Protein 19F NMR in Escherichia coli

Journal of the American Chemical Society

Volumn 132, Issue 1, 2010, Pages 321-327

  Li, Conggang ^a   Wang, Gui Fang ^a   Wang, Yaqiang ^a   Creager Allen, Rachel ^b   Lutz, Evan A ^a   Scronce, Heidi ^a   Slade, Kristin M ^a   Ruf, Rebecca A S ^a   Mehl, Ryan A ^c   Pielak, Gary J ^a,b,d  

^a University of North Carolina at Chapel Hill   (United States)

^b UNIVERSITY OF NORTH CAROLINA SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

^c FRANKLIN AND MARSHALL COLLEGE   (United States)

^d UNIVERSITY OF NORTH CAROLINA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DISORDERED PROTEINS; DYNAMIC INFORMATION; GLOBULAR PROTEINS; IN-CELL; L-PHENYLALANINE; LABELED PROTEINS; OVER-EXPRESSION; SITE-SPECIFIC; TRIFLUOROMETHYL;

AMINO ACIDS; BIOINFORMATICS; ESCHERICHIA COLI; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; ORGANIC ACIDS; PHOSPHATASES; RESONANCE;

PROTEINS;

BACTERIAL PROTEIN; GLOBULAR PROTEIN; PHENYLALANINE DERIVATIVE; TYROSINE DERIVATIVE;

ARTICLE; BACTERIAL CELL; CONTROLLED STUDY; ESCHERICHIA COLI; FLUORINE NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; IMAGE ANALYSIS; MOTION; NONHUMAN; PROTEIN STRUCTURE; UBIQUITINATION;

CHYMOTRYPSIN; ESCHERICHIA COLI; HALOGENATION; MOLECULAR WEIGHT; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PROTEASE INHIBITORS; PROTEINS; RECOMBINANT PROTEINS;

EID: 74849140345     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja907966n     Document Type: Article

References (58)

