Effects of fatty acid inclusion in a DMPC bilayer membrane

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 1, 2009, Pages 92-102

  Peters, Günther H ^a,c   Hansen, Flemming Y ^a   Møller, Martin S ^a,c   Westh, Peter ^b,c  

^a TECHNICAL UNIVERSITY OF DENMARK   (Denmark)

^b ROSKILDE UNIVERSITY   (Denmark)

^c MEMPHYS Center for Biomembrane Physics   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHAINS; MEMBRANES; MOLECULAR DYNAMICS; PROTONATION;

ACID CONCENTRATIONS; BILAYER MEMBRANES; DIMYRISTOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; END-TO-END DISTANCES; MEMBRANE INTERFACE; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; MOLECULAR PACKINGS; REGULATORY MECHANISM;

FATTY ACIDS;

DIMYRISTOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; FATTY ACID; OLEIC ACID; STEARIC ACID; STEARIC ACID DERIVATIVE;

ARTICLE; CELL INCLUSION; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; CONFORMATION; DENSITOMETRY; LIPID BILAYER; TEMPERATURE;

COMPUTER SIMULATION; DENSITOMETRY; DIMYRISTOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; FATTY ACIDS; INCLUSION BODIES; LIPID BILAYERS; MOLECULAR CONFORMATION; OLEIC ACID; STEARIC ACIDS; TEMPERATURE;

EID: 61749090698     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp806205m     Document Type: Article

References (86)

