A study of the conformations of valinomycin in solution phase

Biopolymers

Volumn 75, Issue 1, 2004, Pages 85-93

  Wang, Feng ^a   Zhao, Chunxia ^a   Polavarapu, Prasad L ^a  

^a VANDERBILT UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Ab initio; Conformations; Density functional calculations; Valinomycin; Vibrational circular dichroism

Indexed keywords

ABSORPTION SPECTROSCOPY; CONFORMATIONS; MOLECULAR STRUCTURE; MOLECULAR VIBRATIONS; ORGANIC SOLVENTS; POLYPEPTIDES; PROPELLERS; SOLUTIONS;

MACROCYCLIC PEPTIDES; VALINOMYCIN;

BIOPOLYMERS;

AMIDE; CATION; CESIUM; ESTER; LITHIUM; METHANOL; POTASSIUM; SODIUM; SOLVENT; VALINOMYCIN;

AB INITIO CALCULATION; ABSORPTION; ARTICLE; CIRCULAR DICHROISM; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; DRUG CONFORMATION; VIBRATION;

AMINO ACID SEQUENCE; CIRCULAR DICHROISM; MODELS, MOLECULAR; PROTEIN CONFORMATION; SOLUTIONS; VALINOMYCIN; VIBRATION;

EID: 4444279032     PISSN: 00063525     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/bip.20103     Document Type: Article

References (58)

