Marked difference in the electronic structure of cyanide-ligated ferric protoglobins and myoglobin due to heme ruffling

Inorganic Chemistry

Volumn 51, Issue 16, 2012, Pages 8834-8841

  Van Doorslaer, Sabine ^a   Tilleman, Lesley ^a   Verrept, Ben ^a   Desmet, Filip ^a   Maurelli, Sara ^a,b   Trandafir, Florin ^a   Moens, Luc ^a   Dewilde, Sylvia ^a  

^a UNIVERSITY OF ANTWERP   (Belgium)

^b UNIVERSITY OF TURIN   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FERRICYANIDE; GLOBIN; HEME; LIGAND; MYOGLOBIN; PHENYLALANINE; RECOMBINANT PROTEIN;

ANIMAL; ARTICLE; CHEMISTRY; ELECTRON; ELECTRON SPIN RESONANCE; ESCHERICHIA COLI; GENETICS; HORSE; METHANOSARCINA; PROTEIN CONFORMATION; THERMODYNAMICS;

ANIMALS; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; ELECTRONS; ESCHERICHIA COLI; FERRICYANIDES; GLOBINS; HEME; HORSES; LIGANDS; METHANOSARCINA; MYOGLOBIN; PHENYLALANINE; PROTEIN CONFORMATION; RECOMBINANT PROTEINS; THERMODYNAMICS;

EID: 84865230733     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic3007074     Document Type: Article

References (58)

