Developing DNP/Solid-State NMR Spectroscopy of Oriented Membranes

Applied Magnetic Resonance

Volumn 43, Issue 1-2, 2012, Pages 91-106

  Salnikov, Evgeniy S ^a   Ouari, Olivier ^b   Koers, Eline ^c,f   Sarrouj, Hiba ^a,d   Franks, Trent ^e   Rosay, Melanie ^c   Pawsey, Shane ^c   Reiter, Christian ^d   Bandara, Priyanga ^d   Oschkinat, Hartmut ^e   Tordo, Paul ^b   Engelke, Frank ^d   Bechinger, Burkhard ^a  

^a UNIVERSITÉ DE STRASBOURG   (France)

^b AIX MARSEILLE UNIV   (France)

^c BRUKER BIOSPIN CORPORATION   (United States)

^d BRUKER BIOSPIN GMBH   (Germany)

^e LEIBNIZ INSTITUT FÜR MOLEKULARE PHARMAKOLOGIE   (Germany)

^f UTRECHT UNIVERSITY   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIRADICALS; BULK SOLVENTS; DYNAMIC NUCLEAR POLARIZATION; ENHANCEMENT FACTOR; ENVIRONMENTAL CONDITIONS; FUNCTIONAL STRUCTURE; GLASSY SAMPLES; HYDROPHILIC AND HYDROPHOBIC; LIPID MEMBRANES; MEMBRANE SAMPLES; NMR MEASUREMENTS; NUCLEAR SPINS; PHYSICOCHEMICAL CHARACTERISTICS; PROOF OF CONCEPT; SIGNAL ENHANCEMENT; SOLID STATE NMR; WORK IN PROGRESS;

CHEMICAL STABILITY; LIPID BILAYERS; POLYPEPTIDES;

NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY;

EID: 84864377125     PISSN: 09379347     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1007/s00723-012-0338-5     Document Type: Article

References (62)

