Ligand-induced tertiary relaxations during the T-to-R quaternary transition in hemoglobin

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 40, 2008, Pages 12790-12794

  Ronda, Luca ^a   Abbruzzetti, Stefania ^a   Bruno, Stefano ^a   Bettati, Stefano ^a   Mozzarelli, Andrea ^a   Viappiani, Cristiano ^a  

^a UNIVERSITY OF PARMA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GELATION; GELS; HEMOGLOBIN; PHOTOLYSIS; RATE CONSTANTS; SILICA; SILICA GEL;

ALLOSTERIC EFFECTORS; ELUSIVE; FUNCTION OF TIMES; FUNCTIONAL CHANGES; HUMAN HEMOGLOBINS; MAXIMUM ENTROPIES; NANOPOROUS SILICAS; NANOSECOND LASERS; QUATERNARY TRANSITIONS; REACTION INTERMEDIATES; REBINDING KINETICS;

COLLOIDS;

EID: 54549087647     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp803040j     Document Type: Article

References (47)

1. Henry, E. R.; Jones, C. M.; Hofrichter, J.; Eaton, W. A. Biochemistry 1991, 36, 6511-6528.
2. Jones, C. M.; Ansari, A.; Henry, E. R.; Christoph, G. W.; Hofrichter, J.; Eaton, W. A. Biochemistry 1992, 31, 6692-6702.
3. Blough, N. V.; Hoffman, B. M. Biochemistry 1984, 23, 2875-2882.
4. Shibayama, N.; Imai, K.; Morimoto, H.; Saigo, S. Biochemistry 1995, 34, 4773-4780.
5. Bruno, S.; Bettati, S.; Manfredini, M.; Mozzarelli, A.; Bolognesi, M.; Deriu, D.; Rosano, C.; Tsuneshige, A.; Yonetani, T.; Henry, E. R. Protein Sci. 2000, 9, 683-692.
6. Miyazaki, G.; Morimoto, H.; Yun, K. M.; Park. S. Y.; Nakagawa, A.; Minagawa, H.; Shibayama, N. J. Mol. Biol. 1999, 292, 1121-1136.
7. Shibayama, N.; Yonetani, T.; Regan, R. M.; Gibson, Q. H. Biochemistry 1995, 34, 14658-14667.
8. Sudhakar, K.; Laberge, M.; Tsuneshige, A.; Vanderkooi, J. M. Biochemistry 1998, 37, 7177-7184.
9. McKinnie, R. E.; Olson, J. S. 7. Biol. Cheat. 1981, 256, 8928-8932.
10. Shibayama, N.; Saigo, S. J. Mol. Biol. 1995, 257, 203-209.
11. Bettati, S.; Pioselli, B.; Carapanini, B.; Viappiani, C.; Mozzarelli, A. In Encyclopedia of Nanoscience and Nonotechnology; Nalwa, H. S. Ed.; American Scientific Publishers, Valencia, California, 2004; Vol. 9, pp 81-103.
12. Das, T. K.; Khan, I.; Rousseau, D.; Friedman, J. M. Biospectroscopy 1999, 5, S64-S70.
13. Juszczak, L. J.; Friedman, J. M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 30357-30360.
14. Samuni, U.; Dantsker, D.; Khan, I.; Friedman, A. J.; Peterson, E.; Friedman, J. M. J. Biol. Chem. 2002, 277, 25783-25790.
15. Samuni, U.; Juszczak, L.; Dantsker, D.; Khan, I.; Friedman, A. J.; Perez-Gonzalez-de-Apodaca, J.; Bruno, S.; Hui, H. L.; Colby, J. E.; Karasik, E.; Kwiatkowski, L. D.; Mozzarelli, A.; Noble, R. W.; Friedman, J. M. Biochemistry 2003, 42, 8272-8288.
16. Samuni, U.; Dantsker, D.; Juszczak, L. J.; Bettati, S.; Ronda, L.; Mozzarelli, A.; Friedman, J. M. Biochemistry 2004, 43, 13674-13682.
17. Samuni, U.; Roche, C. J.; Dantsker, D.; Jnszczak, L. J.; Friedman, J. M. Biochemistry 2006, 45, 2820-2835.
18. Ronda, L.; Bruno, S.; Viappiani, C.; Abbruzzetti, S.; Mozzarelli, A.; Lowe, K. C.; Bettati, S. Protein Sci. 2006, 15, 1961-1967.
19. Shibayama, N.; Saigo, S. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 444-445.
20. Shibayama, N.; Saigo, S. FEBS Lett. 2001, 429, 50-53.
