-
5
-
-
0032516049
-
-
Rojnuckarin, A.; Kim, S.; Subramaniam, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 4288
-
(1998)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.95
, pp. 4288
-
-
Rojnuckarin, A.1
Kim, S.2
Subramaniam, S.3
-
6
-
-
0034724392
-
-
Hernández, G.; Jenney, F. E., Jr.; Adams, M. W. W.; LeMaster, D. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 3166
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.97
, pp. 3166
-
-
Hernández, G.1
Jenney, Jr.F.E.2
Adams, M.W.W.3
Lemaster, D.M.4
-
8
-
-
0042171862
-
-
Zhang, Y.; Peters, M. H.; Li, Y. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2003, 52, 339
-
(2003)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.52
, pp. 339
-
-
Zhang, Y.1
Peters, M.H.2
Li, Y.3
-
9
-
-
84963146276
-
-
Grubmüller, H.; Heller, H.; Windemuth, A.; Schulten, K. Mol. Simul. 1991, 6, 121
-
(1991)
Mol. Simul.
, vol.6
, pp. 121
-
-
Grubmüller, H.1
Heller, H.2
Windemuth, A.3
Schulten, K.4
-
10
-
-
33646650705
-
-
Tuckerman, M. E.; Berne, B. J.; Martyna, G. J. J. Chem. Phys. 1992, 97, 1990
-
(1992)
J. Chem. Phys.
, vol.97
, pp. 1990
-
-
Tuckerman, M.E.1
Berne, B.J.2
Martyna, G.J.3
-
11
-
-
0001388416
-
-
Stuart, S. J.; Zhou, R.; Berne, B. J. J. Chem. Phys. 1996, 105, 1426
-
(1996)
J. Chem. Phys.
, vol.105
, pp. 1426
-
-
Stuart, S.J.1
Zhou, R.2
Berne, B.J.3
-
12
-
-
0031117934
-
-
Kopf, A.; Paul, W.; Dünweg, B. Comput. Phys. Commun. 1997, 101, 1
-
(1997)
Comput. Phys. Commun.
, vol.101
, pp. 1
-
-
Kopf, A.1
Paul, W.2
Dünweg, B.3
-
15
-
-
0030918284
-
-
Schlick, T.; Barth, E.; Mandziuk, M. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1997, 26, 181
-
(1997)
Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct.
, vol.26
, pp. 181
-
-
Schlick, T.1
Barth, E.2
Mandziuk, M.3
-
17
-
-
0032226405
-
-
Garcia-Archilla, B.; Sanz-Serna, J. M.; Skeel, R. D. SIAM J. Sci. Comput. 1998, 20, 930
-
(1998)
SIAM J. Sci. Comput.
, vol.20
, pp. 930
-
-
Garcia-Archilla, B.1
Sanz-Serna, J.M.2
Skeel, R.D.3
-
18
-
-
0000921742
-
-
Izaguirre, J. A.; Reich, S.; Skeel, R. D. J. Chem. Phys. 1999, 110, 9853
-
(1999)
J. Chem. Phys.
, vol.110
, pp. 9853
-
-
Izaguirre, J.A.1
Reich, S.2
Skeel, R.D.3
-
20
-
-
0034817509
-
-
Izaguirre, J. A.; Catarello, D. P.; Wozniak, J. M.; Skeel, R. D. J. Chem. Phys. 2001, 114, 2090
-
(2001)
J. Chem. Phys.
, vol.114
, pp. 2090
-
-
Izaguirre, J.A.1
Catarello, D.P.2
Wozniak, J.M.3
Skeel, R.D.4
-
23
-
-
0000026966
-
-
Martyna, G. J.; Tuckerman, M. E.; Tobias, D. J.; Klein, M. L. Mol. Phys. 1996, 87, 1117
-
(1996)
Mol. Phys.
, vol.87
, pp. 1117
-
-
Martyna, G.J.1
Tuckerman, M.E.2
Tobias, D.J.3
Klein, M.L.4
-
27
-
-
0037425870
-
-
Minary, P.; Martyna, G. J.; Tuckerman, M. E. J. Chem. Phys. 2003, 118, 2510
-
(2003)
J. Chem. Phys.
, vol.118
, pp. 2510
-
-
Minary, P.1
Martyna, G.J.2
Tuckerman, M.E.3
-
28
-
-
19644401067
-
-
Minary, P.; Tuckerman, M. E.; Martyna, G. J. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 150201
-
(2004)
Phys. Rev. Lett.
, vol.93
, pp. 150201
-
-
Minary, P.1
Tuckerman, M.E.2
Martyna, G.J.3
-
30
-
-
33947266386
-
-
[ 2006, 139.]
-
[ Lect. Notes Phys. 2006, 703, 139.]
-
Lect. Notes Phys.
, vol.703
-
-
-
35
-
-
0001310692
-
-
Schlick, T.; Mandziuk, M.; Skeel, R. D.; Srinivas, K. J. Comput. Phys. 1998, 140, 1
-
(1998)
J. Comput. Phys.
, vol.140
, pp. 1
-
-
Schlick, T.1
Mandziuk, M.2
Skeel, R.D.3
Srinivas, K.4
-
36
-
-
0346946971
-
-
Ma, Q.; Izaguirre, J. A.; Skeel, R. D. SIAM J. Sci. Comput. 2003, 24, 1951
-
(2003)
SIAM J. Sci. Comput.
