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Molecular BioSystems

Volumn 8, Issue 9, 2012, Pages 2323-2333

Molecular chaperones DnaK and DnaJ share predicted binding sites on most proteins in the E. coli proteome

(5) Srinivasan, Sharan R a Gillies, Anne T a Chang, Lyra a Thompson, Andrea D a Gestwicki, Jason E a

a UNIVERSITY OF MICHIGAN (United States)

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ESCHERICHIA COLI;

CHAPERONE; DNAJ PROTEIN, E COLI; DNAK PROTEIN, E COLI; ESCHERICHIA COLI PROTEIN; HEAT SHOCK PROTEIN 40; HEAT SHOCK PROTEIN 70; PROTEOME;

ARTICLE; BINDING SITE; CHEMISTRY; GENETICS; METABOLISM; PROTEIN BINDING;

BINDING SITES; ESCHERICHIA COLI PROTEINS; HSP40 HEAT-SHOCK PROTEINS; HSP70 HEAT-SHOCK PROTEINS; MOLECULAR CHAPERONES; PROTEIN BINDING; PROTEOME;

EID: 84864661889 PISSN: 1742206X EISSN: 17422051 Source Type: Journal
DOI: 10.1039/c2mb25145k Document Type: Article

Times cited : (30)

References (63)

1
- 0033953974
- D. E. Feldman J. Frydman Curr. Opin. Struct. Biol. 2000 10 26 33
- (2000) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.10 , pp. 26-33
- Feldman, D.E.¹ Frydman, J.²

2
- 35748962910
- P. Genevaux C. Georgopoulos W. L. Kelley Mol. Microbiol. 2007 66 840 857
- (2007) Mol. Microbiol. , vol.66 , pp. 840-857
- Genevaux, P.¹ Georgopoulos, C.² Kelley, W.L.³

3
- 33845808283
- C. Georgopoulos Genetics 2006 174 1699 1707
- (2006) Genetics , vol.174 , pp. 1699-1707
- Georgopoulos, C.¹

4
- 48749089081
- S. Hansen K. Lewis M. Vulic Antimicrob. Agents Chemother. 2008 52 2718 2726
- (2008) Antimicrob. Agents Chemother. , vol.52 , pp. 2718-2726
- Hansen, S.¹ Lewis, K.² Vulic, M.³

5
- 77950165418
- A. Liu L. Tran E. Becket K. Lee L. Chinn E. Park K. Tran J. H. Miller Antimicrob. Agents Chemother. 2010 54 1393 1403
- (2010) Antimicrob. Agents Chemother. , vol.54 , pp. 1393-1403
- Liu, A.¹ Tran, L.² Becket, E.³ Lee, K.⁴ Chinn, L.⁵ Park, E.⁶ Tran, K.⁷ Miller, J.H.⁸

6
- 64649094781
- E. B. Bertelsen L. Chang J. E. Gestwicki E. R. Zuiderweg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 8471 8476
- (2009) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.106 , pp. 8471-8476
- Bertelsen, E.B.¹ Chang, L.² Gestwicki, J.E.³ Zuiderweg, E.R.⁴

7
- 0027484417
- S. Blond-Elguindi S. E. Cwirla W. J. Dower R. J. Lipshutz S. R. Sprang J. F. Sambrook M. J. Gething Cell 1993 75 717 728
- (1993) Cell , vol.75 , pp. 717-728
- Blond-Elguindi, S.¹ Cwirla, S.E.² Dower, W.J.³ Lipshutz, R.J.⁴ Sprang, S.R.⁵ Sambrook, J.F.⁶ Gething, M.J.⁷

8
- 0029937037
- X. Zhu X. Zhao W. F. Burkholder A. Gragerov C. M. Ogata M. E. Gottesman W. A. Hendrickson Science 1996 272 1606 1614
- (1996) Science , vol.272 , pp. 1606-1614
- Zhu, X.¹ Zhao, X.² Burkholder, W.F.³ Gragerov, A.⁴ Ogata, C.M.⁵ Gottesman, M.E.⁶ Hendrickson, W.A.⁷

9
- 0030976048
- S. Rudiger L. Germeroth J. Schneider-Mergener B. Bukau EMBO J. 1997 16 1501 1507
- (1997) EMBO J. , vol.16 , pp. 1501-1507
- Rudiger, S.¹ Germeroth, L.² Schneider-Mergener, J.³ Bukau, B.⁴

