Characterisation of a modified oligonucleotide together with its synthetic impurities using accurate mass measurements

Rapid Communications in Mass Spectrometry

Volumn 25, Issue 4, 2011, Pages 511-525

  Smith, Marco ^a  

^a GLAXOSMITHKLINE   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DATA HANDLING; DISEASE CONTROL; DNA SEQUENCES; DRUG PRODUCTS; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR WEIGHT; NEGATIVE IONS; RNA;

ACCURATE MASS MEASUREMENTS; ANTISENSE; AVERAGE MOLECULAR WEIGHT; CLINICAL DEVELOPMENT; DISEASE STATE; HIGH SPECIFICITY; MODIFIED OLIGONUCLEOTIDES; PHARMACEUTICAL INDUSTRY; PHARMACEUTICAL PRODUCTS; RNA INTERFERENCE;

OLIGONUCLEOTIDES;

EID: 79251522862     PISSN: 09514198     EISSN: 10970231     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/rcm.4886     Document Type: Article

References (31)

1. J. B. Opalinska, A. M. Gewirtz., Nat. Rev. Drug Discov. 2002, 1, 503.
2. A. L. Arnett, J. R. Chamberlain, J. S. Chamberlain., Curr. Opin. Genet. Dev. 2009, 19, 290.
3. J. C. van Deutekom, A. A. Janson, I. B. Ginjaar, W. S. Frankhuizen, A. Aartsma-Rus, M. Bremmer-Bout, J. T. den Dunnen, K. Koop, A. J. van der Kooi, N. M. Goemans, S. J. de Kimpe, P. F. Ekhart, E. H. Venneker, G. J. Platenburg, J. J. Verschuuren, G. J. B. van Ommen., New Eng. J. Med. 2007, 357, 2677.
4. M. Kinali, V. Arechavala-Gomeza, L. Feng, S. Cirak, D. Hunt, C. Adkin, M. Guglieri, E. Ashton, S. Abbs, P. Nihoyannopoulos, M. E. Garralda, M. Rutherford, C. Mcculley, L. Popplewell, I. R. Graham, G. Dickson, M. J. A. Wood, D. J. Wells, S. D. Wilton, R. Kole, V. Straub, K. Bushby, C. Sewry, J. E. Morgan, F. Muntoni., Lancet Neurol. 2009, 8, 918.
5. J. Wu, A. Steding, C. H. Becker., Rapid Commun. Mass Spectrom. 1993, 7, 142.
6. K. Tang, N. I. Tarrnenkno, S. L. Allman, L. Y. Ch'ang, K. B. Jacobson., Rapid Commun. Mass Spectrom. 1994, 8, 673.
7. U. Pieles, W. Zurcher, M. Schar, H. E. Moser., Nucleic Acids Res. 1993, 21, 3191.
8. C. M. Bentzley, M. V. Johnson, B. S. Larsen, S. Gutteridge., Anal. Chem. 1996, 68, 2141.
9. E. Nordhoff, F. Kirpekar, P. Roepstorff., Mass Spectrom Rev. 1997, 15, 67.
10. P. A. Limbach., Mass Spectrom. Rev. 1996, 15, 297.
11. C. G. Huber, H. Oberacher., Mass Spectrom Rev. 2001, 20, 310.
12. An. V. Willems, D. L. Deforce, W. E. Lambert, C. H. Van Peteghem, J. F. Van Bocxlaer., J. Chromatogr. A 2004, 1052, 93.
13. D. P. Little, T. W. Thannhauser, F. W. McLafferty., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 2318.
14. P. Juhasz, M. T. Roskey, I. P. Smirnov, L. A. Haff, M. L. Vestal, S. A. Martin., Anal. Chem. 1996, 68, 941.
15. M. W. Gardner, N. Li, A. D. Ellington, J. S. Brodbelt., J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2010, 21, 580.
16. S. I. Smith, J. S. Brodbelt., 22nd Sanibel Conference, 2010, poster presentation
17. S. A. McLuckey, G. J. Berkel, G. L. Glish., J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1992, 3, 60.
18. J. Ni, S. C. Pomerantz, J. Rozenski, Y. Zhang, J. A. McCloskey., Anal. Chem. 1996, 68, 1989.
19. A. Premstaller, C. Huber., Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001, 15, 1053.
20. U. Bahr, H. Aygun, M. Karas., Anal. Chem. 2009, 81, 3173.
21. J. Farand, F. Gosselin., Anal. Chem. 2009, 81, 3730.
22. M. Gilar, K. J. Fountain, Y. Budman, J. L. Holyoke, H. Davoudi, J. C. Gebler., Oligonucleotides 2003, 13, 229.
23. F. Sanger, S. Nicklen, A. R. Coulson., Proc. Natl. Acad. Sci. 1977, 74, 5463.
24. S. A. McLuckey, S. Habibi-Goudarzi., J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 740.
25. Z. Wang, K. X. Wan, R. Ramanathan, J. S. Taylor, M. L. Gross., J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1998, 9, 683.
26. S. Schurch, J. M. Tromp, T. M. Monn., Nucleosides, Nucleotides, Nucleic Acids 2007, 26, 1629.
27. J. M. Tromp, S. Schurch., J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005, 16, 1262.
28. S. Ouyang, M. A. Vairavamurthy., Proc. 47th ASMS Conf. Mass Spectrometry and Allied Topics, Dallas, 1999.
29. D. A. Eppstein, B. B. Schryver, Y. V. Marsh., J. Biol. Chem. 1986, 261, 5999.
30. F. Morvan, B. Rayner, J.-L. Imbach., Tetrahedron Lett. 1990, 31, 7149.
31. M. Cotton, B. Oberhauser, H. Brunar, A. Holzner, G. Issakides, C. R. Noe, G. Schaffner, E. Wagner, M. L. Birnstiel., Nucleic Acids Res. 1991, 19, 2629.