Experimental and theoretical study on the intermolecular complex formation between trehalose and benzene compounds in aqueous solution

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 32, 2011, Pages 9823-9830

  Sakakura, Kota ^a   Okabe, Atsutoshi ^a   Oku, Kazuyuki ^b,c   Sakurai, Minoru ^a  

^a TOKYO INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (Japan)

^b HAYASHIBARA BIOCHEMICAL LABORATORIES INC   (Japan)

^c Osaka Aoyama University   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPLEXATION; HYDROPHOBICITY; SOLUTIONS;

AMPHIPHILIC CHARACTER; BENZENE MOLECULES; ENERGY MINIMA; FIRST HYDRATION SHELL; HYDROPHILIC AND HYDROPHOBIC; INTERMOLECULAR COMPLEXES; NMR MEASUREMENTS; P-CRESOL; POTENTIAL MEAN FORCES; STRESS PROTECTANTS; THEORETICAL STUDY;

BENZENE;

EID: 80051742164     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp2037203     Document Type: Article

References (50)

1. Elbein, A. D. Adv. Carbohydr. Chem. Biochem. 1974, 30, 227-256
2. Laere, A. V. FEMS Microbiol. Rev. 1989, 63, 201-210
3. Singer, M. A.; Lindquist, S. TIBTECH 1998, 16, 460-468
4. Argüelles, J. C. Arch. Microbiol. 2000, 174, 217-224
5. Sakurai, M.; Furuki, T.; Akao, K.; Tanaka, D.; Nakahara, Y.; Kikawada, T.; Watanabe, M.; Okuda, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 5093-5098
6. Crowe, J. H.; Carpenter, J. F.; Crowe, L. M. Annu. Rev. Physiol. 1998, 60, 73-103
7. Crowe, J. H. In Molecular Aspects of the Stress Response: Chaperones, Membranes and Networks; Csermely, P.; Vígh, L., Eds.; Landes Bioscience and Springer Science and Business Media: New York, 2007; Chapter 13.
8. Oku, K.; Chaen, H.; Fukuda, S.; Kurimoto, M. Nippon Shokuhin Kagaku Kougaku Kaishi 1999, 46, 319-322.
9. Benaroudj, N.; Lee, D. H.; Goldberg, L. A. J. Biol. Chem. 2001, 276, 24261-24267
10. Oku, K.; Kurose, M.; Kubota, M.; Fukuda, S.; Kurimoto, M.; Tujisaka, Y.; Sakurai, M. Nippon Shokuhin Kagaku Kougaku Kaishi 2003, 50, 133-137.
11. Oku, K.; Watanabe, H.; Kubota, M.; Fukuda., S.; Kurimoto, M.; Tujisaka, Y.; Komori, M.; Inoue, Y.; Sakurai, M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 12739-12748
12. Oku, K.; Kurose, M.; Kubota, M.; Fukuda., S.; Kurimoto, M.; Tujisaka, Y.; Okabe, A.; Sakurai, M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 3032-3040
13. Herdeiro, R. S.; Pereira, M. D.; Panek, A. D.; Eleutherio, E. C. A. Biochem. Biophys. Acta 2006, 1760, 340-346
14. Tvaroŝka, I.; Vaclavik, L. Carbohydr. Res. 1987, 160, 137-149
15. Dowd, M. K.; Reilly, P. J.; French, A. D. J. Comput. Chem. 1992, 13, 102-114
16. Donnamaria, M. C.; Howard, E. I.; Grigera, J. R. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1994, 90, 2731-2735
17. Liu, Q.; Schmidt, R. K.; Teo, B.; Karplus, P. A.; Brady, J. W. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7851-7862
18. Sakurai, M.; Murata, M.; Inoue, Y.; Hino, A.; Kobayashi, S. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1997, 70, 847-858
19. Bonanno, G.; Noto, R.; Fornili, S. L. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1998, 94, 2755-2762
20. Conrad, P. B.; Pablo, J. J. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 4049-4055
21. Engelsen, S. B.; Pérez, S. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 9301-9311
22. Kuttel, M. M.; Naidoo, K. J. Carbohydr. Res. 2005, 340, 875-879
23. Lerbret, A.; Bordat, P.; Affouard, F.; Descamps, M.; Migliardo, F. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 11046-11057
24. Choi, Y.; Cho, K. W.; Jeong, K.; Jung, S. Carbohydr. Res. 2006, 341, 1020-1028
25. French, A. D.; Johnson, G. P.; Keltere, A.-M.; Dowd, M. K.; Cramer, C. J. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 4988-4997
26. Brown, G. M.; Rohrer, D. C.; Berking, B.; Beevers, C. A.; Gould, R. O.; Simpson, R. Acta Crystallogr. 1972, B28, 3145-3158
27. Jeffrey, G. A.; Nanni, R. Carbohydr. Res. 1985, 137, 21-30
28. Duda, C. A.; Stephens, E. S. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 7406-7407
29. Duda, C. A.; Stephens, E. S. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 8487-8488
30. Batta, G.; Kövér, K. E.; Gervay, J.; Horyák, M.; Roberts, G. M. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 1336-1345
31. Rudolph, B. R.; Chandrasekhar, I.; Gaber, B. P.; Nagumo, M. Chem. Phys. Lipids 1990, 53, 243-261
32. Palma, R.; Himmel, M. E.; Brady, J. W. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 7228-7234
33. Sakon, J.; Adney, W. S.; Himmel, M. E.; Thomas, S. R.; Karplus, P. A. Biochemistry 1996, 35, 10648-10660
34. Spezio, M.; Wilson, D. B.; Karplus, P. A. Biochemistry 1993, 32, 9906-9916
35. Sakon, J.; Irwin, D.; Wilson, D. B.; Karplus, P. A. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 810-818
36. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, Jr., J. A.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C. Gaussian 03, Revision E.01; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
37. Wang, J.; Wolf., R. M.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157-1174
38. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935
39. Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, M. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021
40. Case, D. A.; Darde., T. A.; Cheatham, T. T.; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Merz, K. M.; Wang, B.; Perlman, D. A. AMBER8; University of California: San Francisco, 2004.
41. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunstern, W. F.; Dinola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690
42. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092
43. Ryckaert, J. P.; Ciccotti., G.; Berendsen., H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341
44. Lucas, R.; Gómez-Pinto, I.; Aviñó, A.; Reina, J. J.; Eritja, R.; González, C.; Morales, J. C. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 1909-1916
45. Tanaka, M.; Machida, Y.; Niu, S.; Ikeda, T.; Jana, N. R.; Doi, H.; Kurosawa, M.; Nekooki, M.; Nukina, N. Nat. Med. 2004, 10, 148-154
46. Arora, A.; Ha, C.; Park., C. B. FEBS Lett. 2004, 564, 121-125
47. Liu, R.; Barkhordarian, H.; Emadi, S.; Park, C. B.; Sierks, M. R. Neurobiol. Dis. 2005, 20, 74-81
48. Davies, J. E.; Sarkar, S.; Rubinsztein, D. C. Hum. Mol. Genet. 2006, 15, 23-31
49. Vilasi, S.; Iannuzzi, C.; Portaccio, M.; Irace, G.; Sirangelo, I. Biochemistry 2008, 47, 1789-1796
50. Morimoto, A.; Irie, K.; Murakami, K.; Masuda, Y.; Ohigashi, H.; Nagao, M.; Fukuda, H.; Shimizu, T.; Shirasawa, T. J. Biol. Chem. 2004, 279, 52781-52788