1. Gennis, R. B. Biomembranes: Molecular Structure and Function; Springer-Verlag: New York, 1989.
2. Stryer, L. Biochemistry; Freeman: New York, 1995.
3. Hotchkiss, R. D.; Dubos, R. J. J Biol Chem 1940, 132, 791-792; Sarges, R.; Witkop, B. J Am Chem Soc 1965, 87, 2011-2020; Weinstein, S.; Wallace, B. A.; Morrow, J.; Veatch, W. R. J Mol Biol 1980, 143, 1-19.
4. Hotchkiss, R. D.; Dubos, R. J. J Biol Chem 1940, 132, 791-792; Sarges, R.; Witkop, B. J Am Chem Soc 1965, 87, 2011-2020; Weinstein, S.; Wallace, B. A.; Morrow, J.; Veatch, W. R. J Mol Biol 1980, 143, 1-19.
5. Hotchkiss, R. D.; Dubos, R. J. J Biol Chem 1940, 132, 791-792; Sarges, R.; Witkop, B. J Am Chem Soc 1965, 87, 2011-2020; Weinstein, S.; Wallace, B. A.; Morrow, J.; Veatch, W. R. J Mol Biol 1980, 143, 1-19.
6. Pressman, B. C. Annu Rev Biochem 1976, 45, 501-530; Ovchinnikov, Yu. A. Eur J Biochem 1979, 94, 321-336.
7. Pressman, B. C. Annu Rev Biochem 1976, 45, 501-530; Ovchinnikov, Yu. A. Eur J Biochem 1979, 94, 321-336.
8. (a) Pinkerton, M.; Steinrauf, L. K.; Dawkins, P. Biochem Biophys Res Commun 1969, 35, 512-518.;
9. (b) Daux, W. L.; Hauptman, H.; Weeks, C. M.; Norton, D. A. Science 1972, 176, 911-914;
10. (c) Karle, I. L. J Am Chem Soc 1975, 97, 4379-4386;
11. (d) Neupert-Laves, K., Dobler, M. Helv Chim Acta 1975, 58, 432-442;
12. (e) Langs, D. A.; Blessing, R. H.; Duax, W. L. Int J Peptide Protein Res 1992, 39, 291-299.
13. Shemyakin, M. M.; Ovchinnikov, Y. A.; Ivanov, V. T.; Antonov, V. K.; Vinogradova, E. I.; Shkrob, A. M.; Malenkov, G. G.; Evstratov, A. V.; Laine, I. A.; Melnik, E. I.; Ryabova, I. D. J Membrane Biol 1969, 1, 402-430.
14. (a) Ivanov, V. T.; Laine, I. A.; Abdullaev, N. D.; Senyavina, L. B.; Popov, E. M.; Ovchinnikov, Y. A.; Shemyakin, M. M. Biochem Biophys Res Commun 1969, 34, 803-811;
15. (b) Ovchinnikov, Yu. A.; Ivanov, V. T. Tetrahedron 1975, 31, 2177-2209.
16. Grell, E.; Funck, T. J Supramol Structure 1973, 1, 307-333.
17. Grell, E.; Funck, T.; Sauter, H. Eur J Biochem 1973, 34, 415-424.
18. (a) Mayers, D. F.; Urray, D. W. J Am Chem. Soc 1972, 94, 77-81;
19. (b) Urry, D. W.; Kumar, N. G. Biochemistry 1974, 13, 1829-1831.
20. Asher, I. M.; Rothschild, K. J.; Anastassakis, E.; Stanley, H. E. J Am Chem Soc 1977, 99, 2024-2032.
21. Rothschild, K. J.; Asher, I. M.; Stanley, H. E.; Anastassakis, E. J Am Chem Soc 1977, 99, 2032-2039.
22. Asher, I. M.; Rothschild, K. J.; Stanley, H. E. J Mol Biol 1974, 89, 205-222.
23. Rothschild, K. J.; Stanley, H. E. Am J Clin Pathol 1975, 63, 695-713.
24. Nafie, L. A.; Keiderling, T. A.; Stephens P. J. J Am Chem Soc 1976, 98, 2715; Nafie, L. A.; Vidrine, D. W.; In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol. 2; Academic Press: New York, 1982; Polavarapu, P. L. In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol 4; Academic Press: New York, 1985; Keiderling, T. A. In Practical Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Krishnan, K. (Eds.); Academic Press: New York, 1990; Tsankov, D.; Eggiman, T.; Weiser, H. Appl Spectrosc 1995, 49, 132-138.
25. Nafie, L. A.; Keiderling, T. A.; Stephens P. J. J Am Chem Soc 1976, 98, 2715; Nafie, L. A.; Vidrine, D. W.; In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol. 2; Academic Press: New York, 1982; Polavarapu, P. L. In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol 4; Academic Press: New York, 1985; Keiderling, T. A. In Practical Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Krishnan, K. (Eds.); Academic Press: New York, 1990; Tsankov, D.; Eggiman, T.; Weiser, H. Appl Spectrosc 1995, 49, 132-138.
26. Nafie, L. A.; Keiderling, T. A.; Stephens P. J. J Am Chem Soc 1976, 98, 2715; Nafie, L. A.; Vidrine, D. W.; In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol. 2; Academic Press: New York, 1982; Polavarapu, P. L. In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol 4; Academic Press: New York, 1985; Keiderling, T. A. In Practical Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Krishnan, K. (Eds.); Academic Press: New York, 1990; Tsankov, D.; Eggiman, T.; Weiser, H. Appl Spectrosc 1995, 49, 132-138.
27. Nafie, L. A.; Keiderling, T. A.; Stephens P. J. J Am Chem Soc 1976, 98, 2715; Nafie, L. A.; Vidrine, D. W.; In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol. 2; Academic Press: New York, 1982; Polavarapu, P. L. In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol 4; Academic Press: New York, 1985; Keiderling, T. A. In Practical Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Krishnan, K. (Eds.); Academic Press: New York, 1990; Tsankov, D.; Eggiman, T.; Weiser, H. Appl Spectrosc 1995, 49, 132-138.
28. Nafie, L. A.; Keiderling, T. A.; Stephens P. J. J Am Chem Soc 1976, 98, 2715; Nafie, L. A.; Vidrine, D. W.; In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol. 2; Academic Press: New York, 1982; Polavarapu, P. L. In Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Basile, L. J., Eds.), Vol 4; Academic Press: New York, 1985; Keiderling, T. A. In Practical Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Ferraro, J. R.; Krishnan, K. (Eds.); Academic Press: New York, 1990; Tsankov, D.; Eggiman, T.; Weiser, H. Appl Spectrosc 1995, 49, 132-138.