1. Singer, S. J.; Nicolson, G. L. Science 1972, 175, 720-731.
2. Israelachvili, J. N.; Marcelja, S.; Horn, R. G. Q. Rev. Biophys. 1980, 13, 121-200.
3. Dowhan, W. Annu. Rev. Biochem. 1997, 66, 199-232.
4. Hampton, M. J.; Floyd, R. A.; Clark, J. B.; Lancaster, J. H. Chem. Phys. Lipids 1980, 27, 177-183.
5. Gudi, S.; Nolan, J. P.; Frangos, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 2515-2519.
6. Mouritsen, O. G.; Andresen, T. L.; Halperin, A.; Hansen, P. L.; Jakobsen, A. F.; Jensen, U. B.; Jensen, M. Ø.; Jørgensen, K.; Kaasgaard, T.; Leidy, C.; Simonsen, A. C.; Peters, G. H.; Weiss, M. J. Phys.: Condens. Matter 2006, 18, 1-12.
7. Leidy, C.; Linderoth, L.; Andresen, T. L.; Mouritsen, O. G.; Jørgensen, K.; Peters, G. H. Biophys. J. 2006, 90, 3165-3175.
8. Ohlrogge, J.; Browse, J. Plant Cell 1995, 7, 957-970.
9. Millar, A. A.; Wrischer, M.; Kunst, L. Plant Cell 1998, 11, 1889-1902.
10. Peters, G. H.; Dahmen-Levison, U.; de Meijere, K.; Brezesinski, G.; Toxvaerd, S.; Svendsen, A.; Kinnunen, P. K. J. Langmuir 2000, 16, 2779-2788.
11. Porat, N.; Gill, D.; Parola, A. H. J. Biol. Chem. 1988, 263, 14608-14611.
12. Cybulski, L. E.; Albanesi, D.; Mansilla, M. C.; Altabe, S.; Aguilar, P. S.; De Mendoza, D. Mol. Microbiol. 2002, 45, 1379-1388.
13. Vigh, L.; Maresca, B.; Harwood, J. L. Trends Biochem. Sci. 1998, 23, 369-374.
14. Razzao, T. M.; Ozegbe, P.; Jury, E. C.; Sembi, P.; Blackwell, N. M.; Kabouridis, P. S. Immunology 2004, 113, 413-426.
15. Pitman, M. C.; Suits, F.; MacKerell, A. D., Jr.; Feller, S. E. Biochemistry 2004, 43, 15328.
16. Roach, C.; Feller, S. E.; Ward, J. A.; Shaikh, S. R.; Zerouga, M.; Stillwell, W. Biochemistry 2004, 43, 6344-6351.
17. Singh, S. C.; Sinha, R. P.; Häder, D.-P. Acta Protozool. 2002, 41, 297-308.
18. Weber, M. H. W.; Klein, W.; Muller, L.; NiesMarahiel, U. M. Mol. Microbiol. 2001, 39, 1321-1329.
19. Koynova, R.; Tenchov, B. Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 2001, 6, 277-286.
20. Aguilar, P. S.; Hernandez-Arriaga, A. M.; Cybulski, L. E.; Erazo, A. C.; De Mendoza, D. EMBO J. 2001, 20, 1681-1691.
21. Tatzer, V.; Zellnig, G.; Kohlwein, S. D.; Schneiter, R. Mol. Biol. Cell 2002, 13, 4429-4442.
22. Cullis, P. R.; Fenske, D. B.; Hope, M. J. New Compr. Biochem. 1996, 31, 1-33.
23. Sinensky, M. Proc Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1974, 71, 522-525.
24. Dey, I.; Buda, C.; Wiik, T.; Halver, J. E.; Farkas, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 7498-7502.
25. Petrini, G. A.; Altabe, S. G.; Uttaro, A. D. Eur. J. Biochem. 2004, 271, 1079-1086.
26. Sakamoto, T.; Murata, N. Curr. Opin. Microbiol. 2002, 5, 206-210.
27. Graumann, P. L.; Marahiel, M. A. J. Microbiol. Biotechnol. 1999, 1, 203-209.
28. Boggs, J. M.; Koshy, K. M.; Rangaraj, G. Biochemistry 1993, 32, 8908-8922.
29. Funari, S. S.; Barcelo, F.; Escriba, P. V. J. Lipid Res. 2003, 44, 567-575.
30. O'Connor, L. J.; Nicholas, T.; Levin, R. M. Adv. Exp. Med. Biol. 1999, 462, 265-273.
31. Hauser, H.; Howell, K.; Dawson, R. M.; Bowyer, D. E. Biochim. Biochim. Acta 1980, 602, 567-577.
32. Harris, R. B.; Foote, J. A.; Hakim, I. A.; Bronson, D. L.; Alberts, D. S. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 2005, 14, 906-912.
33. Escudero, A.; Montilla, J. C.; Garcia, J. M.; Sanchez-Quevedo, M. C.; Periago, J. L.; Hortelano, P.; Suarez, M. D. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1394, 65-73.
34. Vicario, I. M.; Malkova, D.; Lund, E. K.; Johnson, I. T. Ann. Nutr. Metab. 1998, 42, 160-169.
35. Pagnan, A.; Corocher, R.; Ambrosio, G. B.; Ferrari, S.; Guarini, P.; Piccolo, D.; Opportuno, A.; Bassi, A.; Olivieri, O.; Baggio, G. Clin. Sci. 1989, 76, 87-93.
36. Hardman, W. E. J. Nutr. 2004, 134, 34275-34305.
37. Tzonou, A.; Lipworth, L.; Kalandidi, A.; Trichopoulou, A.; Gamatsi, I.; Hsieh, C.-C.; Notara, V.; Trichopoulos, D. Br. J. Cancer 1996, 73, 1284-1290.
38. Ruiz-Gutierrez, V.; Muriana, F. J.; Guerrero, A.; Cert, A. M.; Villar, J. J. Hypertens. 1996, 14, 1483-1490.
39. Martin-Moreno, J. M.; Willett, W. C.; Gorgojo, L.; Banegas, J. R.; Rodriguez-Artalejo, F.; Fernandez-Rodriguez, J. C.; Maisonneuve, P.; Boyle, P. Int. J. Cancer 1994, 58, 774-780.
