Nucleobase lesions and strand breaks in dry DNA thin film selectively induced by monochromatic soft X-rays

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 49, 2009, Pages 16007-16015

  Fujii, Kentaro ^a   Shikazono, Naoya ^a   Yokoya, Akinari ^a  

^a JAPAN ATOMIC ENERGY AGENCY   (Japan)

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CARBON FILMS; GENES; IONIZATION OF LIQUIDS; NITROGEN; NUCLEIC ACIDS; OXYGEN; PARTICLE DETECTORS;

DNA DAMAGES; DNA LESIONS; DNA THIN FILMS; ELECTRONS AND HOLES; ENERGY REGIONS; HYDRATING WATER MOLECULES; IONIZATION ENERGIES; K-SHELL IONIZATION; NUCLEOBASES; PHOTON ENERGY; PLASMID DNA; SELECTIVE INDUCTION; SHELL IONIZATION; SINGLE-STRAND BREAKS; SOFT X-RAY; STRAND BREAKS;

DNA;

EID: 71549138397     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9062737     Document Type: Article

References (56)

1. Free-Radical-Induced DNA Damage and Its Repair; Sonntag, C. v., Ed.; Springer: Muhlheim, 2006.
2. de Lara, C. M.; Hill, M. A.; Jenner, T. J.; Papworth, D.; O'Neill, P. Radiat. Res. 2001, 155, 440.
3. Nikjoo, H.; Bolton, C. E.; Watanabe, R.; Terrissol, M.; O'Neill, P.; Goodhead, D. T. Radiat. Prot. Dosim. 2002, 99, 77.
4. Tanaka, K.; Sako, E. O.; Ikenaga, E.; Isari, K.; Sardar, S. A.; Wada, S.; Sekitani, T.; Mase, K.; Ueno, N. J. Electron Spectrosc. Relat. Phenom. 2001, 119, 255.
5. Tinone, M. C. K.; Tanaka, K.; Maruyama, J.; Ueno, N.; Imamura, M.; Matsubayashi, N. J. Chem. Phys. 1994, 100, 5988.
6. Hieda, K.; Ito, T. Handbook on Synchrotron Radiation; Elsevier: Amsterdam, 1991; Vol.4.
7. Kobayashi, K. Charged Particle and Photon Interaction with Matter; Marcel Dekker: New York, 2004.
8. du Penhoat, M. A. H.; Fayard, B.; Abel, F.; Touati, A.; Gobert, F.; Despiney-Bailly, I.; Ricoul, M.; Sabatier, L.; Stevens, D. L.; Hill, M. A.; Goodhead, D. T.; Chetioui, A. Radiat. Res. 1999, 151, 649.
9. Yokoya, A.; Watanabe, R.; Hara, T. J. Radiat. Res. 1999, 40, 145.
10. Fayard, B.; Touati, A.; Abel, F.; Penhoat, M. A. H. d.; Despiney-Bailly, I.; Gobert, F.; Ricoul, M.; L'hoir, A.; Politis, M. F.; Hill, M. A.; Stevens, D.; Sabatier, L.; Sage, E.; Goodhead, D. T.; Chetioui, A. Radiat. Res. 2002, 157, 128.
11. Eschenbrenner, A.; Herve Du Penhoat, M. A.; Boissiere, A.; Eot-Houllier, G.; Abel, F.; Politis, M. F.; Touati, A.; Sage, E.; Chetioui, A. Int. J. Radiat. Biol. 2007, 83, 687.
12. Agrawala, P. K.; Eschenbrenner, A.; du Penhoat, M. A.; Boissiere, A.; Politis, M. F.; Touati, A.; Sage, E.; Chetioui, A. Int. J. Radiat. Biol. 2008, 84, 1093.
13. Hieda, K.; Hirono, T.; Azami, A.; Suzuki, M.; Furusawa, Y.; Maezawa, H.; Usami, N.; Yokoya, A.; Kobayashi, K. Int. J. Radiat. Biol. 1996, 70, 437.
14. Goodhead, D. T. Synchrotron Radiation in the Biosciences; Oxford Science Publications: New York, 1994.
15. Nikjoo, H.; O'Neill, P.; Terrissol, M.; Goodhead, D. Radiat. Environ. Biophys. 1999, 38, 31.
16. Yokoya, A.; Cunniffe, S.; O'Neill, P. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 8859.
17. Goodhead, D. T. Int. J. Radiat. Biol. 1994, 65, 7.
18. Ward, J. F. Int. J. Radiat. Biol. 1994, 66, 427.
19. Melvin, T.; Cunniffe, S. M.; O'Neill, P.; Parker, A. W.; Roldan-Arjona, T. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 4935.
20. Prise, K. M.; Pullar, C. H.; Michael, B. D. Carcinogenesis 1999, 20, 905.
21. Sutherland, B.; Bennett, P.; Sidorkina, O.; Laval, J. Proc. Natl. Acad Sci. USA. 2000, 97, 103.
22. Milligan, J. R.; Aguilera, J. A.; Nguyen, T. T.; Paglinawan, R. A.; Ward, J. F. Int. J. Radiat. Biol. 2000, 76, 1475.
23. Demple, B.; Linn, S. Nature 1980, 287, 203.
