The role of defective silica surfaces in exogenous delivery of prebiotic compounds: Clues from first principles calculations

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 11, Issue 14, 2009, Pages 2497-2506

  Rimola, Albert ^a   Ugliengo, Piero ^a  

^a UNIVERSITY OF TURIN   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACID ANHYDRIDE; BIOPOLYMER; GLYCINE; SILICON DIOXIDE;

ARTICLE; ASTRONOMY; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CONFORMATION; DUST; HYDROLYSIS; METABOLISM; QUANTUM THEORY; SURFACE PROPERTY;

ANHYDRIDES; BIOPOLYMERS; DUST; EARTH (PLANET); EVOLUTION, CHEMICAL; GLYCINE; HYDROLYSIS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR CONFORMATION; QUANTUM THEORY; SILICON DIOXIDE; SURFACE PROPERTIES;

EID: 66649120341     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b820577a     Document Type: Article

References (91)

1. C. D. Duve, Singularities: Landmarks on the Pathways of Life, Cambridge University Press, New York, 1st edn, 2005
2. R. M. Hazen, Genesis: The Scientific Quest for Life's Origins, Joseph Henry Press, Washington DC, 1st edn, 2005
3. L. E. Orgel Trends Biochem. Sci. 1998 23 491 495
4. M. Bernstein Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. B 2006 361 1689 1702
5. S. L. Miller Science 1953 117 528 529
6. S. L. Miller J. Am. Chem. Soc. 1955 77 2351 2666
7. J. Oró Nature 1961 191 1193 1194
8. G. Schlesinger S. L. Miller J. Mol. Evol. 1983 19 376 382
9. S. Miyakawa H. Yamanashi K. Kobayashi H. J. Cleaves S. L. Miller Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 14628 14631
10. H. J. Cleaves J. H. Chalmers A. Lazcano S. L. Miller J. L. Bada Origins Life Evol. Biosphere 2008 38 105 115
11. G. Wächtershäuser Microbiol. Rev. 1988 52 452 484
12. G. D. Cody N. Z. Boctor T. R. Filley R. M. Hazen J. H. Scott A. Sharma H. S. Y., Jr Science 2000 289
13. G. Wächtershäuser Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1990 87 200 204
14. M. J. Russell A. J. Hall J. Geol. Soc. (London) 1997 154 377 402
15. C. Huber W. Eisenreich S. Hecht G. Wächtershäuser Science 2003 31 938 940
16. J. Oró Nature 1961 190 389 390
17. D. C. B. Whittet Origins Life Evol. Biosphere 1997 27 249 262
18. L. J. Allamandola M. P. Bernstein S. A. Sandford R. L. Walker Space Sci. Rev. 1999 90 219 232
19. H. Cottin M. C. Gazeau F. Raulin Planet. Space Sci. 1999 47
20. H. J. Fraser M. R. S. McCoustra D. A. Williams Astron. Geophys. 2002 43 10 18
21. D. A. Williams W. A. Brown S. D. Price J. M. C. Rawlings S. Viti Astron. Geophys. 2007 48 25 34
22. M. Nuevo G. Auger D. Blanot L. d'Hendecourt Origins Life Evol. Biosphere 2008 38 37 56
23. K. Kobayashi K. T. T. Kaneko J. Koike T. Oshima T. Saito T. Yamamotot H. Yanagawat Adv. Space Res. 1995 16 21 26
24. Y. Takano H. Masuda T. Kaneko K. Kobayashi Chem. Lett. 2002 31 986 987
25. K. Kobayashi H. Masuda K.-i. Ushi A. Ohashi H. Yamanashi T. Kaneko J.-i. Takahashi T. Hosokawa H. Hashimoto T. Saito Adv. Space Res. 2001 27 207 215