40. Dominiczak, A. F.; McLaren, Y.; Kusel, J. R.; Ball, D. L.; Goodfriend, T. L.; Bohr, D. F.; Reid, J. L. Am. J. Hypertens. 1993, 6, 1003-1008.
41. Ma, D. W.; Seo, J.; Switzer, K. C.; Fan, Y. Y.; McMurray, D. N.; Lupton, J. R.; Chapkin, R. S. J. Nutr. Biochem. 2004, 15, 700-706.
42. Rakheja, D.; Kapur, P.; Hoang, M. P.; Roy, L. C.; Bennett, M. J. Med. Hypotheses 2005, 65, 1120-1123.
43. Cistola, D. P.; Hamilton, J. A.; Jackson, D.; Small, D. M. Biochemistry 1988, 27, 1881-1888.
44. Aagaard, T. H.; Kristensen, M. N.; Westh, P. Biophys. Chem. 2006, 119, 61-68.
45. Kale, L.; Skeel, R.; Bhandarkar, M.; Brunner, R.; Gursoy, A.; Krawetz, N.; Phillips, J.; Shinozaki, A.; Varadarajan, K.; Schulten, K. J. Comput. Phys. 1999, 151, 283-312.
46. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Medura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
47. Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33-38.
48. Grubmuller, H. Solvate: a program to create atomic solvent models. 1996.
49. Feller, S. E.; Zhang, Y.; Pastor, R. W.; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 1995, 103, 4613-4621.
50. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593.
51. Hamilton, J. A.; Cistola, D. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83, 82-86.
52. Jensen, M. Ø.; Mouritsen, O. G.; Peters, G. H. Biophys. J. 2004, 86, 3556-3575.
53. Sonne, J.; Hansen, F. Y.; Peters, G. H. J. Chem. Phys. 2005, 122, 1-9.
54. Pedersen, U. R.; Peters, G. H.; Westh, P. Biophys. Chem. 2007, 125, 104-111.
55. Pedersen, U. R.; Leidy, C.; Westh, P.; Peters, G. H. Biochim. Biophys. Acta 2006, 1758, 573-582.
56. Sonne, J.; Jensen, M. Ø.; Hansen, F. Y.; Hemmingsen, L.; Peters, G. H. Biophys. J. 2007, 92, 4157-4167.
57. Douliez, J.-P.; Leonard, A.; Dufourc, E. J. Biophys. J. 1995, 68, 1727-1739.
58. Nagle, J. F.; Tristram-Nagle, S. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1469, 159-195.
59. Kucerka, N.; Liu, Y.; Chu, N.; Petrache, H. I.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. F. Biophys. J. 2005, 88, 2626-2637.
60. Ortiz, A.; Gomez-Fernandez, J. C. Chem. Phys. Lipids 1987, 45, 75-91.
61. Kratky, O.; Leopold, H.; Stabinge, H. Z. Angew. Phys. 1969, 27, 273-277.
62. McGlashan, M. L. Chemical Thermodynamics; Academic Press: London, 1979.
63. Højrup, P.; Davidsen, J.; Jørgensen, K. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 2649-2657.
64. Westh, P.; Trandum, C. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11334-11341.
65. Nagle, J. F.; Wilkinson, D. A. Biophys. J. 1978, 23, 159-175.
66. Goto, M.; Asada, E. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1978, 51, 2456-2459.
67. Ramazanova, A. G.; Yashkova, V. I.; Balmasova, O. V.; Korolev, V. V.; Ivanov, E. V. Russ. Chem. Bull., Int. Ed. 2006, 55, 666-671.
68. LipidBank, 2008.
69. Edholm, O.; Nagle, J. F. Biophys. J. 2005, 89, 1827-1832.
70. Greenwood, A. I.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. F. Chem. Phys. Lipids 2006, 143, 1-10.
71. Tieleman, D. P.; Berendsen, H. J. C. J. Chem. Phys. 1996, 105, 4871-4880.
72. Peters, G. H.; Tildesley, D. J. Langmuir 1996, 12, 1557-1565.
73. Peters, G. H.; Toxvaerd, S.; Olsen, O. H.; Svendsen, A. Langmuir 1995, 11, 4072-4081.
74. Peters, G. H.; Toxvaerd, S.; Olsen, O. H.; Svendsen, A. J. Chem. Phys. 1994, 100, 5996-6010.
75. Hansen, F. Y.; Taub, H. Phys. Rev. Lett. 1992, 69, 652-655.
76. Hansen, F. Y.; Newton, J. C.; Taub, H. J. Chem. Phys. 1993, 98, 4128-4141.
77. Karaboni, S.; Toxvaerd, S. J. Chem. Phys. 1992, 96, 5505-5516.
78. Pope, J.; Walker, L.; Dubro, D. Chem. Phys. Lipids 1984, 35, 259-277.
79. Ly, H. V.; Longo, M. L. Biophys. J. 2004, 87, 1013-1033.
80. Kantor, H. L.; Prestegard, J. H. Biochemistry 1978, 17, 3592-3597.
81. Egret-Charlier, M.; Sanson, A.; Ptak, M. FEBS Lett. 1978, 89, 313-316.
82. Cevc, G.; Seddon, J. M.; Hartung, R.; Eggert, W. Biochim. Biophys. Acta 1988, 940, 219-240.
83. Uhrikova, D. Chem. Phys. Lipids 2007, 145, 97-105.
84. Koenig, B. W.; Gawrisch, K. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1715, 65-70.
85. Armen, R. S.; Uitto, O. D.; Feller, S. E. Biophys. J. 1998, 75, 734-744.
86. Akers, H. A.; Gabler, D. G. Naturwissenschaften 1991, 78, 417-419.