1. Vinogradov, S. N.; Moens, L. J. Biol. Chem. 2008, 283, 8773-8777
2. Hou, S.; Freitas, T.; Larsen, R. W.; Piatibratov, M.; Sivozhelezov, V.; Yamamoto, A.; Meleshkevitch, E. A.; Zimmer, M.; Ordal, G. W.; Alam, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 9353-9358
3. Freitas, T. A. K.; Hou, S.; Dioum, E. M.; Saito, J. A.; Newhouse, J.; Gonzalez, G.; Gilles-Gonzalez, M. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 6675-6680
4. Vinogradov, S. N.; Hoogewijs, D.; Bailly, X.; Arredondo-Peter, R.; Gough, J.; Dewilde, S.; Moens, L.; Vanfleteren, J. R. BMC Evol. Biol. 2006, 6, 31
5. Vinogradov, S. N.; Hoogewijs, D.; Bailly, X.; Mizuguchi, K.; Dewilde, S.; Moens, L.; Vanfleteren, J. R. Gene 2007, 398, 132-142
6. Nardini, M.; Pesce, A.; Thijs, L.; Saito, J. A.; Dewilde, S.; Alam, M.; Ascenzi, P.; Coletta, M.; Ciaccio, C.; Moens, L.; Bolognesi, M. EMBO Rep. 2008, 9, 157-163
7. Pesce, A.; Tilleman, L.; Dewilde, S.; Ascenzi, P.; Coletta, M.; Ciaccio, C.; Bruno, S.; Moens, L.; Bolognesi, M.; Nardini, M. IUBMB Life 2011, 63, 287-294
8. Galagan, J. E.; Nusbaum, C.; Roy, A.; Endrizzi, M. G.; Macdonald, P.; FitzHugh, W.; Calvo, S.; Engels, R.; Smirnov, S.; Atnoor, D.; Brown, A.; Allen, N.; Naylor, J.; Stange-Thomann, N.; DeArellano, K.; Johnson, R.; Linton, L.; McEwan, P.; McKernan, K.; Talamas, J.; Tirrell, A.; Ye, W.; Zimmer, A.; Barber, R. D.; Cann, I.; Graham, D. E.; Grahame, D. A.; Guss, A. M.; Hedderich, R.; Ingram-Smith, C.; Kuettner, H. C.; Krzycki, J. A.; Leigh, J. A.; Li, W.; Liu, J.; Mukhopadhyay, B.; Reeve, J. N.; Smith, K.; Springer, T. A.; Umayam, L. A.; White, O.; White, R. H.; de Macario, E. C.; Ferry, J. G.; Jarrell, K. F.; Jing, H.; Macario, A. J. L.; Paulsen, I.; Pritchett, M.; Sowers, K. R.; Swanson, R. V.; Zinder, S. H.; Lander, E.; Metcalf, W. W.; Birren, B. Genome Res. 2002, 12, 532-542
9. Bapteste, E.; Brochier, C.; Boucher, Y. Archaea 2005, 1, 353-363
10. Battistuzzi, F. U.; Feijao, A.; Hedges, S. B. BMC Evol. Biol. 2004, 4, 44
11. Forti, F.; Boechi, L.; Bikiel, D.; Martí, M. A.; Nardini, M.; Bolognesi, M.; Viappiani, C.; Estrin, D.; Luque, F. J. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 13771-13780
12. Walker, F. A. Coord. Chem. Rev. 1999, 185-186, 471-534
13. Hori, H. Biochem. Biophys. Acta 1971, 251, 227-235
14. Mulks, C. F.; Scholes, C. P.; Dickinson, L. C.; Lapidot, A. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 1645-1654
15. Ohba, Y. Appl. Magn. Reson. 2003, 23, 539-556
16. Magliozzo, R.; Peisach, J. Biochemistry 1993, 32, 8446-8456
17. Arcovito, A.; Benfatto, M.; Cianci, M.; Hasnain, S. S.; Nienhaus, K.; Nienhaus, G. U.; Savino, C.; Strange, R. W.; Vallone, B.; Della Longa, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 6211-6216
18. Bolognesi, M.; Rosano, C.; Losso, R.; Borassi, A.; Rissi, M.; Wittenberg, J. B.; Boffi, A.; Ascenzi, P. Biophys. J. 1999, 77, 1093-1099
19. Dewilde, S.; Kiger, L.; Burmester, T.; Hankeln, T.; Baudin-Creuza, V.; Marden, M. C.; Caubergs, R.; Moens, L. J. Biol. Chem. 2001, 276, 38949-38955
20. Stoll, S.; Schweiger, A. J. Magn. Reson. 2006, 178, 42-55
21. Höfer, P.; Grupp, A.; Nebenführ, H.; Mehring, M. Chem. Phys. Lett. 1986, 132, 279-282
22. Liesum, L.; Schweiger, A. J. Chem. Phys. 2001, 114, 9478-9488
23. Jeschke, G.; Rakhmatullin, R.; Schweiger, A. J. Magn. Reson. 1998, 131, 261-271
24. Mims, W. B. Proc. R. Soc. London, Ser A 1965, 283, 452-457
25. Davies, E. R. Phys. Lett. A. 1974, 47, 1-2
26. Ioanitescu, I. A.; Van Doorslaer, S.; Dewilde, S.; Moens, L. Metallomics 2009, 1, 256-264
