Rapid assessment of the stability of DNA duplexes by impedimetric real-time monitoring of chemically induced denaturation

Lab on a Chip

Volumn 11, Issue 9, 2011, Pages 1656-1663

  Van Grinsven, B ^a   Vanden Bon, N ^b   Grieten, L ^a   Murib, M ^a   Janssens, S D ^a   Haenen, K ^a   Schneider, E ^c   Ingebrandt, S ^c   Schoning M J ^d   Vermeeren, V ^b   Ameloot, M ^b   Michiels, L ^b   Thoelen, R ^a,e   De Ceuninck, W ^a   Wagner, P ^a  

^a HASSELT UNIVERSITY   (Belgium)

^b HASSELT UNIVERSITY   (Belgium)

^c UNIVERSITY OF APPLIED SCIENCES KAISERSLAUTERN   (Germany)

^d AACHEN UNIVERSITY OF APPLIED SCIENCES   (Germany)

^e PHL University College   (Belgium)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DIAMOND; DNA HYBRID; DOUBLE STRANDED DNA; SODIUM HYDROXIDE;

ARTICLE; DNA DENATURATION; DNA HYBRIDIZATION; ELECTROCHEMICAL IMPEDANCE SPECTROSCOPY; ELECTRODE; FLUORESCENCE IMAGING; FLUORESCENCE MICROSCOPY; GENE TARGETING; MELTING POINT; PRIORITY JOURNAL; SENSOR; SIGNAL TRANSDUCTION; SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM;

EID: 79954432726     PISSN: 14730197     EISSN: 14730189     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1lc20027e     Document Type: Article

References (39)

