DFT study on the catalytic reactivity of a functional model complex for intradiol-cleaving dioxygenases

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 17, 2010, Pages 5878-5885

  Georgiev, Valentin ^a   Noack, Holger ^a   Borowski, Tomasz ^a   Blomberg, Margareta R A ^a   Siegbahn, Per E M ^a  

^a STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOMIMETICS; CATALYSIS; CATALYTIC OXIDATION; CHEMICAL BONDS; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; ENZYMES; REACTION INTERMEDIATES; TRANSITION METALS;

ACTIVATION BARRIERS; C-C BOND CLEAVAGES; CATALYTIC CYCLES; CATALYTIC REACTIVITY; CATECHOL DERIVATIVES; FUNCTIONAL MODEL; LIGAND COORDINATION; TRANSITION METAL SYSTEM;

IRON COMPOUNDS;

EID: 77951788403     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp911217j     Document Type: Article

References (35)

1. Hayaishi, O.; Katagiri, M.; Rothberg, S. J. Am. Chem. Soc. 1955, 77, 5450
2. Que, L., Jr. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 182
3. Kovaleva, E. D.; Lipscomb, J. D. Science 2007, 316, 453-457
4. Kovaleva, E. D.; Neibergall, M. B.; Chakrabarty, S.; Lipscomb, J. D. Acc. Chem. Res. 2007, 40, 475-483
5. Siegbahn, P. E. M.; Haeffner, F. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 8919
6. Funabiki, T.; Yamazaki, T. J. Mol. Catal. A 1999, 150, 37
7. Borowski, T.; Georgiev, V.; Siegbahn, P. E. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17303
8. Georgiev, V.; Borowski, T.; Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M. J. Biol. Inorg. Chem. 2008, 13, 929
9. Borowski, T.; Siegbahn, P. E. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128 (39) 12941
10. Xin, M.; Bugg, T. D. H. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130 (31) 10423
11. Cox, D. D.; Que, L., Jr. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 8085
12. Bruijnincx, P. C. A.; Lutz, M.; Spek, A. L.; Hagen, W. R.; van Koten, G.; Klein Gebbink, R. J. M. Inorg. Chem. 2007, 46, 8391
13. Koch, W. O.; Krüger, H.-J. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1995, 34, 2671
14. Walsh, T. A.; Ballou, D. P.; Mayer, R.; Que, L., Jr. J. Biol. Chem. 1983, 258, 14422
15. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785
16. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1992, 96, 2155
17. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1992, 97, 9173
18. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648
19. Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11623
20. Reiher, M.; Salomon, O.; Hess, B. A. Theor. Chem. Acc. 2001, 107, 48
21. Salomon, O.; Reiher, M.; Hess, B. A. J. Chem. Phys. 2002, 117, 4729
22. Oregon "Jaguar 5.5"; Schrödinger, Inc.: Portland, 2000.
23. Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 299
24. Siegbahn, P. E. M. In Advances in Chemical Physics: New Methods in Computational Quantum Mechanics; Prigogine, I.; Rice, S. A., Eds.; John Wiley & Sons: London, 1996.
25. Recent advances in density functional methods, part II; Chong, D. P., Ed.; World Scientific: Singapore, 1997.
26. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision D.01; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
27. Grimme, S. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1463
28. Grimme, S. J. Comput. Chem. 2006, 27, 1787
29. Tannor, D. J.; Marten, B.; Murphy, R.; Friesner, R. A.; Sitkoff, D.; Nicholls, A.; Honig, B.; Ringnalda, M.; Goddard, W. A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11875
30. Marten, B.; Kim, K.; Cortis, C.; Friesner, R. A.; Murphy, R. B.; Ringnalda, M. N.; Sitkoff, D.; Honig, B. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11775
31. Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A. Chem. Rev. 2000, 100, 421
32. Siegbahn, P. E. M. J. Comput. Chem. 2001, 22, 1634
33. Costas, M.; Mehn, M. P.; Jensen, M. P.; Que, L. Chem. Rev. 2004, 104, 939
34. Georgiev, V.; Borowski, T.; Siegbahn, P. E. M. J. Biol. Inorg. Chem. 2006, 11, 571
35. Groce, S. L.; Lipscomb, J. D. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11780