Interaction of C60 derivatives and ssDNA from simulations

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 112, Issue 24, 2008, Pages 8898-8906

  Zhao, Xiongce ^a  

^a OAK RIDGE NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMISTIC MODELLING; INTERACTION OF WATER;

FLOW INTERACTIONS;

EID: 53549119413     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp801180w     Document Type: Article

References (43)

1. Kroto, H. W.; Heath, J. R.; O'Brien, S. C.; Curl, R. F.; Smalley, R. E. Nature 1985, 318, 162.
2. Kratschmer, W.; Lamb, L. D.; Rostiropoulos, K.; Huffman, D. R. Nature 1990, 347, 354.
3. Howard, J. B.; McKinnon, J. T.; Makarovsky, Y.; Lafleur, A. L.; Johnson, M. E. Nature 1991, 352, 139.
4. Hamza, A. V.; Balooch, M. Chem. Phys. Lett. 1993, 201, 404.
5. Deguchi, S.; Alargova, R. G.; Tsuji, K. Langmuir 2001, 17, 6013.
6. Guldi, D. M.; Rato, M. Acc. Chem. Res. 2000, 33, 695.
7. Martin, N.; Sanchez, L.; Llescas, B.; Perez, I. Chem. Rev. 1998, 98, 2527.
8. Da Ros, T.; Prato, M. Chem. Commun. 1999, 663.
9. Tokuyama, H.; Yamago, S.; Nakamura, E.; Shiraki, T.; Sugiura, Y. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 7918.
10. Friedman, S. H.; DeCamp, D. L.; Sijbesma, R. P.; Srdanov, G.; Wudl, R.; Kenyon, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 6506.
11. Sijbesma, R.; Srdanov, G.; Wudl, F.; Castoro, J. A.; Wilkins, C.; Friedman, S. H.; DeCamp, D. L.; Kenyon, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 6510.
12. Korobov, M. V.; Smith, A. L. Fullerenes: Chemistry, Physics, and Technology; Kadish, K. M., Ruoff, R. S., Eds.; Wiley-Interscience: New York, 2000; pp 53-89.
13. Diederich, F.; Gomez-Lopez, M. Chem. Soc. Rev. 1999, 28, 263-277.
14. Ikeda, A.; Hatano, T.; Kawaguchi, M.; Suenaga, H.; Shinkai, S. Chem. Comm. 1999, 15, 1403-1404.
15. Atwood, J. L.; Koutsantonis, G. A.; Raston, C. L. Nature 1994, 368, 229-231.
16. Scrivens, W. A.; Tour, J. M.; Creek, K. E.; Pirisi, L. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 4517.
17. Chiang, L. Y.; Upasani, R. B.; Swirczewski, J. W. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10154-10157.
18. Hirsch, A. Chemistry of Fullerenes; Thieme: Stuttgart, 1994.
19. Diederich, F.; Kessinger, R. Templated Organic Synthesis; Diederich, F., Stang, P., Eds.; Wiley-VCH: Weinheim, 2000; pp 189-218.
20. Nakamura, E.; Isobe, H. Acc. Chem. Res. 2003, 36, 807-815.
21. Nelson, M. A.; Domann, F. E.; Bowden, G. T.; Hooser, S. B.; Fernando, Q.; Carter, D. E. Toxicol, Ind. Health 1993, 9, 623-630.
22. Tabata, Y.; Murakami, Y.; Ikada, Y. Jpn. J. Cancer Res. 1997, 88, 11108-11116.
23. Yamago, S.; Tokuyama, H.; Nakamura, E.; Kikuchi, K.; Kananishi, S.; Sueki, K.; Nakhara, H.; Enomoto, S.; Ambe, F. Chem. Biol. 1995, 2, 385-389.
24. Ranean, F.; Rosan, S.; Boehm, F.; Cantrell, A.; Brellreich, M.; Schoenberger, H.; Hirsch, A.; Moussa, F. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 2002, 67, 157-162.
25. Oberdörster, E. Environ. Health Perspect. 2004, 112, 1058.
26. Bosi, S.; Feruglio, L.; Ros, T. D.; Spalluto, G.; Gregoretti, B.; Terdoslavich, M.; Decorti, G.; Passamonti, S.; Moro, S.; Prato, M. J. Med. Chem. 2004, 47, 6711.
27. Tsuchaya, T.; Oguri, I.; Yamakoshi, Y. N.; Miyata, N. FEBS Lett. 1996, 393, 139.
28. Boutorine, A. S.; Tokuyama, H.; Takasugi, M.; Isobe, H.; Nakamura, E.; Helene, C. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 2462-2465.
29. Yamakoshi, Y. N.; Yagami, T.; Sueyoshi, S.; Miyata, N. J. Org. Chem. 1996, 61, 7236-7237.
30. Zhao, X. C.; Striolo, A.; Cummings, P. T. Biophys. J. 2005, 89, 3856.
31. Nakamura, E.; Isobe, H.; Tomita, N.; Sawamura, M.; Jinno, S.; Okayama, H. Angew. Chem, Int. Ed 2000, 39, 4254-4257.
32. Jorgensen, W. L. J. Am. Chan. Soc. 1981, 103, 335.
33. MacKerell, A. D., Jr J. Phys. Chem B 1998, 102, 3586.
34. Klähn, M.; Mathias, G.; Kötting, C.; Nonella, M.; Schlitter, J.; Gerwert, K.; Tavan, P. J. Phys. Chem A 2004, 108, 6186-6194.
35. Zhu, Z. W.; Schuster, D. I.; Tuckerman, M. E. Biochemistry 2003, 42, 1326-1333.
36. Cheatham, T. E., III; Kollman, P. A. Annu. Rev. Phys. Chem. 2000, 51, 435.
37. Cheatham, T. E., III; Young, M. A. Biopolymers 2001, 56, 232.
38. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Nola, A. D.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684.
39. Kale, L.; Skeel, R.; Bhandarkar, M.; Brunner, R.; Gursoy, A.; Kraweta, N.; Phillips, J.; Shinozaki, A.; Varadarajan, K.; Schulten, K. J. Comput. Phys. 1999, 151, 283.
40. Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 4613-4621.
41. Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 1.
42. Sygula, A.; Fronczek, F. R.; Sygula, R.; Rabideau, P. W.; Olmstead, M. M. J. Am Chem. Soc. 2007, 129, 3842.
43. Raschke, T. M.; Levitt, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 6777.