10
- 0026059137
- G. C. Flynn J. Pohl M. T. Flocco J. E. Rothman Nature 1991 353 726 730
- (1991) Nature , vol.353 , pp. 726-730
- Flynn, G.C.¹ Pohl, J.² Flocco, M.T.³ Rothman, J.E.⁴

11
- 0028012786
- A. Gragerov L. Zeng X. Zhao W. Burkholder M. E. Gottesman J. Mol. Biol. 1994 235 848 854
- (1994) J. Mol. Biol. , vol.235 , pp. 848-854
- Gragerov, A.¹ Zeng, L.² Zhao, X.³ Burkholder, W.⁴ Gottesman, M.E.⁵

12
- 79952364237
- R. Schlecht A. H. Erbse B. Bukau M. P. Mayer Nat. Struct. Mol. Biol. 2011 18 345 351
- (2011) Nat. Struct. Mol. Biol. , vol.18 , pp. 345-351
- Schlecht, R.¹ Erbse, A.H.² Bukau, B.³ Mayer, M.P.⁴

13
- 35649024724
- J. Jiang E. G. Maes A. B. Taylor L. Wang A. P. Hinck E. M. Lafer R. Sousa Mol. Cell 2007 28 422 433
- (2007) Mol. Cell , vol.28 , pp. 422-433
- Jiang, J.¹ Maes, E.G.² Taylor, A.B.³ Wang, L.⁴ Hinck, A.P.⁵ Lafer, E.M.⁶ Sousa, R.⁷

14
- 31344456740
- F. Moro V. Fernandez-Saiz A. Muga Protein Sci. 2006 15 223 233
- (2006) Protein Sci. , vol.15 , pp. 223-233
- Moro, F.¹ Fernandez-Saiz, V.² Muga, A.³

15
- 0034127485
- M. Pellecchia D. L. Montgomery S. Y. Stevens C. W. Vander Kooi H. P. Feng L. M. Gierasch E. R. Zuiderweg Nat. Struct. Biol. 2000 7 298 303
- (2000) Nat. Struct. Biol. , vol.7 , pp. 298-303
- Pellecchia, M.¹ Montgomery, D.L.² Stevens, S.Y.³ Vander Kooi, C.W.⁴ Feng, H.P.⁵ Gierasch, L.M.⁶ Zuiderweg, E.R.⁷

16
- 0037468615
- S. V. Slepenkov S. N. Witt FEBS Lett. 2003 539 100 104
- (2003) FEBS Lett. , vol.539 , pp. 100-104
- Slepenkov, S.V.¹ Witt, S.N.²

17
- 34047268015
- J. F. Swain G. Dinler R. Sivendran D. L. Montgomery M. Stotz L. M. Gierasch Mol. Cell 2007 26 27 39
- (2007) Mol. Cell , vol.26 , pp. 27-39
- Swain, J.F.¹ Dinler, G.² Sivendran, R.³ Montgomery, D.L.⁴ Stotz, M.⁵ Gierasch, L.M.⁶

18
- 77954947810
- H. H. Kampinga E. A. Craig Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2010 11 579 592
- (2010) Nat. Rev. Mol. Cell Biol. , vol.11 , pp. 579-592
- Kampinga, H.H.¹ Craig, E.A.²

19
- 15844372190
- A. W. Karzai R. McMacken J. Biol. Chem. 1996 271 11236 11246
- (1996) J. Biol. Chem. , vol.271 , pp. 11236-11246
- Karzai, A.W.¹ McMacken, R.²

20
- 0032103439
- W. L. Kelley Trends Biochem. Sci. 1998 23 222 227
- (1998) Trends Biochem. Sci. , vol.23 , pp. 222-227
- Kelley, W.L.¹

21
- 0033545978
- T. Laufen M. P. Mayer C. Beisel D. Klostermeier A. Mogk J. Reinstein B. Bukau Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 5452 5457
- (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.96 , pp. 5452-5457
- Laufen, T.¹ Mayer, M.P.² Beisel, C.³ Klostermeier, D.⁴ Mogk, A.⁵ Reinstein, J.⁶ Bukau, B.⁷

22
- 0025730978
- K. Liberek J. Marszalek D. Ang C. Georgopoulos M. Zylicz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 2874 2878
- (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.88 , pp. 2874-2878
- Liberek, K.¹ Marszalek, J.² Ang, D.³ Georgopoulos, C.⁴ Zylicz, M.⁵

23
- 0032214832
- B. Misselwitz O. Staeck T. A. Rapoport Mol. Cell 1998 2 593 603
- (1998) Mol. Cell , vol.2 , pp. 593-603
- Misselwitz, B.¹ Staeck, O.² Rapoport, T.A.³