1. E. Wallin, G. von Heijne, Protein Sci. 7, 1029-1038 (1998).
2. D. Boyd, C. Schierle, J. Beckwith, Protein Sci. 7, 201-205 (1998).
3. B. L. Wu, E. Y. T. Chien, C. D. Mol, G. Fenalti, W. Liu, V. Katritch, R. Abagyan, A. Brooun, P. Wells, F. C. Bi, D. J. Hamel, P. Kuhn, T. M. Handel, V. Cherezov, R. C. Stevens, Science 330, 1066-1071 (2010).
4. D. Wacker, G. Fenalti, M. A. Brown, V. Katritch, R. Abagyan, V. Cherezov, R. C. Stevens, J. Am. Chem. Soc. 132, 11443-11445 (2010).
5. A. Bockmann, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 47, 6110-6113 (2008).
6. M. Renault, M. P. Bos, J. Tommassen, M. Baldus, J. Am. Chem. Soc. 133, 4175-4177 (2011).
7. T. Jacso, W. T. Franks, H. Rose, U. Fink, J. Broecker, S. Keller, H. Oschkinat, B. Reif, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 51, 432-435 (2011).
8. D. E. Warschawski, A. A. Arnold, M. Beaugrand, A. Gravel, E. Chartrand, I. Marcotte, Biochim. Biophys. Acta 1808, 1957-1974 (2011).
9. J. M. Resende, C. Mendonca Moraes, V. H. D. O. Munhoz, C. Aisenbrey, R. M. Verly, P. Bertani, A. Cesar, D. Pilo-Veloso, B. Bechinger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106, 16639-16644 (2009).
10. S. D. Cady, K. Schmidt-Rohr, J. Wang, C. S. Soto, W. F. Degrado, M. Hong, Nature 463, 689-692 (2010).
11. S. Tapaneeyakorn, A. D. Goddard, J. Oates, C. L. Willis, A. Watts, Biochim. Biophys. Acta 1808, 1462-1475 (2011).
12. R. Fu, E. D. Gordon, D. J. Hibbard, M. Cotten, J. Am. Chem. Soc. 131, 10830-10831 (2009).
13. E. Salnikov, B. Bechinger, Biophys. J. 100, 1473-1480 (2011).
14. M. Sharma, M. Yi, H. Dong, H. Qin, E. Peterson, D. D. Busath, H. X. Zhou, T. A. Cross, Science 330, 509-512 (2010).
15. R. Verardi, L. Shi, N. J. Traaseth, N. Walsh, G. Veglia, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 108, 9101-9106 (2011).
16. A. Ramamoorthy, D. K. Lee, T. Narasimhaswamy, R. P. R. Nanga, Biochim. Biophys. Acta 1798, 223-227 (2010).
17. S. D. Cady, C. Goodman, C. D. Tatko, W. F. DeGrado, M. Hong, J. Am. Chem. Soc. 129, 5719-5729 (2007).
18. J. Hirschinger, J. Raya, B. Perrone, B. Bechinger, Chem. Phys. Lett. 508, 155-164 (2011).
19. B. Bechinger, J. M. Resende, C. Aisenbrey, Biophys. Chem. 153, 115-125 (2011).
20. T. A. Cross, Method Enzymol. 289, 672-696 (1997).
21. J. H. Prestegard, C. M. Bougault, A. I. Kishore, Chem. Rev. 104, 3519-3540 (2004).
22. C. Aisenbrey, M. Cusan, S. Lambotte, P. Jasperse, J. Georgescu, U. Harzer, B. Bechinger, Chem. Biol. Chem. 9, 944-951 (2008).
23. T. Prisner, W. Köckenberger, Dynamic Nuclear Polarization: New Experimental and Methodology Approaches and Applications in Physics, Chemistry, Biology and Medicine (Springer, Wien, 2008).
24. A. B. Barnes, B. Corzilius, M. L. Mak-Jurkauskas, L. B. Andreas, V. S. Bajaj, Y. Matsuki, M. L. Belenky, J. Lugtenburg, J. R. Sirigiri, R. J. Temkin, J. Herzfeld, R. G. Griffin, Phys. Chem. Chem. Phys. 12, 5861-5867 (2010).
25. V. S. Bajaj, M. L. Mak-Jurkauskas, M. Belenky, J. Herzfeld, R. G. Griffin, J. Magn. Reson. 202, 9-13 (2010).
26. L. R. Becerra, G. J. Gerfen, R. J. Temkin, D. J. Singel, R. G. Griffin, Phys. Rev. Lett. 71, 3561-3564 (1993).
27. D. A. Hall, D. C. Maus, G. J. Gerfen, S. J. Inati, L. R. Becerra, F. W. Dahlquist, R. G. Griffin, Science 276, 930-932 (1997).
28. T. Maly, G. T. Debelouchina, V. S. Bajaj, K. N. Hu, C. G. Joo, M. L. Mak-Jurkauskas, J. R. Sirigiri, P. C. van Der Wel, J. Herzfeld, R. J. Temkin, R. G. Griffin, J. Chem. Phys. 128, 052211 (2008).
29. U. Akbey, W. T. Franks, A. Linden, S. Lange, R. G. Griffin, B. J. van Rossum, H. Oschkinat, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 49, 7803-7806 (2010).
30. M. J. Bayro, G. T. Debelouchina, M. T. Eddy, N. R. Birkett, C. E. MacPhee, M. Rosay, W. E. Maas, C. M. Dobson, R. G. Griffin, J. Am. Chem. Soc. 133, 13967-13974 (2011).
