Characterization of perfluorooctylbromide-based nanoemulsion particles using atomistic molecular dynamics simulations

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 31, 2010, Pages 10086-10096

  Lee, Sun Joo ^a   Olsen, Brett ^a   Schlesinger, Paul H ^a   Baker, Nathan A ^a  

^a WASHINGTON UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; BROMINE; DYNAMICS; EMULSIFICATION; MECHANICAL PROPERTIES; MOLECULAR DYNAMICS; MONOLAYERS; PHOSPHOLIPIDS;

ATOMISTIC MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; CELLULAR DELIVERY; COARSE-GRAINED; DELIVERY MECHANISM; DIRECT CONTACT; EXPERIMENTAL DATA; FIELD PARAMETERS; FORCE FIELD PARAMETERS; IMAGING APPLICATIONS; INTERFACE STRUCTURES; LIPID MONOLAYER; MELITTIN; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; MOLECULAR LEVELS; NANOEMULSION; PERFLUOROCARBONS; PHENOMENOLOGICAL MODELS; PHOSPHATIDYLCHOLINE; PLANAR CONFIGURATIONS; STRUCTURAL DETAILS; THERAPEUTIC AGENTS; TRYPTOPHAN FLUORESCENCE;

COMPUTER SIMULATION;

EID: 77955312522     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp103228c     Document Type: Article

References (68)