24
- 0028170215
- D. Wall M. Zylicz C. Georgopoulos J. Biol. Chem. 1994 269 5446 5451
- (1994) J. Biol. Chem. , vol.269 , pp. 5446-5451
- Wall, D.¹ Zylicz, M.² Georgopoulos, C.³

25
- 82755187767
- A. Ahmad A. Bhattacharya R. A. McDonald M. Cordes B. Ellington E. B. Bertelsen E. R. Zuiderweg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 18966 18971
- (2011) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.108 , pp. 18966-18971
- Ahmad, A.¹ Bhattacharya, A.² McDonald, R.A.³ Cordes, M.⁴ Ellington, B.⁵ Bertelsen, E.B.⁶ Zuiderweg, E.R.⁷

26
- 15844404388
- B. Banecki K. Liberek D. Wall A. Wawrzynow C. Georgopoulos E. Bertoli F. Tanfani M. Zylicz J. Biol. Chem. 1996 271 14840 14848
- (1996) J. Biol. Chem. , vol.271 , pp. 14840-14848
- Banecki, B.¹ Liberek, K.² Wall, D.³ Wawrzynow, A.⁴ Georgopoulos, C.⁵ Bertoli, E.⁶ Tanfani, F.⁷ Zylicz, M.⁸

27
- 0030030946
- A. Szabo R. Korszun F. U. Hartl J. Flanagan EMBO J. 1996 15 408 417
- (1996) EMBO J. , vol.15 , pp. 408-417
- Szabo, A.¹ Korszun, R.² Hartl, F.U.³ Flanagan, J.⁴

28
- 0345299781
- J. Li X. Qian B. Sha Structure 2003 11 1475 1483
- (2003) Structure , vol.11 , pp. 1475-1483
- Li, J.¹ Qian, X.² Sha, B.³

29
- 80053952650
- F. U. Hartl Nat. Med. 2011 17 1206 1210
- (2011) Nat. Med. , vol.17 , pp. 1206-1210
- Hartl, F.U.¹

30
- 55249108963
- F. Rodriguez F. Arsene-Ploetze W. Rist S. Rudiger J. Schneider-Mergener M. P. Mayer B. Bukau Mol. Cell 2008 32 347 358
- (2008) Mol. Cell , vol.32 , pp. 347-358
- Rodriguez, F.¹ Arsene-Ploetze, F.² Rist, W.³ Rudiger, S.⁴ Schneider-Mergener, J.⁵ Mayer, M.P.⁶ Bukau, B.⁷

31
- 65549103025
- D. W. Summers P. M. Douglas C. H. Ramos D. M. Cyr Trends Biochem. Sci. 2009 34 230 233
- (2009) Trends Biochem. Sci. , vol.34 , pp. 230-233
- Summers, D.W.¹ Douglas, P.M.² Ramos, C.H.³ Cyr, D.M.⁴

32
- 0032549525
- E. V. Pierpaoli E. Sandmeier H. J. Schonfeld P. Christen J. Biol. Chem. 1998 273 6643 6649
- (1998) J. Biol. Chem. , vol.273 , pp. 6643-6649
- Pierpaoli, E.V.¹ Sandmeier, E.² Schonfeld, H.J.³ Christen, P.⁴

33
- 0037928428
- W. Han P. Christen J. Biol. Chem. 2003 278 19038 19043
- (2003) J. Biol. Chem. , vol.278 , pp. 19038-19043
- Han, W.¹ Christen, P.²

34
- 1842737657
- W. Han P. Christen FEBS Lett. 2004 563 146 150
- (2004) FEBS Lett. , vol.563 , pp. 146-150
- Han, W.¹ Christen, P.²

35
- 0028151509
- A. Szabo T. Langer H. Schroder J. Flanagan B. Bukau F. U. Hartl Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994 91 10345 10349
- (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.91 , pp. 10345-10349
- Szabo, A.¹ Langer, T.² Schroder, H.³ Flanagan, J.⁴ Bukau, B.⁵ Hartl, F.U.⁶

36
- 0242414663
- K. Linke T. Wolfram J. Bussemer U. Jakob J. Biol. Chem. 2003 278 44457 44466
- (2003) J. Biol. Chem. , vol.278 , pp. 44457-44466
- Linke, K.¹ Wolfram, T.² Bussemer, J.³ Jakob, U.⁴

