Excited states and energy transfer in G-quadruplexes

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 113, Issue 27, 2009, Pages 11760-11765

  Miannay, François Alexandre ^a   Banyasz, Akos ^a   Gustavsson, Thomas ^a   Markovitsi, Dimitra ^a  

^a CEA SACLAY   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA DUPLEXES; DNA NANOSTRUCTURES; ELECTRONIC COUPLING; EXCIMERS; FEMTO-SECOND RESOLUTION; FLUORESCENCE ANISOTROPY; FLUORESCENCE LIFETIMES; FLUORESCENCE QUANTUM YIELD; FLUORESCENCE UPCONVERSION; G-QUADRUPLEXES; IN-LINE; MOLECULAR MOTIONS; QUADRUPLEXES; STOICHIOMETRIC MIXTURES; SUBPICOSECOND TIME SCALE; TIME-RESOLVED OPTICAL SPECTROSCOPY;

DNA; ENERGY TRANSFER; EXCITED STATES; GENES; NANOSTRUCTURES; NUCLEIC ACIDS; OLIGONUCLEOTIDES; POSITIVE IONS;

FLUORESCENCE;

EID: 67650806121     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp901839x     Document Type: Article

References (51)

1. Simonsson, T. Biol. Chem. 2001, 382, 621.
2. Lane, A. N.; Chaires, J. B.; Gray, R. D.; Trent, J. O. Nucleic Acids Res. 2008, 36, 5482.
3. Mergny, J. L.; Lacroix, L.; Teulade-Fichou, M. P.; Hounsou, C.; Guittat, L.; Hoarau, M.; Arimondo, P. B.; Vigneron, J. P.; Lehn, J. M.; Riou, J. F.; Garestier, T.; Helene, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 3062.
4. Neidle, S.; Parkinson, G. Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 383.
5. Gabelica, V.; Rosu, F.; De Pauw, E.; Antoine, R.; Tabarin, T.; Broyer, M.; Dugourd, P. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1990.
6. Alberti, P.; Mergny, J. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 1569.
7. Alberti, P.; Bourdoncle, A.; Sacca, B.; Lacroix, L.; Mergny, J. L. Org. Biomol. Chem. 2006, 4, 3383.
8. Wyatt, J. R.; Vickers, T. A.; Roberson, J. L.; Buckheit, R. W.; Klimkait, T.; Debaets, E.; Davis, P. W.; Rayner, B.; Imbach, J. L.; Ecker, D. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 1356.
9. Chou, S. H.; Chin, K. H.; Wang, A. H. J. Trends Biochem. Sci. 2005, 30, 231.
10. Gabelica, V.; Baker, E. S.; Teulade-Fichou, M. P.; De Pauw, E.; Bowers, M. T. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 895.
11. Riou, J. F.; Guittat, L.; Mailliet, P.; Laoui, A.; Renou, E.; Petitgenet, O.; Megnin-Chanet, F.; Helene, C.; Mergny, J. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 2672.
12. Ying, L. M.; Green, J. J.; Li, H. T.; Klenerman, D.; Balasubrama- nian, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 14629.
13. Nagatoishi, S.; Nojima, T.; Juskowiak, B.; Takenaka, S. Ansew. Chem.-Int. Edit. 2005, 44, 5067.
14. Markovitsi, D.; Gustavsson, T.; Sharonov, A. Photochem. Photobiol. 2004, 79, 526.
15. Gepshtein, R.; Huppert, D.; Lubitz, I.; Amdursky, N.; Kotlyar, A. B. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 12249.
16. Cadet, J.; Sage, E.; Douki, T. Mutat. Res. 2005, 571, 91.
17. Melnikova, V. O.; Ananthaswamy, H. N. Mutat. Res. 2005, 571, 91.
18. Aboul-ela, F.; Murchie, A. I. H.; Lilley, D. M. J. Nature 1992, 360, 280.
19. Laughlan, G.; Murchie, A. I. H.; Norman, D. G.; Moore, M. H.; Moody, P. C. E.; Lilley, D. M. J.; Luisi, B. Science 1994, 265, 520.
20. Markovitsi, D.; Onidas, D.; Gustavsson, T.; Talbot, F.; Lazzarotto, E. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17130.
