Nitrogen-15 NMR spectroscopy of N-metallated nucleic acids: Insights into 15N NMR parameters and N-metal bonds

Dalton Transactions

Volumn , Issue 37, 2008, Pages 4965-4974

  Tanaka, Yoshiyuki ^a   Ono, Akira ^b  

^a TOHOKU UNIVERSITY   (Japan)

^b KANAGAWA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACIDS; METALS; NITROGEN; NONMETALS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; NUCLEIC ACIDS; SOLUTIONS;

AQUEOUS SOLUTIONS; COORDINATION BONDS; METAL CATIONS; NMR SPECTROS COPY; NUCLEOBASES;

SPECTROSCOPY;

DNA; HEAVY METAL; NITROGEN; RNA;

ARTICLE; BINDING SITE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CONFORMATION; METHODOLOGY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; NUCLEOTIDE SEQUENCE; STANDARD;

BASE SEQUENCE; BINDING SITES; DNA; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; METALS, HEAVY; MODELS, MOLECULAR; NITROGEN; NITROGEN ISOTOPES; NUCLEIC ACID CONFORMATION; REFERENCE STANDARDS; RNA;

EID: 52349103588     PISSN: 14779226     EISSN: 14779234     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b803510p     Document Type: Article

References (101)

1. S. J. Lippard, and J. M. Berg, in Principles of Bioinorganic Chemistry, University Science Books, California, 1996
2. W. Saenger, in Principle of Nucleic Acid Structures, Springer-Verlag, New York, 1984
3. J. L. Sussman S. R. Holbrook R. W. Warrant G. M. Church S.-H. Kim J. Mol. Biol. 1978 123 607 630
4. S.-O. Shan A. V. Kravchuk J. A. Piccirilli D. Herschlag Biochemistry 2001 40 5161
5. J. Marmur P. Doty J. Mol. Biol. 1962 5 109 118
6. W. F. Dove N. Davidson J. Mol. Biol. 1962 5 467 478
7. M. T. Record, Jr. Biopolymers 1967 5 975 992
8. V. A. Bloomfield, D. M. Crothers, and I., Jr. Tinoco, Physical Chemistry of Nucleic Acids, Harper & Row, New York, 1974
9. C. F. Anderson M. T. Record, Jr. Ann. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1990 19 423 465
10. V. K. Misra D. E. Draper J. Mol. Biol. 1999 294 1135 1147
11. Y. Tanaka E. H. Morita H. Hayashi Y. Kasai T. Tanaka K. Taira J. Am. Chem. Soc. 2000 122 11303 11310
12. Y. Tanaka C. Kojima E. H. Morita Y. Kasai K. Yamasaki A. Ono M. Kainosho K. Taira J. Am. Chem. Soc. 2002 124 4595 4601
13. Y. Tanaka Y. Kasai S. Mochizuki A. Wakisaka E. H. Morita C. Kojima A. Toyozawa Y. Kondo M. Taki Y. Takagi A. Inoue K. Yamasaki K. Taira J. Am. Chem. Soc. 2004 126 744 752
14. Y. Tanaka K. Taira Chem. Commun. 2005 2069 2079
15. Y. Miyake H. Togashi M. Tashiro H. Yamaguchi S. Oda M. Kudo Y. Tanaka Y. Kondo R. Sawa T. Fujimoto T. Machinami A. Ono J. Am. Chem. Soc. 2006 128 2172 2173
16. Y. Tanaka H. Yamaguchi S. Oda M. Nomura C. Kojima Y. Kondo A. Ono Nucleosides, Nucleotides Nucleic Acids 2006 25 613 624
17. Y. Tanaka S. Oda H. Yamaguchi Y. Kondo C. Kojima A. Ono J. Am. Chem. Soc. 2007 129 244 245
18. C. J. Hutchins P. D. Rathjen A. C. Forster R. H. Symons Nucleic Acids Res. 1986 14 3627 3640
19. J. M. Buzayan A. Hampel G. Bruening Nucleic Acids Res. 1986 14 9729 9743
20. O. C. Uhlenbeck Nature 1987 328 596 600
21. D. E. Ruffner G. D. Stormo O. C. Uhlenbeck Biochemistry 1990 29 10695 10702
22. H. W. Pley K. M. Flaherty D. B. McKay Nature 1994 372 68 74