37
- 77958547635
- J. Perales-Calvo A. Muga F. Moro J. Biol. Chem. 2010 285 34231 34239
- (2010) J. Biol. Chem. , vol.285 , pp. 34231-34239
- Perales-Calvo, J.¹ Muga, A.² Moro, F.³

38
- 1242269219
- C. Y. Fan S. Lee D. M. Cyr Cell Stress Chaperones 2003 8 309 316
- (2003) Cell Stress Chaperones , vol.8 , pp. 309-316
- Fan, C.Y.¹ Lee, S.² Cyr, D.M.³

39
- 0032561360
- Z. Lu D. M. Cyr J. Biol. Chem. 1998 273 27824 27830
- (1998) J. Biol. Chem. , vol.273 , pp. 27824-27830
- Lu, Z.¹ Cyr, D.M.²

40
- 77954377096
- L. Chang A. D. Thompson P. Ung H. A. Carlson J. E. Gestwicki J. Biol. Chem. 2010 285 21282 21291
- (2010) J. Biol. Chem. , vol.285 , pp. 21282-21291
- Chang, L.¹ Thompson, A.D.² Ung, P.³ Carlson, H.A.⁴ Gestwicki, J.E.⁵

41
- 33745700348
- B. Hu M. P. Mayer M. Tomita Biophys. J. 2006 91 496 507
- (2006) Biophys. J. , vol.91 , pp. 496-507
- Hu, B.¹ Mayer, M.P.² Tomita, M.³

42
- 0029013908
- J. S. McCarty A. Buchberger J. Reinstein B. Bukau J. Mol. Biol. 1995 249 126 137
- (1995) J. Mol. Biol. , vol.249 , pp. 126-137
- McCarty, J.S.¹ Buchberger, A.² Reinstein, J.³ Bukau, B.⁴

43
- 67650473997
- P. Kota D. W. Summers H. Y. Ren D. M. Cyr N. V. Dokholyan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 11073 11078
- (2009) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.106 , pp. 11073-11078
- Kota, P.¹ Summers, D.W.² Ren, H.Y.³ Cyr, D.M.⁴ Dokholyan, N.V.⁵

44
- 0035283043
- S. Rudiger J. Schneider-Mergener B. Bukau EMBO J. 2001 20 1042 1050
- (2001) EMBO J. , vol.20 , pp. 1042-1050
- Rudiger, S.¹ Schneider-Mergener, J.² Bukau, B.³

45
- 0029980091
- J. Frydman F. U. Hartl Science 1996 272 1497 1502
- (1996) Science , vol.272 , pp. 1497-1502
- Frydman, J.¹ Hartl, F.U.²

46
- 0026696625
- J. Gamer H. Bujard B. Bukau Cell 1992 69 833 842
- (1992) Cell , vol.69 , pp. 833-842
- Gamer, J.¹ Bujard, H.² Bukau, B.³

47
- 0030044799
- J. Gamer G. Multhaup T. Tomoyasu J. S. McCarty S. Rudiger H. J. Schonfeld C. Schirra H. Bujard B. Bukau EMBO J. 1996 15 607 617
- (1996) EMBO J. , vol.15 , pp. 607-617
- Gamer, J.¹ Multhaup, G.² Tomoyasu, T.³ McCarty, J.S.⁴ Rudiger, S.⁵ Schonfeld, H.J.⁶ Schirra, C.⁷ Bujard, H.⁸ Bukau, B.⁹

48
- 0037160010
- S. Y. Kim S. Sharma J. R. Hoskins S. Wickner J. Biol. Chem. 2002 277 44778 44783
- (2002) J. Biol. Chem. , vol.277 , pp. 44778-44783
- Kim, S.Y.¹ Sharma, S.² Hoskins, J.R.³ Wickner, S.⁴

49
- 0029094250
- A. Wawrzynow M. Zylicz J. Biol. Chem. 1995 270 19300 19306
- (1995) J. Biol. Chem. , vol.270 , pp. 19300-19306
- Wawrzynow, A.¹ Zylicz, M.²

50
- 0036926615
- L. Stols M. Gu L. Dieckman R. Raffen F. R. Collart M. I. Donnelly Protein Expression Purif. 2002 25 8 15
- (2002) Protein Expression Purif. , vol.25 , pp. 8-15
- Stols, L.¹ Gu, M.² Dieckman, L.³ Raffen, R.⁴ Collart, F.R.⁵ Donnelly, M.I.⁶

