Coil-stretch transition of DNA molecules in slitlike confinement

Macromolecules

Volumn 43, Issue 6, 2010, Pages 3081-3089

  Tang, Jing ^a   Trahan, Daniel W ^a   Doyle, Patrick S ^a  

^a Massachusetts Institute of Technology Cambridge   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COIL-STRETCH TRANSITION; CRITICAL STRAINS; DNA MOLECULES; DUMBBELL MODEL; EXPERIMENTAL OBSERVATION; SINGLE DNA MOLECULES; TWO STAGE;

DNA; ELECTRIC FIELDS; GENES;

STRAIN RATE;

EID: 77951919220     PISSN: 00249297     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ma902689c     Document Type: Article

References (40)

1. Han, J.; Craighead, H. G. Science 2000, 288, 1026.
2. Doyle, P. S.; Bibette, J.; Bancaud, A.; Viovy, J.-L. Science 2002, 295, 2237.
3. Chan, E. Y.; Goncalves, N. M.; Haeusler, R. A.; Hatch, A. J.; Larson, J. W.; Maletta, A. M.; Yantz, G. R.; Carstea, E. D.; Fuchs, M.; Wong, G. G.; Gullans, S. R.; Gilmanshin, R. Genome Res. 2004, 14, 1137.
4. Jo, K.; Dhingra, D. M.; Odijk, T.; de Pablo, J. J.; Graham, M. D.; Runnheim, R.; Forrest, D.; Schwartz, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 2673.
5. Brochard, F.; de Gennes, P. G. J. Chem. Phys. 1977, 67, 52.
6. Daoud, M.; de Gennes, P. G. J. Phys. (Paris) 1977, 38, 85.
7. Brochard, F. J. Phys. (Paris) 1977, 38, 1285.
8. Odijk, T. Macromolecules 1983, 16, 1340.
9. Guo, L. J.; Cheng, X.; Chou, C. F. Nano Lett. 2004, 4, 69.
10. Reisner, W.; Morton, K. J.; Riehn, R.; Wang, Y. M.; Yu, Z. N.; Rosen, M.; Sturm, J. C.; Chou, S. Y.; Frey, E.; Austin, R. H. Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 196101.
11. Mannion, J. T.; Reccius, C. H.; Cross, J. D.; Craighead, H. G. Biophys. J. 2006, 90, 4538.
12. Douville, N.; Huh, D.; Takayama, S. Anal. Bioanal. Chem. 2008, 391, 2395.
13. Zhang, C.; Zhang, F.; van Kan, J. A.; van der Maarel, J. R. C. J. Chem. Phys. 2008, 128, 225109.
14. Balducci, A. G.; Tang, J.; Doyle, P. S. Macromolecules 2008, 41, 9914.
15. de Gennes, P. G. J. Chem. Phys. 1974, 60, 5030.
16. Hsieh, C.-C.; Doyle, P. S. Korea-Aust. Rheol. J. 2008, 20, 127.
17. Balducci, A.; Hsieh, C. C.; Doyle, P. S. Phys. Rev. Lett. 2007, 99, 238102.
18. Perkins, T. T.; Smith, D. E.; Chu, S. Science 1997, 276, 2016.
19. Smith, D. E.; Chu, S. Science 1998, 281, 1335.
20. Schroeder, C. M.; Babcock, H. P.; Shaqfeh, E. S. G.; Chu, S. Science 2003, 301, 1515.
21. Schroeder, C M.; Shaqfeh, E. S. G.; Chu, S. Macromolecules 2004, 37, 9242.
22. Gerashchenko, S.; Steinberg, V. Phys. Rev. E 2008, 78, 040801(R).
23. Juang, Y. J.; Wang, S.; Hu, X.; Lee, L. J. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 268105.
24. Tang, J.; Doyle, P. S. Appl. Phys. Lett. 2007, 90, 224103.
25. Larson, R. G.; Magda, J. J. Macromolecules 1989, 22, 3004.
26. Vincenzi, D.; Bodenschatz, E. J. Phys. A 2006, 39, 10691.
27. Celani, A.; Puliafito, A.; Vincenzi, D. Phys. Rev. Lett. 2006, 97, 118301.
28. Bakajin, O. B.; Duke, T. A. J.; Chou, C. F.; Chan, S. S.; Austin, R. H.; Cox, E. C. Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 2737.
29. Balducci, A.; Mao, P.; Han, J. Y.; Doyle, P. S. Macromolecules 2006, 39, 6273.
30. Hsieh, C.-C.; Balducci, A.; Doyle, P. S. Macromolecules 2007, 40, 5196.
31. Deen, W. M. Analysis of Transport Phenomena; Oxford University Press: New York, 1998.
32. Randall, G. C.; Doyle, P. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 10813.
33. Mao, P.; Han, J. Y. Lab Chip 2005, 5, 837.
34. Hsieh, C.-C.; Balducci, A.; Doyle, P. S. Nano Lett. 2008, 8, 1683.
35. Long, D.; Dobrynin, A. V.; Rubinstein, M.; Ajdari, A. J. Chem. Phys. 1998, 108, 1234.
36. Bird, R. B.; Curtiss, C. F.; Armstrong, R. C.; Hassager, O. Dynamics of Polymeric Liquids, 2nd ed.; Wiley-Interscience: New York, 1987; Vol.2.
37. Marko, J. F.; Siggia, E. D. Macromolecules 1995, 28, 8759.
38. Rubinstein, M.; Colby, R. H. Polymer Physics; Oxford University Press: New York, 2003.
39. Beck, V. A.; Shaqfeh, E. S. G. J. Chem. Phys. 2006, 124, 094902.
40. Beck, V. A.; Shaqfeh, E. S. G. J. Rheol. 2007, 51, 561.