Lee, W.-S. Yeo, Y.-J. Jeong, D.-E. Kim, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008, 366, 738
34. S. Myong, M. M. Bruno, A. N. Pyle, T. Ha, Science 2007, 317, 513.
35. J.-H. Zhang, T. D. Y. Chung, K. R. Oldenburg, J. Biomol. Screening 1999, 4, 67.
36. D.-H. Min, W.-J. Tang, M. Mrksich, Nat. Biotechnol. 2004, 22, 717.
37. T. Pietschmann, V. Lohmann, G. Rutter, K. Kurpanek, R. Bartenschlager, J. Virol. 2001, 75, 1252
38. V. Lohmann, S. Hoffmann, U. Herian, F. Penin, R. Bartenschlager, J. Virol. 2003, 77, 3007.
39. H. Zhao, W. Lin, K. Kumthip, D. Cheng, D. N. Fusco, O. Hofmann, N. Jilg, A. W. Tai, K. Goto, L. Zhang, W. Hide, J. Y. Jang, L. F. Peng, R. T. Chung, J. Hepatol. 2012, 56, 326.
40. J. Lee, D.-H. Min, Analyst 2012, 137, 2024
41. J. Lee, Y.-K. Kim, D.-H. Min, Anal. Chem. 2011, 83, 8906.