51
- 79951837256
- L. Chang Y. Miyata P. M. Ung E. B. Bertelsen T. J. McQuade H. A. Carlson E. R. Zuiderweg J. E. Gestwicki Chem. Biol. 2011 18 210 221
- (2011) Chem. Biol. , vol.18 , pp. 210-221
- Chang, L.¹ Miyata, Y.² Ung, P.M.³ Bertelsen, E.B.⁴ McQuade, T.J.⁵ Carlson, H.A.⁶ Zuiderweg, E.R.⁷ Gestwicki, J.E.⁸

52
- 39149117364
- S. Wisen J. E. Gestwicki Anal. Biochem. 2008 374 371 377
- (2008) Anal. Biochem. , vol.374 , pp. 371-377
- Wisen, S.¹ Gestwicki, J.E.²

53
- 0032493416
- S. Diamant P. Goloubinoff Biochemistry 1998 37 9688 9694
- (1998) Biochemistry , vol.37 , pp. 9688-9694
- Diamant, S.¹ Goloubinoff, P.²

54
- 0029956153
- A. de Crouy-Chanel M. Kohiyama G. Richarme J. Biol. Chem. 1996 271 15486 15490
- (1996) J. Biol. Chem. , vol.271 , pp. 15486-15490
- De Crouy-Chanel, A.¹ Kohiyama, M.² Richarme, G.³

55
- 0032524646
- B. Feifel H. J. Schonfeld P. Christen J. Biol. Chem. 1998 273 11999 12002
- (1998) J. Biol. Chem. , vol.273 , pp. 11999-12002
- Feifel, B.¹ Schonfeld, H.J.² Christen, P.³

56
- 2142738304
- G. E. Crooks G. Hon J. M. Chandonia S. E. Brenner Genome Res. 2004 14 1188 1190
- (2004) Genome Res. , vol.14 , pp. 1188-1190
- Crooks, G.E.¹ Hon, G.² Chandonia, J.M.³ Brenner, S.E.⁴

57
- 0033783190
- M. P. Mayer S. Rudiger B. Bukau Biol. Chem. 2000 381 877 885
- (2000) Biol. Chem. , vol.381 , pp. 877-885
- Mayer, M.P.¹ Rudiger, S.² Bukau, B.³

58
- 15944386011
- J. Li B. Sha Biochem. J. 2005 386 453 460
- (2005) Biochem. J. , vol.386 , pp. 453-460
- Li, J.¹ Sha, B.²

59
- 33646907087
- A. L. Horwich G. W. Farr W. A. Fenton Chem. Rev. 2006 106 1917 1930
- (2006) Chem. Rev. , vol.106 , pp. 1917-1930
- Horwich, A.L.¹ Farr, G.W.² Fenton, W.A.³

60
- 33750489742
- E. Chapman G. W. Farr R. Usaite K. Furtak W. A. Fenton T. K. Chaudhuri E. R. Hondorp R. G. Matthews S. G. Wolf J. R. Yates M. Pypaert A. L. Horwich Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 15800 15805
- (2006) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.103 , pp. 15800-15805
- Chapman, E.¹ Farr, G.W.² Usaite, R.³ Furtak, K.⁴ Fenton, W.A.⁵ Chaudhuri, T.K.⁶ Hondorp, E.R.⁷ Matthews, R.G.⁸ Wolf, S.G.⁹ Yates, J.R.¹⁰ Pypaert, M.¹¹ Horwich, A.L.¹²

61
- 79952833763
- J. Hageman M. A. van Waarde A. Zylicz D. Walerych H. H. Kampinga Biochem. J. 2011 435 127 142
- (2011) Biochem. J. , vol.435 , pp. 127-142
- Hageman, J.¹ Van Waarde, M.A.² Zylicz, A.³ Walerych, D.⁴ Kampinga, H.H.⁵

62
- 0023032008
- J. C. Bardwell K. Tilly E. Craig J. King M. Zylicz C. Georgopoulos J. Biol. Chem. 1986 261 1782 1785
- (1986) J. Biol. Chem. , vol.261 , pp. 1782-1785
- Bardwell, J.C.¹ Tilly, K.² Craig, E.³ King, J.⁴ Zylicz, M.⁵ Georgopoulos, C.⁶

63
- 66849143696
- F. U. Hartl M. Hayer-Hartl Nat. Struct. Mol. Biol. 2009 16 574 581
- (2009) Nat. Struct. Mol. Biol. , vol.16 , pp. 574-581
- Hartl, F.U.¹ Hayer-Hartl, M.²

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.