21. Markovitsi, D.; Gustavsson, T.; Talbot, F. Photochem. Photobiol. Sci. 2007, 717.
22. Miannay, F. A.; Banyasz, A.; Gustavsson, T.; Markovitsi, D. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 14574.
23. Onidas, D.; Gustavsson, T.; Lazzarotto, E.; Markovitsi, D. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 9644.
24. Onidas, D.; Gustavsson, T.; Lazzarotto, E.; Markovitsi, D. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 5143.
25. Mergny, J. L.; De Cian, A.; Ghelab, A.; Sacca, B.; Lacroix, L. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 81.
26. Onidas, D.; Markovitsi, D.; Marguet, S.; Sharonov, A.; Gustavsson, T. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 11367.
27. Gustavsson, T.; Sharonov, A.; Markovitsi, D. Chem. Phys. Lett. 2002, 351, 195.
28. Gustavsson, T.; Sharonov, A.; Onidas, D.; Markovitsi, D. Chem. Phys. Lett. 2002, 356, 49.
29. Markovitsi, D.; Onidas, D.; Talbot, F.; Marguet, S.; Gustavsson, T.; Lazzarotto, E. J. Photochem. Photobiol. A: Chem. 2006, 183,1.
30. Gabelica, V.; Rosu, F.; Tabarin, T.; Kinet, C.; Antoine, R.; Broyer, M.; De Pauw, E.; Dugourd, P. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4706.
31. Bouvier, B.; Gustavsson, T.; Markovitsi, D.; Millie, P. Chem. Phys. 2002, 275, 75.
32. Starikov, E. B. Modern Phys. Lett. B 2004, 18, 825.
33. Varsano, D.; Di Felice, R.; Marques, M. A. L.; Rubio, A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 7129.
34. Santoro, F.; Barone, V.; Improta, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 9931.
35. Santoro, F.; Barone, V.; Improta, R. ChemPhysChem 2008, 9, 2531.
36. Rashbah, E. I.; Sturge, M. D. Excitons; North-Holland: Amsterdam, 1982.
37. Kasha, M.; Rawls, H. R.; El-Bayoumi, M. A. Pure Awl. Chem. 1965, 11, 371.
38. Marguet, S.; Markovitsi, D.; Millie, P.; Sigal, H.; Kumar, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 4697.
39. Ecoffet, C.; Markovitsi, D.; Millie, P.; Lemaistre, J. Chem. Phys. 1993, 177, 629.
40. Bouvier, B.; Dognon, J. P.; Lavery, R.; Markovitsi, D.; Millie, P.; Onidas, D.; Zakrzewska, K. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 13512.
41. Higgins, D. A.; Reid, P. J.; Barbara, P. F. J. Phys. Chem. 1996, 100, 1174.
42. Emanuele, E.; Zakrzewska, K.; Markovitsi, D.; Lavery, R.; Millie, P. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 16109.
43. Emanuele, E.; Markovitsi, D.; Millie, P.; Zakrzewska, K. ChemP- hysChem 2005, 6, 1387.
44. Bittner, E. R. J. Photochem. Photobiol. A: Chem. 2007, 190, 328.
45. Starikov, E. B.; Lewis, J. P.; Sankey, O. F. Intern. J. Modern Phys. B 2005, 19, 4331.
46. Gustavsson, T.; Banyasz, A.; Lazzarotto, E.; Markovitsi, D.; Scalmani, G.; Frisch, M. J.; Barone, V.; Improta, R. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 607.
47. Markovitsi, D.; Talbot, F.; Gustavsson, T.; Onidas, D.; Lazzarotto, E.; Marguet, S. Nature 2006, 441, E7.
48. McGovern, D. A.; Quinn, S.; Doorley, G. W.; Whelan, A. M.; Ronayne, K. L.; Towrie, M.; Parker, A. W.; Kelly, J. M. Chem. Comm. 2007, 5158.
49. Sundstrom, V. Annu. Rev. Phys. Chem. 2008, 59, 53.
50. Markovitsi, D.; Germain, A.; Millie, P.; Lecuyer, I.; Gallos, L.; Argyrakis, P.; Bengs, H.; Ringsdorf, H. J. Phys. Chem. 1995, 99, 1005.
51. Bittner, E. R. J. Chem. Phys. 2006, 125, 094909.