21. Khan, I.; Shannon, C. F.; Dantsker, D.; Friedman, A. J.; Perez-Gonzales-de-Apodaca, J.; Friedman, J. M. Biochemistry 2000, 39, 16099-16109.
22. Abbruzzetti, S.; Viappiani, C.; Bruno, S.; Bettati, S.; Bonaccio, M.; Mozzarelli, A. J. Nanosci. Nanotech. 2001, 1, 407-415.
23. Bruno, S.; Bonaccio, M.; Bettati, S.; Rivetti, C.; Viappiani, C.; Abbruzzetti, S.; Mozzarelli, A. Protein Sci. 2001, 10, 2401-2407.
24. Viappiani, C.; Bettati, S.; Bruno, S.; Ronda, L.; Abbruzzetti, S.; Mozzarelli, A.; Eaton, A. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 14414-14419.
25. Sottini, S.; Abbruzzetti, S.; Viappiani, C.; Bettati, S.; Ronda, L.; Mozzarelli, A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 11411-11413.
26. Sottini, S.; Abbruzzetti, S.; Viappiani, C.; Ronda, L.; Mozzarelli, A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 19523-19528.
27. Sottini, S.; Abbruzzetti, S.; Spyrakis. F.; Bettati, S.; Ronda, L.; Mozzareili, A.; Viappiani, C. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17427-17432.
28. Samnni, U.; Roche, C. J.; Dantsker, D.; Friedman, J. M. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 12756-12764.
29. Henry, E. R.; Bettati, S.; Hofrichter, J.; Eaton, W. A. Biophys. Chem. 2002, 98, 149-164.
30. Eaton, W. A.; Henry, E. R.; Hofrichter, J.; Bettati, S.; Viappiani, C.; Mozzarelli, A. IUBMB Life 2007, 59, 586-599.
31. Monod, J.; Wyman, J.; Changeux, J. P. J. Mol. Biol. 1965, 12, 88-118.
32. Brunori, M.; Coletta, M.; DiCera, E Biophys. Chem. 1986, 23, 215-222.
33. Gill, S. J.; Robert, C. H.; Coletta, M.; DiCera, E.; Brunori, M. Biophys. J. 1986, 50, 747-752.
34. Szabo, A.; Karplus, M. J. Mol. Biol. 1972, 72, 163-197.
35. Lee, A. W.-M.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 1983, 80, 7055-7059.
36. Lee, A. W.-M.; Karplus, M.; Poyart, C.; Bursaux, E. Biochemistry 1988, 27, 1285-1301.
37. Rivetti, C.; Mozzarelli, A.; Rossi, G. L.; Henry, E. R.; Eaton, W. A. Biochemistry 1993, 32, 2888-2906.
38. Sottini, S.; Viappiani, C.; Ronda, L.; Bettati, S.; Mozzarelli, A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 8475-8484.
39. Abbruzzetti, S.; Viappiani, C.; Bruno, S.; Mozzarelli, A. Chem. Phys. Lett. 2001, 346, 430-436.
40. Abbruzzetti, S.; Bruno, S.; Faggiano, S.; Grandi, E.; Mozzarelli, A.; Viappiani, C. Photochem. PhotobioL Sci. 2006, 5, 1109-1120.
41. Abbruzzetti, S.; Bruno, S.; Faggjaoo, S.; Rooda, L.; Grandi, E.; Mozzarelli, A.; Viappiani, C. Globins and other NO-Reactive Proteins in Microbes, Plants and Invertebrates. Methods Emymol. 2007, 437, 327-343.
42. Steinbach, P. J. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2002, 42, 1476-1478.
43. Steinbach, P. J.; lonescu, R.; Matthews, C. R. Biophys. J. 2002, 82, 2244-2255.
44. Henry, E. R.; Sommer, J. H.; Hofrichter, J.; Eaton, W. A. J. Mol. Biol. 1983, 166, 443-451.
45. Terreau, C.; Blouquit, Y.; Novikov, E.; Quiniou, E.; Lavalette, D. Biophys. J. 2004, 86, 435-447.
46. Schirò, G.; Cupane, A. Biochemistry 2007, 46, 11568-11576.
47. Eaton, W. A.; Henry, E R.; Hofrichter, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 4472-4475.