1. P. Y. Kwok Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2001 2 235 258
2. J. K. K. Ng W.-T. Liu Anal. Bioanal. Chem. 2006 3 427 434
3. J. Hooyberghs E. Carlon Biosens. Bioelectron. 2010 26 1692 1695
4. E. A. Tindall D. C. Petersen P. Woodbridge K. Schipany V. M. Hayes Hum. Mutat. 2009 30 876 883
5. R. Fodde M. Losekoot Hum. Mutat. 1994 3 83 94
6. L. Lodewyckx C. Vandevyver C. Vandervorst W. Van Steenbergen J. Raus L. Michiels Hum. Mutat. 2001 18 243 250
7. C. Dekker Nat. Nanotechnol. 2007 2 209 215
8. Y. Astier O. Braha H. Bayley J. Am. Chem. Soc. 2006 128 10684 10685
9. J. Clarke H. C. Wu L. Jayasinghe A. Patel S. Reid H. Bayley Nat. Nanotechnol. 2009 4 265 270
10. U. Rant K. Arinaga S. Scherer E. Pringsheim S. Fujita N. Yokoyama M. Tornow G. Abstreiter Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 17364 17369
11. Y. Xiao A. A. Lubin B. R. Baker K. W. Plaxco A. J. Heeger Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 4017 4021
12. F. Uslu S. Ingebrandt D. Mayer S. Böcker-Meffert M. Odenthal A. Offenhäusser Biosens. Bioelectron. 2004 19 1721 1731
13. T. Sakata Y. Miyahara ChemBioChem 2005 6 703 710
14. S. Ingebrandt Y. Han F. Nakamura A. Poghossian M. J. Schöning A. Offenhäusser Biosens. Bioelectron. 2007 22 2834 2840
15. A. Poghossian A. Cherstvy S. Ingebrandt A. Offenhäusser M. J. Schöning Sens. Actuators, B 2005 111 470 480
16. F. Davis M. A. Hughes A. R. Cossins S. P. J. Higson Anal. Chem. 2007 79 1153 1157
17. J.-Y. Park S.-M. Park Sensors 2009 9 9513 9532
18. E. Özkumur S. Ahn A. Yalcin C. A. Lopez E. Cevik R. J. Irani C. DeLisi M. Chiari M. S. Unlü Biosens. Bioelectron. 2010 25 1789 1795
19. J. Hooyberghs M. Baiesi A. Ferrantini E. Carlon Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2010 81 012901
20. E. Katz I. Willner Electroanalysis 2003 15 913 947
21. V. Vermeeren N. Bijnens S. Wenmackers M. Daenen K. Haenen O. A. Williams M. Ameloot M. vandeVen P. Wagner L. Michiels Langmuir 2007 23 13193 13202
22. B. van Grinsven T. Vandenryt S. Duchateau A. Gaulke L. Grieten R. Thoelen S. Ingebrandt W. De Ceuninck P. Wagner Phys. Status Solidi A 2010 207 2110 2113
23. L. Tang C. Tsai W. W. Gerberich L. Kruckeberg D. R. Kania Biomaterials 1995 16 483 488
24. N. Smisdom I. Smets O. A. Williams M. Daenen S. Wenmackers K. Haenen M. Nesládek J. D'Haen P. Wagner J.-M. Rigo M. Ameloot M. vandeVen Phys. Status Solidi A 2009 206 2042 2046
25. A. Härtl E. Schmich J. A. Garrido J. Hernando S. C. R. Catharino S. Walter P. Feulner A. Kromka D. Steinmüller M. Stutzmann Nat. Mater. 2004 3 736 742
26. W. Yang O. Auciello J. E. Butler W. Cai J. A. Carlisle J. E. Gerbi D. M. Gruen T. Knickerbocker T. L. Lasseter J. N. Russell, Jr L. M. Smith R. J. Hamers Nat. Mater. 2002 1 253 257
27. P. Christiaens V. Vermeeren S. Wenmackers M. Daenen K. Haenen M. Nesládek M. vandeVen M. Ameloot L. Michiels P. Wagner Biosens. Bioelectron. 2006 22 170 177
28. S. Wenmackers V. Vermeeren M. vandeVen M. Ameloot N. Bijnens K. Haenen L. Michiels P. Wagner Phys. Status Solidi A 2009 206 391 408
29. V. Vermeeren S. Wenmackers P. Wagner L. Michiels Sensors 2009 9 5600 5636
30. H. Gu X. Su K. P. Loh J. Phys. Chem. B 2005 109 13611 13618
31. S. Kuga S. Tajima J. H. Yang K. Hirama H. Kawarada IEEE Int. Electron Devices Meet., Tech. Dig., 50th 2008 483 486
32. N. Yang H. Uetsuka E. Osawa C. E. Nebel Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 5183 5185
33. O. A. Williams M. Nesládek M. Daenen S. Michaelson A. Hoffman E. Osawa K. Haenen R. B. Jackman Diamond Relat. Mater. 2008 17 1080 1088
34. X. Y. Wang R. E. Ruther J. A. Streifer R. J. Hamers J. Am. Chem. Soc. 2010 132 4048 4049
35. V. Vermeeren S. Wenmackers M. Daenen K. Haenen O. A. Williams M. Ameloot M. vandeVen P. Wagner L. Michiels Langmuir 2008 24 13193 13202
36. S. Wenmackers S. D. Pop K. Roodenko V. Vermeeren O. A. Williams M. Daenen O. Douheret J. D'Haen A. Hardy M. K. Van Bael K. Hinrichs C. Cobet M. vandeVen M. Ameloot K. Haenen L. Michiels N. Esser P. Wagner Langmuir 2008 24 7269 7299
37. J. Poté P. Rossé W. Roselli W. T. Van W. Wildi Chemosphere 2005 61 677 684
38. M. Leber L. Kaderali A. Schönhuth R. Schrader Bioinformatics 2005 21 2375 2382
39. M. Bonnauron S. Saada C. Mer C. Gesset O. A. Williams L. Rousseau E. Scorsone P. Mailley M. Nesládek J. C. Arnault P. Bergonzo Phys. Status Solidi A 2008 205 2126 2129