Digital polymerase chain reaction in an array of femtoliter polydimethylsiloxane microreactors

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 10, 2012, Pages 4262-4266

  Men, Yongfan ^a   Fu, Yusi ^a   Chen, Zitian ^a,b   Sims, Peter A ^c   Greenleaf, William J ^d   Huang, Yanyi ^a,b  

^a PEKING UNIVERSITY   (China)

^b PEKING UNIVERSITY   (China)

^c NewYork Presbyterian Hospital   (United States)

^d STANFORD UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPACT DEVICES; MICRO REACTOR; MICRO-FLUIDIC DEVICES; PDMS MEMBRANE; POLYDIMETHYLSILOXANE PDMS; POTENTIAL APPLICATIONS; REACTION EFFICIENCY; SAMPLE CONSUMPTION;

CHEMICAL REACTIONS; CHEMICAL REACTORS; MICROCHANNELS; POLYMERASE CHAIN REACTION;

SILICONES;

BAYSILON; DIMETICONE; HOMEOBOX A1 PROTEIN; HOMEODOMAIN PROTEIN; TRANSCRIPTION FACTOR;

ANIMAL; ARTICLE; CHEMISTRY; INSTRUMENTATION; METHODOLOGY; MICROFLUIDIC ANALYSIS; MOUSE; POLYMERASE CHAIN REACTION;

ANIMALS; DIMETHYLPOLYSILOXANES; HOMEODOMAIN PROTEINS; MICE; MICROFLUIDIC ANALYTICAL TECHNIQUES; POLYMERASE CHAIN REACTION; TRANSCRIPTION FACTORS;

EID: 84861173939     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac300761n     Document Type: Article

References (45)

