GPU-computing in econophysics and statistical physics

European Physical Journal: Special Topics

Volumn 194, Issue 1, 2011, Pages 87-119

  Preis, T ^a,b  

^a Boston University   (United States)

^b Artemis Capital Asset Management GmbH   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 79953294551     PISSN: 19516355     EISSN: 19516401     Source Type: Journal    
DOI: 10.1140/epjst/e2011-01398-x     Document Type: Review

References (108)

1. T. Preis, H. E. Stanley, J. Stat. Phys. 138, 431 (2010).
2. D. P. Landau, K. Binder, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics (Cambridge University Press, 2005).
3. J. A. van Meel, A. Arnold, D. Frenkel, S. F. Portegies Zwart, R. G. Belleman, Mol. Simul. 34, 259 (2008).
4. H. Köstler, R. Schmid, U. Rüde, C. Scheit, Comput. Visual. Sci. 11, 115 (2008).
5. J. J. Schneider, S. Kirkpatrick, Stochastic Optimization (Springer, 2006).
6. L. Dagum, R. Menon, IEEE Comput. Sci. Eng. 5, 46 (1998).
7. E. Gabriel, G. E. Fagg, G. Bosilca, T. Angskun, J. J. Dongarra, J. M. Squyres, V. Sahay, P. Kambadur, B. Barrett, A. Lumsdaine, R. H. Castain, D. J. Daniel, R. L. Graham, T. S. Woodall, Proceedings, 11th European PVM/MPI Users' Group Meeting, 97 (2004).
8. S. J. Park, J. A. Ross, D. R. Shires, D. A. Richie, B. J. Henz, L. H. Nguyen, IEEE Trans. Parallel Distrib. Syst. 22, 46 (2011).
9. A. Ruiz, M. Ujaldon, L. Cooper, K. Huang, J. Sig. Proc. Syst. Signal Image Video 55, 229 (2009).
10. O. M. Lozano, K. Otsuka, J. Sig. Proc. Syst. Signal Image Video 57, 285 (2009).
11. A. C. Thompson, C. J. Fluke, D. G. Barnes, B. R. Barsdell, New Astron. 15, 16 (2010).
12. E. B. Ford, New Astron. 14, 406 (2009).
13. R. B. Wayth, L. J. Greenhill, F. H. Briggs, Publ. Astron. Soc. Pac. 121, 857 (2009).
14. R. G. Belleman, J. Bedorf, S. F. P. Zwart, New Astron. 13, 103 (2008).
15. I. S. Haque, V. S. Pande, J. Comput. Chem. 31, 117 (2010).
16. N. Schmid, M. Botschi, W. F. van Gunsteren, J. Comput. Chem. 31, 1636 (2010).
17. J. E. Stone, J. C. Phillips, P. L. Freddolino, D. J. Hardy, L. G. Trabuco, K. Schulten, J. Comput. Chem. 28, 2618 (2007).
18. V. B. Putz, J. Dunkel, J. M. Yeomans, Chem. Phys. 375, 557 (2010).
19. S. Tomov, M. McGuigan, R. Bennett, G. Smith, J. Spiletic, Comput. Graph. 29, 71 (2005).
20. E. Gutierrez, S. Romero, M. A. Trenas, E. L. Zapata, Comput. Phys. Commun. 181, 283 (2010).
21. F. Molnar, T. Szakaly, R. Meszaros, I. Lagzi, Comput. Phys. Commun. 181, 105 (2010).
22. K. Hagiwara, J. Kanzaki, N. Okamura, D. Rainwater, T. Stelzer, Eur. Phys. J. C 66, 477 (2010).
23. S. Bianchi, R. Di Leonardo, Comput. Phys. Commun. 181, 1442 (2010).
24. B. Block, P. Virnau, T. Preis, Comput. Phys. Commun. 181, 1549 (2010).
25. D. Komatitsch, G. Erlebacher, D. Goddeke, D. Michea, J. Comput. Phys. 229, 7692 (2010).
26. S. Rostrup, H. De Sterck, Comput. Phys. Commun. 181, 2164 (2010).
27. T. Preis, P. Virnau, W. Paul, J. J. Schneider, J. Comput. Phys. 228, 4468 (2009).
28. N. Sanna, I. Baccarelli, G. Morelli, Comput. Phys. Commun. 180, 2544 (2009).
29. J. A. Anderson, C. D. Lorenz, A. Travesset, J. Comput. Phys. 227, 5342 (2008).
30. T. Preis, P. Virnau, W. Paul, J. J. Schneider, New J. Phys. 11, 093024 (2009).
31. D. Michea, D. Komatitsch, Geophys. J. Int. 182, 389 (2010).
