Computational calculations of pKa values of imidazole in Cu(ii) complexes of biological relevance

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 17, 2011, Pages 7852-7861

  Alí Torres, Jorge ^a   Rodríguez Santiago, Luis ^a   Sodupe, Mariona ^a  

^a UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COPPER; IMIDAZOLE; IMIDAZOLE DERIVATIVE;

ARTICLE; CHEMISTRY; MOLECULAR DYNAMICS; THERMODYNAMICS;

COPPER; IMIDAZOLES; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; THERMODYNAMICS;

EID: 79956042304     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0cp02319a     Document Type: Conference Paper

References (72)

1. M. Ullmann L. Noodleman D. Case JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2002 7 632 639
2. G. T. Babcock M. Wikstrom Nature 1992 356 301 309
3. S. Ferguson-Miller G. T. Babcock Chem. Rev. 1996 96 2889 2907
4. R. B. Gennis Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 12747 12749
5. H. Michel J. Behr A. Harrenga A. Kannt Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1998 27 329 356
6. M. Wikstrom Curr. Opin. Struct. Biol. 1998 8 480 488
7. M. K. F. Wikstrom Nature 1977 266 271 273
8. I. Belevich M. I. Verkhovsky M. Wikstroem Nature 2006 440 829 832
9. M. R. A. Blomberg P. E. M. Siegbahn J. Comput. Chem. 2006 27 1373 1384
10. E. Fadda C.-H. Yu R. Pomès Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2008 1777 277 284
11. J. A. Fee D. A. Case L. Noodleman J. Am. Chem. Soc. 2008 130 15002 15021
12. J. P. Hosler S. Ferguson-Miller D. A. Mills Annu. Rev. Biochem. 2006 75 165 187
13. V. R. I. Kaila M. P. Johansson D. Sundholm L. Laakkonen M. Wikström Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2009 1787 221 233
14. D. M. Popovic A. A. Stuchebrukhov FEBS Lett. 2004 566 126 130
15. D. M. Popovic A. A. Stuchebrukhov J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1858 1871
16. M. A. Sharpe S. Ferguson-Miller J. Bioenerg. Biomembr. 2008 40 541 549
17. M. H. M. Olsson A. Warshel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 6500 6505
18. D. M. Popovic A. A. Stuchebrukhov Photochem. Photobiol. Sci. 2006 5 611 620
19. W. W. Cleland P. A. Frey J. A. Gerlt J. Biol. Chem. 1998 273 25529 25532
20. H. Walba R. W. Isensee J. Am. Chem. Soc. 1955 77 5488 5492
21. G. Yagil Tetrahedron 1967 23 2855 2861
22. J. Quenneville D. M. Popovic A. A. Stuchebrukhov J. Phys. Chem. B 2004 108 18383 18389
23. E. Fadda N. Chakrabarti R. Pomes J. Phys. Chem. B 2005 109 22629 22640
24. E. Gaggelli H. Kozlowski D. Valensin G. Valensin Chem. Rev. 2006 106 1995 2044
25. Y. H. Hung A. I. Bush R. A. Cherny JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2010 15 61 76
26. A. Rauk Dalton Trans. 2008 1273 1282
27. A. Rauk Chem. Soc. Rev. 2009 38 2698 2715
28. R. B. Martin J. T. Edsall J. Am. Chem. Soc. 1960 82 1107 1111
29. R. K. Boggess R. B. Martin Inorg. Chem. 1974 13 1525 1527
30. R. J. Sundberg R. B. Martin Chem. Rev. 1974 74 471 517
31. R. B. Martin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1974 71 4346 4347
32. I. Sovago T. Kiss A. Gergely J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1978 964 968
33. M. Itabashi K. Itoh Bull. Chem. Soc. Jpn. 1980 53 3131 3137
34. J. G. Mesu T. Visser F. Soulimani E. E. van Faassen P. de Peinder A. M. Beale B. M. Weckhuysen Inorg. Chem. 2006 45 1960 1971
35. K. Osz K. Varnagy H. Suili-Vargha D. Sanna G. Micera I. Sovago Inorg. Chim. Acta 2002 339 373 382
36. K. Osz K. Varnagy H. Suli-Vargha D. Sanna G. Micera I. Sovago Dalton Trans. 2003 2009 2016
