Molecular Dynamics Simulations of Hen Egg White Lysozyme Adsorption at a Charged Solid Surface

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 36, 2009, Pages 12189-12200

  Kubiak, Karina ^a,b   Mulheran, Paul A ^a  

^a UNIVERSITY OF STRATHCLYDE   (United Kingdom)

^b NICOLAUS COPERNICUS UNIVERSITY   (Poland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ENZYMES; IONIC STRENGTH; MOLECULAR DYNAMICS; SODIUM CHLORIDE; SURFACE STRUCTURE;

ADSORPTION PATTERNS; ADSORPTION SITE; ATOMISTIC MOLECULAR DYNAMICS; CHARGED SOLID SURFACES; CHARGED SURFACES; COMPUTATIONAL STUDIES; ELECTROSTATIC ATTRACTIONS; FLAT SURFACES; HELICAL CONTENT; HEN EGG WHITE LYSOZYME; HYDROPHILIC SURFACES; INITIAL ORIENTATION; LONG AXIS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; PARTIAL UNFOLDING; TERTIARY STRUCTURES;

ADSORPTION;

EID: 69949139818     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp901521x     Document Type: Article

References (59)

1. Kasemo, B. Surf. Sci. 2002, 500, 656
2. Ghoshk, R. Biochem. Eng. J. 2003, 14, 109
3. Moradi, O.; Modarress, H.; Noroozi, M. J. Colloid Interface Sci. 2004, 271, 16
4. Bayramoglu, G.; Yilmaz, M.; Arica, M. Y. Colloids Surf., A 2004, 243, 11
5. Daly, S. M.; Przybycien, T. M.; Tilton, R. D. Colloids Surf., B 2007, 57, 81
6. Adam, N. K. The physics and chemistry of surfaces; Oxford University Press: London, 1941
7. Blake, C. C. F.; Koenig, D. F.; Mair, G. A.; North, A. C. T.; Phillips, D. C;. Sarma, V. R. Nature 1965, 206, 757
8. Lee-Huang, S.; Huang, P. L.; Sun, Y.; Huang, P. L.; Kung, H.; Blithe, D. L.; Chen, H. C. Proc. Natl. Acad. Sci. 1999, 96, 2678
9. Li, B.; Huang, Y.; Paskewitz, S. M. FEBS Lett. 2006, 580, 1877
10. Garcia Rojas, E. E.; Dos Reis Coimbra, J. S.; Minim, L. A.; Saraiva, S. H.; Sodre de Silva, C. A. J. Chromatogr., B 2006, 840, 85
11. Qiao, S. Z.; Djojoputro, H.; Hu, Q.; Lu, G. Q. Prog. Solid State Chem. 2006, 34, 249
12. Deere, J.; Magner, E.; Wall, J. G.; Hodnett, B. K. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7340
13. Etheve, J.; Dejardin, P.; Boissiere, M. Colloids Surf., B 2003, 28, 285
14. Peng, Z. G.; Hidajat, K.; Uddin, M. S. J. Colloid Interface Sci. 2005, 287, 11
15. Rezwan, K.; Meier, L. P.; Gauckler, L. J. Biomaterials 2005, 26, 4351
16. Lu, J. R.; Su, T. J.; Howlin, B. J. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 5903
17. Malmsten, M.; Veide, A. J. Colloid Interface Sci. 1996, 178, 160
18. Shen, D.; Huang, M.; Chow, L.-M.; Yang, M. Sens. Actuators, B 2001, 77, 664
19. Haynes, C. A.; Norde, W. J. Colloid Interface Sci. 1995, 169, 313
20. Bujis, J.; Hlady, V. J. Colloid Interface Sci. 1997, 190, 171
21. Dismer, F.; Petzhold, M.; Hubbuch, J. J. Chromatogr., A 2008, 1194, 11
22. Shamim, N.; Liang, H.; Hidajat, K.; Uddin, M. S. J. Colloid Interface Sci. 2008, 320, 15
23. Su, Y.-L.; Li, Ch. Appl. Surf. Sci. 2008, 254, 2003
24. Peng, Z. G.; Hidajat, K.; Uddin, M. S. Colloids Surf., B 2004, 35, 69
25. Nguyen, T. T.-B.; Chang, H.-Ch.; Wu, V. W.-K. Diamond Relat. Mater. 2007, 16, 872
26. Kim, D. T.; Blanch, H. W.; Radke, C. J. Langmuir 2002, 18, 5841
27. Leisen, F.; Wiechmann, M.; Enders, O.; Kolb, H.-A. J. Colloid Interface Sci. 2006, 298, 508
28. Mulheran, P. A.; Pellenc, D.; Bennett, R. A.; Green, R. J.; Sperrin, M. Phys. Rev. Lett. 2008, 100, 068102