32. X. K. Zhang, X. Zhang, Z. H. Zhou, J. Struct. Biol. 172, 400 (2010).
33. D. Castano-Diez, D. Moser, A. Schoenegger, S. Pruggnaller, A. S. Frangakis, J. Struct. Biol. 164, 153 (2008).
34. D. Dynerman, E. Butzlaff, J. C. Mitchell, J. Comput. Biol. 16, 523 (2009).
35. J. Buckner, J. Wilson, M. Seligman, B. Athey, S. Watson, F. Meng, Bioinformatics 26, 134 (2010).
36. J. M. Cecilia, J. M. Garcia, G. D. Guerrero, M. A. Martinez-del Amor, I. Perez-Hurtado, M. J. Perez-Jimenez, Brief. Bioinform. 11, 313 (2010).
37. L. Dematte, D. Prandi, Brief. Bioinform. 11, 323 (2010).
38. P. B. Noel, A. M. Walczak, J. H. Xu, J. J. Corso, K. R. Hoffmann, S. Schafer, Comp. Meth. Progr. Biomed. 98, 271 (2010).
39. W. F. Shen, D. M. Wei, W. M. Xu, X. Zhu, S. Z. Yuan, Comp. Meth. Progr. Biomed. 100, 87 (2010).
40. J. C. Phillips, J. E. Stone, Comm. ACM 52, 34 (2009).
41. S. Hissoiny, B. Ozell, P. Despres, Med. Phys. 37, 1029 (2010).
42. C. Rohkohl, B. Keck, H. G. Hofmann, J. Hornegger, Med. Phys. 36, 3940 (2009).
43. M. de Greef, J. Crezee, J. C. van Eijk, R. Pool, A. Bel, Med. Phys. 36, 4095 (2009).
44. C. H. Men, X. J. Gu, D. J. Choi, A. Majumdar, Z. Y. Zheng, K. Mueller, S. B. Jiang, Phys. Med. Biol. 54, 6565 (2009).
45. A. Badal, A. Badano, Med. Phys. 36, 4878 (2009).
46. S. S. Samant, J. Y. Xia, P. Muyan-Ozcelilk, J. D. Owens, Med. Phys. 35, 3546 (2008).
47. Z. A. Taylor, O. Comas, M. Cheng, J. Passenger, D. J. Hawkes, D. Atkinson, S. Ourselin, Med. Image Anal. 13, 234 (2009).
48. K. Xu, D. Z. Ding, Z. H. Fan, R. S. Chen, Microw. Opt. Technol. Lett. 52, 502 (2010).
49. V. Demir, A. Z. Elsherbeni, Appl. Comput. Electrom. Soc. J. 25, 303 (2010).
50. V. Demir, Appl. Comput. Electromagn. Soc. J. 25, 323 (2010).
51. N. Godel, N. Nunn, T. Warburton, M. Clemens, Appl. Comput. Electromagn. Soc. J. 25, 331 (2010).
52. F. Rossi, C. McQuay, P. So, Appl. Comput. Electromagn. Soc. J. 25, 348 (2010).
53. A. Capozzoli, C. Curcio, G. DÉlia, A. Liseno, P. Vinetti, Appl. Comput. Electromagn. Soc. J. 25, 355 (2010).
54. N. Godel, S. Schomann, T. Warburton, M. Clemens, IEEE Trans. Magn. 46, 2735 (2010).
55. N. Godel, N. Nunn, T. Warburton, M. Clemens, IEEE Trans. Magn. 46, 3469 (2010).
56. J. M. Nageswaran, N. Dutt, J. L. Krichmar, A. Nicolau, A. V. Veidenbaum, Neural Networks 22, 791 (2009).
57. Y. C. Liu, B. Schmidt, W. G. Liu, D. L. Maskell, Patt. Recogn. Lett. 31, 2170 (2010).
58. A. Munawar, M. Wahib, M. Munetomo, K. Akama, Genetic Program. Evolvable Mach. 10, 391 (2009).
59. C. Muller, S. Frey, M. Strengert, C. Dachsbacher, T. Ertl, IEEE Trans. Visualiz. Comp. Grap. 15, 605 (2009).
60. C. Wang, Y. J. Chiang, IEEE Trans. Visualiz. Comp. Graph. 15, 1367 (2009).
61. D. M. Hughes, I. S. Lim, IEEE Trans. Visualiz. Comp. Graph. 15, 1555 (2009).
62. A. Godiyal, J. Hoberock, M. Garland, J. C. Hart, I. G. E. D. Tollis, M. Patrignani, Graph Drawing 5417, 90 (2009).
63. D. Goddeke, R. Strzodka, IEEE Trans. Parall. Distrib. Syst. 22, 22 (2011).
64. J. Nickolls, W. J. Dally, IEEE Micro 30, 56 (2010).
65. A. Benso, S. Di Carlo, G. Politano, A. Savino, A. Scionti, Control Eng. Appl. Inform. 12, 34 (2010).
66. K. Jang, S. Han, S. Han, S. Moon, K. Park, Comp. Comm. Rev. 40, 437 (2010).
67. A. Akoglu, G. M. Striemer, Cluster Computing. The J. Networks Software Tools Appl. 12, 341 (2009).
