IR spectroscopy of isolated neutral and protonated adenine and 9-methyladenine

ChemPhysChem

Volumn 12, Issue 10, 2011, Pages 1921-1927

  Van Zundert, Gydo C P ^a   Jaeqx, Sander ^a   Berden, Giel ^a   Bakker, Joost M ^a   Kleinermanns, Karl ^b   Oomens, Jos ^a,c   Rijs, Anouk M ^a  

^a FOM INSTITUTE FOR PLASMA PHYSICS RIJNHUIZEN   (Netherlands)

^b HEINRICH HEINE UNIVERSITY   (Germany)

^c UNIVERSITY OF AMSTERDAM   (Netherlands)

Author keywords

conformational analysis; density functional calculations; IR spectroscopy; nucleobases; tautomerism

Indexed keywords

DENSITY FUNCTIONAL THEORY; DISSOCIATION; ELECTROSPRAY IONIZATION; INFRARED SPECTROSCOPY; MOLECULAR BEAMS; PHOTOIONIZATION; PHOTONS; PROTONATION; SPACECRAFT INSTRUMENTS;

CONFORMATIONAL ANALYSIS; EXPERIMENTAL SPECTRA; MULTIPLE-PHOTON DISSOCIATION; NUCLEOBASES; PROTONATION SITE; STRETCHING REGION; TAUTOMERISM; THEORETICAL CALCULATIONS;

FOURIER TRANSFORM INFRARED SPECTROSCOPY;

EID: 79959805737     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.201100133     Document Type: Article

References (52)