29. Barron, L. D. Molecular Light Scattering and Optical Activity; Cambridge University Press: Cambridge, 1982; Polavarapu, P. L. Vibrational Spectra: Principles and Applications with Emphasis on Optical Activity; Elsevier: New York, 1997.
30. Barron, L. D. Molecular Light Scattering and Optical Activity; Cambridge University Press: Cambridge, 1982; Polavarapu, P. L. Vibrational Spectra: Principles and Applications with Emphasis on Optical Activity; Elsevier: New York, 1997.
31. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
32. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
33. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
34. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
35. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
36. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
37. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
38. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
39. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
40. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
41. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
42. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
43. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
44. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
45. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
46. Sen, A. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1984, 23, 1519-1532; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1986, 25, 5-15; Malon, P.; Kobrinskaya, R.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1988, 27, 733-746; Birke, S. S.; Agbaje, I.; Diem, M. Biochemistry 1992, 31, 450; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A. J Am Chem Soc 1986, 108, 5576-5581; Baumruk, V. L.; Huo, D.; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Lelievre, D.; Brack, A. Biopolymers 1994, 34, 1115-1121; Gupta, V. P.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1992, 32, 239-248; Paterlini, M. G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1986, 25, 1751-1765; Yasui, S. C.; Keiderling, T. A.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. (1986) Biopolymers 1986, 25, 79-89; Yasui, S. C., Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Bonora, G. M.; Toniolo, C. J Am Chem Soc 1986, 108, 4988-4993; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747-1761; Dukor, R. K.; Keiderling, T. A.; Gut, V. Int J Peptide Protein Res 1991, 38, 198-203; Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103-111; Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 32, 1237-1242; Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl Spectrosc 1996, 50, 644-648; Zhao, C.; Polavarapu, P. L.; Das, C.; Balaram, P. J Am Chem Soc 2000, 122, 8228-8231.
47. Zhao, C.; Polavarapu, P. L. J Am Chem Soc 1999, 121, 11259-11260; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. Biospectroscopy, 1999, 5, 276-283; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. In Chirality: Physical Chemistry, ACS Symposium Series No. 810 (Hicks, J. M., Ed.), 2001; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. Biospectroscopy 2001, 62, 336-340.
48. Zhao, C.; Polavarapu, P. L. J Am Chem Soc 1999, 121, 11259-11260; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. Biospectroscopy, 1999, 5, 276-283; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. In Chirality: Physical Chemistry, ACS Symposium Series No. 810 (Hicks, J. M., Ed.), 2001; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. Biospectroscopy 2001, 62, 336-340.
49. Zhao, C.; Polavarapu, P. L. J Am Chem Soc 1999, 121, 11259-11260; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. Biospectroscopy, 1999, 5, 276-283; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. In Chirality: Physical Chemistry, ACS Symposium Series No. 810 (Hicks, J. M., Ed.), 2001; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. Biospectroscopy 2001, 62, 336-340.
50. Zhao, C.; Polavarapu, P. L. J Am Chem Soc 1999, 121, 11259-11260; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. Biospectroscopy, 1999, 5, 276-283; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. In Chirality: Physical Chemistry, ACS Symposium Series No. 810 (Hicks, J. M., Ed.), 2001; Zhao, C.; Polavarapu, P. L. Biospectroscopy 2001, 62, 336-340.
51. Wang, F.; Polavarapu, P. L.; Drabowicz, J.; Kielbasinski, P.; Potrzebowski, M. J.; Mikolajczyk, M.; Wieczorek, M. W.; Majzner, W. W.; Lazewska, I. J Phys Chem A 2004, 108, 2072-2079.
52. Fernandez-Lopez, S.; Kim, H. S.; Choi, E. C.; Delgado, M.; Granza, J. R.; Khasanov, A.; Kraehenbuehl, K.; Long, G.; Weinberger, D. A.; Wilcoxen, K. M.; Ghadri, M. R. Nature 2001, 412, 452-456.
53. Schweitzer-Stenner, R. Biophys J 2002, 83, 523-532; Eker, F.; Cao, X.; Nafie, L. A.; Huang, Q.; Schweitzer-Stenner, R. J Phys Chem B 2003, 107, 358-365.
54. Schweitzer-Stenner, R. Biophys J 2002, 83, 523-532; Eker, F.; Cao, X.; Nafie, L. A.; Huang, Q.; Schweitzer-Stenner, R. J Phys Chem B 2003, 107, 358-365.
55. Hamm, P.; Lim, M.; GeGrado, W. F.; Hochstrasser, R. M. Proc Natl Acad Sci U.S.A. 1999, 96, 2036-2041.
56. Kubelka, J.; Keiderling, T. A., J Am Chem Soc 2001, 123, 12048-12058.
57. ChemSite for Windows, Pyramid Learning, Aptos, CA.
58. Gaussian 98 and 03, Gaussian, Inc., Wallingford, CT (www.gaussian.com).