Ultrafast bond twisting dynamics in amyloid fibril sensor

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 7, 2010, Pages 2541-2546

  Singh, Prabhat K ^a   Kumbhakar, Manoj ^a   Pal, Haridas ^a   Nath, Sukhendu ^a  

^a BHABHA ATOMIC RESEARCH CENTRE   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EMISSION SPECTROSCOPY; EXCITED STATES; FLUORESCENCE; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; GLYCOPROTEINS; PHOTOEXCITATION; QUANTUM CHEMISTRY; SENSORS;

AMYLOID FIBRIL; DYNAMIC STOKES SHIFT; FLUORESCENCE DECAYS; FLUORESCENCE SENSING; INTRAMOLECULAR CHARGE TRANSFERS; QUANTUM CHEMICAL CALCULATIONS; SINGLE BOND; SPECTRAL WIDTHS; SUBPICOSECOND; THIOFLAVIN T; TIME CONSTANTS; TIME DOMAIN; TIME-RESOLVED EMISSION SPECTRA; TIME-RESOLVED FLUORESCENCE; TIME-RESOLVED FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; TWISTED STATE; ULTRA-FAST; ULTRA-FAST DYNAMICS;

QUANTUM THEORY;

EID: 77249163891     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp911544r     Document Type: Article

References (47)

