Two-color single molecule tracking combined with photobleaching for the detection of rare molecular interactions in fluid biomembranes

Soft Matter

Volumn 6, Issue 3, 2010, Pages 568-581

  Ruprecht, Verena ^a   Brameshuber, Mario ^a   Schütz, Gerhard J ^a  

^a JOHANNES KEPLER UNIVERSITY LINZ   (Austria)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTICORRELATION; BIOMEMBRANES; CHOLERA TOXIN B; DIFFUSION CONSTANT; FALSE NEGATIVES; FALSE POSITIVE; FLUORESCENT PROBE MOLECULES; INTERACTING MOLECULES; PROOF-OF-PRINCIPLE EXPERIMENTS; SINGLE-MOLECULE MICROSCOPY; SINGLE-MOLECULE TRACKING; STATISTICAL DESCRIPTIONS; SUPPORTED LIPID BILAYERS; SURFACE DENSITY; TWO-COLOR;

LIPID BILAYERS; PHOTOBLEACHING; STOICHIOMETRY;

MOLECULES;

EID: 75949110393     PISSN: 1744683X     EISSN: 17446848     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b916734j     Document Type: Article

References (56)

1. D. A. Brown J. K. Rose Cell 1992 68 533 544
2. I. Stefanova V. Horejsi I. J. Ansotegui W. Knapp H. Stockinger Science 1991 254 1016 1019
3. K. Simons E. Ikonen Nature 1997 387 569 572
4. N. Madore K. L. Smith C. H. Graham A. Jen K. Brady S. Hall R. Morris EMBO J. 1999 18 6917 6926
5. I. A. Prior C. Muncke R. G. Parton J. F. Hancock J. Cell Biol. 2003 160 165 170
6. B. F. Lillemeier J. R. Pfeiffer Z. Surviladze B. S. Wilson M. M. Davis Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 18992 18997
7. P. Sharma R. Varma R. C. Sarasij Ira K. Gousset G. Krishnamoorthy M. Rao S. Mayor Cell 2004 116 577 589
8. D. Goswami K. Gowrishankar S. Bilgrami S. Ghosh R. Raghupathy R. Chadda R. Vishwakarma M. Rao S. Mayor Cell 2008 135 1085 1097
9. C. Espenel E. Margeat P. Dosset C. Arduise C. Le Grimellec C. A. Royer C. Boucheix E. Rubinstein P. E. Milhiet J. Cell Biol. 2008 182 765 776
10. G. J. Schütz G. Kada V. P. Pastushenko H. Schindler EMBO J. 2000 19 892 901
11. A. Kusumi C. Nakada K. Ritchie K. Murase K. Suzuki H. Murakoshi R. S. Kasai J. Kondo T. Fujiwara Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2005 34 351 378
12. S. T. Hess T. J. Gould M. V. Gudheti S. A. Maas K. D. Mills J. Zimmerberg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 17370 17375
13. P. F. Lenne L. Wawrezinieck F. Conchonaud O. Wurtz A. Boned X. J. Guo H. Rigneault H. T. He D. Marguet EMBO J. 2006 25 3245 3256
14. P. H. Lommerse G. A. Blab L. Cognet G. S. Harms B. E. Snaar-Jagalska H. P. Spaink T. Schmidt Biophys. J. 2004 86 609 616
15. H. Heerklotz Biophys. J. 2002 83 2693 2701
16. M. Vrljic S. Y. Nishimura S. Brasselet W. E. Moerner H. M. McConnell Biophys. J. 2002 83 2681 2692
17. I. Koyama-Honda K. Ritchie T. Fujiwara R. Iino H. Murakoshi R. S. Kasai A. Kusumi Biophys. J. 2005 88 2126 2136
18. K. Drbal M. Moertelmaier C. Holzhauser A. Muhammad E. Fuertbauer S. Howorka M. Hinterberger H. Stockinger G. J. Schutz Int. Immunol. 2007 19 675 684
19. J. W. Comeau S. Costantino P. W. Wiseman Biophys. J. 2006 91 4611 4622
20. D. J. Irvine M. A. Purbhoo M. Krogsgaard M. M. Davis Nature 2002 419 845 849
21. W. Trabesinger G. J. Schütz H. J. Gruber H. Schindler T. Schmidt Anal. Chem. 1999 71 279 283
22. A. D. Douglass R. D. Vale Cell 2005 121 937 950
23. S. Manley J. M. Gillette G. H. Patterson H. Shroff H. F. Hess E. Betzig J. Lippincott-Schwartz Nat. Methods 2008 5 155 157