1. Wagner, V.; Dullaart, A.; Bock, A.-K.; Zweck, A. Nat. Biotechnol. 2006, 24, 1211-1217
2. Soppimath, K. S.; Aminabhavi, T. M.; Kulkarni, A. R.; Rudzinski, W. E. J. Controlled Release 2001, 70, 1-20
3. Wang, I. C.; Tai, L. A.; Lee, D. D.; Kanakamma, P. P.; Shen, C. K. F.; Luh, T.-Y.; Cheng, C. H.; Hwang, K. C. J. Med. Chem. 1999, 42, 4614-4620
4. Pradhan, P.; Giri, J.; Samanta, G.; Sarma, H. D.; Mishra, K. P.; Bellare, J.; Banerjee, R.; Bahadur, D. J. Biomed. Mater. Res. B 2007, 81B, 12-22
5. Winter, P. M.; Caruthers, S. D.; Kassner, A.; Harris, T. D.; Chinen, L. K.; Allen, J. S.; Lacy, E. K.; Zhang, H.; Robertson, J. D.; Wickline, S. A.; Lanza, G. M. Cancer Res. 2003, 63, 5838-5843
6. Winter, P. M.; Morawski, A. M.; Caruthers, S. D.; Fuhrhop, R. W.; Zhang, H.; Williams, T. A.; Allen, J. S.; Lacy, E. K.; Robertson, J. D.; Lanza, G. M.; Wickline, S. A. Circulation 2003, 108, 2270-2274
7. Bührer-Sékula, S.; Smits, H. L.; Gussenhoven, G. C.; van Leeuwen, J.; Amador, S.; Fujiwara, T. T.; Klatser, P. R.; Oskam, L. J. Clin. Microbiol. 2003, 41, 1991-1995
8. Woo, K. M.; Jun, J.-H.; Chen, V. J.; Seo, J.; Baek, J.-H.; Ryoo, H.-m.; Kim, G.-S.; Somerman, M. J.; Ma, P. X. Biomaterials 2007, 28, 335-343
9. Weiland, J. D.; Liu, W.; Humayun, M. S. Annu. Rev. Biomed. Eng. 2005, 7, 361-401
10. Caruthers, S. D.; Wickline, S. A.; Lanza, G. M. Curr. Opin. Biotechol. 2007, 18, 26-30
11. Winter, P. M.; Neubauer, A. M.; Caruthers, S. D.; Harris, T. D.; Robertson, J. D.; Williams, T. A.; Schmieder, A. H.; Hu, G.; Allen, J. S.; Lacy, E. K.; Zhang, H.; Wickline, S. A.; Lanza, G. M. Arterioscler., Thromb., Vasc. Biol. 2006, 26, 2103-2109
12. Kaneda, M.; Caruthers, S.; Lanza, G.; Wickline, S. Ann. Biomed. Eng. 2009, 37, 1922-1933
13. Soman, N. R.; Lanza, G. M.; Heuser, J. M.; Schlesinger, P. H.; Wickline, S. A. Nano Lett. 2008, 8, 1131-1136
14. Mattrey, R. F.; Scheible, F. W.; Gosink, B. B.; Leopold, G. R.; Long, D. M.; Higgins, C. B. Radiology 1982, 145, 759-762
15. Mattrey, R. F. Am. J. Roentgenol. 1989, 152, 247-252
16. Mattrey, R. F.; Long, D. M. Invest. Radiol. 1988, 23 (Suppl. 1) S298-S301
17. André, M.; Nelson, T.; Mattrey, R. Invest. Radiol. 1990, 25, 983-987
18. Weers, J. G. J. Fluorine Chem. 1993, 64, 73-93
19. Rossi, M. Use of Lecithin and Lecithin Fractions. In Bioactive Egg Compounds; Huopalahti, R.; Lopez-Fandino, R.; Anton, M.; Schade, R., Eds.; Springer: Berlin Heidelberg, 2007.
20. Morawski, A. M.; Winter, P. M.; Yu, X.; Fuhrhop, R. W.; Scott, M. J.; Hockett, F.; Robertson, D. D.; Gaffney, P. J.; Lanza, G. M.; Wickline, S. A. Magnet. Reson. Med. 2004, 52, 1255-1262
21. Neubauer, A. M.; Caruthers, S. D.; Hockett, F. D.; Cyrus, T.; Robertson, J. D.; Allen, J. S.; Williams, T. D.; Fuhrhop, R. W.; Lanza, G. M.; Wickline, S. A. J. Cardiovasc. Magn. Reson. 2007, 9, 565-573
22. Partlow, K. C.; Chen, J.; Brant, J. A.; Neubauer, A. M.; Meyerrose, T. E.; Creer, M. H.; Nolta, J. A.; Caruthers, S. D.; Lanza, G. M.; Wickline, S. A. FASEB J. 2007, 21, 1647-1654
23. Soman, N. R.; Baldwin, S. L.; Hu, G.; Marsh, J. N.; Lanza, G. M.; Heuser, J. E.; Arbeit, J. M.; Wickline, S. A.; Schlesinger, P. H. J. Clin. Invest. 2009, 119, 2830-2842
24. Partlow, K. C.; Lanza, G. M.; Wickline, S. A. Biomaterials 2008, 29, 3367-3375
25. Lanza, G. M.; Yu, X.; Winter, P. M.; Abendschein, D. R.; Karukstis, K. K.; Scott, M. J.; Chinen, L. K.; Fuhrhop, R. W.; Scherrer, D. E.; Wickline, S. A. Circulation 2002, 106, 2842-2847
26. Yang, L.; Huang, H. W. Science 2002, 297, 1877-1879
27. Bolen, E. J.; Holloway, P. W. Biochemistry 1990, 29, 9638-9643
28. Chambers, R. D.; Sandford, G.; Shah, A. Synth. Commun. 1996, 26, 1861-1866
29. Berger, O.; Edholm, O.; Jähnig, F. Biophys. J. 1997, 72, 2002-2013