1. Chiti, F.; Dobson, C. M. Annu. Rev. Biochem. 2006, 75, 333.
2. Gestwicki, J. E.; Crabteee, G. R.; Graef, I. A. Science 2004, 306, 865.
3. Gilead, S.; Gazit, E. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 4041.
4. Mishra, R.; Winter, R. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 6518.
5. Singh, P. K.; Kumbhakar, M.; Pal, H.; Nath, S. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 8532.
6. Maskevich, A. A.; Stsiapura, V. I.; Kuzmitsky, V. A.; Kuznetsova, I. M.; Povarova, O. I.; Uversky, V. N.; Turoverov, K. K. J. Proteome Res. 2007, 6, 1392.
7. Ban, T.; Yamaguchi, K.; Goto, Y. Acc. Chem. Res. 2006, 39, 663.
8. Cabaleiro-Lago, C; Quinlan-Pluck, F.; Lynch, L; Lindman, S.; Minogue, A. M.; Thulin, E.; Walsh, D. M.; Dawson, K. A.; Linse, S. J. Am. Chem. Soc 2008, 130, 15437.
9. LeVine, H., III. Protein Sci. 1993, 2, 404.
10. Vetei, V.; Canale, C.; Relini, A.; Librizzi, F.; Militello, V.; Gliozzi, A.; Leone, M. Biophys. Chem. 2007, 125, 184.
11. Khurana, R.; Coleman, C.; lonescu-Zanetti, C.; Carter, S. A.; Krishna, V.; Graver, R. K.; Roy, R.; Singh, S. J. Struct. Biol 2005, 151, 229.
12. Groenning, M.; Olsen, L.; van de Weert, M.; Flink, J. M.; Frokjaer, S.; Jørgensen, F. S. J. Struct. Biol 2007, 158, 358.
13. Kitts, C. C.; Bout, D. A. V. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 12090.
14. Sabate, R.; Saupe, S. J. Biochem. Biophys. Res. Commun, 2007, 360, 135.
15. Rodrliguez, C; Sánchez de Groot, N.; Rimola, A.; Alvarez-Larena, A.; Lloveras, V.; Vidal-Gancedo, J.; Ventura, S.; Vendrell, J.; Sodupe, M.; Gonzalez-Duarte, P. J. Am. Chem. Soc 2009, 131, 1436.
16. Groenning, M.; Norrman, M.; Flink, J. M.; van de Weert, M.; Bukrinsky, J. T.; Schluckebier, G.; Frokjaer, S. J. Struct. Biol. 2007, 159, 483.
17. Ahn, J. S.; Lee, J.-H.; Kim, J.-H.; Paik, S. R. Anal. Biochem. 2007, 367, 259.
18. Ferguson, N.; Berriman, J.; Petrovich, M.; Sharpe, T. D.; Finch, J. T.; Fersht, A. R. Proc. Natl Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 9814.
19. Schirra, R. Chem. Phys. Lett. 1985, 119, 463.
20. Raj, C. R.; Ramaraj, R. Photochem. Photobiol. 2001, 74, 752.
21. Sabate, R.; Lascu, I.; Saupe, S. J. J. Struct. Biol. 2008, 162, 387.
22. Friedhoff, P.; Schneider, A.; Mandelkow, E.-M.; Mandelkow, E. Biochemstry 1998, 37, 10223.
23. Raj, C. R.; Ramaraj, R. Photochem. Photobiol. A: Chem. 1999, 122, 39.
24. Manno, M.; Giacomazza, D.; Newman, J.; Martorana, V.; Biagio, P. L. S. Langmuir, published online Nov 13, 2009, http://dx.doi.org/10.1021/la903340v.
25. Velapoldi, R. A.; Mielenz, K. D. Natl. Bur. Stand. (U.S.) Spec. Publ 1980, 260.
26. Singh, P. K.; Nath, S.; Bhasikuttan, A. C; Kumbhakar, M.; Mohanty, J.; Sarkar, S. K.; Mukherjee, T.; Pal, H. J. Chem. Phys. 2008, 129, 114504.
27. O'Connor, D. V.; Phillips, D. Time Correlated Single Photon Counting; Academic Press: New York, 1984.
28. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
29. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1998, 37, 785.
30. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M. Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Steatmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
31. Barone, V.; Cossi, M. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1995.
32. Maroncelli, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1987, 86, 6221.
33. Koti, A. S. R.; Periasamy, N. J. Chem. Phys. 2001, 115, 7094.
34. Koti, A. S. R.; Krishna, M. M. G.; Periasamy, N. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 1767.
35. Rocker, C.; Heilemann, A.; Fromherz, P. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12172.
36. Volchkov, V. V.; Hoa, G. H. B.; Kossanyi, J. A.; Gromov, S. P.; Alfimov, M. V.; Uzhinov, B. M. Phys. Org. Chem. 2005, 18, 21.
37. Huang, Y.; Cheng, T.; Li, F.; Huang, C.-H.; Wang, S.; Huang, W.; Gong, Q. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 10041.
38. van Veldhoven, E.; Zhang, H.; Rettig, W.; Brown, R. G.; Hepworth, J. D.; Glasbeek, M. Chem. Phys. Lett. 2002, 363, 189.
39. Hawe, A.; Sutter, M.; Jiskoot, W. Pharm. Res. 2008, 25, 1487.
40. Stsiapura, V. I.; Maskevich, A. A.; Kuzmitsky, V. A.; Uversky, V. N.; Kuznetsova, I. M.; Turoverov, K. K. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 15893.
41. Grabowski, Z. R.; Rotkiewicz, K.; Rettig, W. Chem, Rev. 2003, 103, 3899, and references therein.
42. Glasbeek, M.; Zhang, H. Chem. Rev. 2004, 104, 1929.
43. Oster, G.; Nishijima, Y. J. Am. Chem. Soc. 1956, 78, 1581.
44. Loutfy, R. O.; Arnold, B. A. J. Phys. Chem. 1982, 86, 4205.
45. Fodera, V.; Groenning, M.; Vetri, V.; Librizzi, F.; Spagnolo, S.; Cornett, C.; Olsen, L.; van. de Weert, M.; Leone, M. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 15174.
46. Dzwolak, W.; Pecul, M. FEBS Lett. 2005, 579, 6601.
47. Stsiapura, V. I.; Maskevich, A. A.; Kuzmitsky, V. A.; Turoverov, K. K.; Kuznetsova, I. M. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 4829.