26. A. G. G. M. Tielens S. B. Charnley Origins Life Evol. Biosphere 1997 27 23 51
27. M. P. Bernstein J. P. Dworkin S. A. Sandford G. W. Cooper L. J. Allamandola Nature 2002 416 401 403
28. G. M. Muñoz-Caro U. J. Meierhenrich W. A. Schutte B. Barbier A. A. Segovia H. Rosenbauer W. H.-P. Thiemann A. Brack J. M. Greenberg Nature 2002 416
29. D. E. Woon, http://www.astrochymist.org/astrochymist-ism.html, (accessed 24 September 2008)
30. Y.-J. Kuan S. B. Charnley H.-C. Huang W.-L. Tseng Z. Kisiel Astrophys. J. 2004 593
31. L. E. Snyder F. J. Lovas J. M. Hollis D. N. Friedel P. R. Jewell A. Remijan V. V. Ilyushin E. A. Alekseev S. F. Dyubko Astrophys. J. 2005 619 914 930
32. C. Ceccarelli L. Loinard A. Castets A. Faure B. Lefloch Astron. Astrophys. 2000 362 1122 1126
33. L. E. Snyder Origins Life Evol. Biosphere 1997 27 115 133
34. S. Pizzarello Acc. Chem. Res. 2006 39 231 237
35. P. Ehrenfreund M. A. Sephton Faraday Discuss. 2006 133 277 288
36. E. Anders Nature 1989 342 255 257
37. C. Chyba C. Sagan Nature 1992 355 125 132
38. M. Pasek D. Lauretta Origins Life Evol. Biosphere 2008 38 5 21
39. S. B. Charnley P. Ehrenfreund Y.-J. Kuan Spectrochim. Acta, Part A 2001 57 685 704
40. J. E. Chiar Origins Life Evol. Biosphere 1997 27 79 100
41. B. T. Draine Annu. Rev. Astron. Astrophys. 2003 41 241 289
42. E. L. Gibb D. C. B. Whittet W. A. Schutte A. C. A. Boogert J. E. Chiar P. Ehrenfreund P. A. Gerakines J. V. Keane A. G. G. M. Tielens E. F. V. Dishoeck O. Kerkhof Astrophys. J. 2000 536
43. D. C. B. Whittet Origins Life Evol. Biosphere 1997 27 101 113
44. D. A. Williams E. Herbst Surf. Sci. 2002 500 823 837
45. R. Garrod I. H. Park P. Casellic E. Herbst Faraday Discuss. 2006 133 51 62
46. T. P. M. Goumans C. R. A. Catlow W. A. Brown J. Chem. Phys. 2008 128 134709
47. T. P. M. Goumans A. Wander C. R. A. Catlow W. A. Brown Mon. Not. R. Astron. Soc. 2007 382 1829 1832
48. V. Pirronello O. Biham C. liu L. Shen G. Vidali Astrophys. J. 1997 483 L131 L134
49. G. Vidali J. E. Roser L. Ling E. Congiu G. Manicò V. Pirronello Faraday Discuss. 2006 133 125 135
50. C. M. Lisse J. VanCleve A. C. Adams M. F. A'Hearn Y. R. Fernández T. L. Farnham L. Armus C. J. Crillmair J. Ingalls M. J. S. Belton O. Groussin L. A. McFadden K. J. Meech P. H. Schultz B. C. Clark L. M. Feaga J. M. Sunshine Science 2006 313 635
51. F. Boccuzzi S. Coluccia G. Ghiotti C. Morterra A. Zecchina J. Phys. Chem. 1978 82 1298 1303
52. V. Bolis B. Fubini L. Marchese G. Martra D. Costa J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1991 87 497 505
53. B. C. Bunker D. M. Haaland K. J. Ward T. A. Michalske W. L. Smith J. S. Binkley C. F. Melius C. A. Balfe Surf. Sci. 1989 210 406 428
54. B. A. Morrow I. A. Cody J. Phys. Chem. 1975 79 761 762
55. B. A. Morrow I. A. Cody J. Phys. Chem. 1976 80 1995 1998
56. B. A. Morrow I. A. Cody J. Phys. Chem. 1976 80 1998 2004
57. B. A. Morrow I. A. Cody L. S. M. Lee J. Phys. Chem. 1976 80 2761 2767