24. Breimer, L. H.; Lindahl, T. J. Biol. Chem. 1984, 259, 5543.
25. Dizdaroglu, M.; Laval, J.; Boiteux, S. Biochemistry 1993, 32, 12105.
26. Hatahet, Z.; Kow, Y. W.; Purmal, A. A.; Cunningham, R. P.; Wallace, S. S. J. Biol. Chem. 1994, 269, 18814.
27. Chetsanga, C. J.; Lindahl, T. Nucleic Acids Res. 1979, 6, 3673.
28. Boiteux, S.; Gajewski, E.; Laval, J.; Dizdaroglu, M. Biochemistry 1992, 37, 106.
29. Tchou, J.; Kasai, H.; Shibutani, S.; Chung, M. H.; Laval, J.; Grollman, A. P.; Nishimura, S. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991, 88, 4690.
30. Haring, M.; Rudiger, H.; Demple, B.; Boiteux, S.; Epe, B. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 2010.
31. Saitoh, Y.; Nakatani, T.; Matsushita, T.; Agui, A.; Yoshigoe, A.; Teraoka, Y.; Yokoya, A. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res., Sect. A 2001, 474, 253.
32. Tanaka, H.; Adachi, M.; Aoki, T.; Asaka, T.; Baron, A.; Date, S.; Fukami, K.; Furukawa, Y.; Hanaki, H.; Hosoda, N.; Ishikawa, T.; Kimura, H.; Kobayashi, K.; Kobayashi, T.; Kohara, S.; Kumagai, N.; Masaki, M.; Masuda, T.; Matsui, S.; Mizuno, A.; Nakamura, T.; Nakatani, T.; Noda, T.; Ohata, T.; Ohkuma, H.; Ohshima, T.; Oishi, M.; Sasaki, S.; Schimizu, J.; Shoji, M.; Soutome, K.; Suzuki, M.; Suzuki, S.; Suzuki, Y.; Takáno, S.; Takao, M.; Takashima, T.; Takebe, H.; Takeuchi, A.; Tamura, K.; Tanaka, R.; Tanaka, Y.; Taniuchi, T.; Taniuchi, Y.; Tsumaki, K.; Yamashita, A.; Yanagida, K.; Yoda, Y.; Ynehara, H.; Yorita, T.; Yoshioka, M.; Takata, M. J. Synchrotron Radiat. 2006, 13, 378.
33. Henke, B. L.; Gullikson, E. M.; Davis, J. C. At. Data Nucl. Data Tables 1993, 55, 349.
34. Jones, G. D.; Boswell, T. V.; Ward, J. F. Radiat. Res. 1994, 138, 291.
35. Rydberg, B. Radiat. Res. 2000, 153, 805.
36. Hodgkins, P. S.; Fairman, M. P.; O'Neill, P. Radiat. Res. 1996, 145, 24.
37. Milligan, J. R.; Arnold, A. D.; Ward, J. F. Radiat. Res. 1992, 132, 69.
38. Fujii, K.; Yokoya, A.; Shikazono, N. Int. J. Radiat. Biol. 2008, 84, 1104.
39. Fujii, K.; Akamatsu, K.; Yokoya, A. Radiat. Res. 2004, 161, 435.
40. Yokoya, A.; Fujii, K.; Shikazono, N.; Akamatsu, K.; Urushibara, A.; Watanabe, R. Int. J. Radiat. Biol. 2008, 84, 1069.
41. Yokoya, A.; Fujii, K.; Fukuda, Y.; Ukai, M. Radiat. Phys. Chem. 2009, 78, 1211.
42. Bernhard, W. A.; Close, D. M. Charged Particle and Photon Interaction with Matter; Marcel Dekker: New York, 2004.
43. Purkayastha, S.; Milligan, J. R.; Bernhard, W. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 26286.
44. Boudaïffa, B.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Huels, M. A.; Sanche, L. Science 2000, 287, 1658.
45. Ito, T.; Saito, M. Photochem. Photobiol. 1988, 48, 567.
46. Urushibara, A.; Shikazono, N.; O'Neill, P.; Fujii, K.; Wada, S.; Yokoya, A. Int. J. Radiat. Biol. 2008, 84, 23.
47. Yokoya, A.; Fujii, K.; Ushigome, T.; Shikazono, N.; Urushibara, A.; Watanabe, R. Radiat. Prot. Dosim. 2006, 122, 86.
48. Ormerod, M. G. Int. J. Radiat. Biol. 1965, 9, 291.
49. Akamatsu, K.; Fujii, K.; Yokoya, A. Int. J. Radiat. Biol. 2004, 80, 849.
50. Akamatsu, K.; Fujii, K.; Yokoya, A. Radiat. Res. 2004, 161, 442.
51. Tao, N.; Lindsay, S. Biopolymers 1989, 28, 1019.
52. Cadet, J.; Douki, T.; Ravanat, J. L. Acc. Chem. Res. 2008, 41, 1075.
53. Pratviel, G.; Meunier, B. Chem.-Eur. J. 2006, 12, 6018.
54. Yokoya, A.; Cunniffe, S.; Watanabe, R.; Kobayashi, K.; O'Neill, P. Radiat. Res. 2009, 172, 296.
55. Gromova, M.; Balanzat, E.; Gervais, B.; Nardin, R.; Cadet, J. Int. J. Radiat. Biol. 1998, 74, 81.
56. Swarts, S. G.; Becker, D.; Sevilla, M.; Wheeler, K. T. Radiat. Res. 1996, 145, 304.