Proteome-wide protein concentrations in the human heart

Molecular BioSystems

Volumn 6, Issue 10, 2010, Pages 1917-1927

  Aye, Thin Thin ^a,b   Scholten, Arjen ^a,b   Taouatas, Nadia ^a,b   Varro, Andras ^d   Van Veen, Toon A B ^c   Vos, Marc A ^c   Heck, Albert J R ^a,b  

^a UTRECHT UNIVERSITY   (Netherlands)

^b NETHERLANDS PROTEOMICS CENTRE   (Netherlands)

^c UNIVERSITY MEDICAL CENTER UTRECHT   (Netherlands)

^d UNIVERSITY OF SZEGED   (Hungary)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MUSCLE PROTEIN; PHOSPHOPROTEIN PHOSPHATASE; PROTEIN KINASE; PROTEOME;

ARTICLE; ENZYMOLOGY; HEART VENTRICLE; HUMAN; LIQUID CHROMATOGRAPHY; METABOLISM; PHOSPHORYLATION; PROTEIN DATABASE; SIGNAL TRANSDUCTION; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

CHROMATOGRAPHY, LIQUID; DATABASES, PROTEIN; HEART VENTRICLES; HUMANS; MUSCLE PROTEINS; PHOSPHOPROTEIN PHOSPHATASES; PHOSPHORYLATION; PROTEIN KINASES; PROTEOME; SIGNAL TRANSDUCTION; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EID: 77956520064     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c004495d     Document Type: Article

References (47)