58. S. T. Bromley M. A. Zwijnenburg T. Maschmeyer Phys. Rev. Lett. 2003 90 035502
59. S. T. Bromley F. Illas Phys. Chem. Chem. Phys. 2007 9 1078 1086
60. E. Flikkema S. T. Bromley J. Phys. Chem. B 2004 108 9638 9645
61. T. R. Walsh M. Wilson A. P. Sutton J. Chem. Phys. 2000 113 9191
62. M.-H. Du A. Kolchin H.-P. Chenga J. Chem. Phys. 2003 119 6418
63. M.-H. Du A. Kolchin H.-P. Cheng J. Chem. Phys. 2004 120 1044
64. Y. Ma A. S. Foster R. M. Nieminen J. Chem. Phys. 2005 122 144709
65. P. Masini M. Bernasconi J. Phys.: Condens. Matter 2002 14 4133 4144
66. A. Rimola P. Ugliengo J. Chem. Phys. 2008 128 204702
67. S. Hamad S. T. Bromley Chem. Commun. 2008 4156 4158
68. B. Civalleri S. Casassa E. Garrone C. Pisani P. Ugliengo J. Phys. Chem. B 1999 103 2165 2171
69. B. Civalleri P. Ugliengo J. Phys. Chem. B 2000 104 9491 9499
70. A. Rimola M. Sodupe S. Tosoni B. Civalleri P. Ugliengo Langmuir 2006 22 6593 6604
71. T. Vreven K. Morokuma J. Comput. Chem. 2000 21 1419 1432
72. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648 5652
73. C. Lee W. Yang R. G. Parr Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1988 37 785 789
74. A. Rimola S. Tosoni M. Sodupe P. Ugliengo ChemPhysChem 2006 7 157 163
75. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheesman, J. A. Montgomery, T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmanu, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, GAUSSIAN 03, Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2004
76. D. McQuarrie, Statistical Mechanics, Harper and Row, New York, 1986
77. M. Cossi N. Rega G. Scalmani V. Barone J. Comput. Chem. 2003 24 669 681
78. A. Klamt G. Schueuermann J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1993 799 805
79. V. A. Basiuk T. Y. Gromovoy V. G. Golovaty A. M. Glukhoy Orig. Life Evol. Biosph. 1990-1991 20 483 498
80. R. W. Court M. A. Sephton J. Parnell I. Gilmour Geochim. Cosmochim. Acta 2006 70 1020 1039
81. M. Noguera L. Rodriguez-Santiago M. Sodupe J. Bertran J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2001 537 307 318
82. L. Rodriguez-Santiago M. Sodupe A. Oliva J. Bertran J. Phys. Chem. A 2000 104 1256 1261
83. S. Simon M. Sodupe J. Bertran J. Phys. Chem. A 2002 106 5697 5702
84. S. Simon A. Gil M. Sodupe J. Bertrán J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2005 727 191 197
85. D. Marx and J. Hutter, in Modern Methods and Algorithms of Quantum Chemistry, ed., J. Grotendorst, NIC, FZ, Jülich, 2000, pp. 301-449
86. A. Laio M. Parrinello Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 12562 12566
87. A. Rimola B. Civalleri P. Ugliengo Langmuir 2008 24 14027 14034
88. J. W. Gauld H. Audier J. Fossey L. Radom J. Am. Chem. Soc. 1996 118 6299 6300
89. J. W. Gauld L. Radom J. Am. Chem. Soc. 1997 119 9831 9839
90. A. J. Chalk L. Radom J. Am. Chem. Soc. 1997 119 7573 7578
91. R. Ramaekers J. Pajak B. Lambie G. Maes J. Chem. Phys. 2004 120 4182 4193