, vol.24
, pp. 1951
-
-
Ma, Q.1
Izaguirre, J.A.2
Skeel, R.D.3
-
37
-
-
0001672771
-
-
Ciccotti, G.; Ryckaert, J. P.; Ferrario, M. Mol. Phys. 1982, 47, 1253
-
(1982)
Mol. Phys.
, vol.47
, pp. 1253
-
-
Ciccotti, G.1
Ryckaert, J.P.2
Ferrario, M.3
-
39
-
-
0041784950
-
-
MacKerell, A. D., Jr.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L., Jr.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E., III; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiórkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586
-
-
MacKerell, Jr.A.D.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack, Jr.R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-Mccarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher Iii, W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stote, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiórkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
40
-
-
0000116495
-
-
Chen, B.; Martin, M. G.; Siepmann, J. I. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2578
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 2578
-
-
Chen, B.1
Martin, M.G.2
Siepmann, J.I.3
-
41
-
-
0001068141
-
-
Dullweber, A.; Leimkuhler, B.; McLachlan, R. J. Chem. Phys. 1997, 107, 5840
-
(1997)
J. Chem. Phys.
, vol.107
, pp. 5840
-
-
Dullweber, A.1
Leimkuhler, B.2
McLachlan, R.3
-
46
-
-
0037157302
-
-
Miller, T. F., III; Eleftheriou, M.; Pattnaik, P.; Ndirango, A.; Newns, D.; Martyna, G. J. J. Chem. Phys. 2002, 116, 8649
-
(2002)
J. Chem. Phys.
, vol.116
, pp. 8649
-
-
Miller Iii, T.F.1
Eleftheriou, M.2
Pattnaik, P.3
Ndirango, A.4
Newns, D.5
Martyna, G.J.6
-
50
-
-
20544474227
-
-
Kamberaj, H.; Low, R. J.; Neal, M. P. J. Chem. Phys. 2005, 122, 224114
-
(2005)
J. Chem. Phys.
, vol.122
, pp. 224114
-
-
Kamberaj, H.1
Low, R.J.2
Neal, M.P.3
-
51
-
-
33847664584
-
-
Okumura, H.; Itoh, S. G.; Okamoto, Y. J. Chem. Phys. 2007, 126, 084103
-
(2007)
J. Chem. Phys.
, vol.126
, pp. 084103
-
-
Okumura, H.1
Itoh, S.G.2
Okamoto, Y.3
-
54
-
-
67649105585
-
-
Davidchack, R. L.; Handel, R.; Tretyakov, M. V. J. Chem. Phys. 2009, 130, 234101
-
(2009)
J. Chem. Phys.
, vol.130
, pp. 234101
-
-
Davidchack, R.L.1
Handel, R.2
Tretyakov, M.V.3
-
55
-
-
36749110571
-
-
Swope, W. C.; Andersen, H. C.; Berens, P. H.; Wilson, K. R. J. Chem. Phys. 1982, 76, 637
-
(1982)
J. Chem. Phys.
, vol.76
, pp. 637
-
-
Swope, W.C.1
Andersen, H.C.2
Berens, P.H.3
Wilson, K.R.4
-
56
-
-
33646982851
-
-
Omelyan, I. P.; Mryglod, I. M.; Folk, R. Phys. Rev. E 2002, 65, 056706
-
(2002)
Phys. Rev. e
, vol.65
, pp. 056706
-
-
Omelyan, I.P.1
Mryglod, I.M.2
Folk, R.3
-
58
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
60
-
-
0035424713
-
-
Zhou, R.; Harder, E.; Xu, H.; Berne, B. J. J. Chem. Phys. 2001, 115, 2348
-
(2001)
J. Chem. Phys.
, vol.115
, pp. 2348
-
-
Zhou, R.1
Harder, E.2
Xu, H.3
Berne, B.J.4
-
62
-
-
33846386224
-
-
Han, G.; Deng, Y.; Glimm, J.; Martyna, G. Comput. Phys. Commun. 2007, 176, 271
-
(2007)
Comput. Phys. Commun.
, vol.176
, pp. 271
-
-
Han, G.1
Deng, Y.2
Glimm, J.3
Martyna, G.4
-
63
-
-
77953320249
-
-
Morrone, J. A.; Zhou, R.; Berne, B. J. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 1798
-
(2010)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.6
, pp. 1798
-
-
Morrone, J.A.1
Zhou, R.2
Berne, B.J.3
-
67
-
-
33646347635
-
-
Omelyan, I. P.; Mryglod, I. M.; Tokarchuk, M. V. Condens. Matter Phys. 2005, 8, 25
-
(2005)
Condens. Matter Phys.
, vol.8
, pp. 25
-
-
Omelyan, I.P.1
Mryglod, I.M.2
Tokarchuk, M.V.3
-
68
-
-
4344567754
-
-
Hirata, F. Kluwer Academic Publishers: Norwell, MA, Vol. Chapter 4.
-
Kovalenko, A. In Molecular Theory of Solvation; Hirata, F., Ed.; Kluwer Academic Publishers: Norwell, MA, 2003; Vol. 24, Chapter 4.
-
(2003)
Molecular Theory of Solvation
, vol.24
-
-
Kovalenko, A.1
-
70
-
-
77950130534
-
-
Luchko, T.; Gusarov, S.; Roe, D. R.; Simmerling, C.; Case, D. A.; Tuszynski, J.; Kovalenko, A. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 607
-
(2010)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.6
, pp. 607
-
-
Luchko, T.1
Gusarov, S.2
Roe, D.R.3
Simmerling, C.4
Case, D.A.5
Tuszynski, J.6
Kovalenko, A.7
|