Exploring the effects of intramolecular vibrational energy redistribution on the operation of the proton wire in green fluorescent protein

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 42, 2008, Pages 13443-13452

  Vendrell, Oriol ^b   Gelabert, Ricard ^a   Moreno, Miquel ^a   Lluch, José M ^a  

^a UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA   (Spain)

^b UNIVERSITY OF HEIDELBERG   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DYNAMICS; ENERGY TRANSFER; FLUORESCENCE; LIGHT EMISSION; LUMINESCENCE; MECHANICS; PROTEINS; PROTONS; QUANTUM THEORY; WIRE;

CHARACTERISTIC TIMES; DEGREES OF FREEDOMS; DONOR AND ACCEPTORS; GREEN FLUORESCENT PROTEINS; HARMONIC OSCILLATORS; INTRAMOLECULAR VIBRATIONAL ENERGY REDISTRIBUTIONS; QUANTUM DYNAMICS; RISE TIMES; STRONG COUPLINGS; VIBRATIONAL ENERGIES;

PROTON TRANSFER;

EID: 55649083555     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp805049c     Document Type: Article

References (27)

1. Zimmer, M. Chem. Rev. 2002, 102, 759-781.
2. Yang, F.; Moss, L. G.; Phillips, G. N. Nat. Biotechnol. 1996, 14, 1246-1251
3. Brejc, K.; Sixma, T. K.; Kitts, P. A.; Kain, S. R.; Tsien, R. Y.; Ormö, M.; Remington, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 2306-2311.
4. Niwa, H.; Inouye, S.; Hirano, T.; Matsuno, T.; Kojima, S.; Kubota, M.; Ohashi, M.; Tsuji, F. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 13617-13622.
5. Heim, R.; Cubitt, A. B.; Tsien, R. Y. Nature 1995, 373, 663-664.
6. Ormö, M.; Cubitt, A. B.; Kallio, K.; Gross, L. A.; Tsien, R. Y.; Remington, S. J. Science 1996, 273, 1392-1395.
7. Chattoraj, M.; King, B. A.; Bublitz, G. U.; Boxer, S. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 8362-8367.
8. Palm, G. J.; Zdanov, A.; Gaitanaris, G. A.; Stauber, R.; Pavlakis, G. N.; Wlodawer, A. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 361-365.
9. Lill, M. A.; Helms, V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 2778-2781.
10. Weber, W.; Helms, V.; McCammon, J. A.; Langhoff, P. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 6177-6182.
11. Vendrell, O.; Gelabert, R.; Moreno, M.; Lluch, J. M. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 5500-5511.
12. Vendrell, O.; Gelabert, R.; Moreno, M.; Lluch, J. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 3564-3574.
13. Vendrell, O.; Gelabert, R.; Moreno, M.; Lluch, J. M. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1138-1150.
14. Sinicropi, A.; Andruniow, T.; Ferre, N.; Basosi. R.; Olivucci, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 11534-11535.
15. Marks, D.; Prosposito, P.; Zhang, H.; Glasheek, M. Chem. Phys. Lett. 1998, 289, 535-540.
16. De Belder, G.; Schweitzer, G.; Jordens, S.; Lor, M.; Mitra, S.; Hofkens, J.; De Feyter, S.; Van der Auweraer, M.; Herrmann, A.; Weil, T.; Müllen, K.; De Schryver, F. C. Chem. Phys. Chem. 2001, 2, 49-55.
17. Chou, P. T.; Chen, Y. C.; Yu, W. S.; Chou, Y. H.; Wei, C. Y.; Cheng. Y. M. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 1731-1740.
18. Gelabert, R.; Moreno, M.; Lluch, J. M. Chem. Phys. Chem. 2004, 5, 1372-1378.
19. Meyer, H.-D.; Manthe, U.; Cederbaum, L. S. Chem. Phys. Lett. 1990, 165, 73-78.
20. Beck, M. H.; Jäckle, A.; Worth, G. A.; Meyer, H.-D. Phys. Rep. 2000, 324, 1-105.
21. Meyer, H.-D.; Worth, G. A. Theor. Chem. Acc. 2003, 109, 251-267.
22. Worth, G. A.; Beck, M. H.; Jäckle, A.; Meyer, H.-D.; Heitz, M.-C.; Wefing, S.; Manthe, U.; Sukiasyan, S.; Raab, A.; Ehara, M.; Cattarius, C.; Gatti, F.; Otto, F.; Nest, M.; Markmann, A.; Brill, M. R.; Vendrell, O. The MCTDH Package, Versions 8.3, 8.4; See http://www.pci.uni-heidelberg.de/tc/usr/ mctdh, 2000-2007.
23. Warshel, A. J. Phys. Chem. 1982, 86, 2218-2224.
24. Vendrell, O.; Meyer, H.-D. J. Chem. Phys. 2005, 122, 104505.
25. Kim, S. Y.; Hammes-Schiffer, S. J. Chem. Phys. 2006, 124, 244102.
26. Wang, H. B.; Thoss, M.; Sorge, K. L.; Gelabert, R.; Giménez, X.; Miller, W. H. J. Chem. Phys. 2001, 114, 2562-2571.
27. Caldeira, A.; Leggell, A. J. Phys. Rev. Lett. 1981, 46, 211-214.