Modulation of ligand-field parameters by heme ruffling in cytochromes c revealed by epr spectroscopy

Inorganic Chemistry

Volumn 50, Issue 23, 2011, Pages 12018-12024

  Can, Mehmet ^a   Zoppellaro, Giorgio ^b   Andersson, K Kristoffer ^b   Bren, Kara L ^a  

^a UNIVERSITY OF ROCHESTER   (United States)

^b UNIVERSITY OF OSLO   (Norway)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CYTOCHROME C; HEME; LIGAND;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ELECTRON SPIN RESONANCE; ENZYMOLOGY; METABOLISM; METHODOLOGY; PROTEIN CONFORMATION; PSEUDOMONAS AERUGINOSA;

CYTOCHROMES C; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; HEME; LIGANDS; MODELS, MOLECULAR; PROTEIN CONFORMATION; PSEUDOMONAS AERUGINOSA;

EID: 82355163006     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic201479q     Document Type: Article

References (42)

1. Bowman, S. E. J.; Bren, K. L. Nat. Prod. Rep. 2008, 25, 1118-1130
2. Reedy, C. J.; Elvekrog, M. M.; Gibney, B. R. Nucleic Acids Res. 2008, 36, D307-D313
3. Fufezan, C.; Zhang, J.; Gunner, M. R. Proteins 2008, 73, 690-704
4. Senn, H.; Keller, R. M.; Wüthrich, K. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1980, 92, 1362-1369
5. Moore, G. R.; Pettigrew, G. W. Cytochromes c; Evolutionary, Structural, and Physicochemical Aspects; Springer-Verlag: Berlin, 1990.
6. Zhong, L.; Wen, X.; Rabinowitz, T. M.; Russell, B. S.; Karan, E. F.; Bren, K. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 8637-8642
7. Bren, K. L.; Kellogg, J. A.; Kaur, R.; Wen, X. Inorg. Chem. 2004, 43, 7934-7944
8. Zoppellaro, G.; Teschner, T.; Harbitz, E.; Schuenemann, V.; Karlsen, S.; Arciero, D. M.; Ciurli, S.; Trautwein, A. X.; Hooper, A. B.; Andersson, K. K. ChemPhysChem 2006, 7, 1258-1267
9. Zoppellaro, G.; Harbitz, E.; Kaur, R.; Ensign, A. A.; Bren, K. L.; Andersson, K. K. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 15348-15360
10. Zoppellaro, G.; Bren, K. L.; Ensign, A. A.; Harbitz, E.; Kaur, R.; Hersleth, H. P.; Ryde, U.; Hederstedt, L.; Andersson, K. K. Biopolymers 2009, 91, 1064-1082
11. Matsuura, Y.; Takano, T.; Dickerson, R. E. J. Mol. Biol. 1982, 156, 389-409
12. Walker, F. A. Chem. Rev. 2004, 104, 589-615
13. Bertini, I.; Luchinat, C.; Parigi, G.; Walker, F. A. J. Biol. Inorg. Chem. 1999, 4, 515-519
14. Shokhirev, N. V.; Walker, F. A. J. Biol. Inorg. Chem. 1998, 3, 581-594
15. Taylor, C. P. S. Biochim. Biophys. Acta 1977, 491, 137-149
16. Liptak, M. D.; Wen, X.; Bren, K. L. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 9753-9763
17. Borgia, A.; Bonivento, D.; Travaglini-Allocatelli, C.; Di Matteo, A.; Brunori, M. J. Biol. Chem. 2006, 281, 9331-9336
18. Michel, L. V.; Ye, T.; Bowman, S. E. J.; Levin, B. D.; Hahn, M. A.; Russell, B. S.; Elliott, S. J.; Bren, K. L. Biochemistry 2007, 46, 11753-11760
19. Bowman, S. E. J.; Bren, K. L. Inorg. Chem. 2010, 49, 7890-7897
20. Travaglini-Allocatelli, C.; Gianni, S.; Dubey, V. K.; Borgia, A.; Di Matteo, A.; Bonivento, D.; Cutruzzolà, F.; Bren, K. L.; Brunori, M. J. Biol. Chem. 2005, 280, 25729-25734
21. Hobbs, J. D.; Shelnutt, J. A. J. Protein Chem. 1995, 14, 19-25
22. Jentzen, W.; Song, X. Z.; Shelnutt, J. A. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 1684-1699
23. Karan, E. F.; Russell, B. S.; Bren, K. L. J. Biol. Inorg. Chem. 2002, 7, 260-272
24. Arslan, E.; Schulz, H.; Zufferey, R.; Kunzler, P.; Thöny-Meyer, L. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998, 251, 744-747
25. Fee, J. A.; Chen, Y.; Todaro, T. R.; Bren, K. L.; Patel, K. M.; Hill, M. G.; Gomez-Moran, E.; Loehr, T. M.; Ai, J. Y.; Thony-Meyer, L.; Williams, P. A.; Stura, E.; Sridhar, V.; McRee, D. E. Protein Sci. 2000, 9, 2074-2084
26. Wen, X.; Bren, K. L. Inorg. Chem. 2005, 44, 8587-8593
27. Russell, B. S.; Zhong, L.; Bigotti, M. G.; Cutruzzolà, F.; Bren, K. L. J. Biol. Inorg. Chem. 2003, 8, 156-166
28. Hanson, G. R.; Gates, K. E.; Noble, J. C.; Griffin, M.; Mitchell, A.; Benson, S. J. Inorg. Biochem. 2004, 98, 903-916
29. Griffith, J. S. Nature 1957, 180, 30-31
30. Griffith, J. S. Mol. Phys. 1971, 21, 135-139
31. Castner, T. J., Jr. Phys. Rev. 1959, 115, 1506-1515
32. Poulos, T. L. J. Biol. Inorg. Chem. 1996, 1, 356-359
33. Shokhireva, T. K.; Shokhirev, N. V.; Berry, R. E.; Zhang, H. J.; Walker, F. A. J. Biol. Inorg. Chem. 2008, 13, 941-959
34. Chacko, V. P.; Lamar, G. N. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 7002-7007
35. Ma, J. G.; Vanderkooi, J. M.; Zhang, J.; Jia, S. L.; Shelnutt, J. A. Biochemistry 1999, 38, 2787-2795
36. Neya, S.; Suzuki, M.; Hoshino, T.; Ode, H.; Imai, K.; Komatsu, T.; Ikezaki, A.; Nakamura, M.; Furutani, Y.; Kandori, H. Biochemistry 2010, 49, 5642-5650
37. Bikiel, D. E.; Forti, F.; Boechi, L.; Nardini, M.; Javier Luque, F.; Martí, M. A.; Estrin, D. A. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 8536-8543
38. Olea, C.; Boon, E. M.; Pellicena, P.; Kuriyan, J.; Marletta, M. A. ACS Chem. Biol. 2008, 3, 703-710
39. Benini, S.; Gonzalez, A.; Rypniewski, W. R.; Wilson, K. S.; Van Beeumen, J. J.; Ciurli, S. Biochemistry 2000, 39, 13115-13126
40. Stevens, J. M.; Daltrop, O.; Allen, J. W. A.; Ferguson, S. J. Acc. Chem. Res. 2004, 37, 999-1007
41. Allen, J. W. A.; Barker, P. D.; Daltrop, O.; Stevens, J. M.; Tomlinson, E. J.; Sinha, N.; Sambongi, Y.; Ferguson, S. J. Dalton Trans. 2005, 3410-3418
42. Zheng, Z.; Gunner, M. R. Proteins 2009, 75, 719-734