Modeling structures and vibrational frequencies for dinitrosyl iron complexes (DNICs) with density functional theory

Inorganic Chemistry

Volumn 50, Issue 17, 2011, Pages 8532-8540

  Brothers, Scott M ^a   Darensbourg, Marcetta Y ^a   Hall, Michael B ^a  

^a TEXAS A AND M UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FERRIC ION; NITROGEN OXIDE;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; QUANTUM THEORY; STEREOISOMERISM; VIBRATION;

FERRIC COMPOUNDS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR STRUCTURE; NITROGEN OXIDES; QUANTUM THEORY; STEREOISOMERISM; VIBRATION;

EID: 80052191285     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic201137t     Document Type: Article

References (57)

1. Lippard, S. J.; Berg, J. M. Principles of Bioinorganic Chemistry; University Science Books: Mill Valley, CA, 1994.
2. Fontijn, A.; Sabadell, A. J.; Ronco, R. J. Anal. Chem. 1970, 42, 575
3. Rand, M. J.; Li, C. G.; La, M.; De Luca, A.; Najbar-Kaszkiel, A.; Jiang, F.; Di Iulio, J.; Ellis, A. Asia Pac. J. Pharmacol. 1997, 12, 137
4. Talman, W. T. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1997, 835, 225
5. Lowenstein, C. J.; Dinerman, J. L.; Snyder, S. H. Ann. Intern. Med. 1994, 120, 227
6. Gladwin, M. T.; Raat, N. J. H.; Shiva, S.; Dezfulian, C.; Hogg, N.; Kim-Shapiro, D. B.; Patel, R. P. Am. J. Physiol. 2006, 291, H2026
7. Nahrevanian, H.; Amini, M. Iran. J. Basic Med. Sci. 2009, 11, 197
8. Tripathi, P. Indian J. Biochem. Biophys. 2007, 44, 310
9. Hsieh, C.-H.; Darensbourg, M. Y. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 14118
10. Vanin, A. F.; Mikoyan, V. D.; Kubrina, L. N. Biophysics 2010, 55, 5
11. Chang, H.-H.; Huang, H.-J.; Ho, Y.-L.; Wen, Y.-D.; Huang, W.-N.; Chiou, S.-J. Dalton Trans. 2009, 6396
12. Chen, Y.-J.; Ku, W.-C.; Feng, L.-T.; Tsai, M.-L.; Hsieh, C.-H.; Hsu, W.-H.; Liaw, W.-F.; Hung, C.-H.; Chen, Y.-J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10929
13. Tsai, M.-L.; Hsieh, C.-H.; Liaw, W.-F. Inorg. Chem. 2007, 46, 5110
14. Lu, T.-T.; Chiou, S.-J.; Chen, C.-Y.; Liaw, W.-F. Inorg. Chem. 2006, 45, 8799
15. Tsai, M.-L.; Liaw, W.-F. Inorg. Chem. 2006, 45, 6583
16. Dillinger, S. A. T.; Schmalle, H. W.; Fox, T.; Berke, H. Dalton Trans. 2007, 3562
17. Xu, N.; Yi, J.; Richter-Addo, G. B. Inorg. Chem. 2010, 49, 6253 and references therein
18. Sanina, N. A.; Rakova, O. A.; Aldoshin, S. M.; Shilov, G. V.; Shulga, Y. M.; Kulikov, A. V.; Ovanesyan, N. S. Mendeleev Commun. 2004, 7
19. Rakova, O. A.; Sanina, N. A.; Shilov, G. V.; Shulga, Y. M.; Martynenko, V. M.; Ovanesyan, N. S.; Aldoshin, S. M. Russ. J. Coord. Chem. 2002, 28, 341
20. Sanina, N. A.; Rakova, O. A.; Aldoshin, S. M.; Chuev, I. I.; Atovmyan, E. G.; Ovanesyan, N. S. Russ. J. Coord. Chem. 2001, 27, 179
21. Glidewell, C.; Harman, M. E.; Hursthouse, M. B.; Johnson, I. L.; Motevalli, M. J. Chem. Res. 1988, 212, 1676
22. Marsh, R. E.; Spek, A. L. Acta Crystallogr. 2001, 57, 800
23. Harrop, T. C.; Song, D.; Lippard, S. J. J. Inorg. Biochem. 2007, 101, 1730
24. Harrop, T. C.; Song, D.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 3528
25. Chen, Y.-J.; Ku, W.-C.; Feng, L.-T.; Tsai, M.-L.; Hsieh, C.-H.; Hsu, W.-H.; Liaw, W.-F.; Hung, C.-H.; Chen, Y.-J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10929
