Vibrational optical activity of cysteine in aqueous solution: A comparison of theoretical and experimental spectra

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 116, Issue 16, 2012, Pages 4976-4990

  Kamiński, MacIej ^a   Kudelski, Andrzej ^a   Pecul, Magdalena ^a  

^a UNIVERSITY OF WARSAW   (Poland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; CONTINUUM MECHANICS; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; MOLECULAR DYNAMICS; OPTICAL MATERIALS; SOLUTIONS;

AQUEOUS ENVIRONMENT; EXPERIMENTAL SPECTRA; MICROSOLVATION; POLARIZABLE CONTINUUM MODEL; RAMAN OPTICAL ACTIVITY; STANDARD FORCE FIELD; VIBRATIONAL CIRCULAR DICHROISM SPECTRUM; VIBRATIONAL OPTICAL ACTIVITY;

AMINO ACIDS;

EID: 84860287092     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp300699e     Document Type: Article

References (61)

1. McCann, D. M.; Stephens, P. J.; Cheeseman, J. R. J. Org. Chem. 2004, 69, 8709-8717
2. Stephens, P. J.; McCann, D. M.; Butkus, E.; Stončius, S.; Cheeseman, J. R.; Frisch, M. J. J. Org. Chem. 2004, 69, 1948-1958
3. Polavarapu, P. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 4544-4546
4. Costante, J.; Hecht, L.; Polavarapu, P. L.; Collet, A.; Barron, L. D. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1997, 36, 885-887
5. He, J. T.; Petrovich, A.; Polavarapu, P. L. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 1671-1680
6. Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Cheeseman, J. R.; Frisch, M. J.; Bortolini, O.; Besse, P. Chirality 2003, 15, S57-S64
7. Zuber, G.; Hug, W. Helv. Chim. Acta 2004, 87, 2208-2234
8. Haesler, J.; Schindelholz, I.; Riguet, E.; Bochet, C.; Hug, W. Nature 2007, 446, 526-529
9. Lovchik, M. A.; Frater, G.; Goeke, A.; Hug, W. Chem. Biodiversity 2008, 5, 126-139
10. Gheorghe, R.; Chamoreau, L. M.; Kapitan, J.; Ovanesyan, N. S.; Aldoshin, S. M.; Hecht, L.; Barron, L. D.; Train, C.; Gruselle, M. Chirality 2007, 20, 1085-1091
11. Polavarapu, P. L. Chirality 2008, 20, 664-672
12. Polavarapu, P. L. Chem. Rec. 2007, 7, 125-136
13. Freedman, T. B.; Cao, X.; Oliveira, R. V.; Cass, Q. B.; Nafie, L. A. Chirality 2003, 15, 196-200
14. Freedman, T. B.; Cao, X.; Dukor, R. K.; Nafie, L. A. Chirality 2003, 15, 743-758
15. Buděšínský, M.; Daněček, P.; Bednárová, L.; Kapitán, J.; Baumruk, V.; Bouř, P. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 8633-8640
16. Buděšínský, M.; Sebestnik, J.; Bednárová, L.; Baumruk, V.; Safarik, M.; Bouř, P. J. Org. Chem. 2008, 73, 1481-1489
17. Pecul, M. Chirality 2009, 21, E98-E104
18. Devlin, F. J.; Stephens, P. J.; Österle, C.; Wiberg, K. B.; Cheeseman, J. R.; Frisch, M. J. J. Org. Chem. 2002, 67, 8090-8096
19. Keiderling, T. A. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 682-688
20. Cappelli, C.; Monti, S.; Rizzo, A. Int. J. Quantum Chem. 2005, 104, 744-757
21. Zhu, F.; Isaacs, N. W.; Hecht, L.; Barron, L. D. Structure 2005, 13, 1409-1419
22. Blanch, E. W.; Hecht, L.; Barron, L. D. Methods 2003, 29, 196
23. Zhu, F.; Tranter, G. E.; Isaacs, N. W.; Hecht, L.; Barron, L. D. J. Mol. Biol. 2006, 363, 19-26
24. Barron, L. D.; Hecht, L.; Blanch, E. W.; Bell, A. F. Prog. Biophys. Mol. Biol. 2000, 73, 1-49
25. Wang, L.; Pancoska, P.; Keiderling, T. A. Biochemistry 1994, 33, 8428-8435
26. Polyanichko, A.; Wieser, H. Spectroscopy 2010, 24, 239-244
