Fluorescence intermittency from the main plant light-harvesting complex: Resolving shifts between intensity levels

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 18, 2011, Pages 5071-5082

  Krüger, Tjaart P J ^a   Ilioaia, Cristian ^a   Van Grondelle, Rienk ^a  

^a VU UNIVERSITY AMSTERDAM   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

SHOT NOISE;

AMOUNT OF INFORMATION; ARTIFACTUAL EFFECTS; EMISSION DATA; FLUORESCENCE INTERMITTENCY; INTENSITY FLUCTUATIONS; INTENSITY LEVELS; INTENSITY SHIFT; KINETIC MODELS; LIGHT-HARVESTING COMPLEX; SIMPLE METHOD; SINGLE-MOLECULE; STANDARD DEVIATION; TIME TRACE; TIME-RESOLVED; TWO-STATE;

FLUORESCENCE;

EID: 79958204385     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp201609c     Document Type: Article

References (62)

1. Ambrose, W. P.; Goodwin, P.M.; Martin, J. C.; Keller, R. A. Phys. Rev. Lett. 1994, 72, 160.
2. Xie, X. S.; Dunn, R C. Science 1994, 265, 361.
3. Basche, T.; Kummer, S.; Brauchle, C. Nature 1995, 373, 132.
4. Vogel, M.; Gruber, A.; Wrachtrup, J.; Vonborczyskowski, C. J. Phys. Chem. 1995, 99, 14915.
5. Nirmal, M.; Dabbousi, B. O.; Bawendi, M. G.; Macklin, J. J.; Trautman, J. K.; Harris, T. D.; Brus, L. E. Nature 1996, 383, 802.
6. Bopp, M. A.; Jia, Y. W.; Li, L. Q.; Cogdell, R. J.; Hochstrasser, R M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 10630.
7. Dickson, R. M.; Cubitt, A. B.; Tsien, R. Y.; Moerner, W. E. Nature 1997, 388, 355.
8. Ha, T.; Enderle, T.; Chemla, D. S.; Selvin, P. R.; Weiss, S. Chem. Phys. Lett. 1997, 271, 1.
9. Vanden Bout, D. A.; Yip, W. T.; Hu, D. H.; Fu, D. K.; Swager, T. M.; Barbara, P. F. Science 1997, 277, 1074.
10. Wennmalm, S.; Edman, L.; Rigler, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 10641.
11. Weston, K. D.; Buratto, S. K. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 3635.
12. Ying, L. M.; Xie, X. S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 10399.
13. Yip, W. T.; Hu, D. H.; Yu, J.; Vanden Bout, D. A.; Barbara, P. F. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 7564.
14. Peterman, E.J. G.; Brasselet, S.; Moerner, W. E. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 10553.
15. Hofkens, J.; Vosch, T.; Maus, M.; Kohn, F.; Cotlet, M.; Weil, T.; Herrmann, A.; Mullen, K.; De Schryver, F. C. Chem. Phys. Lett. 2001, 333, 255.
16. Wang, S.; Querner, C.; Emmons, T.; Drndic, M.; Crouch, C. H. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 23221.
17. Wormke, S.; Mackowski, S.; Brotosudarmo, T. H. P.; Jung, C.; Zumbusch, A.; Ehrl, M.; Scheer, H.; HofMann, E.; Hiller, R. G.; Brauchle, C. Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2007, 1767, 956.
18. Kuno, M.; Fromm, D. P.; Hamann, H. F.; Gallagher, A.; Nesbitt, D. J. J. Chem. Phys. 2001, 115, 1028.
19. Verberk, R.; Chon, J. W. M.; Gu, M.; Orrit, M. Phys. E 2005, 26, 19.
20. Naaman, O.; Aumentado, J. Phys. Rev. Lett. 2006, 96.
21. Haase, M.; Hubner, C. G.; Reuther, E.; Herrmann, A.; Mullen, K.; Basche, T. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10445.
22. Zhang, K.; Chang, H. Y.; Fu, A. H.; Alivisatos, A. P.; Yang, H. Nano Lett. 2006, 6, 843.
23. Watkins, L. P.; Yang, H. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 617.
24. Frantsuzov, P. A.; Volkan-Kacso, S.; Janko, B. Phys. Rev. Lett. 2009, 103.
25. Crouch, C. H.; Sauter, O.; Wu, X. H.; Purcell, R.; Querner, C.; Drndic, M.; Pelton, M. Nano Lett. 2010, 10, 1692.
26. Lippitz, M.; Kulzer, F.; Orrit, M. ChemPhysChem 2005, 6, 770.
27. Lee, D. H.; Yuan, C. T.; Tachiya, M.; Tang, J. Appl. Phys. Lett. 2009, 95.
28. Schwille, P.; Kummer, S.; Heikal, A. A.; Moerner, W. E.; Webb, W. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 151.
