Tyrosyl radical in the W164Y mutant of P. eryngii versatile peroxidase: An EPR and DFT/PCM study

Applied Magnetic Resonance

Volumn 37, Issue 1, 2010, Pages 279-288

  Bernini, Caterina ^a   Sinicropi, Adalgisa ^a   Basosi, Riccardo ^a   Pogni, Rebecca ^a  

^a UNIVERSITY OF SIENA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPOUND I; CONTINUUM MODEL; DENSITY FUNCTIONALS; ELECTRON NUCLEAR DOUBLE RESONANCE; ELECTRON PARAMAGNETIC RESONANCE; FUNGAL ENZYMES; LONG-RANGE ELECTRON TRANSFER; NEUTRAL RADICAL; RADICAL SITES; REDOX POTENTIALS; TYROSYL RADICALS; VERSATILE PEROXIDASE; WILD TYPES; X-BAND EPR;

AMINO ACIDS; CATALYSTS; CONTINUUM MECHANICS; ELECTRON RESONANCE; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; ELECTRON TRANSITIONS; ENZYMES; FREE RADICAL REACTIONS; PARAMAGNETIC RESONANCE; PARAMAGNETISM; PLANTS (BOTANY); PORPHYRINS; QUANTUM THEORY;

SUBSTRATES;

EID: 71149111218     PISSN: 09379347     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1007/s00723-009-0068-5     Document Type: Article

References (38)

1. P. Kersten, D. Cullen, Fungal Genet. Biol. 44, 77-87 (2007).
2. T. K. Kirk, R. L. Farrell, Annu. Rev. Microbiol. 41, 465-505 (1987).
3. A. T. Martínez, M. Speranza, F. J. Ruiz-Dueñas, P. Ferreira, S. Camarero, F. Guillén, M. J. Martínez, A. Gutiérrez, J. C. del Río, Int. Microbiol. 8, 195-204 (2005).
4. K. E. Hammel, D. Cullen, Curr. Opin. Plant Biol. 11, 349-355 (2008).
5. A. T. Martínez, Enzyme Microb. Technol. 30, 425-444 (2002).
6. W. A. Doyle, W. Blodig, N. C. Veitch, K. Piontek, A. T. Smith, Biochemistry 37, 15097-15105 (1998).
7. T. Mester, K. Ambert-Balay, S. Ciofi-Baffoni, L. Banci, A. D. Jones, M. Tien, J. Biol. Chem. 276, 22985-22990 (2001).
8. M. Pérez-Boada, F. J. Ruiz-Dueñas, R. Pogni, R. Basosi, T. Choinowski, M. J. Martínez, K. Piontek, A. T. Martínez, J. Mol. Biol. 354, 385-402 (2005).
9. M. H. Gold, H. L. Youngs, M. D. Gelpke, Met. Ions Biol. Syst. 37, 559-586 (2000).
10. F. J. Ruiz-Dueñas, M. Morales, M. Pérez-Boada, T. Choinowski, M. J. Martínez, K. Piontek, A. T. Martínez, Biochemistry 46, 66-77 (2007).
11. A. T. Smith, N. C. Veitch, Curr. Opin. Chem. Biol. 2, 269-278 (1998).
12. R. Pogni, M. C. Baratto, S. Giansanti, C. Teutloff, J. Verdin, B. Valderram, F. Lendzian, W. Lubitz, R. Vazquez-Duhalt, R. Basosi, Biochemistry 44, 4267-4274 (2005).
13. R. Pogni, M. C. Baratto, C. Teutloff, S. Giansanti, F. J. Ruiz-Duenas, T. Choinowski, K. Piontek, A. T. Martinez, F. Lendzian, R. Basosi, J. Biol. Chem. 28, 9517-9526 (2006).
14. R. Pogni, C. Teutloff, F. Lendzian, R. Basosi, Appl. Magn. Reson. 31, 509-526 (2007).
15. F. J. Ruiz-Dueñas, R. Pogni, M. Morales, S. Giansanti, M. J. Mate, A. Romero, M. J. Martínez, R. Basosi, A. T. Martínez, J. Biol. Chem. 284, 7986-7994 (2009).
16. J. Stubbe, W. A. Der Donk, Chem. Rev. 98, 705-762 (1998).
17. H. Pelletier, J. Kraut, Science 258, 1748-1755 (1992).
18. C. Aubert, P. Mathis, A. P. Eker, K. Brettel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 5423-5427 (1999).
19. A. Ivancich, C. Jakopitsch, M. Auer, S. Un, C. Obinger, J. Am. Chem. Soc. 125, 14093-14102 (2003).
20. K. Ranguelova, S. Girotto, G. J. Gerfen, S. Yu, J. Suarez, R. S. Metlitsky, R. S. Magliozzo, J. Biol. Chem. 282, 6255-6264 (2007).
21. P. Reichard, A. Ehrenberg, Science 221, 514-519 (1983).
22. C. W. Hoganson, M. Sahlin, B.-M. Sjöberg, G. T. Babcock, J. Am. Chem. Soc. 118, 4672-4679 (1996).
23. V. Schünemann, F. Lendzian, C. Jung, J. Contzen, A. L. Barra, S. G. Sligar, A. X. Trautwein, J. Biol. Chem. 279, 10919-10930 (2004).
24. A. Svistunenko, Biochim. Biophys. Acta 1707, 127-155 (2005).
25. A. D. Becke, J. Chem. Phys. 98, 5648-5652 (1993).
26. C. Lee, W. Yang, R. G. Parr, Phys. Rev. B 37, 785-789 (1988).
27. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian 03 (Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2003).
28. V. Barone, in Recent Advances in Density Functional Methods (Part I), ed. by D. P. Chong (World Scientific Publishing Company, Singapore, 1995), pp.287-334.
29. V. Barone, A. Polimeno, Phys. Chem. Chem. Phys. 8, 4609-4629 (2006).
30. J. Tomasi, M. Persico, Chem. Rev. 94, 2027-2094 (1994).
31. G. Bleifuss, M. Kolberg, S. Pötsch, W. Hofbauer, R. Bittl, W. Lubitz, A. Gräslund, G. Lassmann, F. Lendzian, Biochemistry 40, 1562-1568 (2001).
32. A. Ivancich, G. Mazza, A. Desbois, Biochemistry 40, 6860-6866 (2001).
33. F. Lendzian, Biochim. Biophys. Acta 1707, 67-90 (2005).
34. S. Un, C. Gerez, E. Elleingand, M. Fontecave, J. Am. Chem. Soc. 123, 3048-3054 (2001).
35. D. A. Svistunenko, C. E. Cooper, Biophys. J. 87, 582-595 (2004).
36. F. Lendzian, M. Sahlin, F. MacMillan, R. Bittl, R. Fiege, S. Pötsch, B.-M. Sjöberg, A. Gräslund, W. Lubitz, G. Lassmann, J. Am. Chem. Soc. 118, 8111-8120 (1996).
37. F. Himo, A. Gräslund, L. A. Eriksson, Biophys. J. 72, 1556-1567 (1997).
38. D. T. Edmonds, C. P. Summers, J. Magn. Reson. 12, 134-142 (1973).