68. A. Leist, D. P. Playne, K. A. Hawick, Concurr. Comp.-Pract. Exper. 21, 2400 (2009).
69. M. Garland, S. Le Grand, J. Nickolls, J. Anderson, J. Hardwick, S. Morton, E. Phillips, Y. Zhang, V. Volkov, IEEE Micro 28, 13 (2008).
70. S. S. Stone, J. P. Haldar, S. C. Tsao, W. M. W. Hwu, B. P. Sutton, Z. P. Liang, J. Parallel Distrib. Comp. 68, 1307 (2008).
71. S. Che, M. Boyer, J. Y. Meng, D. Tarjan, J. W. Sheaffer, K. Skadron, J. Parallel Distrib. Comp. 68, 1370 (2008).
72. R. J. Rost, OpenGL Shading Language (2004).
73. R. Fernando, M. J. Kilgard, The Cg Tutorial: The Definitive Guide to Programmable Real-Time Graphics (2003).
74. NVIDIA Corporation, NVIDIA CUDA Compute Unified Device Architecture, Programming Guide Version 2. 0 (2008).
75. ATI Technologies Inc., ATI CTM Guide, Technical Reference Manual Version 1. 01 (2006).
76. NVIDIA Corporation, NVIDIA GeForce GTX 280 Specifications (2008).
77. B. B. Mandelbrot, R. L. Hudson, The (Mis)behavior of Markets: A Fractal View of Risk, Ruin and Reward (Basic Books, 2004).
78. T. Preis, Eur. Phys. J. Special Topics 194, 5 (2011).
79. H. E. Hurst, Trans. Amer. Soc. Civil Eng. 116, 770 (1951).
80. T. Preis, W. Paul, J. J. Schneider, Europhys. Lett. 82, 68005 (2008).
81. G. A. Darbellay, D. Wuertz, Physica A 287, 429 (2000).
82. M. Ausloos, Physica A 285, 48 (2000).
83. A. Carbone, G. Castelli, H. E. Stanley, Physica A 344, 267 (2004).
84. G.-F. Gu, W.-X. Zhou, Eur. Phys. J. B 67, 585 (2009).
85. T. Preis, S. Golke, W. Paul, J. J. Schneider, Phys. Rev. E 76, 016108 (2007).
86. T. Preis, S. Golke, W. Paul, J. J. Schneider, Eur. Lett. 75, 510 (2006).
87. H. E. Stanley, S. V. Buldyrev, G. Franzese, S. Havlin, F. Mallamace, P. Kumar, V. Plerou, T. Preis, Physica A 389, 2880 (2010).
88. T. Preis, D. Reith, H. E. Stanley, Philosoph. Trans. Royal Soc. A 368, 5707 (2010).
89. T. Preis, J. Phys.: Conf. Ser. 221, 012019 (2010).
90. E. Ising, Z. Phys. 31, 253 (1925).
91. K. Binder, E. Luijten, Phys. Rep. 344, 179 (2001).
92. L. Onsager, Phys. Rev. 65, 117 (1944).
93. K. Binder, Z. Phys. B Cond. Matt. 43, 119 (1981).
94. B. Fierro, F. Bachmann, E. E. Vogel, Phys. B: Cond. Matt. 384, 215 (2006).
95. H.-O. Heuer, J. Phys. A: General Phys. 26, L333 (1993).
96. M. E. Fisher, Reports Progr. Phys. 30, 615 (1967).
97. R. N. Mantegna, H. E. Stanley, An Introduction to Econophysics: Correlations and Complexity in Finance (Cambridge University Press, 2000).
98. W. Paul, J. Baschnagel, Stochastic Processes: From Physics to Finance (Springer, 2000).
99. W. Liu, B. Schmidt, G. Voss, W. Müller-Wittig, Comp. Phys. Comm. 179, 634 (2008).
100. M. Matsumoto, T. Nishimura, ACM Trans. Model. Comp. Simul. 8, 3 (1998).
101. N. Metropolis, A. W. Rosenbluth, M. N. Rosenbluth, A. H. Teller, E. Teller, J. Chem. Phys. 21, 1087 (1953).
102. R. H. Swendsen, J.-S. Wang, Phys. Rev. Lett. 58, 86 (1987).
103. U. Wolff, Phys. Rev. Lett. 62, 361 (1989).
104. S. Wansleben, J. G. Zabolitzky, C. Kalle, J. Stat. Phys. 37, 271 (1984).
105. R. Zorn, H. J. Herrmann, C. Rebbi, Comput. Phys. Commun. 23, 337 (1981).
106. N. Ito, Y. Kanada, Supercomputer 7, 29 (1990).
107. N. Ito, Y. Kanada, Supercomputer 5, 31 (1988).
108. NVIDIA Corporation, NVIDIA Tesla C1060 Specifications (2009).