Lipids enhance apolipoprotein C-II-derived amyloidogenic peptide oligomerization but inhibit fibril formation

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 28, 2009, Pages 9447-9453

  Hung, Andrew ^a   Griffin, Michael D W ^b   Howlett, Geoffrey J ^b   Yarovsky, Irene ^a  

^a RMIT UNIVERSITY   (Australia)

^b UNIVERSITY OF MELBOURNE   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DIMERS; GLYCOPROTEINS; HYDROPHOBICITY; MOLECULAR DYNAMICS; OLIGOMERIZATION; PHOSPHOLIPIDS; PROTEINS;

AMYLOID FIBRIL FORMATION; AMYLOID PEPTIDES; AMYLOIDOGENIC PEPTIDES; APOLIPOPROTEIN; ATOMIC LEVELS; COMPUTATIONAL RESULTS; DIMER COMPLEXES; FIBRIL FORMATION; FLUORESCENCE STUDIES; HYDROPHOBIC INTERACTIONS; INHIBITORY EFFECT; INITIAL STAGES; LIPID MIXTURES; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; NUCLEATION AND GROWTH; OLIGOMERIC COMPLEXES; RANDOM COIL; SEDIMENTATION EQUILIBRIUM ANALYSIS; THIOFLAVIN T; UMBRELLA SAMPLING;

AMINES;

EID: 67650323736     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp901051n     Document Type: Article

References (29)

1. Bucciantini, M.; Giannoni, C.; Chiti, F.; Baroni, F.; Formigli, L.; Zurdo, J.; Taddei, N.; Ramponi, G.; Dobson, C. M.; Stefani, M. Nat. Biotechnol. 2002, 416, 507.
2. Nelson, R.; Eisenberg, D. Curr. Ovin. Struct. Biol. 2006, 16, 260.
3. Kirkitadze, M. D.; Bitan, G.; Teplow, D. B. J. Neurosci. Res. 2002, 69, 567.
4. Walsh, D. M.; Klyubin, L; Fadeeva, J. V.; Rowan, M. J.; Selkoe, D. J. Biochem. Soc. Trans. 2002, 30, 552.
5. Kayed, R.; Head, E.; Thompson, J. L.; McIntire, T. M.; Milton, S. C; Cotman, C. W.; Glabe, C. G. Science 2003, 300, 486.
6. Berger, O.; Edholm, O.; Jahnig, F. Biophys. J. 1997, 72, 2002.
7. Stewart, C. R.; Haw, Á.; Lopez, R.; McDonald, T. O.; Callaghan, J. M.; McConville, M. J.; Moore, K. J.; Howlett, G. J.; O'Brien, K. D. J. Lipid Res. 2007, 48, 2162.
8. MacRaild, C. Á.; Hatters, D. M.; Howlett, G. J.; Gooley, P. R. Biochemistry (Mosc). 2001, 40, 5414.
9. Zdunek, J.; Martinez, G. V.; Schleucher, J.; Lycksell, P. O.; Yin, Y.; Nilsson, S.; Shen, Y.; Olivecrona, G.; Wijmenga, S. Biochemistry, (Mosc). 2003, 42, 1872.
10. MacRaild, C. Á.; Howlett, G. J.; Gooley, P. R. Biochemistry (Mosc). 2004, 43, 8084.
11. Hatters, D. M.; Howlett, G. J. Eur. Biophys. J. 2002, 31, 2.
12. Griffin, M. D. W.; Mok, M. L. Y.; Wilson, L. M.; Pham, C. L. L.; Waddington, L. J.; Perugini, M. Á.; Howlett, G. J. J. Mol. Biol. 2008, 375, 240.
13. Hatters, D. M.; Lawrence, L. J.; Howlett, G. J. FEBS Lett. 2001, 494, 220.
14. Griffin, M. D.; Mok, M. L.; Wilson, L. M.; Pham, C. L.; Waddington, L. J.; Perugini, M. Á.; Howlett, G. J. J. Mol. Biol. 2008, 375, 240.
15. Hung, Á.; Griffin, M. D.; Howlett, G. J.; Yarovsky, I. Eur. Biophys. J. 2008, 38, 99.
16. Van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J. C J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701.
17. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306.
18. Gunsteren, W. F. v. ; Kruger, P.; Billeter, S. R.; Mark, Á. Å.; Eising, Á. Á.; Scott, W. R. P.; Huneberger, P. H.; Tironi, I. G. Biomolecular Simulation: The GROMOS96 Manual and User Guide; Biomos & Hochschulverlag AG an der ÅÔÇ Zurich: Groningen & Zurich, 1996.
19. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089.
20. Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C; Fraaije, J. G. E. M. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463.
21. Berendsen, H. J. C; Postma, J. P. M.; Vangunsteren, W. F.; Dinola, Á.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684.
22. Humphrey, W.; Dalke, Á.; Schuiten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33.
23. Hwang, W.; Zhang, S. G.; Kamm, R. D.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 12916.
24. Katchalskikatzir, E.; Shariv, L; Eisenstein, M.; Friesem, Á. Á.; Aflalo, C; Vakser, I. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992, 89, 2195.
25. Tarus, B.; Straub, J. E.; Thirumalai, D. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 16159.
26. Berendsen, H. J. C; Postma, J. P. M.; Gunsteren, W. F. v. ; Hermans, J. Intermolecular Forces; Pullman, B., Ed.; Reidel: Dordrecht, 1981; p 331.
27. Roux, B. Comput. Phys. Commun. 1995, 91, 275.
28. Cohen, E.; Bieschke, J.; Perciavalle, R. M.; Kelly, J. W.; Dillin, Á. Science 2006, 313, 1604.
29. Bagriantsev, S.; Liebman, S. BMC Biol. 2006, 4.