29. Pellenc, D.; Bennett, R. A.; Green, R. J.; Sperrin, M.; Mulheran, P. A. Langmuir 2008, 24, 9648
30. Mulheran, P. A.; Kubiak, K. Mol. Simul. 2009, 35, 501
31. Su, T. J.; Lu, J. R.; Thomas, R. K.; Cui, Z. F.; Penfold, J. J. Colloid Interface Sci. 1998, 203, 419
32. Lu, J. R.; Su, T. J.; Thirtle, P. N.; Thomas, R. K.; Rennie, A. R.; Cubitt, R. J. Colloid Interface Sci. 1998, 206, 212
33. Lu, J. R.; Su, T. J.; Thomas, R. K.; Penfold, J.; Webster, J. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1998, 94, 3279
34. Gidalevitz, D.; Huang, Z.; Rice, S. A. Proc. Natl. Acad. Sci. 1999, 96, 2608
35. Schladitz, C.; Viera, E. P.; Hermel, H.; Mohwald, H. Biophys. J. 1999, 77, 3305
36. Alahverdjieva, V. S.; Grigoriev, D. O.; Ferri, J. K.; Fainerman, V. B.; Aksenenko, E. V.; Leser, M. E.; Michel, M.; Miller, R. Colloids Surf., A 2008, 323, 167
37. Postel, C.; Abillon, O.; Desbat, B. J. Colloid Interface Sci. 2003, 266, 74
38. Yokoyama, Y.; Ishiguro, R.; Maeda, H.; Mukaiyama, M.; Kameyama, K.; Hiramatsu, K. J. Colloid Interface Sci. 2003, 268, 23
39. Larsericsdotter, H.; Oscarsson, S.; Bujis, J. J. Colloid Interface Sci. 2004, 276, 261
40. Romanini, D.; Braia, M.; Angarten, R. G.; Loh, W.; Pico, G. J. Chromatogr., B 2007, 857, 25
41. Clark, A. J.; Kotlicki, A.; Haynes Ch, A.; Whitehead, L. A. Langmuir 2007, 23, 5591
42. Aizawa, T.; Koganesawa, N.; Kamakura, A.; Masaki, K.; Matsuura, A.; Nagadome, H.; Terada, Y.; Kawano, K.; Nitta, K. FEBS Lett. 1998, 422, 175
43. Sauter, C.; Otalora, F.; Gavira, J. A.; Vidal, O.; Giege, R.; GarciaRuiz, J. M. Acta Crystallogr., Sect. D 2001, 57, 1119
44. Ravichandran, S.; Talbot, J. Biophys. J. 2000, 78, 110
45. Ravichandran, S.; Madura, J. D.; Talbot, J. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 3610
46. Carlsson, F.; Hyltner, E.; Arnebrant, T.; Malmsten, M.; Linse, P. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 9871
47. Yokomizo, T.; Higo, J.; Nakasako, M. Chem. Phys. Lett. 2005, 410, 31
48. Hamon, V.; Calligari, P.; Hinsen, K.; Kneller, G. R. J. Non-Cryst. Solids 2006, 325, 4417
49. Calandrini, V.; Hamon, V.; Hinsen, K.; Calligari, P.; BellissentFunel, M.-C.; Kneller, G. R. Chem. Phys. 2008, 345, 289
50. Lerbret, A.; Affouard, F.; Bordat, P.; Hedoux, A.; Guinet, Y.; Descamps, M. Chem. Phys. 2008, 345, 267
51. Hery, S.; Genest, D.; Smith, J. C. J. Mol. Biol. 1998, 279, 303
52. Sterpone, F.; Ceccarelli, M.; Marchi, M. J. Mol. Biol. 2001, 311, 409
53. Ionov, R.; Hedoux, A.; Guinet, Y.; Bordat, P.; Lerbet, A.; Affouard, F.; Prevost, D.; Descamps, M. J. Non-Cryst. Solids 2006, 352, 4430
54. McCarthy, A. N.; Grigera, J. R. J. Mol. Graphics Modell. 2006, 24, 254
55. Phillips, J. C.; Braun, R.; Wang, W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid, E.; Villa, E.; Chipot, Ch.; Skeel, R. D.; Kale, L.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781
56. Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33
57. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pederson, L. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577
58. Kastenholz, M. A.; Hünenberger, P. H. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 774
59. Wu, X.; Narsimhan, G. Biochim. Biophys. Acta 2008, 1784, 1694