Water interaction with α,α-trehalose: Molecular dynamics simulation

Journal of the Chemical Society - Faraday Transactions

Volumn 94, Issue 18, 1998, Pages 2755-2762

  Bonanno, Giovanni ^a   Noto, Rosina ^b   Fornili, Sandro L ^a,b  

^a INFM   (Italy)

^b CNR   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 33748668803     PISSN: 09565000     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/a804257h     Document Type: Article

References (37)

1. F. Franks and J. R. Grigera, in Water Science Reviews, ed. F. Franks, Cambridge University Press, Cambridge, 1990, p. 187.
2. J. H. Crowe, L. M. Crowe and D. Chapman, Science, 1984, 223, 701.
3. B. Roser, Trends Food Sci. Technol., 1991, 7, 166.
4. A. D. Panek, Braz. J. Med. Biol. Res., 1995, 28, 169.
5. G. M. Sastry and N. Agmon, Biochemistry, 1997, 36, 7097.
6. L. Cordone. P. Galajda, E. Vitrano, A. Gassmann, A. Ostermann and F. Parak, Eur. Biophys. J., 1998, 27, 173.
7. G. Xie and S. N. Timasheff, Biophys. Chem., 1997, 64, 25.
8. J. H. Crowe, J. F. Carpenter, L. M. Crowe and T. J. Anchordoguy, Cryobiology, 1990, 27, 219.
9. F. Franks, R. H. M. Hartley and S. F. Mathias, Biopharm., 1991, 10, 38.
10. J. L. Green and C. A. Angell, J. Phys. Chem., 1989, 93, 2880.
11. L. M. Crowe, D. S. Reid and J. H. Crowe, Biophys. J., 1996, 71, 2087.
12. D. P. Miller, J. J. de Pablo and H. Corti, Pharm. Res., 1997, 14, 578.
13. B. J. Aldous, A. D. Auffret and F. Franks, Cryo-Lett., 1995, 16, 181.
14. M. C. Donnamaria, E. I. Howard and R. J. Grigera, J. Chem. Soc., Faraday Trans., 1994, 90, 2731.
15. Q. Liu, R. K. Schmidt, B. Teo, P. A. Karplus and J. W. Brady, J. Am. Chem. Soc., 1997, 119, 7851.
16. M. Sakurai, M. Murata, Y. Inoue, A. Hino and S Kobayashi, Bull. Chem. Soc. Jpn, 1997, 70, 847.
17. R. J. Woods, R. A. Dwek, C. J. Edge and B. Fraser-Reid, J. Phys. Chem., 1995, 99, 3832;
18. R. J. Woods, personal communication concerning the new set of GLYCAM parameters.
19. W. D. Cornell, P. Cieplak, C. I. Bayly, I. R. Gould, K. M. Merz Jr, D. M. Ferguson, D. C. Spellmeyer, T. Fox, J. W. Caldwell and P. A. Kollmann, J. Am. Chem. Soc., 1995, 117, 5179.
20. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, P. M. W. Gill, B. J. Johnson, M. W. Wong, J. B. Foresman, M. A. Robb, M. Head-Gordon, E. S. Replogle, R. Gomperts, J. L. Andres, K. Raghavachari, J. S. Binkley, C. Gonzales, R. L. Martin, D. J. Fox, D. J. Defrees, J. Baker, J. J. P. Stewart and J. A. Pople, Gaussian 92/DFT, rev. G.2, Gaussian Inc., Pittsburgh, 1993.
21. D. A. Case, D. A. Pearlman, J. W. Caldwell, T. E. Cheatham III, W. S. Ross, C. L. Simmerling, T. A. Darden, K. M. Merz, R. V. Stanton, A. L. Cheng, J. J. Vincent, M. Crowley, D. M. Ferguson, R. J. Radmer, G. L. Seibel, U. C. Singh, P. K. Weiner and P. A. Kollman, AMBER 5, University of California, San Francisco, 1997.
22. W. L. Jorgensen, J. Chandrasekhar, J. D. Madura, R. W. Impey and M. L. Klein, J. Chem. Phys., 1983, 79, 926.
23. H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. van Gusteren, A. Di Nola and J. R. Haak, J. Chem. Phys., 1984, 81, 3684.
24. J. P. Ryckaert, G. Ciccotti and H. J. C. Berendsen, J. Comput. Phys., 1977, 23, 327.
25. D. L. Bergman, L. Laaksonen and A. Laaksonen, J. Mol. Graph. Modeling, 1998, to be published.
26. R. Sayle, BioMolecular Structure Group, Glaxo Research and Development, Greenford, Middlesex, UK, 1994.
27. C. M. Breneman and K. B. Wiberg, J. Comput. Chem., 1990, 11, 361.
28. C. I. Bayly, P. Cieplak, W. D. Cornell and P. A. Kollman, J. Phys. Chem., 1993, 97, 10269.
29. J. W. Brady, J. Am. Chem. Soc., 1989, 111, 5155.
30. T. Taga, M. Senma and K. Osaki, Acta Crystallogr., sect. B, 1972, B28, 3258.
31. G. Batta, K. E. Kövér, J. Gervay, M. Hornyák and G. M. Roberts, J. Am. Chem. Soc., 1997, 119, 1336.
32. D. A. Rees and D. Thom, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 1977, 191.
33. C. A. Duda and E. S. Stevens, J. Am. Chem. Soc., 1990, 112, 7406.
34. L. M. J. Kroon-Batenburg and J. Kroon, Biopolymers, 1990, 29, 1243.
35. J. W. Brady and R. K. Schmidt, J. Phys. Chem., 1993, 97, 958.
36. P. G. Kusalik and I. M. Svishchev, Science, 1994, 265, 1219.
37. H. J. C. Berendsen, J. R. Grigera and T. P. Straatsma, J. Phys. Chem., 1987, 91, 6269.