Effects of charge location on the absorptions and lifetimes of protonated tyrosine peptides in vacuo

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 116, Issue 7, 2012, Pages 1701-1709

  Kelly, Orla ^a   Calvert, Christopher R ^a   Greenwood, Jason B ^a   Zettergren, Henning ^b   Nielsen, Steen Brøndsted ^c   Wyer, Jean A ^c  

^a QUEEN'S UNIVERSITY BELFAST   (United Kingdom)

^b STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

^c AARHUS UNIVERSITY   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION BAND; ACTION SPECTRA; AMMONIUM GROUPS; CHARGE INFLUENCE; DIPEPTIDE; ELECTRONIC ENERGY LEVELS; IONIC HYDROGEN BOND; LIFETIME MEASUREMENTS; LOWER ENERGIES; MOBILE PROTONS; MOLECULAR CONFIGURATIONS; NUMBER OF DEGREES OF FREEDOM; PEPTIDE IONS; PROTONATED; SPECTRAL DIFFERENCES; TRIPEPTIDE;

ACTIVATION ENERGY; AMINO ACIDS; AMMONIUM COMPOUNDS; COMPLEXATION; CROWN ETHERS; ELECTRON ENERGY LEVELS; ETHERS; HYDROGEN BONDS; IONS; LASERS; PEPTIDES; PHOTOEXCITATION; PROTONATION;

CHROMOPHORES;

PEPTIDE; PROTON; TYROSINE;

ABSORPTION; ARTICLE; CHEMISTRY; HALF LIFE TIME; HYDROGEN BOND; PROTEIN FOLDING; VACUUM;

ABSORPTION; HALF-LIFE; HYDROGEN BONDING; PEPTIDES; PROTEIN FOLDING; PROTONS; TYROSINE; VACUUM;

EID: 84857438134     PISSN: 10895639     EISSN: 15205215     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp208578w     Document Type: Article

References (40)