1. Vogelstein, B.; Kinzler, K. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9236-9241
2. Pohl, G.; Shih, I. M. Expert Rev. Mol. Diagn. 2004, 4, 41-47
3. Holland, P. M.; Abramson, R. D.; Watson, R.; Gelfand, D. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 7276-7280
4. Shih, I. M.; Zhou, W.; Goodman, S. N.; Lengauer, C.; Kinzler, K. W.; Vogelstein, B. Cancer Res. 2001, 61, 818-822
5. Zhou, W.; Galizia, G.; Lieto, E.; Goodman, S. N.; Romans, K. E.; Kinzler, K. W.; Vogelstein, B.; Choti, M. A.; Montgomery, E. A. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 78-81
6. Chang, H. W.; Ali, S. Z.; Cho, S. K.; Kurman, R. J.; Shih, I, M. Clin. Cancer Res. 2002, 8, 2580-2585
7. Chang, H. W.; Lee, S. M.; Goodman, S. N.; Singer, G.; Cho, S. K.; Sokoll, L. J.; Montz, F. J.; Roden, R.; Zhang, Z.; Chan, D. W.; Kurman, R. J.; Shih, I, M. J. Natl. Cancer Inst. 2002, 94, 1697-1703
8. Zhou, W.; Goodman, S. N.; Galizia, G.; Lieto, E.; Ferraraccio, F.; Pignatelli, C.; Purdie, C. A.; Piris, J.; Morris, R.; Harrison, D. J.; Paty, P. B.; Culliford, A.; Romans, K. E.; Montgomery, E. A.; Choti, M. A.; Kinzler, K. W.; Vogelstein, B. Lancet 2002, 359, 219-225
9. Traverso, G.; Shuber, A.; Olsson, L.; Levin, B.; Johnson, C.; Hamilton, S. R.; Boynton, K.; Kinzler, K. W.; Vogelstein, B. Lancet 2002, 359, 403-404
10. Yan, H.; Dobbie, Z.; Gruber, S. B.; Markowitz, S.; Romans, K.; Giardiello, F. M.; Kinzler, K. W.; Vogelstein, B. Nat. Genet. 2002, 30, 25-26
11. Warren, L. A.; Weinstein, J. A.; Quake, S. R., 2007, pp 1-9; http://thebigone.stanford.edu/papers/Weinstein%20DigResCurve.pdf (Accessed 2007).
12. Dube, S.; Qin, J.; Ramakrishnan, R. PLoS One 2008, 3, e2876
13. Kreutz, J. E.; Munson, T.; Huynh, T.; Shen, F.; Du, W.; Ismagilov, R. F. Anal. Chem. 2011, 83, 8158-8168
14. Shen, F.; Sun, B.; Kreutz, J. E.; Davydova, E. K.; Du, W.; Reddy, P. L.; Joseph, L. J.; Ismagilov, R. F. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 17705-17712
15. Piggee, C. Anal. Chem. 2007, 79, 8828
16. Sundberg, S. O.; Wittwer, C. T.; Gao, C.; Gale, B. K. Anal. Chem. 2010, 82, 1546-1550
17. Zhang, C.; Xing, D. Chem. Rev. 2010, 8, 4910-4947
18. Shen, F.; Du, W.; Kreutz, J. E.; Fok, A.; Ismagilov, R. F. Lab Chip 2010, 10, 2666-2672
19. Ottesen, E. A.; Hong, J. W.; Quake, S. R.; Leadbetter, J. R. Science 2006, 314, 1464-1467
20. Tadmor, A. D.; Ottesen, E. A.; Leadbetter, J. R.; Phillips, R. Science 2011, 333, 58-62
21. Warren, L.; Bryder, D.; Weissman, I. L.; Quake, S. R. Proc. Natl. Acad. Sci. 2006, 103, 17807-17812
22. Tay, S.; Hughey, J. J.; Lee, T. K.; Lipniacki, T.; Quake, S. R.; Covert, M. W. Nature 2010, 466, 267-271
23. Fan, H. C.; Quake, S. R. Anal. Chem. 2007, 79, 7576-7579
24. Fan, H. C.; Blumenfeld, Y. J.; El-Sayed, Y. Y.; Chueh, J.; Quake, S. R. Am. J. Obstet. Gynecol. 2009, 200, e1-e7
25. Qin, J.; Jones, R. C.; Ramakrishnan, R. Nucleic Acids Res. 2008, 36, e116
26. Pushkarev, D.; Neff, N. F.; Quake, S. R. Nat. Biotechnol. 2009, 27, 847-850
27. Oehler, V. G.; Qin, J.; Ramakrishnan, R.; Facer, G.; Ananthnarayan, S.; Cummings, C.; Deininger, M.; Shah, N.; Mccormick, F.; Willis, S.; Daridon, A.; Unger, M.; Radich, J. P. Leukemia 2009, 23, 396-399
28. Yung, T. K.; Chan, K. C.; Mok, T. S.; Tong, J.; To, K. F.; Lo, Y. M. Clin. Cancer Res. 2009, 15, 2076-2084
29. Wang, J.; Ramakrishnan, R.; Tang, Z.; Fan, W.; Kluge, A.; Dowlati, A.; Jones, R. C.; Ma, P. C. Clin. Chem. 2010, 56, 623-632
30. Corbisier, P.; Bhat, S.; Partis, L.; Xie, V. R.; Emslie, K. R. Anal. Bioanal. Chem. 2010, 396, 2143-2150
31. White Iii, R. A.; Quake, S. R.; Curr, K. J. Virol. Methods 2011, 1, 45-50
32. Blainey, P. C.; Quake, S. R. Nucleic Acids Res. 2011, 39, e19
33. Gansen, A.; Herrick, A. M.; Dimov, I. K.; Lee, L. P.; Chiu, D. T. Lab Chip 2012, 10.1039/C2LC21247A
34. Heyries, K. A.; Tropini, C.; Vaninsberghe, M.; Doolin, C.; Petriv, O. I.; Singhal, A.; Leung, K.; Hughesman, C. B.; Hansen, C. L. Nat. Methods 2011, 8, 649-651
35. Hatch, A. C.; Fisher, J. S.; Pentoney, S. L.; Yang, D. L.; Lee, A. P. Lab Chip 2011, 11, 2509-2517
36. Hindson, B. J.; Ness, K. D.; Masquelier, D. A.; Belgrader, P.; Heredia, N. J.; Makarewicz, A. J.; Bright, I. J.; Lucero, M. Y.; Hiddessen, A. L.; Legler, T. C.; Kitano, T. K.; Hodel, M. R.; Petersen, J. F.; Wyatt, P. W.; Steenblock, E. R.; Shah, P. H.; Bousse, L. J.; Troup, C. B.; Mellen, J. C.; Wittmann, D. K.; Erndt, N. G.; Cauley, T. H.; Koehler, R. T.; So, A. P.; Dube, S.; Rose, K. A.; Montesclaros, L.; Wang, S.; Stumbo, D. P.; Hodges, S. P.; Romine, S.; Milanovich, F. P.; White, H. E.; Regan, J. F.; Karlin-Neumann, G. A.; Hindson, C. M.; Saxonov, S.; Colston, B. W. Anal. Chem. 2011, 83, 8604-8610
37. Pinheiro, L. B.; Coleman, V. A.; Hindson, C. M.; Herrmann, J.; Hindson, B. J.; Bhat, S.; Emslie, K. R. Anal. Chem. 2012, 84, 1003-1011
38. Qi, Z.; Ma, Y.; Deng, L.; Wu, H.; Zhou, G.; Kajiyama, T.; Kambara, H. Analyst 2011, 136, 2252-2259
39. Zhong, Q.; Bhattacharya, S.; Kotsopoulos, S.; Olson, J.; Taly, V.; Griffiths, A. D.; Link, D. R.; Larson, J. W. Lab Chip 2011, 11, 2167-2174
40. Hatch, A. C.; Fisher, J. S.; Tovar, A. R.; Hsieh, A. T.; Lin, R.; Pentoney, S. L.; Yang, D. L.; Lee, A. P. Lab Chip 2011, 11, 3838-3845
41. Sims, P. A.; Greenleaf, W. J.; Duan, H.; Xie, X. S. Nat. Methods 2011, 8, 575-580
42. Gong, Y.; Ogunniyi, A. O.; Love, J. C. Lab Chip 2010, 10, 2334-2337
43. Unger, M. A. Science 2000, 288, 113-116
44. Aird, D.; Ross, M. G.; Chen, W. S.; Danielsson, M.; Fennell, T.; Russ, C.; Jaffe, D. B.; Nusbaum, C.; Gnirke, A. Genome Biol. 2011, 12, R18
45. Shiroguchi, K.; Jia, T. Z.; Sims, P. A.; Xie, X. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 1347-1352