-
3
-
-
26944481188
-
-
Chandler, D. Nature 2005, 437, 640-647
-
(2005)
Nature
, vol.437
, pp. 640-647
-
-
Chandler, D.1
-
5
-
-
28844445518
-
-
Malham, R.; Johnstone, S.; Bingham, R. J.; Barratt, E.; Phillips, S. E. V.; Laughton, C. A.; Homans, S. W. J. Am. Chem. Soc. 2008, 127, 17061-17067
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.127
, pp. 17061-17067
-
-
Malham, R.1
Johnstone, S.2
Bingham, R.J.3
Barratt, E.4
Phillips, S.E.V.5
Laughton, C.A.6
Homans, S.W.7
-
7
-
-
14744270949
-
-
Vondrášek, J.; Bendová, L.; Klusák, V.; Hobza, P. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 2615-2619
-
(2005)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.127
, pp. 2615-2619
-
-
Vondrášek, J.1
Bendová, L.2
Klusák, V.3
Hobza, P.4
-
8
-
-
33646172409
-
-
Řeha, D.; Hocek, M.; Hobza, P. Chem.-Eur. J. 2006, 12, 3587-3595
-
(2006)
Chem.-Eur. J.
, vol.12
, pp. 3587-3595
-
-
Řeha, D.1
Hocek, M.2
Hobza, P.3
-
10
-
-
0023667625
-
-
Sowers, L. C.; Shaw, B. R.; Sedwick, W. D. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1987, 148, 790-794
-
(1987)
Biochem. Biophys. Res. Commun.
, vol.148
, pp. 790-794
-
-
Sowers, L.C.1
Shaw, B.R.2
Sedwick, W.D.3
-
13
-
-
0026319199
-
-
Nicholls, A.; Sharp, K. A.; Honig, B. Prot. Struc. Func. Gen. 1991, 11, 281-296
-
(1991)
Prot. Struc. Func. Gen.
, vol.11
, pp. 281-296
-
-
Nicholls, A.1
Sharp, K.A.2
Honig, B.3
-
15
-
-
77955003137
-
-
Riley, K. E.; Pitoňák, M.; Jurečka, P.; Hobza, P. Chem. Rev. 2010, 110, 5023-5063
-
(2010)
Chem. Rev.
, vol.110
, pp. 5023-5063
-
-
Riley, K.E.1
Pitoňák, M.2
Jurečka, P.3
Hobza, P.4
-
18
-
-
77955578570
-
-
Gráfová, L.; Pitoňák, M.; Řezáč, J.; Hobza, P. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 2365-2376
-
(2010)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.6
, pp. 2365-2376
-
-
Gráfová, L.1
Pitoňák, M.2
Řezá č, J.3
Hobza, P.4
-
19
-
-
5844302556
-
-
Andersson, Y.; Langreth, D. C.; Lundqvist, B. I. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 102-105
-
(1996)
Phys. Rev. Lett.
, vol.76
, pp. 102-105
-
-
Andersson, Y.1
Langreth, D.C.2
Lundqvist, B.I.3
-
22
-
-
33846595224
-
-
Jurečka, P.; Černý, J.; Hobza, P.; Salahub, D. J. Comput. Chem. 2007, 28, 555-569
-
(2007)
J. Comput. Chem.
, vol.28
, pp. 555-569
-
-
Jurečka, P.1
Černý, J.2
Hobza, P.3
Salahub, D.4
-
24
-
-
0242443693
-
Protein Simulations
-
Academic Press Inc.: San Diego, CA
-
Ponder, J. W.; Case, D. A. Protein Simulations. Advances in Protein Chemistry; Academic Press Inc.: San Diego, CA, 2003; Vol. 66, pp 27-85.
-
(2003)
Advances in Protein Chemistry
, vol.66
, pp. 27-85
-
-
Ponder, J.W.1
Case, D.A.2
-
26
-
-
34548703110
-
-
Shirts, M.; Mobley, D.; Chodera, J. Ann. Rep.Comput. Chem. 2007, 3, 41-59
-
(2007)
Ann. Rep.Comput. Chem.
, vol.3
, pp. 41-59
-
-
Shirts, M.1
Mobley, D.2
Chodera, J.3
-
28
-
-
77954996425
-
-
Kolář, M.; Berka, K.; Jurečka, P.; Hobza, P. ChemPhysChem 2010, 11, 2399-2408
-
(2010)
ChemPhysChem
, vol.11
, pp. 2399-2408
-
-
Kolář, M.1
Berka, K.2
Jurečka, P.3
Hobza, P.4
-
29
-
-
56749154419
-
-
Černý, J.; Kabeláč, M.; Hobza, P. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 16055-16059
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.130
, pp. 16055-16059
-
-
Černý, J.1
Kabeláč, M.2
Hobza, P.3
-
30
-
-
66349120814
-
-
Černý, J.; Vondrášek, J.; Hobza, P. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 5657-5660
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 5657-5660
-
-
Černý, J.1
Vondrášek, J.2
Hobza, P.3
-
31
-
-
0032922174
-
-
Cheatham, T. E.; Cieplak, P.; Kollman, P. A. J. Biomol. Struc. Dyn. 1999, 16, 845-862
-
(1999)
J. Biomol. Struc. Dyn.
, vol.16
, pp. 845-862
-
-
Cheatham, T.E.1
Cieplak, P.2
Kollman, P.A.3
-
32
-
-
0001312393
-
-
Jeziorski, B.; Moszynski, R.; Szalewicz, K. Chem. Rev. 1994, 94, 1887-1930
-
(1994)
Chem. Rev.
