The effect of π-stacking and H-bonding on ionization energies of a nucleobase: Uracil dimer cation

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 11, Issue 9, 2009, Pages 1303-1311

  Golubeva, Anna A ^a   Krylov, Anna I ^a  

^a UNIVERSITY OF SOUTHERN CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 60449101749     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b817284f     Document Type: Article

References (61)

1. D. Dougherty K. Wittel J. Meeks S. P. McGlynn J. Am. Chem. Soc. 1976 98 3815
2. S. Urano X. Yang P. LeBrenton J. Mol. Struct. 1989 214 315
3. G. Lauer W. Schäfer A. Schweig Tetrahedron Lett. 1975 16 45 3939
4. C. Yu T. O'Donnel P. LeBreton J. Phys. Chem. 1981 85 3851 3855
5. S. Kim W. Lee D. Herschbach J. Phys. Chem. 1996 100 7933 7937
6. E. Cauët D. Dehareng J. Liévin J. Phys. Chem. A 2006 110 9200 9211
7. D. Roca-Sanjuán M. Rubio M. Merchán L. Serrano- Andrés J. Chem. Phys. 2006 125 084302
8. E. Cauët J. Liévin Adv. Quantum Chem. 2007 52 121 147
9. K. Müller-Dethlefs P. Hobza Chem. Rev. 2000 100 143 167
10. J. Sponer J. Leszczynski P. Hobza Biopolimers 2002 61 3 31
11. C. Crespo-Hernández B. Cohen P. Hare B. Kohler Chem. Rev. 2004 104 1977 2019
12. H. Fernando G. Papadantonakis N. Kim P. LeBreton Proc. Nat. Acad. Sci. 1998 95 5550 5555
13. L. Belau K. Wilson S. Leone M. Ahmed J. Phys. Chem. A 2007 111 7562 7568
14. C. Crespo-Hernández D. Close L. Gorb J. Leszczynski J. Phys. Chem. B 2007 111 5386 5395
15. S. Schumm M. Prévost D. Garcia-Fresnadillo O. Lentzen C. Moucheron A. Krisch-De Mesmaeker J. Phys. Chem. B 2002 106 2763 2768
16. V. Chebny R. Shukla R. Rathore J. Phys. Chem. A 2006 110 13003 13006
17. H. Sugiyama I. Saito J. Am. Chem. Soc. 1996 118 7063 7068
18. F. Prat K. Houk C. Foote J. Am. Chem. Soc. 1998 120 845
19. G. Hutchison M. Ratner T. Marks J. Am. Chem. Soc. 2005 127 16866 16881
20. D. Roca-Sanjuán M. Merchán L. Serrano-Andrés Chem. Phys. Lett. 2008 349 188 196
21. M. Bixon J. Jortner J. Phys. Chem. A 2001 105 10322 10328
22. G. Schuster Acc. Chem. Res. 2000 33 253 260
23. F. Lewis R. Letsinger M. Wasielewski Acc. Chem. Res. 2001 34 159 170
24. R. Rathore S. Abdelwahed I. Guzei J. Am. Chem. Soc. 2003 125 8712 8713
25. F. Gervasio A. Laio M. Parrinello M. Boero Phys. Rev. Lett. 2005 94 158103
26. E. Bittner J. Chem. Phys. 2006 125 094909
27. E. Davidson W. Borden J. Phys. Chem. 1983 87 4783 4790
28. N. Russ T. Crawford G. Tschumper J. Chem. Phys. 2004 120 7298 7306
29. J. Nash R. Squires J. Am. Chem. Soc. 1996 118 11872 11883
30. W. Eisfeld K. Morokuma J. Chem. Phys. 2000 113 5587 5597
31. P. Pieniazek S. Bradforth A. Krylov J. Chem. Phys. 2008 129 074104
32. V. Polo E. Kraka D. Cremer Mol. Phys. 2002 100 1771 1790
33. Y. Zhang W. Yang J. Chem. Phys. 1998 109 7 2604 2608
34. T. Bally G. Sastry J. Phys. Chem. A 1997 101 7923 7925