1. Brøndsted Nielsen, S.; Lapierre, A.; Andersen, J. U.; Pedersen, U. V.; Tomita, S.; Andersen, L. H. Phys. Rev. Lett. 2001, 87, 228102
2. Andersen, L. H.; Nielsen, I. B.; Kristensen, M. B.; El Ghazaly, M. O. A.; Haacke, S.; Brøndsted Nielsen, M.; Petersen, M. Å. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12347-12350
3. Nielsen, I. B.; Lammich, L.; Andersen, L. H. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 018304
4. Lakowicz, J. R. Principles of Fluorescence Spectroscopy; Kluwer Academic/Plenum Publishers: New York, 1999.
5. Harada, I.; Takeuchi, H. In Spectroscopy of Biological Systems; Clark, R. J. H.; Hester, R. E., Eds.; Advances in Spectroscopy 13; Wiley: New York, 1986; pp 113-175.
6. Kang, H.; Jouvet, C.; Dedonder-Lardeux, C.; Martrenchard, S.; Gregoire, G.; Desfrancois, C.; Schermann, J. P.; Barat, M.; Fayeton, J. A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 394-398
7. Lucas, B.; Barat, M.; Fayeton, J. A.; Perot, M.; Jouvet, C.; Gregoire, G.; Brøndsted Nielsen, S. J. Chem. Phys. 2008, 128, 164302
8. Weinkauf, R.; Schanen, P.; Metsala, A.; Schlag, E. W.; Burgle, M.; Kessler, H. J. Phys. Chem. 1996, 100, 18567-18585
9. Weinkauf, R.; Schlag, E. W.; Martinez, T. J.; Levine, R. D. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 7702-7710
10. Hu, Y. J.; Hadas, B.; Davidovitz, M.; Balta, B.; Lifshitz, C. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 6507-6514
11. Cui, W.; Hu, Y.; Lifshitz, C. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 565-571
12. Boyarkin, O. V.; Mercier, S. R.; Kamariotis, A.; Rizzo, T. R. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 2816-2817
13. Yoon, S. H.; Kim, M. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1729-1739
14. Oh, J. Y.; Moon, J. H.; Kim, M. S. J. Mass Spectrom. 2005, 40, 899-907
15. Weinkauf, R.; Schanen, P.; Yang, D.; Sonkara, S.; Schlag, E. W. J. Phys. Chem. 1995, 99, 11255-11265
16. Sobolewski, A. L.; Shemesh, D.; Domcke, W. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 542-550
17. Cohen, R.; Brauer, B.; Nir, E.; Grace, L.; de Vries, M. S. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6351-6355
18. Joly, L.; Antoine, R.; Allouche, A. R.; Broyer, M.; Lemoine, J.; Dugourd, P. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 8428-8429
19. Joly, L.; Antoine, R.; Broyer, M.; Lemoine, J.; Dugourd, P. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 898-903
20. Andersen, L. H.; Bluhme, H.; Boye, S.; Jørgensen, T. J. D.; Krogh, H.; Nielsen, I. B.; Brøndsted Nielsen, S.; Svendsen, A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2617-2627
21. Wyer, J. A.; Ehlerding, A.; Zettergren, H.; Kirketerp, M.-B. S.; Brøndsted Nielsen, S. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 9277-9285
22. Gregoire, G.; Dedonder-Lardeux, C.; Jouvet, C.; Desfrancois, C.; Fayeton, J. A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 78-82
23. Møller, S. P. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res., Sect. A 1997, 394, 281-286
24. Andersen, J. U.; Hvelplund, P.; Brøndsted Nielsen, S.; Tomita, S.; Wahlgreen, H.; Møller, S. P.; Pedersen, U. V.; Forster, J. S.; Jørgensen, T. J. D. Rev. Sci. Instrum. 2002, 73, 1284-1287
25. Antoine, R.; Dugourd, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 16494-16509
26. Bellina, B.; Compagnon, I.; Joly, L.; Albrieux, F.; Allouche, A. R.; Bertorelle, F.; Lemoine, J.; Antoine, R.; Dugourd, P. Int. J. Mass Spectrom. 2010, 297, 36-40
27. Prell, J. S.; O'Brien, J. T.; Holm, A. I. S.; Leib, R. D.; Donald, W. A.; Willialms, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 12680-12689
28. Raevsky, O. A.; Solovev, V. P.; Solotnov, A. F.; Schneider, H. J.; Rudiger, V. J. Org. Chem. 1996, 61, 8113-8116
29. Julian, R. R.; Beauchamp, J. L. Int. J. Mass Spectrom. 2001, 210, 613-623
30. Wilson, J. J.; Kirkovits, G. J.; Sessler, J. L.; Brodbelt, J. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 257-260
31. Andersen, J. U.; Cederquist, H.; Forster, J. S.; Huber, B. A.; Hvelplund, P.; Jensen, J.; Liu, B.; Manil, B.; Maunoury, L.; Brøndsted Nielsen, S.; Pedersen, U. V.; Rangama, J.; Schmidt, H. T.; Tomita, S.; Zettergren, H. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2676-2681
32. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision D.01; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2003.
33. Martin, R. L. J. Chem. Phys. 2003, 118, 4775-4777
34. Kirketerp, M. B. S.; Ryhding, T.; Støchkel, K.; Nielsen, M. B.; Brøndsted Nielsen, S. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 1222-1227
35. Aravind, G.; Klærke, B.; Rajput, J.; Toker, Y.; Andersen, L. H.; Bochenkova, A. V.; Antoine, R.; Lemoine, J.; Racaud, A.; Dugourd, P. J. Chem. Phys. 2012, 136, 014307
36. Wysocki, V. H.; Resing, K. A.; Zhang, Q. F.; Cheng, G. L. Methods 2005, 35, 211-222
37. Wysocki, V. H.; Tsaprailis, G.; Smith, L. L.; Breci, L. A. J. Mass Spectrom. 2000, 35, 1399-1406
38. Chakraborty, T.; Holm, A. I. S.; Hvelplund, P.; Brøndsted Nielsen, S.; Poully, J. C.; Worm, E. S.; Williams, E. R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006, 17, 1675-1680
39. Schnier, P. D.; Price, W. D.; Jockusch, R. A.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7178-7189
40. Wyer, J. A.; Brøndsted Nielsen, S. J. Chem. Phys. 2010, 133, 084306