30. Lindahl, E.; Edholm, O. J. Chem. Phys. 2000, 113, 3882-3893
31. Tieleman, D. P.; MacCallum, J. L.; Ash, W. L.; Kandt, C.; Xu, Z.; Monticelli, L. J. Phys.: Condens. Matter 2006, 18, S1221-S1234
32. Gurtovenko, A. A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 244902+
33. Olsen, B. N.; Schlesinger, P. H.; Baker, N. A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 4854-4865
34. Shin, S.; Collazo, N.; Rice, S. A. J. Chem. Phys. 1992, 96, 1352-1366
35. Hariharan, A.; Harris, J. G. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4156-4165
36. Cui, S. T.; Siepmann, J. I.; Cochran, H. D.; Cummings, P. T. Fluid Phase Equilib. 1998, 146, 51-61
37. Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225-11236
38. Peterson, K. A.; Figgen, D.; Goll, E.; Stoll, H.; Dolg, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 11113-11123
39. Ryckaert, J.-P.; Bellemans, A. Faraday Discuss. Chem. Soc. 1978, 66, 95-106
40. Besler, B. H.; Merz, K. M.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1990, 11, 431-439
41. Henneré, G.; Prognon, P.; Brion, F.; Nicolis, I. Chem. Phys. Lipids 2009, 157, 86-93
42. Mashl, R. J.; Scott, H. L.; Subramaniam, S.; Jakobsson, E. Biophys. J. 2001, 81, 3005-3015
43. Hristova, K.; Dempsey, C. E.; White, S. H. Biophys. J. 2001, 80, 801-811
44. Chiu, S.-W.; Clark, M. M.; Balaji, V.; Subramaniam, S.; Scott, H. L.; Jakobsson, E. Biophys. J. 1995, 69, 1230-1245
45. Berendsen, H. J. C.; Grigera, J. R.; Straatsma, T. P. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6269-6271
46. Kaminski, G. A.; Friesner, R. A.; Tirado-Rives, J.; Jorgensen, W. L. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6474-6487
47. Chakrabarti, N.; Neale, C.; Payandeh, J.; Pai, E. F.; Pomès, R. Biophys. J. 2010, 98, 784-792
48. Hess, B.; Kutzner, C.; van der Spoel, D.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 435-447
49. Lee, S.-J.; Song, Y.; Baker, N. A. Biophys. J. 2008, 94, 3565-3576
50. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092
51. Parrinello, M.; Rahman, A. J. Appl. Phys. 1981, 52, 7182-7190
52. Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695-1697
53. Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C.; Fraaije, J. G. E. M. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463-1472
54. Grossfield, A.; Zuckerman, D. M. Annu. Rep. Comput. Chem. 2009, 5, 23-48
55. Kučerka, N.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. J. Membr. Biol. 2006, 208, 193-202
56. Jójárt, B.; Martinek, T. A. J. Comput. Chem. 2007, 28, 2051-2058
57. Gerber, F.; Krafft, M. P.; Vandamme, T. F.; Goldmann, M.; Fontaine, P. Biophys. J. 2006, 90, 3184-3192
58. Patra, M.; Salonen, E.; Terama, E.; Vattulainen, I.; Faller, R.; Lee, B. W.; Holopainen, J.; Karttunen, M. Biophys. J. 2006, 90, 1121-1135
59. Gurtovenko, A. A.; Vattulainen, I. J. Chem. Phys. 2009, 130, 215107+
60. Sachs, J. N.; Crozier, P. S.; Woolf, T. B. J. Chem. Phys. 2004, 121, 10847-10851
61. Ladokhin, A. S.; Holloway, P. W. Biophys. J. 1995, 69, 506-517
62. Song, W.; Rossky, P. J.; Maroncelli, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 9145-9162
63. Baoukina, S.; Monticelli, L.; Risselada, H. J.; Marrink, S. J.; Tieleman, D. P. Proc. Natl. Acad. Sci. 2008, 105, 10803-10808
64. Laing, C.; Baoukina, S.; Tieleman, D. P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 1916-1922
65. Yokoyama, H.; Nakahara, H.; Nakagawa, T.; Shimono, S.; Sueishi, K.; Shibata, O. J. Colloid Interface Sci. 2009, 337, 191-200
66. Riess, J. G. Chem. Rev. 2001, 101, 2797-2920
67. Gregor, T.; Schmalisch, G.; Burkhardt, W.; Proquitté, H.; Wauer, R. R.; Rüdiger, M. Intensive Care Med. 2003, 29, 1354-1360
68. Faithfull, N. S.; Weers, J. G. US Patent 5655521 August 1997.