35. M. Lundber P. Siegbahn J. Chem. Phys. 2005 122 224103 1 9
36. V. Vanovschi A. Krylov P. Wenthold Theor. Chim. Acta 2008 120 45 58
37. P. Pieniazek J. VandeVondele P. Jungwirth A. Krylov S. Bradforth J. Phys. Chem. A 2008 112 6159 6170
38. D. Sinha D. Mukhopadhyay D. Mukherjee Chem. Phys. Lett. 1986 129 369 374
39. S. Pal M. Rittby R. Bartlett D. Sinha D. Mukherjee Chem. Phys. Lett. 1987 137 273 278
40. J. Stanton J. Gauss J. Chem. Phys. 1994 101 10 8938 8944
41. M. Nooijen R. Bartlett J. Chem. Phys. 1995 102 3629 3647
42. P. Pieniazek A. Krylov S. Bradforth J. Chem. Phys. 2007 127 044317
43. P. Pieniazek S. Arnstein S. Bradforth A. Krylov C. Sherrill J. Chem. Phys. 2007 127 164110
44. P. Pieniazek, E. Sundstrom, S. Bradforth and A. Krylov, to be published, 2008
45. P. Atkins and R. Friedman, Molecular Quantum Mechanics, Oxford University Press, New York, 2005
46. P. Jurečka J. Šponer J. Černú P. Hobza Phys. Chem. Chem. Phys. 2006 8 1985
47. M. Pitoňák K. Riley P. Neogrády P. Hobza Comp. Phys. Comm. 2008 9 1636 1644
48. M. Sinnokrot C. Sherrill J. Phys. Chem. A 2004 108 10200 10207
49. M. Sinnokrot C. Sherrill J. Phys. Chem. A 2006 110 10656 10668
50. H. Nakatsuji K. Hirao J. Chem. Phys. 1978 68 2053 2065
51. H. Nakatsuji K. Ohta K. Hirao J. Chem. Phys. 1981 75 2952
52. H. Nakatsuji Chem. Phys. Lett. 1991 177 3 331 337
53. A. Krylov Annu. Rev. Phys. Chem. 2008 59 433 462
54. S. Levchenko T. Wang A. Krylov J. Chem. Phys. 2005 122 224106 224116
55. M. Oana A. Krylov J. Chem. Phys. 2007 127 234106
56. We found that this functional yields geometries that are in good agreement with the EOM-IP-CCSD ones in the case of the ionized benzene dimers (P. Pieniazek, private communication).
57. A. Golubeva and A. Krylov, 2008
58. W. Hehre R. Ditchfield J. Pople J. Chem. Phys. 1972 56 2257
59. R. Krishnan J. Binkley R. Seeger J. Pople J. Chem. Phys. 1980 72 650
60. T. Dunning J. Chem. Phys. 1989 90 1007 1023
61. Y. Shao L. F. Molnar Y. Jung J. Kussmann C. Ochsenfeld S. Brown A. T. B. Gilbert L. V. Slipchenko S. V. Levchenko D. P. O'Neil R. A. Distasio, Jr R. C. Lochan T. Wang G. J. O. Beran N. A. Besley J. M. Herbert C. Y. Lin T. Van Voorhis S. H. Chien A. Sodt R. P. Steele V. A. Rassolov P. Maslen P. P. Korambath R. D. Adamson B. Austin J. Baker E. F. C. Bird H. Daschel R. J. Doerksen A. Drew B. D. Dunietz A. D. Dutoi T. R. Furlani S. R. Gwaltney A. Heyden S. Hirata C.-P. Hsu G. S. Kedziora R. Z. Khalliulin P. Klunziger A. M. Lee W. Z. Liang I. Lotan N. Nair B. Peters E. I. Proynov P. A. Pieniazek Y. M. Rhee J. Ritchie E. Rosta C. D. Sherrill A. C. Simmonett J. E. Subotnik H. L. Woodcock III W. Zhang A. T. Bell A. K. Chakraborty D. M. Chipman F. J. Keil A. Warshel W. J. Herhe H. F. Schaefer III J. Kong A. I. Krylov P. M. W. Gill M. Head-Gordon Phys. Chem. Chem. Phys. 2006 8 3172 3191