, vol.94
, pp. 1887-1930
-
-
Jeziorski, B.1
Moszynski, R.2
Szalewicz, K.3
-
37
-
-
0029011701
-
-
Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K.M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179-5197
-
(1995)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.117
, pp. 5179-5197
-
-
Cornell, W.D.1
Cieplak, P.2
Bayly, C.I.3
Gould, I.R.4
Merz . K, M.5
Ferguson, D.M.6
Spellmeyer, D.C.7
Fox, T.8
Caldwell, J.W.9
Kollman, P.A.10
-
38
-
-
77957973536
-
-
Zgarbová, M.; Otyepka, M.; Šponer, J.; Hobza, P.; Jurečka, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 10476-10493
-
(2010)
Phys. Chem. Chem. Phys.
, vol.12
, pp. 10476-10493
-
-
Zgarbová, M.1
Otyepka, M.2
Šponer, J.3
Hobza, P.4
Jurečka, P.5
-
39
-
-
0011960339
-
-
Lum, K.; Chandler, D.; Weeks, J. D. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 4570-4577
-
(1999)
J. Phys. Chem. B
, vol.103
, pp. 4570-4577
-
-
Lum, K.1
Chandler, D.2
Weeks, J.D.3
-
40
-
-
36849103820
-
-
Weeks, J. D.; Chandler, D.; Andersen, H. C. J. Chem. Phys. 1971, 54, 5237-5247
-
(1971)
J. Chem. Phys.
, vol.54
, pp. 5237-5247
-
-
Weeks, J.D.1
Chandler, D.2
Andersen, H.C.3
-
41
-
-
0020621373
-
-
Chandler, D.; Weeks, J. D.; Andersen, H. C. Science 1983, 220, 787-794
-
(1983)
Science
, vol.220
, pp. 787-794
-
-
Chandler, D.1
Weeks, J.D.2
Andersen, H.C.3
-
42
-
-
0042208326
-
-
Levy, R. M.; Zhang, L. Y.; Gallicchio, E.; Felts, A. K. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9523-9530
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.125
, pp. 9523-9530
-
-
Levy, R.M.1
Zhang, L.Y.2
Gallicchio, E.3
Felts, A.K.4
-
43
-
-
65249147164
-
-
Shivakumar, D.; Deng, Y.; Roux, B. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 919-930
-
(2009)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.5
, pp. 919-930
-
-
Shivakumar, D.1
Deng, Y.2
Roux, B.3
-
44
-
-
72949108781
-
-
Athawale, M. V.; Jamadagni, S. N.; Garde, S. J. Chem. Phys. 2009, 131, 115102-115109
-
(2009)
J. Chem. Phys.
, vol.131
, pp. 115102-115109
-
-
Athawale, M.V.1
Jamadagni, S.N.2
Garde, S.3
-
47
-
-
33751157732
-
-
Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11623-11627
-
(1994)
J. Phys. Chem.
, vol.98
, pp. 11623-11627
-
-
Stephens, P.J.1
Devlin, F.J.2
Chabalowski, C.F.3
Frisch, M.J.4
-
48
-
-
3042524904
-
-
Bayly, Ch. I.; Cieplak, P.; Cornell, W.; Kollman, P. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10269-10280
-
(1993)
J. Phys. Chem.
, vol.97
, pp. 10269-10280
-
-
Bayly, Ch.I.1
Cieplak, P.2
Cornell, W.3
Kollman, P.A.4
-
51
-
-
0038626673
-
-
revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT
-
Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision C.02;
-
(2004)
Gaussian 03
-
-
Frisch, M.J.1
Trucks, G.W.2
Schlegel, H.B.3
Scuseria, G.E.4
Robb, M.A.5
Cheeseman, J.R.6
Montgomery Jr., J.A.7
Vreven, T.8
Kudin, K.N.9
Burant, J.C.10
Millam, J.M.11
Iyengar, S.S.12
Tomasi, J.13
Barone, V.14
Mennucci, B.15
Cossi, M.16
Scalmani, G.17
Rega, N.18
Petersson, G.A.19
Nakatsuji, H.20
Hada, M.21
Ehara, M.22
Toyota, K.23
Fukuda, R.24
Hasegawa, J.25
Ishida, M.26
Nakajima, T.27
Honda, Y.28
Kitao, O.29
Nakai, H.30
Klene, M.31
Li, X.32
Knox, J.E.33
Hratchian, H.P.34
Cross, J.B.35
Bakken, V.36
Adamo, C.37
Jaramillo, J.38
Gomperts, R.39
Stratmann, R.E.40
Yazyev, O.41
Austin, A.J.42
Cammi, R.43
Pomelli, C.44
Ochterski, J.W.45
Ayala, P.Y.46
Morokuma, K.47
Voth, G.A.48
Salvador, P.49
Dannenberg, J.J.50
Zakrzewski, V.G.51
Dapprich, S.52
Daniels, A.D.53
Strain, M.C.54
Farkas, O.55
Malick, D.K.56
Rabuck, A.D.57
Raghavachari, K.58
Foresman, J.B.59
Ortiz, J.V.60
Cui, Q.61
Baboul, A.G.62
Clifford, S.63
Cioslowski, J.64
Stefanov, B.B.65
Liu, G.66
Liashenko, J.67
Piskorz, P.68
Komaromi, I.69
Martin, R.L.70
Fox, D.J.71
Keith, T.72
Al-Laham, M.A.73
Peng, C.Y.74
Nanayakkara, A.75
Challacombe, M.76
Gill, P.M.W.77
Johnson, B.78
Chen, W.79
Wong, M.W.80
Gonzalez, C.81
Pople, J.A.82
more..
|