29. Larson, D. R.; Zipfel, W. R.; Williams, R. M.; Clark, S. W.; Bruchez, M. P.; Wise, F. W.; Webb, W. W. Science 2003, 300, 1434.
30. Verberk, R.; van Oijen, A. M.; Orrit, M. Phys. Rev. B 2002, 66, 233202.
31. Andrec, M.; Levy, R. M.; Talaga, D. S. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 7454.
32. Blumenfeld, M. L.; Tackett, B. S.; Schirra, L. K.; Tyler, J. M.; Monti, O. L. A. Rev. Sci. Instrum. 2009, 80.
33. Weakliem, D. L. Sociol. Methods Res. 1999, 27, 359.
34. Wustholz, K. L.; Bott, E. D.; Kahr, B.; Reid, P.J. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 7877.
35. Goldsmith, R. H.; Moerner, W. E. Nature Chem. 2010, 2, 179.
36. Hofkens, J.; Schroeyers, W.; Loos, D.; Cotlet, M.; Kohn, F.; Vosch, T.; Maus, M.; Herrmann, A.; Mullen, K.; Gensch, T.; De Schryver, F. C. Spectrochim. Acta, Part A 2001, 57, 2093.
37. Loos, D.; Cotlet, M.; De Schryver, F.; Habuchi, S.; Hofkens, J. Biophys. J. 2004, 87, 2598.
38. Holt, N. E.; Fleming, G. R.; Niyogi, K. K. Biochemistry 2004, 43, 8281.
39. Horton, P.; Ruban, A. V.; Walters, R. G. Ann. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1996, 47, 655.
40. Niyogi, K. K Ann. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1999, 50, 333.
41. van Roon, H.; van Breemen, J. F. L.; de Weerd, F. L.; Dekker, J. P.; Boekema, E. J. Photosynth. Res. 2000, 64, 155.
42. Kruger, T. P. J.; Novoderezhkin, V. I.; Ilioaia, C.; van Grondelle, R Biophys. J. 2010, 98, 3093.
43. Rutkauskas, D.; Novoderezhkin, V.; Cogdell, R. J.; van Grondelle, R. Biophys. J. 2005, 88, 422.
44. Cogdell, R. J.; Kohler, J. Biochem. J. 2009, 422, 193.
45. Peterman, E. J. G.; Dukker, F. M.; vanGrondelle, R.; vanAmerongen, H. Biophys. J. 1995, 69, 2670.
46. Mozzo, M.; Dall'Osto, L.; Hienerwadel, R.; Bassi, R.; Croce, R. J. Biol. Chem. 2008, 283, 6184.
47. van Oort, B.; van Hoek, A.; Ruban, A. V.; van Amerongen, H. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 7631.
48. Ilioaia, C.; Johnson, M. P.; Horton, P.; Ruban, A. V. J. Biol. Chem. 2008, 283, 29505.
49. Jung, G.; Wiehler, J.; Gohde, W.; Tittel, J.; Basche, T.; Steipe, B.; Brauchle, C. Bioimaging 1998, 6, 54.
50. Kuhlbrandt, W.; Wang, D. N.; Fujiyoshi, Y. Nature 1994, 367, 614.
51. Zondervan, R.; Kulzer, F.; Orlinskii, S. B.; Orrit, M. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 6770.
52. Shimizu, K T.; Neuhauser, R G.; Leatherdale, C. A.; Empedocles, S. A.; Woo, W. K.; Bawendi, M. G. Phys. Rev. B 2001, 63, 205316.
53. Tang, J.; Marcus, R. A. Phys. Rev. Lett. 2005, 95, 107401.
54. Heyes, C.D.; Kobitski, A. Y.; Breus, V. V.; Nienhaus, G. U. Phys. Rev. B 2007, 75, 125431.
55. Frantsuzov, P.; Kuno, M.; Janko, B.; Marcus, R. A. Nat. Phys. 2008, 4, 519.
56. Wang, S.; Querner, C.; Fischbein, M. D.; Willis, L.; Novikov, D. S.; Crouch, C. H.; Drndic, M. Nano Lett. 2008, 8, 4020.
57. Durisic, N.; Wiseman, P. W.; Grutter, P.; Heyes, C. D. ACS Nano 2009, 3, 1167.
58. Hoogenboom, J. P.; Hernando, J.; van Dijk, E.; van Hulst, N. F.; Garcia-Parajo, M. F. ChemPhysChem 2007, 8, 823.
59. Cichos, F.; von Borczyskowski, C.; Orrit, M. Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 2007, 12, 272.
60. Schuster, J.; Cichos, F.; von Borczyskowski, C. Opt. Spectrosc. 2005, 98, 712.
61. Yeow, E. K. L.; Melnikov, S. M.; Bell, T. D. M.; De Schryver, F. C.; Hofkens, J. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 1726.
62. Clifford, J. N.; Bell, T. D. M.; Tinnefeld, P.; Heilemann, M.; Melnikov, S. M.; Hotta, J.; Sliwa, M.; Dedecker, P.; Sauer, M.; Hofkens, J.; Yeow, E. K. L. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 6987.