Enzyme-Catalyzed Substrate Attachment to Phage Surfaces for the Selection of Catalytic Activities

ChemBioChem

Volumn 12, Issue 3, 2011, Pages 380-386

  Sunbul, Murat ^a   Emerson, Nyssa ^a   Yin, Jun ^a  

^a UNIVERSITY OF CHICAGO   (United States)

Author keywords

Biotin ligase; Directed evolution; Phage display; Protein engineering; Streptavidin; Transferases

Indexed keywords

ARTICLE; BACTERIOPHAGE; CATALYSIS; ENZYME ACTIVITY; ENZYME SUBSTRATE; NONHUMAN; PHAGE DISPLAY; PRIORITY JOURNAL;

AMINO ACID SEQUENCE; BACTERIOPHAGES; BIOCATALYSIS; CARBON-NITROGEN LIGASES; ESCHERICHIA COLI; ESCHERICHIA COLI PROTEINS; PEPTIDES; PROTEIN ENGINEERING; REPRESSOR PROTEINS; SUBSTRATE SPECIFICITY;

EID: 79551538216     PISSN: 14394227     EISSN: 14397633     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.201000475     Document Type: Article

References (31)

1. A. Fernandez-Gacio, M. Uguen, J. Fastrez, Trends Biotechnol. 2003, 21, 408.
2. S. S. Sidhu, W. J. Fairbrother, K. Deshayes, ChemBioChem 2003, 4, 14.
3. G. P. Smith, V. A. Petrenko, Chem. Rev. 1997, 97, 391.
4. Y. Jin, J. Yu, Y. G. Yu, Chem. Biol. 2002, 9, 157.
5. J. Kasanov, G. Pirozzi, A. J. Uveges, B. K. Kay, Chem. Biol. 2001, 8, 231.
6. H. Leong, J. R. Sloan, P. D. Nash, G. L. Greene, Mol. Endocrinol. 2005, 19, 2930.
7. K. Ozaki, K. Inoue, H. Sato, A. Iida, Y. Ohnishi, A. Sekine, H. Sato, K. Odashiro, M. Nobuyoshi, M. Hori, Y. Nakamura, T. Tanaka, Nature 2004, 429, 72.
8. B. Xie, E. Tassi, M. R. Swift, K. McDonnell, E. T. Bowden, S. Wang, Y. Ueda, Y. Tomita, A. T. Riegel, A. Wellstein, J. Biol. Chem. 2006, 281, 1137.
9. A. Zucconi, L. Dente, E. Santonico, L. Castagnoli, G. Cesareni, J. Mol. Biol. 2001, 307, 1329.
10. C. F. Barbas III, D. R. Burton, J. K. Scott, G. J. Silverman, Phage Display, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2000.
11. B. K. Kay, J. Winter, J. McCafferty, Phage Display of Peptides and Proteins, Academic Press, Boston, 1996.
12. J. Yin, A. J. Lin, D. E. Golan, C. T. Walsh, Nat. Protoc. 2006, 1, 280.
13. J. L. Jestin, P. Kristensen, G. Winter, Angew. Chem. 1999, 111, 1196; Angew. Chem. Int. Ed. 1999, 38, 1124.
14. H. Pedersen, S. Holder, D. P. Sutherlin, U. Schwitter, D. S. King, P. G. Schultz, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1998, 95, 10523.
15. A. Y. Ting, K. Witte, K. Shah, B. Kraybill, K. M. Shokat, P. G. Schultz, Biopolymers 2001, 60, 220.
16. G. Xia, L. Chen, T. Sera, M. Fa, P. G. Schultz, F. E. Romesberg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 6597.
17. S. Demartis, A. Huber, F. Viti, L. Lozzi, L. Giovannoni, P. Neri, G. Winter, D. Neri, J. Mol. Biol. 1999, 286, 617.
18. C. Heinis, A. Huber, S. Demartis, J. Bertschinger, S. Melkko, L. Lozzi, P. Neri, D. Neri, Protein Eng. 2001, 14, 1043.
19. S. Atwell, J. A. Wells, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 9497.
20. K. R. Love, J. G. Swoboda, C. J. Noren, S. Walker, ChemBioChem 2006, 7, 753.
21. M. Sunbul, N. J. Marshall, Y. Zou, K. Zhang, J. Yin, J. Mol. Biol. 2009, 387, 883.
22. J. Yin, P. D. Straight, S. M. McLoughlin, Z. Zhou, A. J. Lin, D. E. Golan, N. L. Kelleher, R. Kolter, C. T. Walsh, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 15815.
23. M. Sunbul, M. Yen, Y. Zou, J. Yin, Chem. Commun. 2008, 5927.
24. D. Beckett, Annu. Rev. Genet. 2007, 41, 443.
25. A. Chapman-Smith, J. E. Cronan, Jr., Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 359.
26. R. N. Perham, Annu. Rev. Biochem. 2000, 69, 961.
27. P. K. Howard, J. Shaw, A. J. Otsuka, Gene 1985, 35, 321.
28. D. Beckett, E. Kovaleva, P. J. Schatz, Protein Sci. 1999, 8, 921.
29. I. Chen, M. Howarth, W. Lin, A. Y. Ting, Nat. Methods 2005, 2, 99.
30. C. F. Barbas III, A. S. Kang, R. A. Lerner, S. J. Benkovic, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 7978.
31. R. Crameri, M. Suter, Gene 1993, 137, 69.