NCIPLOT: A program for plotting noncovalent interaction regions

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 7, Issue 3, 2011, Pages 625-632

  Contreras García, Julia ^a   Johnson, Erin R ^b   Keinan, Shahar ^a   Chaudret, Robin ^c,d   Piquemal, Jean Philip ^c,d   Beratan, David N ^a   Yang, Weitao ^a  

^a DUKE UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^c SORBONNE UNIVERSITÉ   (France)

^d LABORATOIRE DE CHIMIE THÉORIQUE   (France)

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EID: 79952583698     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct100641a     Document Type: Article

References (44)

1. Chandler, D. Nature 2005, 437, 640
2. Panigrahi, S. K.; Desiraju, G. R. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2007, 67, 128
3. Fenniri, H.; Packiarajan, M.; Vidale, K. L.; Sherman, D. M.; Hallenga, K.; Wood, K. V.; Stowell, J. G. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3854
4. Kruse, P.; Johnson, E. R.; DiLabio, G. A.; Wolkow, R. A. Nano Lett. 2002, 2, 807
5. Fiedler, S.; Broecker, J.; Keller, S. Cell. Mol. Life Sci. 2010, 67, 1779
6. Dill, K. A. Biochemistry 1990, 29, 7133
7. Silvi, B. Phys. Rev. Lett. 1994, 73, 842
8. Bickelhaupt, F. M.; Baerends, E. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 4183
9. Weinhold, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 4188
10. Cioslowski, J.; Mixon, S. T. Can. J. Chem. 1992, 70, 443
11. Matta, C. F.; Herna ndez-Trujillo, J.; Tang, T.; Bader, R. F. W. Chem. - Eur. J. 2003, 9, 1940
12. Klein, R. A. Chem. Phys. Lett. 2006, 425, 128
13. Bader, R. F. W. Atoms in Molecules: A Quantum Theory; Oxford University Press: Oxford, U.K., 1990.
14. Espinosa, E.; Souhassou, M.; Lachekar, H.; Lecomte, C. Acta Crystallogr., Sect. B 1999, 55, 563
15. Grabowski, S. J. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 10739
16. Becke, A. D.; Edgecombe, K. E. J. Chem. Phys. 1990, 92, 5397
17. Silvi, B.; Savin, A. Nature 1994, 371, 683
18. Contreras-García, J.; Recio, J. M. Theor. Chem. Acc. DOI: 10.1007/s00214-010-0828-1.
19. Alikhani, M. E.; Fuster, F.; Silvi, B. Struct. Chem. 2005, 16, 203
20. Johnson, E. R.; Keinan, S.; Mori-Sánchez, P.; Contreras- García, J.; Cohen, A. J.; Yang, W. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 6498
21. Bohórquez, H. J.; Boyd, R. J. Theor. Chem. Acc. 2010, 127, 393
22. Arfken, G. Mathematical Methods for Physicists; Academic Press: Orlando, FL, 1985.
23. Bader, R. F. W.; Essén, H. J. Chem. Phys. 1984, 80, 1943
24. Noury, S.; Krokidis, X.; Fuster, F.; Silvi, B. Comput. Chem. 1999, 23, 597
25. Spackman, M. A.; Maslen, E. N. J. Phys. Chem. 1986, 90, 2020
26. Pendás, A. M.; Luaña, V.; Pueyo, L.; Francisco, E.; Mori-Sánchez, P. J. Chem. Phys. 2002, 117, 1017
27. Perdew, J. P.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1992, 45, 13244
28. DeLucia, M. L.; Coppens, P. Inorg. Chem. 1978, 17, 2336
29. Pritchina, E. A.; Gritsan, N. P.; Zibarev, A. V.; Bally, T. Inorg. Chem. 2009, 48, 4075
30. Gleiter, R. J. Chem. Soc. A 1970, 3174
31. Salahub, D. R.; Messmer, R. P. J. Chem. Phys. 1976, 64, 2039
32. Stevens, W. J.; Fink, W. H. Chem. Phys. Lett. 1987, 139, 15
33. Liu, S.; Rupic, C.; Mukhpadhayay, P.; Chakrabarti, S.; Zavalij, P. Y.; Isaacs, L. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1595
34. Jeon, W. S.; Moon, K.; Park, S. H.; Chun, H.; Ko, Y. H.; Lee, J. Y.; Samal, S.; Selvapalam, N.; Rekharsky, M. V.; Sindelar, V.; Sobransingh, D.; Inoue, Y.; Kaifer, A. E.; Kim, K. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12984
35. Rekharsky, M. V.; Mori, T.; Yang, C.; Ko, Y. H.; Selvapalam, N.; Kim, H.; Sobransingh, D.; Kaifer, A. E.; Liu, S.; Isaacs, L.; Chen, W.; Moghaddam, S.; K. Gilson, M. K.; Kim, K.; Inoue, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104, 20737
36. Liu, S.; Ruspic, C.; Mukhopadhyay, P.; Chakrabarti, S.; Zavalij, P. Y.; Isaacs, L. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 15959
37. Moghaddam, S.; Inoue, S.; Gilson, M. K. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 4012
38. Vannini, A.; Volpari, C.; Gallinari, P.; Jones, P.; Mattu, M.; Carfi, A.; Defrancesco, R.; Steinkuhler, C.; Di Marco, S. EMBO Rep. 2007, 8, 879
39. Popelier, P. L. A. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1873
40. Morrison, C. A.; Siddick, M. M. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2004, 116, 4884
41. Richardson, T. B.; de Gala, S.; Crabtree, R. H.; Siegbahn, P. E. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 12875
42. Klooster, W. T.; Koetzle, T. F.; Siegbahn, P. E. M.; Richardson, T. B.; Crabtree, R. H. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 6337
43. Johnson, E. R.; Wolkow, R. A.; DiLabio, G. A. Chem. Phys. Lett. 2004, 394, 334
44. Brown, M. P.; Heseltine, R. W. Chem. Commun. (London) 1968, 23, 1551