Synthesis of formacetal-linked dinucleotides to facilitate dsDNA bending and binding to the homeodomain of Pax6

European Journal of Organic Chemistry

Volumn , Issue 12, 2008, Pages 2100-2106

  Pitulescu, Marian ^a   Grapp, Marcel ^a   Krätzner, Ralph ^a   Knepel, Willhart ^a   Diederichsen, Ulf ^a  

^a UNIVERSITY OF GÖTTINGEN   (Germany)

Author keywords

DNA bending; DNA recognition; Formacetal linker; Pax6 homeodomain; Transcription

Indexed keywords

EID: 53749102727     PISSN: 1434193X     EISSN: 10990690     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/ejoc.200701178     Document Type: Article

References (28)

1. P. J. Mitchell, R. Tjian, Science 1989, 245, 371.
2. C. F. Calkhoven, G. Ab, Biochem. J. 1996, 317, 329.
3. M. Sander, A. Neubuser, J. Kalamaras, H. C. Ee, G. R. Martin, M. S. German, Genes Dev. 1997, 11, 1662.
4. R. Grzeskowiak, J. Amin, E. Oetjen, W. Knepel, J. Biol. Chem. 2000, 275, 30037.
5. Z. Kozmik, Curr. Opin. Genet. Dev. 2005, 15, 430.
6. G. Jiang, B. B. Zhang, Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab. 2003, 284, 671.
7. R. W. Gelling, X. Q. Du, D. S. Dichmann, J. Romer, H. Huang, L. Cui, S. Obici, B. Tang, J. J. Holst, C. Fledelius, P. B. Johansen, L. Rossetti, L. A. Jelicks, P. Serup, E. Nishmura, M. J. Charron, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 1438.
8. L. St-Onge, B. Sosa-Pineda, K. Chowdhury, A. Mansouri, P. Gruss, Nature 1997, 387, 406.
9. R. H. Unger, L. Orci, N. Engl. J. Med. 1981, 304, 1518.
10. R. H. Unger, L. Orci, N. Engl. J. Med. 1981, 304, 1575.
11. S. Schinner, A. Barthel, C. Dellas, R. Grzeskowiak, S. K. Sharma, E. Oetjen, R. Blume, W. Knepel, J. Biol. Chem. 2005, 280, 7369.
12. P. J. Lefebvre, Diabetes Care 1995, 18, 715.
13. C. Punzo, S. Kurata, W. J. Gehring, Genes Dev. 2001, 15, 1716.
14. Y. Zhang, S. W. Emmons, Nature 1995, 377, 55.
15. D. Wilson, G. Sheng, T. Lecuit, N. Dostatni, C. Desplan, Genes Dev. 1993, 7, 2120.
16. D. S. Wilson, B. Guenther, C. Desplan, J. Kuriyan, Cell 1995, 82, 709.
17. Y. Fichou, C. Ferec, Trends Biotechnol. 2006, 24, 563.
18. J. Micklefield, Curr. Med. Chem. 2001, 8, 1157.
19. X. Gao, F. K. Brown, P. Jeffs, N. Bischofberger, K.-Y. Lin, A. J. Pipe, S. A. Noble, Biochemistry 1992, 31, 6228.
20. G.-X. He, J. P. Williams, M. J. Postich, S. Swaminathan, R. G. Shea, T. Terhorst, V. S. Law, C. T. Mao, C. Sueoka, S. Coutré, N. Bischofberger, J. Med. Chem. 1998, 41, 4224.
21. A. D. Mirzabekov, A. Rich, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1979, 76, 1118.
22. a) M. Matteucci, Tetrahedron Lett. 1990, 31, 2385;
23. b) R. J. Jones, K.-Y. Lin, J. F. Milligan, S. Wadwani, M. D. Matteucci, J. Org. Chem. 1993, 58, 2983.
24. G. H. Veeneman, G. A. van der Marel, H. van den Elst, J. H. van Boom, Tetrahedron 1991, 47, 1547.
25. P. L. M. Quaedflieg, C. Timmers, G. A. van der Marel, E. Kuyl-Yeheskiely, J. H. van Boom, Synthesis 1993, 627.
26. M. J. Gait, Oligonucleotide Synthesis - A Practical Approach, IRL Oxford University Press, Oxford, 1984.
27. I. Mikkola, J. A. Bruun, T. Holm, T. Johansen, J. Biol. Chem. 2001, 276, 4109.
28. W. Knepel, L. Jepeal, J. F. Habener, J. Biol. Chem. 1990, 265, 8725.