Spectroscopic visualization of right- and left-handed helical alignments of DNA in chiral vortex flows

Bulletin of the Chemical Society of Japan

Volumn 84, Issue 10, 2011, Pages 1031-1038

  Tsujimoto, Yuya ^a   Ie, Machiko ^a   Ando, Yasunari ^a   Yamamoto, Taiki ^a   Tsuda, Akihiko ^a  

^a KOBE UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CLOCK WISE; COUNTER-CLOCKWISE; DNA MOLECULES; ETHIDIUM BROMIDE; INDUCED CIRCULAR DICHROISM; LINEAR DICHROISM; OPTICAL CELLS; PURE WATER; SAMPLE SOLUTION; SPECTRAL INTENSITY; SPECTRAL PATTERNS; SPECTRAL PROFILE; SPIRAL FLOW;

BROMINE COMPOUNDS; DICHROISM; DNA; SODIUM CHLORIDE; VISUALIZATION;

VORTEX FLOW;

EID: 80054101142     PISSN: 00092673     EISSN: 13480634     Source Type: Journal    
DOI: 10.1246/bcsj.20110178     Document Type: Article

References (41)

1. S.B.Smith, L. Finzi, C. Bustamante, Science 1992, 258, 1122.
2. T. T. Perkins, D. E. Smith, R. G. Larson, S. Chu, Science 1995, 268, 83.
3. J.Jing, J. Reed, J. Huang, X. Hu, V. Clarke, J. Edington, D. Housman, T. S. Anantharaman, E. J. Huff, B. Mishra, B. Porter, A. Shenker, E. Wolfson, C. Hiort, R. Kantor, C. Aston, D. C. Schwartz, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 8046.
4. B. Nordén, C. Elvingson, M. Jonsson, B. A. Kerman, Q. Rev. Biophys. 1991, 24, 103.
5. R. Marrington, T. R. Dafforn, D. J. Halsall, J. I. MacDonald, M. Hicks, A. Rodger, Analyst 2005, 130, 1608.
6. B. Nordén, A. Rodger, T. Dafforn, Linear Dichroism and Circular Dichroism: A Textbook on Polarized-Light Spectroscopy, 1st ed., Royal Society of Chemistry, Cambridge, 2010.
7. J. Rajendra, M. Baxendale, L. G. D. Rap, A. Rodger, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 11182.
8. J. F. Marko, E. D. Siggia, Science 1994, 265, 506.
9. F. R. Hama, J. Nutant, Phys. Fluids 1961, 4, 28.
10. S. F. Mason, Nature 1984, 311, 19.
11. D. K. Kondepudi, R. J. Kaufman, N. Singh, Science 1990, 250, 975.
12. O. Ohno, Y. Kaizu, H. Kobayashi, J. Chem. Phys. 1993, 99, 4128.
13. J. M. Ribó, J. Crusats, F. Sagués, J. Claret, R. Rubires, Science 2001, 292, 2063.
14. C. Escudero, J. Crusats, I. Díez-Pérez, Z. El-Hachemi, J. M. Ribó, Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 8032.
15. Z. El-Hachemi, O. Arteaga, A. Canillas, J. Crusats, C. Escudero, R. Kuroda, T. Harada, M. Rosa, J. M. Ribó, Chem. Eur. J. 2008, 14, 6438.
16. T. R. Strick, J.-F. Allemand, D. Bensimon, A. Bensimon, V. Croquette, Science 1996, 271, 1835.
17. P. R. Selvin, D. N. Cook, N. G. Pon, W. R. Bauer, M. P. Klein, J. E. Hearst, Science 1992, 255, 82.
18. Z. Bryant, M. D. Stone, J. Gore, S. B. Smith, N. R. Cozzarelli, C. Bustamante, Nature 2003, 424, 338.
19. S. Neukirch, Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 198107.
20. M. D. Stone, Z. Bryant, N. J. Crisona, S. B. Smith, A. Vologodskii, C. Bustamante, N. R. Cozzarelli, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 8654.
21. A. Tsuda, M. A. Alam, T. Harada, T. Yamaguchi, N. Ishii, T. Aida, Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 8198.
22. D. B. Amabilino, Nat. Mater. 2007, 6, 924.
23. G. P. Spada, Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 636.
24. M. Wolffs, S. J. George, Ž. Tomović, S. C. J. Meskers, A. P. H. J. Schenning, E. W. Meijer, Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 8203.
25. A. Davidsson, B. Nordén, S. Seth, Chem. Phys. Lett. 1980, 70, 313.
26. A. Tsuda, Y. Nagamine, R. Watanabe, Y. Nagatani, N. Ishii, T. Aida, Nat. Chem. 2010, 2, 977.
27. K. Tanaka, Y. Okahata, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 10679.
28. B. Porsch, R. Laga, J. Horský, C. Konák, K. Ulbrich, Biomacromolecules 2009, 10, 3148.
29. M. F. Maestre, C. Reich, Biochemistry 1980, 19, 5214.
30. R. Brandes, D. R. Kearns, Biochemistry 1986, 25, 5890.
31. G. P. Spada, P. Brigidi, G. Gottarelli, J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1988, 953.
32. J. Schellman, H. P. Jensen, Chem. Rev. 1987, 87, 1359.
33. F. D. Saeva, J. J. Wysocki, J. Am. Chem. Soc. 1971, 93, 5928.
34. C. G. Baumann, S. B. Smith, V. A. Bloomfield, C. Bustamante, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 6185.
35. M. Saminathan, T. Antony, A. Shirahata, L. H. Sigal, T. Thomas, T. J. Thomas, Biochemistry 1999, 38, 3821.
36. K. Miwa, Y. Furusho, E. Yashima, Nat. Chem. 2010, 2, 444.
37. N. G. Hunt, J. E. Hearst, J. Chem. Phys. 1991, 95, 9329.
38. D. Freifelder, J. Mol. Biol. 1971, 60, 401.
39. S. F. Yen, E. J. Gabbay, W. D. Wilson, Biochemistry 1982, 21, 2070.
40. M. Balaz, M. De Napoli, A. E. Holmes, A. Mammana, K. Nakanishi, N. Berova, R. Purrello, Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 4006.
41. Y. Shindo, M. Nishio, S. Maeda, Biopolymers 1990, 30, 405.