31. L. Reggie, J. J. Lopez, I. Collinson, C. Glaubitz, M. Lorch, J. Am. Chem. Soc. 133, 19084-19086 (2011).
32. A. H. Linden, S. Lange, W. T. Franks, U. Akbey, E. Specker, B. J. van Rossum, H. Oschkinat, J. Am. Chem. Soc. 133, 19266-19269 (2011).
33. M. Rosay, A. C. Zeri, N. S. Astrof, S. J. Opella, J. Herzfeld, R. G. Griffin, J. Am. Chem. Soc. 123, 1010-1011 (2001).
34. E. Salnikov, M. Rosay, S. Pawsey, O. Ouari, P. Tordo, B. Bechinger, J. Am. Chem. Soc. 132, 5940-5941 (2010).
35. Y. Matsuki, T. Maly, O. Ouari, H. Karoui, M. F. Le, E. Rizzato, S. Lyubenova, J. Herzfeld, T. Prisner, P. Tordo, R. G. Griffin, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 48, 4996-5000 (2009).
36. D. K. Lee, B. S. Kwon, A. Ramamoorthy, Langmuir 24, 13598-13604 (2008).
37. E. S. Salnikov, M. De Zotti, F. Formaggio, X. Li, C. Toniolo, J. D. O'Neil, J. Raap, S. A. Dzuba, B. Bechinger, J. Phys. Chem. B 113, 3034-3042 (2009).
38. M. Rosay, L. Tometich, S. Pawsey, R. Bader, R. Schauwecker, M. Blank, P. M. Borchard, S. R. Cauffman, K. L. Felch, R. T. Weber, R. J. Temkin, R. G. Griffin, W. E. Maas, Phys. Chem. Chem. Phys. 12, 5850-5860 (2010).
39. K. R. Thurber, R. Tycko, J. Magn. Reson. 195, 179-186 (2008).
40. C. Ysacco, E. Rizzato, M. A. Virolleaud, H. Karoui, A. Rockenbauer, F. Le Moigne, D. Siri, O. Ouari, R. G. Griffin, P. Tordo, Phys. Chem. Chem. Phys. 12, 5841-5845 (2010).
41. A. Zagdoun, G. Casano, O. Ouari, G. Lapadula, A. J. Rossini, M. Lelli, M. Baffert, D. Gajan, L. Veyre, W. E. Maas, M. M. Rosay, R. T. Weber, C. Thieuleux, C. Coperet, A. Lesage, P. Tordo, L. Emsley, J. Am. Chem. Soc. 134, 2284-2291 (2012).
42. C. Sizun, B. Bechinger, J. Am. Chem. Soc. 124, 1146-1147 (2002).
43. C. Glaubitz, A. Watts, J. Magn. Reson. 130, 305-316 (1998).
44. C. Aisenbrey, B. Bechinger, J. Am. Chem. Soc. 126, 16676-16683 (2004).
45. B. Bechinger, C. Sizun, Concepts Magn. Reson. 18A, 130-145 (2003).
46. P. C. van der Wel, J. R. Lewandowski, R. G. Griffin, Biochemistry-Us 49, 9457-9469 (2010).
47. K. N. Hu, C. Song, H. H. Yu, T. M. Swager, R. G. Griffin, J. Chem. Phys. 128, 052302 (2008).
48. K. R. Thurber, W. M. Yau, R. Tycko, J. Magn. Reson. 204, 303-313 (2010).
49. C. Aisenbrey, P. Bertani, B. Bechinger, Solid-state NMR investigations of membrane-associated antimicrobial peptides, in Antimicrobial Peptides Humana Press, ed. by A. Guiliani, A. C. Rinaldi (Springer, New York, 2010), pp. 209-233.
50. M. Rosay, J. C. Lansing, K. C. Haddad, W. W. Bachovchin, J. Herzfeld, R. J. Temkin, R. G. Griffin, J. Am. Chem. Soc. 125, 13626-13627 (2003).
51. P. C. van Der Wel, K. N. Hu, J. Lewandowski, R. G. Griffin, J. Am. Chem. Soc. 128, 10840-10846 (2006).
52. U. Akbey, S. Lange, W. Trent Franks, R. Linser, K. Rehbein, A. Diehl, B. J. van Rossum, B. Reif, H. Oschkinat, J. Biomol. NMR 46, 67-73 (2010).
53. E. G. Finer, J. Chem. Soc., Faraday Trans. II(69), 1590-1600 (1973).
54. C. Mendonca de Moraes, B. Bechinger, Magn. Reson. Chem. 42, 155-161 (2004).
55. K. N. Hu, G. T. Debelouchina, A. A. Smith, R. G. Griffin, J. Chem. Phys. 134, 125105 (2011).
56. K. Yamamoto, J. D. Xu, K. E. Kawulka, J. C. Vederas, A. Ramamoorthy, J. Am. Chem. Soc. 132, 6929 (2010).
57. K. Yamamoto, S. Vivekanandan, A. Ramamoorthy, J. Phys. Chem. B 115, 12448-12455 (2011).
58. A. Ramamoorthy, Y. Wei, D. Lee, Annu. Rep. NMR Spectrosc. 52, 1-52 (2004).
59. C. S. Song, K. N. Hu, C. G. Joo, T. M. Swager, R. G. Griffin, J. Am. Chem. Soc. 128, 11385-11390 (2006).
60. Y. Matsuki, T. Maly, O. Ouari, S. Lyubenova, J. Herzfeld, T. Prisner, P. Tordo, R. G. Griffin, Angewandte Chemie 48, 4996-5000 (2009).
61. M. Bak, J. T. Rasmussen, N. C. Nielsen, J. Magn. Reson. 147, 296-330 (2000).
62. E. J. Dufourc, C. Mayer, J. Stohrer, G. Althoff, G. Kothe, Biophys.J. 61, 42-57 (1992).