27. Appleby, C. A.; Blumberg, W. E.; Peisach, J.; Wittenberg, B. A.; Wittenberg, J. B. J. Biol. Chem. 1976, 251, 6090-6096
28. Das, T. K.; Lee, H. C.; Duff, S. M. G.; Hill, R. D.; Peisach, J.; Rousseau, D. L.; Wittenberg, B. A.; Wittenberg, J. B. J. Biol. Chem. 1999, 274, 4207-4212
29. Ikeda-Saito, M.; Kimura, S. Arch. Biochem. Biophys. 1990, 283, 351-355
30. Yang, T.-C.; McNaughton, R. L.; Clay, M. D.; Jenney, F. E., Jr.; Krishnan, R.; Kurtz, D. M., Jr.; Adams, M. W. W.; Johnson, M. K.; Hoffmann, B. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 16566-16578
31. Bikiel, D. E.; Forti, F.; Boechi, L.; Nardini, M.; Luque, F. J.; Martí, M. A.; Estrin, D. A. J. Phys. Chem. 2010, 114, 8536-8543
32. Olea, C.; Boon, E. M.; Pellicena, P.; Kuriyan, J.; Marletta, M. A. ACS Chem. Biol. 2008, 3, 703-710
33. Emerson, S. D.; La Mar, G. N. Biochemistry 1990, 29, 1556-1566
34. Peisach, J.; Blumber, W. E.; Wyluda, B. J. Eur. Biophys. Congr. Proc. 1971, 1, 109-112
35. Fittipaldi, M.; García-Rubio, I.; Trandafir, F.; Gromov, I.; Schweiger, A.; Bouwen, A.; Van Doorslaer, S. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 3859-3870
36. Vinck, E.; Van Doorslaer, S.; Dewilde, S.; Mitrikas, G.; Schweiger, A.; Moens, L. J. Biol. Inorg. Chem. 2006, 11, 467-475
37. Scholes, C. P.; Van Camp, H. L. Biochim. Biophys. Acta 1976, 434, 290-296
38. Can, M.; Zoppellaro, G.; Andersson, K. K.; Bren, K. L. Inorg. Chem. 2011, 50, 12018-12024
39. Ikeue, T.; Ohgo, Y.; Saitoh, T.; Yamaguchi, T.; Nakamura, M. Inorg. Chem. 2001, 40, 3423-3434
40. Walker, F. A. Inorg. Chem. 2003, 42, 4526-4544
41. Yatsunyk, L. A.; Shokhirev, N. V.; Walker, F. A. Inorg. Chem. 2005, 44, 2848-2866
42. Ikezaki, A.; Nakamura, M. Inorg. Chem. 2002, 41, 2761-2768
43. Watson, C. T.; Cai, S.; Shokhirev, N. V.; Walker, F. A. Inorg. Chem. 2005, 44, 7468-7484
44. Taylor, C. P. S. Biochim. Biophys. Acta 1977, 491, 137-149
45. Alonso, P. J.; Martínez, J. I.; García-Rubio, I. Coord. Chem. Rev. 2007, 251, 12-24
46. McGarvey, B. R. Coord. Chem. Rev. 1998, 170, 75-92
47. McGarvey, B. R. Quim. Nova 1998, 21, 206-213
48. Astashkin, A. V.; Raitsimring, A. M.; Kennedy, A. R.; Shokhireva, T. Kh.; Walker, F. A. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 74-82
49. Raitsimring, A. M.; Borbat, P.; Shokhireva, T. Kh.; Walker, F. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 5235-5244
50. Liptak, M. D.; Wen, X.; Bren, K. L. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 9753-9763
51. Desmet, F.; Thijs, L.; El Mkami, H.; Dewilde, S.; Moens, L.; Smith, G.; Van Doorslaer, S. J. Inorg. Biol. Biochem. 2010, 104, 1022-1028
52. Scholes, C. P.; Falkowski, K. M.; Chen, S.; Bank, J. J. Am. Chem. Soc. 1985, 108, 1660-1671
53. Fahnenschmidt, M.; Bittl, R.; Rau, H. K.; Haehnel, W.; Lubitz, W. Chem. Phys. Lett. 2000, 323, 329-339
54. Safo, M. K.; Walker, F. A.; Raitsimring, A. M.; Walters, W. P.; Dolata, D. P.; Debrunner, P. G.; Scheidt, W. R. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7760-7770
55. Shokhireva, T. K.; Weichsel, A.; Smith, K. M.; Berry, R. E.; Shokhirev, N. V.; Balfour, C. A.; Zhang, H.; Montfort, W. R.; Walker, F. A. Inorg. Chem. 2007, 46, 2041-2056
56. Roberts, S. A.; Weichsel, A.; Qiu, Y.; Shelnutt, J. A.; Walker, F. A.; Montfort, W. R. Biochemistry 2001, 40, 11327-11337
57. Shokhireva, T. K.; Berry, R. E.; Zhang, H.; Shokhirev, N. V.; Walker, F. A. J. Inorg. Biochem. 2011, 105, 1238-1257
58. Neya, S.; Suzuki, M.; Hoshino, T.; Ode, H.; Imai, K.; Komatsu, T.; Ikezaki, A.; Nakamura, M.; Furutani, Y.; Kandori, H. Biochemistry 2010, 49, 5642-5650