1. C. E. Crespo-Hernández, B. Cohen, P. M. Hare, B. Kohler, Chem. Rev. 2004, 104, 1977.
2. M. J. Nowak, L. Lapinski, J. S. Kwiatkowski, J. Leszczynski, J. Phys. Chem. 1996, 100, 3527.
3. S. K. Mishra, M. K. Shukla, P. C. Mishra, Spectrochim. Acta A 2000, 56, 1355.
4. A. Laxer, D. T. Major, H. E. Gottlieb, B. Fischer, J. Org. Chem. 2001, 66, 5463.
5. C. Plützer, K. Kleinermanns, Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 4877.
6. J. S. Kwiatkowski, J. Leszczynski, THEOCHEM 1990, 67, 35.
7. M. J. Nowak, H. Rostkowska, L. Lapinski, J. S. Kwiatkowski, J. Leszczynski, J. Phys. Chem. 1994, 98, 2813.
8. C. Plützer, E. Nir, M. S. de Vries, K. Kleinermanns, Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 5466.
9. L. M. Salter, G. M. Chaban, J. Phys. Chem. A 2002, 106, 4251.
10. M. Hanus, M. Kabelac, J. Rejnek, F. Ryjacek, P. Hobza, J. Phys. Chem. B 2004, 108, 2087.
11. M. D. Topal, J. R. Fresco, Nature 1976, 263, 285.
12. V. H. Harris, C. L. Smith, W. J. Cummins, A. L. Hamilton, H. Adams, M. Dickman, D. P. Hornby, D. M. Williams, J. Mol. Biol. 2003, 326, 1389.
13. V. I. Danilov, V. M. Anisimov, C. Kurita, D. Hovorun, Chem. Phys. Lett. 2005, 412, 285.
14. U. Norinder, THEOCHEM 1987, 151, 259.
15. J. Wiorkiewicz-Kuczera, M. Karplus, J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 5324.
16. M. Sabio, S. Topiol, W. C. Lumma, J. Phys. Chem. 1990, 94, 1366.
17. C. Fonseca Guerra, F. M. Bickelhaupt, S. Saha, F. Wang, J. Phys. Chem. A 2006, 110, 4012.
18. A. Sygula, A. Buda, THEOCHEM 1983, 92, 267.
19. S. G. Stepanian, G. G. Sheina, E. D. Radchenko, Y. P. Blagoi, J. Mol. Struct. 1985, 131, 333.
20. M. J. Nowak, L. Lapinski, J. S. Kwiatkowski, Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 14.
21. M. J. Nowak, L. Lapinski, J. S. Kwiatkowski, J. Leszczynski, Spectrochim. Acta Part A 1991, 47, 87.
22. M. J. Nowak, H. Rostkowska, L. Lapinski, J. S. Kwiatkowski, J. Leszczynski, Spectrochim. Acta Part A 1994, 50, 1081.
23. J. Lin, C. Yu, S. Peng, I. Akiyama, K. Li, L. K. Lee, P. R. LeBreton, J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 4627.
24. R. D. Brown, P. D. Godfrey, D. McNaughton, A. P. Pierlot, Chem. Phys. Lett. 1989, 156, 61.
25. P. Colarusso, K. Zhang, B. Guo, P. F. Bernath, Chem. Phys. Lett. 1997, 269, 39.
26. N. J. Kim, G. Jeong, Y. S. Kim, J. Sung, S. K. Kim, Y. D. Park, J. Chem. Phys. 2000, 113, 10051.
27. D. C. Lührs, J. Viallon, I. Fischer, Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 1827.
28. E. Nir, K. Kleinermanns, L. Grace, M. S. de Vries, J. Phys. Chem. A 2001, 105, 5106.
29. E. Nir, C. Plützer, K. Kleinermanns, M. S. de Vries, Eur. Phys. J. D 2002, 20, 317.
30. S. Smolarek, A. M. Rijs, W. J. Buma, M. Drabbels, Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 15600.
31. Y. Xue, D. Xie, G. Yan, Int. J. Quantum Chem. 2000, 76, 686.
32. N. R. Cheong, S. H. Nam, H. S. Park, S. Ryu, J. K. Song, S. M. Park, M. Perot, B. Lucas, M. Barat, J. A. Fayeton, C. Jouvet, Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 291.
33. C. Marian, D. Nolting, R. Weinkauf, Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 3306.
34. D. Nolting, R. Weinkauf, I. V. Hertel, T. Schultz, ChemPhysChem 2007, 8, 751.
35. K. Rajabi, K. Theel, E. A. L. Gillis, G. Beran, T. D. Fridgen, J. Phys. Chem. A 2009, 113, 8099.
36. C. C. Nelson, J. A. McCloskey, J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 3661.
37. W. Zierkiewicz, L. Komorowski, D. Michalska, J. Cerny, P. Hobza, J. Phys. Chem. B 2008, 112, 16734.
38. R. Santamaria, E. Charro, A. Zacarias, M. Castro, J. Comput. Chem. 1999, 20, 511.
39. H. Piest, G. von Helden, G. Meijer, J. Chem. Phys. 1999, 110, 2010.
40. A. M. Rijs, N. Sandig, M. N. Blom, J. Oomens, J. S. Hannam, D. A. Leigh, F. Zerbetto, W. J. Buma, Angew. Chem. 2010, 121, 3988
41. Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 3896.
42. H. Zhu, M. Blom, I. Compagnon, A. M. Rijs, S. Roy, G. von Helden, B. Schmidt, Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 3415.
43. D. Oepts, A. F. G. Van der Meer, P. W. Van Amersfoort, Infrared Phys. Technol. 1995, 36, 297.
44. T. H. Mize, I. Taban, M. Duursma, M. Seynen, M. Konijnenburg, A. Vijftigschild, C. V. Doornik, G. V. Rooij, R. M. A. Heeren, Int. J. Mass Spectrom. 2004, 235, 243.
45. N. C. Polfer, J. Oomens, Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 3804.
46. J. J. Valle, J. R. Eyler, J. Oomens, D. T. Moore, A. F. G. van der Meer, G. von Helden, G. Meijer, C. L. Hendrickson, A. G. Marshall, G. T. Blakney, Rev. Sci. Instrum. 2005, 76, 023103.
47. A. G. Marshall, T. C. L. Wang, T. L. Ricca, J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 7893.
48. Gaussian 03, (Revision C.02), M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2004.
49. A. D. Becke, J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
50. A. D. Becke, J. Chem. Phys. 1996, 104, 1040.
51. C. T. Lee, W. T. Yang, R. G. Parr, Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
52. M. P. Andersson, P. Uvdal, J. Phys. Chem. A 2005, 109, 2937.