Second-chance forward isomerization dynamics of the red/green cyanobacteriochrome NpR6012g4 from nostoc punctiforme

Journal of the American Chemical Society

Volumn 134, Issue 1, 2012, Pages 130-133

  Kim, Peter W ^a   Freer, Lucy H ^a   Rockwell, Nathan C ^a   Martin, Shelley S ^a   Lagarias, J Clark ^a   Larsen, Delmar S ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CROSSING OVER; FORWARD REACTIONS; GLOBAL ANALYSIS; META-STABLE STATE; MULTICOMPONENTS; NOSTOC PUNCTIFORME; PHOTOPRODUCTS; RED-SHIFTED; THERMAL BARRIER; TRANSIENT ABSORPTION; ULTRA-FAST;

DYNAMICS; GROUND STATE; ISOMERIZATION; ISOMERS; QUANTUM THEORY; QUANTUM YIELD;

EXCITED STATES;

CYANOBACTERIOCHROME; PHYTOCHROME; UNCLASSIFIED DRUG;

ABSORPTION; ARTICLE; CHEMICAL REACTION KINETICS; ISOMERIZATION; MOLECULAR DYNAMICS; NONHUMAN; NOSTOC; NOSTOC PUNCTIFORME; QUANTUM YIELD; REACTION TIME; SPECTROSCOPY; TRANSIENT ABSORPTION PUMP DUMP PROBE SPECTROSCOPY;

ISOMERISM; KINETICS; NOSTOC; PHOTOCHEMICAL PROCESSES; PIGMENTS, BIOLOGICAL;

EID: 84855645629     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja209533x     Document Type: Article

References (35)

1. Rockwell, N. C.; Su, Y. S.; Lagarias, J. C. Annu. Rev. Plant Biol. 2006, 57, 837
2. Auldridge, M. E.; Forest, K. T. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2011, 46, 67
3. Franklin, K. A.; Quail, P. H. J. Exp. Bot. 2010, 61, 11
4. Ikeuchi, M.; Ishizuka, T. Photochem. Photobiol. Sci. 2008, 7, 1159
5. Rockwell, N. C.; Lagarias, J. C. ChemPhysChem 2010, 11, 1172
6. Rockwell, N. C.; Martin, S. S.; Feoktistova, K.; Lagarias, J. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 11854
7. Gambetta, G. A.; Lagarias, J. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 10566
8. Zhang, J. A.; Wu, X. J.; Wang, Z. B.; Chen, Y.; Wang, X.; Zhou, M.; Scheer, H.; Zhao, K. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5456
9. Shu, X. K.; Royant, A.; Lin, M. Z.; Aguilera, T. A.; Lev-Ram, V.; Steinbach, P. A.; Tsien, R. Y. Science 2009, 324, 804
10. Moeglich, A.; Moffat, K. Photochem. Photobiol. Sci. 2010, 9, 1286
11. Toh, K. C.; Stojkovic, E. A.; van Stokkum, I. H. M.; Moffat, K.; Kennis, J. T. M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 11985
12. Kelly, J. M.; Lagarias, J. C. Biochemistry 1985, 24, 6003
13. Toh, K. C.; Stojkovic, E. A.; van Stokkum, I. H. M.; Moffat, K.; Kennis, J. T. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 9170
14. Kim, J. E.; Tauber, M. J.; Mathies, R. A. Biochemistry 2001, 40, 13774
15. Vanbrederode, M. E.; Gensch, T.; Hoff, W. D.; Hellingwerf, K. J.; Braslavsky, S. E. Biophys. J. 1995, 68, 1101
16. Kim, P. W.; Freer, L. H.; Rockwell, N. C.; Martin, S. S.; Lagarias, J. C.; Larsen, D. S. Biochemistry 2011, 10.1021/bi201507k
17. Wang, Q.; Schoenlein, R. W.; Peteanu, L. A.; Mathies, R. A.; Shank, C. V. Science 1994, 266, 422
18. Visser, H. M.; Kleima, F. J.; van Stokkum, I. H. M.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. Chem. Phys. 1996, 210, 297
19. Connelly, J. P.; Muller, M. G.; Bassi, R.; Croce, R.; Holzwarth, A. R. Biochemistry 1997, 36, 281
20. Devanathan, S.; Pacheco, A.; Ujj, L.; Cusanovich, M.; Tollin, G.; Lin, S.; Woodbury, N. Biophys. J. 1999, 77, 1017
21. Larsen, D. S.; Vengris, M.; van Stokkum, I. H. M.; van der Horst, M. A.; Cordfunke, R. A.; Hellingwerf, K. J.; van Grondelle, R. Chem. Phys. Lett. 2003, 369, 563
22. Larsen, D. S.; Papagiannakis, E.; van Stokkum, I. H. M.; Vengris, M.; Kennis, J. T. M.; van Grondelle, R. Chem. Phys. Lett. 2003, 381, 733
23. Kennis, J. T. M.; Larsen, D. S.; Ohta, K.; Facciotti, M. T.; Glaeser, R. M.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6067
24. Rupenyan, A.; van Stokkum, I. H. M.; Arents, J. C.; van Grondelle, R.; Hellingwerf, K. J.; Groot, M. L. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 16251
25. Larsen, D. S.; van Stokkum, I. H. M.; Vengris, M.; van der Horst, M. A.; de Weerd, F. L.; Hellingwerf, K. J.; van Grondelle, R. Biophys. J. 2004, 87, 1858
26. Kennis, J. T. M.; Larsen, D. S.; van Stokkum, I. H. M.; Vengris, M.; van Thor, J. J.; van Grondelle, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 17988
27. Gai, F.; McDonald, J. C.; Anfinrud, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 6201
28. Larsen, D. S.; Vengris, M.; van Stokkum, I. H. M.; van der Horst, M. A.; de Weerd, F. L.; Hellingwerf, K. J.; van Grondelle, R. Biophys. J. 2004, 86, 2538
29. Fukushima, Y.; Iwaki, M.; Narikawa, R.; Ikeuchi, M.; Tomita, Y.; Itoh, S. Biochemistry 2011, 50, 6328
30. van Stokkum, I. H. M.; Larsen, D. S.; van Grondelle, R. Biochim. Biophys. Acta 2004, 1657, 82
31. Müller, M. G.; Lindner, I.; Martin, I.; Gartner, W.; Holzwarth, A. R. Biophys. J. 2008, 94, 4370
32. Holzwarth, A. R.; Venuti, E.; Braslavsky, S. E.; Schaffner, K. Biochim. Biophys. Acta 1992, 1140, 59
33. Liu, R. S. H. Acc. Chem. Res. 2001, 34, 555
34. Warshel, A. Nature 1976, 260, 679
35. Dasgupta, J.; Frontiera, R. R.; Taylor, K. C.; Lagarias, J. C.; Mathies, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 1784