1. S. Arab A. O. Gramolini P. Ping T. Kislinger B. Stanley J. van Eyk M. Ouzounian D. H. MacLennan A. Emili P. P. Liu J. Am. Coll. Cardiol. 2006 48 1733 1741
2. E. McGregor M. J. Dunn Circ. Res. 2006 98 309 321
3. A. S. Jaffe J. Ravkilde R. Roberts U. Naslund F. S. Apple M. Galvani H. Katus Circulation 2000 102 1216 1220
4. J. A. Westbrook J. X. Wheeler R. Wait S. Y. Welson M. J. Dunn Electrophoresis 2006 27 1547 1555
5. K. G. Kline B. Frewen M. R. Bristow M. J. Maccoss C. C. Wu J. Proteome Res. 2008 7 5055 5061
6. S. Shenolikar Annu. Rev. Cell Biol. 1994 10 55 86
7. L. S. Maier T. Zhang L. Chen J. DeSantiago J. H. Brown D. M. Bers Circ. Res. 2003 92 904 911
8. N. Delmotte U. Kobold T. Meier A. Gallusser A. Strancar C. G. Huber Anal. Bioanal. Chem. 2007 389 1065 1074
9. D. R. Zakhary C. S. Moravec R. W. Stewart M. Bond Circulation 1999 99 505 510
10. B. Zhang N. C. VerBerkmoes M. A. Langston E. Uberbacher R. L. Hettich N. F. Samatova J. Proteome Res. 2006 5 2909 2918
11. W. M. Old K. Meyer-Arendt L. Aveline-Wolf K. G. Pierce A. Mendoza J. R. Sevinsky K. A. Resing N. G. Ahn Mol. Cell. Proteomics 2005 4 1487 1502
12. P. Lu C. Vogel R. Wang X. Yao E. M. Marcotte Nat. Biotechnol. 2007 25 117 124
13. J. Malmstrom M. Beck A. Schmidt V. Lange E. W. Deutsch R. Aebersold Nature 2009 460 762 765
14. A. Scholten M. K. Poh T. A. van Veen B. van Breukelen M. A. Vos A. J. Heck J. Proteome Res. 2006 5 1435 1447
15. L. N. Mueller M. Y. Brusniak D. R. Mani R. Aebersold J. Proteome Res. 2008 7 51 61
16. A. Scholten T. T. Aye A. J. Heck Mass Spectrom. Rev. 2008 27 331 353
17. G. S. Omenn D. J. States M. Adamski T. W. Blackwell R. Menon H. Hermjakob R. Apweiler B. B. Haab R. J. Simpson J. S. Eddes E. A. Kapp R. L. Moritz D. W. Chan A. J. Rai A. Admon R. Aebersold J. Eng W. S. Hancock S. A. Hefta H. Meyer Y. K. Paik J. S. Yoo P. Ping J. Pounds J. Adkins X. Qian R. Wang V. Wasinger C. Y. Wu X. Zhao R. Zeng A. Archakov A. Tsugita I. Beer A. Pandey M. Pisano P. Andrews H. Tammen D. W. Speicher S. M. Hanash Proteomics 2005 5 3226 3245
18. L. S. Maier Front. Biosci. 2009 14 486 496
19. C. J. Vlahos S. A. McDowell A. Clerk Nat. Rev. Drug Discovery 2003 2 99 113
20. G. Manning D. B. Whyte R. Martinez T. Hunter S. Sudarsanam Science 2002 298 1912 1934
21. Y. Wang Circulation 2007 116 1413 1423
22. L. F. Couchonnal M. E. Anderson Physiology (Bethesda) 2008 23 151 159
23. J. R. Mauban M. O'Donnell S. Warrier S. Manni M. Bond Physiology (Bethesda) 2009 24 78 87
24. G. E. Hannigan C. Leung-Hagesteijn L. Fitz-Gibbon M. G. Coppolino G. Radeva J. Filmus J. C. Bell S. Dedhar Nature 1996 379 91 96
25. C. L. Antos T. A. McKinsey N. Frey W. Kutschke J. McAnally J. M. Shelton J. A. Richardson J. A. Hill E. N. Olson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 907 912
26. D. M. Watterson J. P. Schavocky L. Guo C. Weiss A. Chlenski V. P. Shirinsky L. J. Van Eldik J. Haiech J. Cell. Biochem. 1999 75 481 491
27. K. D. Min M. Asakura Y. Liao K. Nakamaru H. Okazaki T. Takahashi K. Fujimoto S. Ito A. Takahashi H. Asanuma S. Yamazaki T. Minamino S. Sanada O. Seguchi A. Nakano Y. Ando T. Otsuka H. Furukawa T. Isomura S. Takashima N. Mochizuki M. Kitakaze Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010 393 55 60
28. A. Hergovich M. R. Stegert D. Schmitz B. A. Hemmings Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2006 7 253 264
29. R. Pfeifer M. Ferrari A. Borner T. Deufel H. R. Figulla Resuscitation 2008 79 46 53
30. E. Delpire K. B. Gagnon Biochem. J. 2008 409 321 331
31. M. Tamari Y. Daigo Y. Nakamura J. Hum. Genet. 1999 44 116 120
32. K. I. Patterson T. Brummer P. M. O'Brien R. J. Daly Biochem. J. 2009 418 475 489
33. S. Lemeer A. J. Heck Curr. Opin. Chem. Biol. 2009 13 4 414 420
34. D. Schwartz S. P. Gygi Nat. Biotechnol. 2005 23 1391 1398
35. K. Cieslik C. M. Lee J. L. Tang K. K. Wu J. Biol. Chem. 1999 274 34669 34675
36. R. Linding L. J. Jensen G. J. Ostheimer M. A. van Vugt C. Jorgensen I. M. Miron F. Diella K. Colwill L. Taylor K. Elder P. Metalnikov V. Nguyen A. Pasculescu J. Jin J. G. Park L. D. Samson J. R. Woodgett R. B. Russell P. Bork M. B. Yaffe T. Pawson Cell 2007 129 1415 1426
37. S. Sadayappan J. Gulick H. Osinska L. A. Martin H. S. Hahn G. W. Dorn, 2nd R. Klevitsky C. E. Seidman J. G. Seidman J. Robbins J. N. Lorenz M. Sargent J. D. Molkentin Circ. Res. 2005 97 1156 1163
38. S. Sadayappan H. Osinska R. Klevitsky J. N. Lorenz M. Sargent J. D. Molkentin C. E. Seidman J. G. Seidman J. Robbins J. Gulick L. A. Martin H. S. Hahn G. W. Dorn, 2nd Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 16918 16923
39. H. Haase Cardiovasc. Res. 2007 73 19 25
40. K. N. Dalby N. Morrice F. B. Caudwell J. Avruch P. Cohen J. Biol. Chem. 1998 273 1496 1505
41. T. T. Aye S. Mohammed H. W. van den Toorn T. A. van Veen M. A. van der Heyden A. Scholten A. J. Heck Mol. Cell. Proteomics 2009 8 1016 1028
42. J. W. Gouw B. B. Tops P. Mortensen A. J. Heck J. Krijgsveld Anal. Chem. 2008 80 7796 7803
43. S. Gauci A. O. Helbig M. Slijper J. Krijgsveld A. J. Heck S. Mohammed Anal. Chem. 2009 81 4493 4501
44. N. Taouatas M. M. Drugan A. J. Heck S. Mohammed Nat. Methods 2008 5 405 407
45. J. E. Elias S. P. Gygi Nat. Methods 2007 4 207 214
46. P. Mortensen J. W. Gouw J. V. Olsen S. E. Ong K. T. Rigbolt J. Bunkenborg J. Cox L. J. Foster A. J. Heck B. Blagoev J. S. Andersen M. Mann J. Proteome Res. 2010 9 1 393 403
47. J. C. Braisted S. Kuntumalla C. Vogel E. M. Marcotte A. R. Rodrigues R. Wang S. T. Huang E. S. Ferlanti A. I. Saeed R. D. Fleischmann S. N. Peterson R. Pieper BMC Bioinformatics 2008 9 529