24. M. Moertelmaier M. Brameshuber M. Linimeier G. J. Schütz H. Stockinger Appl. Phys. Lett. 2005 87 263903
25. A. Orte R. Clarke S. Balasubramanian D. Klenerman Anal. Chem. 2006 78 7707 7715
26. J. R. James S. S. White R. W. Clarke A. M. Johansen P. D. Dunne D. L. Sleep W. J. Fitzgerald S. J. Davis D. Klenerman Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 17662 17667
27. W. Trabesinger B. Hecht U. P. Wild G. J. Schütz H. Schindler T. Schmidt Anal. Chem. 2001 73 1100 1105
28. P. D. Dunne R. A. Fernandes J. McColl J. W. Yoon J. R. James S. J. Davis D. Klenerman Biophys. J. 2009 97 L5 7
29. S. Wieser G. J. Schutz Methods 2008 46 131 140
30. S. Wieser M. Moertelmaier E. Fuertbauer H. Stockinger G. J. Schutz Biophys. J. 2007 92 3719 3728
31. T. Schmidt G. J. Schütz H. J. Gruber H. Schindler Anal. Chem. 1996 68 4397 4401
32. G. J. Schutz M. Sonnleitner H. Schindler J. Fluoresc. 2001 11 177 185
33. E. A. Merritt S. Sarfaty F. van den Akker C. L'Hoir J. A. Martial W. G. Hol Protein Sci 1994 3 166 175
34. J. Shi T. Yang S. Kataoka Y. Zhang A. J. Diaz P. S. Cremer J. Am. Chem. Soc. 2007 129 5954 5961
35. S. Lauer B. Goldstein R. L. Nolan J. P. Nolan Biochemistry 2002 41 1742 1751
36. F. Bergstrom I. Mikhalyov P. Hagglof R. Wortmann T. Ny L. B. Johansson J. Am. Chem. Soc. 2002 124 196 204
37. G. J. Schütz H. Schindler T. Schmidt Biophys. J. 1997 73 1073 1080
38. A. Sonnleitner G. J. Schutz T. Schmidt Biophys. J. 1999 77 2638 2642
39. Y. H. Yang J. M. Nam Anal. Chem. 2009 81 2564 2568
40. M. C. Leake N. P. Greene R. M. Godun T. Granjon G. Buchanan S. Chen R. M. Berry T. Palmer B. C. Berks Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 15376 15381
41. P. M. Haggie A. S. Verkman J. Biol. Chem. 2008 283 23510 23513
42. R. Schlapak H. Kinns C. Wechselberger J. Hesse S. Howorka ChemPhysChem 2007 8 1618 1621
43. S. A. Mutch B. S. Fujimoto C. L. Kuyper J. S. Kuo S. Bajjalieh D. T. Chiu Biophys. J. 2007 92 2926 2943
44. M. C. Leake J. H. Chandler G. H. Wadhams F. Bai R. M. Berry J. P. Armitage Nature 2006 443 355 358
45. M. H. Ulbrich E. Y. Isacoff Nat Methods 2007 4 319 321
46. A. Penna A. Demuro A. V. Yeromin S. L. Zhang O. Safrina I. Parker M. D. Cahalan Nature 2008 456 116 120
47. W. Ji P. Xu Z. Li J. Lu L. Liu Y. Zhan Y. Chen B. Hille T. Xu L. Chen Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 13668 13673
48. P. G. Saffman M. Delbruck Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1975 72 3111 3113
49. Y. Gambin R. Lopez-Esparza M. Reffay E. Sierecki N. S. Gov M. Genest R. S. Hodges W. Urbach Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 2098 2102
50. B. D. Hughes B. A. Pailthorpe L. R. White W. H. Sawyer Biophys J 1982 37 673 676
51. E. P. Petrov P. Schwille Biophys. J. 2008 94 L41 43
52. W. L. Vaz P. F. Almeida Biophys. J. 1991 60 1553 1554
53. J. K. Jaiswal S. M. Simon Nat. Chem. Biol. 2007 3 92 98
54. C. W. van den Berg T. Cinek M. B. Hallett V. Horejsi B. P. Morgan J. Cell Biol. 1995 131 669 677
55. G. Vereb J. Szollosi J. Matko P. Nagy T. Farkas L. Vigh L. Matyus T. A. Waldmann S. Damjanovich Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 8053 8058
56. S. Wieser J. Weghuber M. Sams H. Stockinger G. J. Schütz Soft Matter 2009 5 3287 3294