23. W. G. Scott J. T. Finch A. Klug Cell 1995 81 991 1002
24. W. G. Scott J. B. Murray J. R. Arnold B. L. Stoddard A. Klug Science 1996 274 2065 2069
25. J. B. Murray D. P. Terwey L. Maloney A. Karpeisky N. Usman L. Beigelman W. G. Scott Cell 1998 92 665 673
26. S. Katz J. Am. Chem. Soc. 1952 74 2238 2245
27. S. Katz Nature 1962 194 569
28. S. Katz Nature 1962 195 997 998
29. C. A. Thomas J. Am. Chem. Soc. 1954 76 6032 6034
30. W. F. Dove T. Yamane Biochem. Biophys. Res. Commun. 1960 3 608
31. T. Yamane N. Davidson J. Am. Chem. Soc. 1961 83 2599 2607
32. T. Yamane N. Davidson Biochim. Biophys. Acta 1962 55 780 782
33. D. W Gruenwedel N. Davidson J. Mol. Biol. 1966 21 129 144
34. D. W. Gruenwedel M. K. Cruikshank G. M. Smith J. Inorg. Biochem. 1993 52 251 261
35. D. W. Gruenwedel J. Inorg. Biochem. 1994 56 201 212
36. D. W. Gruenwedel Biophys. Chem. 1994 52 115 123
37. D. W. Gruenwedel Eur. J. Biochem. 1994 219 491 496
38. S. Mansy T. E. Wood J. C. Sprowle R. S. Tobias J. Am. Chem. Soc. 1974 96 1762 1770
39. S. Mansy R. S. Tobias J. Am. Chem. Soc. 1974 96 6874 6885
40. S. Mansy R. S. Tobias J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1974 957 958
41. S. Mansy J. P. Frick R. S. Tobias Biochim. Biophys. Acta 1975 378 319 332
42. S. Mansy R. S. Tobias Inorg. Chem. 1975 14 287 291
43. S. Mansy R. S. Tobias Biochemistry 1975 14 2952 2961
44. R. W. Chrisman S. Mansy H. J. Peresie A. Ranade T. A. Berg R. S. Tobias Bioinorg. Chem. 1977 7 245 266
45. A. J. Canty R. S. Tobias Inorg. Chem. 1979 18 413 417
46. R. Savoie J.-J. Jutier L. Prizant A. L. Beauchamp Spectrochim. Acta, Part A 1982 38 561 568
47. B. Morzyk-Ociepa D. Michalska J. Mol. Struct. 2001 598 133 144
48. B. Morzyk-Ociepa D. Michalska Spectrochim. Acta, Part A 2003 59 1247 1254
49. B. Morzyk-Ociepa M. J. Nowak D. Michalska Spectrochim. Acta, Part A 2004 60 2113 2123
50. J. A. Carrabine M. Sundaralingam Biochemistry 1971 10 292 299
51. L. D. Kosturko C. Folzer R. F. Stewart Biochemistry 1974 13 3949 3952
52. E. Buncel A. R. Norris W. J. Racz S. E. Taylor Inorg. Chem. 1981 20 98 103
53. E. Buncel C. Boone H. Joly R. Kumar A. R. J. Norris J. Inorg. Biochem. 1985 25 61 73
54. E. Buncel C. Boone H. Joly Inorg. Chim. Acta 1986 125 167 172
55. N. Å. Frøystein E. Sletten J. Am. Chem. Soc. 1994 116 3240 3250
56. N. Å. Frøystein, E. Sletten, NMR, Studies of Oligonucleotide-Metal Ion Interactions, A. Sigel, H. Sigel, eds., Metal Ions in Biological Systems., 32, 1996, 397-418
57. E. Sletten, W. Nerdal, Interaction, of Mercury with Nucleic Acids and Their Components, A. Sigel, H. Sigel, eds., Metal Ions in Biological Systems, 34, 1997, 479-501
58. J. Vinje E. Sletten Chem.-Eur. J. 2006 12 676 688
59. G. Wang B. L. Gaffney R. A. Jones J. Am. Chem. Soc. 2004 126 8908 8909
60. G. W. Buchanan J. B. Stothers Can. J. Chem. 1982 60 787 791
61. G. W. Buchanan M. J. Bell Can. J. Chem. 1983 61 2445 2448
62. G. W. Buchanan M. J. Bell Magn. Reson. Chem. 1986 24 493 497
63. M. Polak J. Plavec Eur. J. Inorg. Chem. 1999 547 555
64. M. Katahira H. Sato K. Mishima S. Uesugi S. Fujii Nucleic Acids Res. 1993 21 5418 5424