26. Lu, T.-T.; Tsou, C.-C.; Huang, H.-W.; Hsu, I.-J.; Chen, J.-M.; Kuo, T.-S.; Wang, Y.; Liaw, W.-F. Inorg. Chem. 2008, 47, 6040
27. Tsou, C.-C.; Lu, T.-T.; Liaw, W.-F. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 12626
28. Wang, R.; Camacho-Fernandez, M. A.; Xu, W.; Zhang, J.; Li, L. Dalton Trans 2009, 777
29. 7 system
30. Neese, F. Coord. Chem. Rev. 2009, 253, 526
31. Cramer, C. J. Essentials of Computational Chemistry, 2 nd ed.; Wiley: West Sussex, England, 2004.
32. Perdew, J. P.; Ruzsinszky, A.; Tao, J.; Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E.; Csonka, G. I. J. Chem. Phys. 2005, 123, 062201
33. Conradie, J.; Hopmann, K. H.; Ghosh, A. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 8517
34. Hopmann, K. H.; Noodleman, L.; Ghosh, A. Chem.-Eur. J. 2010, 16, 10397
35. Hopmann, K. H.; Ghosh, A.; Noodleman, L. Inorg. Chem. 2009, 48, 9155
36. Hopmann, K. H.; Conradie, J.; Ghosh, A. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 10540
37. Ye, S.; Neese, F. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 3646
38. Jaworska, M. Polyhedron 2007, 26, 3247
39. Shestakov, A. F.; Shulga, Y. M.; Emelyanova, N. S.; Sanina, N. A.; Aldoshin, S. M. Russ. Chem. Bull., Int. Ed. 2007, 56, 1289
40. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648
41. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1988, 37, 785
42. Miehlich, B.; Savin, A.; Stoll, H.; Preuss, H. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 200
43. Becke, A. D. Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1988, 38, 3098
44. Perdew, J. P. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1986, 33, 8822-8824
45. Tao, J. M.; Perdew, J. P.; Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 146401
46. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 2008, 120, 215
47. Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 270
48. Chai, J.-D.; Head-Gordon, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 6615
49. Kaupp, M.; Schleyer, P. V. R.; Stoll, H.; Preuss, H. J. Chem. Phys. 1991, 94, 1360
50. Check, C. E.; Faust, T. O.; Bailey, J. M.; Wright, B. J.; Gilbert, T. M.; Sunderlin, L. S. J. Phys. Chem. A. 2001, 105, 8111
51. AMPAC 9; Semichem, Inc.: Shawnee, KS, 1992-2008.
52. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, J. A., Jr.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.; Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, N. J.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Farkas, Ö.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J. Gaussian 09, Revision A.1; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2009.
53. Cerius2, version 3.0; MSI: Cambridge, U.K.
54. Hedberg, L.; Hedberg, K.; Satija, S. K.; Swanson, B. I. Inorg. Chem. 1985, 24, 2766
55. Chen, H.-W.; Lin, C.-W.; Chen, C.-C.; Yang, L.-B.; Chiang, M.-H.; Liaw, W.-F. Inorg. Chem. 2005, 44, 3226
56. Davies, S. C.; Evans, D. J.; Hughes, D. L.; Konkol, M.; Richards, R. L.; Sanders, J. R.; Sobota, P. Dalton Trans. 2002, 2473
57. Chiang, C.-Y.; Lee, J.; Dalrymple, C.; Sarahan, M. C.; Reibenspies, J. H.; Darensbourg, M. Y. Inorg. Chem. 2005, 44, 9007