37. J. Ho M. Coote Theor. Chem. Acc. 2009 125 3 21
38. M. D. Tissandier K. A. Cowen W. Y. Feng E. Gundlach M. H. Cohen A. D. Earhart J. V. Coe T. R. Tuttle J. Phys. Chem. A 1998 102 7787 7794
39. D. M. Camaioni C. A. Schwerdtfeger J. Phys. Chem. A 2005 109 10795 10797
40. C. Lim D. Bashford M. Karplus J. Phys. Chem. 1991 95 5610 5620
41. V. S. Bryantsev M. S. Diallo W. A. Goddard III J. Phys. Chem. B 2008 112 9709 9719
42. F. Ding J. M. Smith H. Wang J. Org. Chem. 2009 74 2679 2691
43. Y. Fu L. Liu R.-Q. Li R. Liu Q.-X. Guo J. Am. Chem. Soc. 2004 126 814 822
44. C. P. Kelly C. J. Cramer D. G. Truhlar J. Phys. Chem. A 2006 110 2493 2499
45. J. R. Pliego, Jr. J. M. Riveros J. Phys. Chem. A 2002 106 7434 7439
46. X.-x. Wang H. Fu D.-m. Du Z.-y. Zhou A.-g. Zhang C.-f. Su K.-s. Ma Chem. Phys. Lett. 2008 460 339 342
47. J. R. Pliego Chem. Phys. Lett. 2003 367 145 149
48. J. R. Pliego, Jr. J. M. Riveros J. Phys. Chem. A 2001 105 7241 7247
49. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648 5652
50. C. Lee W. Yang R. G. Parr Phys. Rev. B 1988 37 785 789
51. P. J. Stephens F. J. Devlin C. F. Chabalowski M. J. Frisch J. Phys. Chem. 1994 98 11623 11627
52. Y. Zhao D. G. Truhlar J. Phys. Chem. A 2004 108 6908 6918
53. I. Georgieva N. Trendafilova L. Rodriguez-Santiago M. Sodupe J. Phys. Chem. A 2005 109 5668 5676
54. J. Poater M. Sola A. Rimola L. Rodriguez-Santiago M. Sodupe J. Phys. Chem. A 2004 108 6072 6078
55. A. Rimola E. Constantino L. Rodriguez-Santiago M. Sodupe J. Phys. Chem. A 2008 112 3444 3453
56. A. Rimola L. Rodriguez-Santiago M. Sodupe J. Phys. Chem. B 2006 110 24189 24199
57. M. Sodupe J. Bertran L. Rodriguez-Santiago E. J. Baerends J. Phys. Chem. A 1999 103 166 170
58. K. Raghavachari G. W. Trucks J. A. Pople M. Head-Gordon Chem. Phys. Lett. 1989 157 479 483
59. A. J. H. Wachters J. Chem. Phys. 1970 52 1033 1037
60. P. J. Hay J. Chem. Phys. 1977 66 4377 4384
61. K. Raghavachari G. W. Trucks J. Chem. Phys. 1989 91 1062 1065
62. D. McQuarrie, Statistical Mechanics, Harper and Row, New York, 1986
63. V. Barone M. Cossi J. Phys. Chem. A 1998 102 1995 2001
64. M. T. Frisch, G., H. Schlegel, G. Scuseria, M. Robb, J. Cheeseman, J. Montgomery, T. Vreven, K. Kudin, J. Burant, J. Millam, S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. Knox, H. Hratchian, J. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. Stratmann, O. Yazyev, A. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. Ochterski, P. Ayala, K. Morokuma, G. Voth, P. Salvador, J. Dannenberg, V. Zakrzewski, S. Dapprich, A. Daniels, M. Strain, O. Farkas, D. Malick, A. Rabuck, K. Raghavachari, J. Foresman, J. Ortiz, Q. Cui, A. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Martin, D. Fox, T. Keith, M. Al-Laham, C. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. Wong, C. Gonzalez and J. Pople, GAUSSIAN 03, 2004
65. T. N. Brown N. Mora-Diez J. Phys. Chem. B 2006 110 9270 9279
66. J. I. a. Mujika J. M. Mercero X. Lopez J. Phys. Chem. A 2003 107 6099 6107
67. J. Mujika J. Ugalde X. Lopez Theor. Chem. Acc. 2010 128 477
68. A. E. Reed L. A. Curtiss F. Weinhold Chem. Rev. 1988 88 899 926
69. F. Weinhold and J. E. Carpenter, The Structure of Small Molecules and Ions, Plenum, New York, 1988
70. CRC Handbook of Chemistry and Physics, ed., D. R. Lide,, CRC, Boca Raton, FL, 2009
71. R. Rios-Font M. Sodupe L. Rodriguez-Santiago P. R. Taylor J. Phys. Chem. A 2010 114 10857 10863
72. A. Gergely I. Sovago Inorg. Chim. Acta 1976 20 19 25