65. M. Katahira M. Kanagawa H. Sato S. Uesugi S. Fujii T. Kohno T. Maeda Nucleic Acids Res. 1994 22 2752 2759
66. A. Peracchi L. Beigelman N. Usman D. Herschlag Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996 93 11522 11527
67. A. Peracchi L. Beigelman E. C. Scott O. C. Uhlenbeck D. Herschlag J. Biol. Chem. 1997 272 26822 26826
68. E. C. Scott O. C. Uhlenbeck Nucleic Acids Res. 1999 27 479 484
69. S. Wang K. Karbstein A. Peracchi L. Beigelman D. Herschlag Biochemistry 1999 38 14363 14378
70. K. Yoshinari K. Taira Nucleic Acids Res. 2000 28 1730 1742
71. Y. Nakamatsu T. Kuwabara M. Warashina Y. Tanaka K. Yoshinari K. Taira Genes Cells 2000 5 603 612
72. M. Alei, Jr. L. O. Morgan W. E. Wageman Inorg. Chem. 1981 20 940 942
73. V. Sychrovsky J. Sponer P. Hobza J. Am. Chem. Soc. 2004 126 663 672
74. H. J. Jakobsen P. D. Ellis R. R. Inners C. F. J. Jensen J. Am. Chem. Soc. 1982 104 7442 7452
75. C. Damblon C. Prosperi L.-Y. Lian I. Barsukov R. P. Soto M. Galleni J.-M. Frere G. C. K. Roberts J. Am. Chem. Soc. 1999 121 11575 11576
76. S. Katz Biochim. Biophys. Acta 1963 68 240 253
77. Z. Kuklenyik L. G. Marzilli Inorg. Chem. 1996 35 5654 5662
78. G. Otting B. A. Messerle L. P. Soler J. Am. Chem. Soc. 1997 119 5425 5434
79. A. R. Butler C. Glidewell A. R. Hyde Polyhedron 1984 3 1165 1167
80. A. Bagno G. J. Saielli J. Am. Chem. Soc. 2007 129 11360 11361
81. A. J. Dingley S. J. Grzesiek J. Am. Chem. Soc. 1998 120 8293 8297
82. K. Pervushin A. Ono C. Fernández T. Szyperski M. Kainosho K. Wüthrich Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 14147 14151
83. M. Barfield A. J. Dingley J. Feigon S. J. Grzesiek J. Am. Chem. Soc. 2001 123 4014 4022
84. E. H. Curzon N. Herron P. Moore J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1980 721 725
85. M. Krumm E. Zangrando L. Randaccio S. Menzer A. Danzmann D. Holthenrich B. Lippert Inorg. Chem. 1993 32 2183 2189
86. J. Müller E. Zangrando N. Pahlke E. Freisinger L. Randaccio B. Lippert Chem.-Eur. J. 1998 4 397 405
87. F. Zamora M. Sabat B Lippert Inorg. Chem. 1996 35 4858 4864
88. M. Hopp A. Erxleben I. Rombeck B. Lippert Inorg. Chem. 1996 35 397 403
89. M. Hopp A. Erxleben I. Rombeck B. Lippert Inorg. Chem. 1996 35 6352
90. F. Zamora M. Kunsman M. Sabat B. Lippert Inorg. Chem. 1997 36 1583 1587
91. G. C. Levy, R. L. Lichiter, Nitrogen-15 Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy, John Wiley & Sons, Inc., New York, 1979
92. A. C. de Dios Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrom. 1996 29 229 278
93. A. C. Forster R. H. Symons Cell 1987 50 9 16
94. L. M. Pabon-Pena Y. Zhang L. M. Epstein Mol. Cell. Biol. 1991 11 6109 6115
95. Y. Zhang M. Epstein Gene 1996 172 183 190
96. O. Mitrasinovic L. M. Epstein Nucleic Acids Res. 1997 25 2189 2196
97. R. F. Collins D. L. Gellatly O. P. Sehgal M. G. Abouhaidar Virology 1998 241 269 275
98. M. Martick W. G. Scott Cell 2006 126 309 320
99. I. Onyido A. R. Norris E. Buncel Chem. Rev. 2004 104 5911 5929
100. J. Müller R. K.O. Sigel B. J. Lippert J. Inorg. Biochem. 2000 79 261 265
101. M. E. Ariza M. V. J. Williams Biochem. Mol. Toxicol. 1999 13 107 112