27. Yamamoto, S.; Straka, M.; Watarai, H.; Bour, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 11021-11032
28. Cappelli, C.; Corni, S.; Mennucci, B.; Cammi, R.; Tomasi, J. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 12331-12339
29. Wang, F.; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. Biopolymers 2004, 75, 85-93
30. Pecul, M.; Lamparska, E.; Cappelli, C.; Frediani, L.; Ruud, K. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 2807-2815
31. Debie, E.; Bultinck, P.; Herrebout, W.; van der Veken, B. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 3498-3508
32. Tomasi, J.; Persico, M. Chem. Rev. 1994, 94, 2027-2094
33. Tomasi, J.; Mennucci, B.; Cammi, R. Chem. Rev. 2005, 105, 2999-3094
34. Cammi, R.; Mennucci, B.; Tomasi, J. In Computational Chemistry, Review of Current Trends; Leszczynski, J., Ed.; World Scientific: Singapore, 2003; Vol. 8.
35. Klamt, A.; Schüürmann, G. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1993, 799-805
36. Klamt, A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 2224-2235
37. Klamt, A.; Jonas, V. J. Chem. Phys. 1996, 105, 9972-9980
38. Wesolowski, T. A. Int. J. Mod. Phys. C 1991, 2, 531-535
39. Jensen, L.; van Duijnen, P. T.; Snijders, J. G. J. Chem. Phys. 2003, 118, 514-521
40. Hopmann, K. H.; Ruud, K.; Pecul, M.; Kudelski, A.; Dračí nský, M.; Bouř, P. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 4128-4137
41. Kubelka, J.; Huang, R.; Keiderling, T. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 8231-8243
42. Šebek, J.; Kapitaán, J.; Šebestík, J.; Baumruk, V.; Bouř., P J. Phys. Chem. A 2009, 113, 7760-7768
43. Cheeseman, J. R.; Majeed, S. S.; Popelier, P. L. A.; Blanch, E. W. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 4991-4997
44. Pecul, M. Chem. Phys. Lett. 2006, 427, 166-176
45. Osinska, K.; Pecul, M.; Kudelski, A. Chem. Phys. Lett. 2010, 496, 86-90
46. Gargaro, A. R.; Barron, L. D.; Hecht, L. J. Raman Spectrosc. 1993, 24, 91-96
47. Sadlej, J.; Dobrowolski, J. C.; Rode, J. E.; Jamróz, M. H. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 10703-10711
48. Graff, M.; Bukowska, J. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 9567-9574
49. Hug, W.; Hangartner, G. A. J. Raman Spectrosc. 1999, 30, 841-852
50. Hug, W. Appl. Spectrosc. 2003, 57, 1
51. Abdali, S. J. Raman Spectrosc. 2006, 37, 1341-1345
52. Shaw, R. A.; Wieser, H.; Dutler, R.; Rauk, A. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 5401-5410
53. Berthier, D.; Buffeteau, T.; Léger, J.; Oda, R.; Huc, I. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 13486-13494
54. Cannan, R. K.; Knight, B. C. J. G. Biochem. J. 1927, 21, 1384-1390
55. Gronert, S.; O'Hair, R. A. J. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2071-2081
56. Dobrowolski, J. C.; Rode, J. E.; Sadlej, J. J. Mol. Struct. 2007, 810, 129-134
57. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Gaussian 03, revision a.1; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2003.
58. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Gaussian 09, revision A.1; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2009.
59. Ponder, J. W. Tinker-software tools for molecular design, version 5.1; 2010.
60. Bouř, P.; Keiderling, T. A. J. Chem. Phys. 2002, 117, 4126-4132
61. Susi, H.; Byler, D. M.; Gerasimowicz, W. V. J. Mol. Struct. 1983, 102, 63-79