1. Luby-Phelps, K. Int. Rev. Cytol. 2000, 192, 189-221.
2. Malmström, J.; Beck, M.; Schmidt, A.; Lange, V.; Deutsch, E. W.; Aebersold, R. Nature 2009, 460, 762-765.
3. Zimmerman, S. B.; Trach, S. O. J. Mol. Biol. 1991, 222, 599-620.
4. Augustus, A. M.; Reardon, P. N.; Spicer, L. D. Proc. Natl. Aca. Sci. U.S.A. 2009, 106, 5065-5069.
5. Brindle, K. M.; Williams, S.-P.; Boulton, M. FEBS Lett. 1989, 255, 121-124.
6. Burz, D. S.; Dutta, K.; Cowburn, D.; Shekhtman, A. Nat. Protoc. 2006, 1, 146-152.
7. Dedmon, M. M.; Patel, C. N.; Young, G. B.; Pielak, G. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 12681-12684.
8. Hubbard, J. A.; MacLachlan, L. K.; King, G. W.; Jones, J. J.; Fosberry, A. P. Mol. Microbiol. 2003, 49, 1191-1200.
9. Inomata, K.; Ohno, A.; Tochio, H.; Isogai, S.; Tenno, T.; Nakase, I.; Takeuchi, T.; Futaki, S.; Ito, Y.; Hiroaki, H.; Shirakawa, M. Nature 2009, 458, 106-109.
10. McNulty, B. C.; Young, G. B.; Pielak, G. J. J. Mol. Biol. 2006, 355, 893-897.
11. Pielak, G. J.; Li, C.; Miklos, A. C.; Schlesinger, A. P.; Slade, K. M.; Wang, G.; Zigoneanu, I. G. Biochemistry 2008, 48, 226-234.
12. Sakai, T.; Tochio, H.; Tenno, T.; Ito, Y.; Kokubo, T.; Hiroaki, H.; Shirakawa, M. J. Biomol. NMR 2006, 36, 179-188.
13. Selenko, P.; Serber, Z.; Gadea, B.; Ruderman, J.; Wagner, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 11904-11909.
14. Selenko, P.; Wagner, G. Nat. Methods 2006, 3, 80-81.
15. Serber, Z.; Dötsch, V. Biochemistry 2001, 40, 14317-14323.
16. Serber, Z.; Keatinge-Clay, A. T.; Ledwidge, R.; Kelly, A. E.; Miller, S. M.; Dötsch, V. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2446-2447.
17. Serber, Z.; Selenko, P.; Hansel, R.; Reckel, S.; Lohr, F.; Ferrell, J. E., Jr.; Wagner, G.; Dötsch, V. Nat. Protoc. 2006, 1, 2701-2709.
18. Serber, Z.; Straub, W.; Corsini, L.; Nomura, A. M.; Shimba, N.; Craik, C. S.; Ortiz de Montellano, P.; Dötsch, V. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 7119-7125.
19. Xie, J.; Thapa, R.; Reverdatto, S.; Burz, D. S.; Shekhtman, A. J. Med. Chem. 2009, 52, 3516-3522.
20. Sakakibara, D.; Sasaki, A.; Ikeya, T.; Hamatsu, J.; Hanashima, T.; Mishima, M.; Yoshimasu, M.; Hayashi, N.; Mikawa, T.; Walchli, M.; Smith, B. O.; Shirakawa, M.; Guntert, P.; Ito, Y. Nature 2009, 458, 102-105.
21. Pielak, G. J. Biochemistry 2007, 46, 8206.
22. Cellitti, S. E.; et al. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 9268-9281.
23. Danielson, M. A.; Falke, J. J. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1996, 25, 163-195.
24. Li, C.; Lutz, E. A.; Slade, K. M.; Ruf, R. A.; Wang, G.; Pielak, G. J. Biochemistry 2009, 48, 8578-8584.
25. Li, H.; Frieden, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 11993-11998.
26. Haggie, P. M.; Brindle, K. M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 3941-3945.
27. Williams, S. P.; Fulton, A. M.; Brindle, K. M. Biochemistry 1993, 32, 4895-4902.
28. Williams, S. P.; Haggie, P. M.; Brindle, K. M. Biophys. J. 1997, 72, 490-498.
29. Jackson, J. C.; Hammill, J. T.; Mehl, R. A. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 1160-1166.
30. Pervushin, K. V.; Wider, G.; Riek, R.; Wüthrich, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9607-9612.
31. Charlton, L. M.; Barnes, C. O.; Li, C.; Orans, J.; Young, G. B.; Pielak, G. J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 6826-6830.
32. Petit, C. M.; Zhang, J.; Sapienza, P. J.; Fuentes, E. J.; Lee, A. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 18249-18254.
33. Slade, K. M.; Baker, R.; Chua, M.; Thompson, N. L.; Pielak, G. J. Biochemistry 2009, 48, 5083-5089.
34. Khan, F.; Kuprov, I.; Craggs, T. D.; Hore, P. J.; Jackson, S. E. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 10729-10737.
35. Hammill, J. T.; Miyake-Stoner, S.; Hazen, J. L.; Jackson, J. C.; Mehl, R. A. Nat. Protoc. 2007, 2, 2601-2607.
36. Delaglio, F.; Grzesiek, S.; Vuister, G. W.; Zhu, G.; Pfeifer, J.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1995, 6, 277-293.
37. Johnson, B. A.; Blevins, R. A. J. Biomol. NMR 1994, 4, 603-614.
38. Li, C.; Charlton, L. M.; Lakkavaram, A.; Seagle, C.; Wang, G.; Young, G. B.; Macdonald, J. M.; Pielak, G. J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 6310-6311.
39. Bryant, J. E.; Lecomte, J. T.; Lee, A. L.; Young, G. B.; Pielak, G. J. Biochemistry 2005, 44, 9275-9279.
40. Schneider, D. M.; Dellwo, M. J.; Wand, A. J. Biochemistry 1992, 31, 3645-3652.
41. Law, A. B.; Fuentes, E. J.; Lee, A. L. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 6322-6323.
42. Burz, D. S.; Shekhtman, A. PLoS ONE 2008, 3, e2571.
43. Kitevski-LeBlanc, J. L.; Evanics, F.; Prosser, R. S. J. Biomol. NMR 2009, 45, 255-264.
44. Jaren, O. R.; Kranz, J. K.; Sorensen, B. R.; Wand, A. J.; Shea, M. A. Biochemistry 2002, 41, 14158-14166.
45. Pedersen, S.; Bloch, P. L.; Neidhardt, F. C. Cell 1978, 14, 179-190.
46. Ishihama, Y.; Schmidt, T.; Rappsilber, J.; Mann, M.; Hartl, F. U.; Kerner, M.; Frishman, D. BMC Genomics 2008, 9, 102.
47. Eliezer, D.; Kutluay, E.; Bussell, R., Jr.; Browne, G. J. Mol. Biol. 2001, 307, 1061-1073.
48. Wu, K. P.; Kim, S.; Fela, D. A.; Baum, J. J. Mol. Biol. 2008, 378, 1104-1115.
49. Debye, P. J. Polar Molecules; Chemical Catalog Company: New York, 1929.
50. Li, C.; Wang, Y.; Pielak, G. J. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 13390-13392.
51. Srere, P. A. Trends Biochem. Sci. 2000, 25, 150-153.
52. Persson, E.; Halle, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 6266-6271.
53. Li, C.; Pielak, G. J. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1368-1369.
54. Jarymowycz, V. A.; Stone, M. J. Chem. Rev. 2006, 106, 1624-1671.
55. Xu, A. S. L.; Waldeck, R.; Kuchel, P. W. NMR Biomed. 1993, 6, 136-143.
56. Ghaemmaghami, S.; Oas, T. G. Nat. Struct. Mol. Biol. 2001, 8, 879-882.
57. Ignatova, Z.; Gierasch, L. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 523-528.
58. Lindon, J. C.; Beckonert, O. P.; Holmes, E.; Nicholson, J. K. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2009, 55, 79-100.