mRNA expression analysis and classification of colonic biopsy samples using oligonucleotide and cDNA microarray techniques;Vastagbél-biopsziás minták mRNS-expressziós vizsgálata és klasszifikációja oligonukleotid és cDNS microarray-technika segítségével

Orvosi Hetilap

Volumn 149, Issue 29, 2008, Pages 1373-1377

  Galamb, Orsolya ^a,b,c  

^a SEMMELWEIS UNIVERSITY   (Hungary)

^b INSTITUTE OF EXPERIMENTAL MEDICINE   (Hungary)

^c Semmelweis Egyetem   (Hungary)

Author keywords

Adenoma; Colorectal cancer; Gene expression pattern; Inflammatory bowel diseases; Microarray

Indexed keywords

COMPLEMENTARY DNA; MESSENGER RNA; OLIGONUCLEOTIDE; OSTEONECTIN; OSTEOPONTIN;

ARTICLE; CANCER GROWTH; COLON BIOPSY; COLORECTAL ADENOMA; COLORECTAL CARCINOMA; DIAGNOSTIC ACCURACY; DISEASE CLASSIFICATION; DNA MICROARRAY; ENTERITIS; FOLLOW UP; GENE EXPRESSION PROFILING; GENE IDENTIFICATION; GENE OVEREXPRESSION; HIGH THROUGHPUT SCREENING; HISTOPATHOLOGY; HUMAN; MALIGNANT TRANSFORMATION; MICROARRAY ANALYSIS; MICROFLUIDIC ANALYSIS; REPRODUCIBILITY; REVERSE TRANSCRIPTION POLYMERASE CHAIN REACTION; RNA ANALYSIS; STANDARDIZATION; VALIDATION STUDY;

EID: 49449085707     PISSN: 00306002     EISSN: 17886120     Source Type: Journal    
DOI: 10.1556/OH.2008.28397     Document Type: Article

References (25)

1. Cancer Research Campaign: Cancer statistics: Large bowel - UK. London: CRC. 1999.
2. Szentirmay Z., Csuka O.: A vastagbélrák molekuláris patológiája. In: A vastagbélrák megelozése és kezelése. Szerk.: Tulassay Zs. Springer Tudományos Kiadó, Budapest, 2004, 31-62.
3. O'Connell, J. B., Maggard, M. A., Ko, C. Y.: Colon cancer survival rates with the new American Joint Committee on Cancer sixth edition staging. J. Natl. Cancer Inst., 2004, 96, 1420-1425.
4. Herszényi, L., Sipos, F., Galamb, O. és mtsai: Matrix metalloproteinase-9 expression in the normal mucosa-adenoma-dysplasia-adenocarcinoma sequence of the colon. Pathol. Oncol. Res., 2008 (nyomtatásban).
5. Sipos, F., Galamb, O., Herszényi, L. és mtsai: Elevated insulin-like growth factor 1 receptor, hepatocyte growth factor receptor and telomerase protein expression in mildly active ulcerative colitis. Scand. J. Gastroenterol., 2008, 43, 289-298.
6. Hagymási K, Molnár B., Sipos F. és mtsai: A colorectalis rák kialakulásának ossejtelmélete és összefüggése a molekuláris biológiai adatokkal. Orv. Hetil., 2007, 148, 779-785.
7. Model, F., Osborn, N., Ahlquist, D. és mtsai: Identification and validation of colorectal neoplasia-specific methylation markers for accurate classification of disease. Mol. Cancer Res., 2007, 5, 153-163.
8. Miheller P., Müzes G., Galamb O. és mtsai: A gyulladásos bélbetegségek molekuláris háttere. Orv. Hetil., 2006, 147, 1395-1403.
9. Molnár, B., Sipos, F., Galamb, O. és mtsa: Molecular detection of circulating cancer cells. Dig. Dis., 2003, 21, 320-325.
10. Galamb, O., Gyorffy, B., Sipos, F. és mtsai: Inflammation, adenoma and cancer: objective classification of colon biopsy specimens with gene expression signature. Dis. Markers, 2008 (nyomtatásban).
11. Galamb, O., Gyorffy, B., Sipos, F. és mtsai: Helicobacter pylori and antrum erosion specific gene expression patterns: the discriminative role of CXCL13 and VCAM1 transcripts. Helicobacter, 2008, 13, 112-126.
12. Galamb O., Sipos F., Dinya E. és mtsai: Vastagbél-biopszia funkcionális mRNS-expressziós vizsgálata és osztályozása általános cDNS microarray technikával. Orv. Hetil., 2008, 149, 219-232.
13. Galamb O., Gyorffy B., Sipos F. és mtsai: Vastagbél-adenoma, vastagbélrák és IBD-specifikus génexpressziós mintázatok meghatározása teljes genomszintu oligonukleotid microarray-rendszerrel. Orv. Hetil., 2007, 148, 2067-2079.
14. Galamb, O., Sipos, F., Molnár, B. és mtsai: Evaluation of malignant and benign gastric biopsy specimens by mRNA expression profile and multivariate statistical methods. Cytometry B Clin. Cytom., 2007, 72, 299-309.
15. Galamb O., Sipos F., Dinya E. és mtsai: MRNA expression, functional profiling and multivariate classification of colon biopsy specimen by cDNA overall glass microarray. World J. Gastroenterol., 2006, 12, 6998-7006.
16. Galamb, O., Sipos, F., Fischer, K. és mtsai: The results of the expression array studies correlate and enhance the known genetic basis of gastric and colorectal cancer. Cytometry B Clin. Cytom., 2005, 68, 1-17.
17. Galamb O., Molnár B., Tulassay Zs.: DNS chipek génexpressziós mintázatok vizsgálatára és alkalmazásuk a diagnosztikában. Orv. Hetil., 2003, 144, 21-27.
18. Tóth K., Galamb O., Hevér-Pálfy T. és mtsai: Vastagbélbetegségben szenvedok perifériás vérének mRNS expressziós vizsgálata. Magy. Belorv. Arch., 2007, 60, 531-539.
19. Nagy G. R., Gyorffy B., Galamb O. és mtsai: Use of routinely collected amniotic fluid for whole-genome expression analysis of polygenic disorders. Clin. Chem., 2006, 52, 2013-2020.
20. Sipos F., Galamb O., Molnár B. és mtsa: Chiptechnikák alkalmazása vastagbélrákban. Orv. Hetil., 2004, 145, 993-999.
21. Spisák S., Molnár B., Galamb O. és mtsai: Fehérjechipek elméleti alapjai és alkalmazási lehetoségük az orvosi diagnosztikában és kutatásban. Orv. Hetil., 2007, 148, 1511-1520.
22. Tumor Analysis Best Practices Working Group: Expression profiling-best practices for data generation and interpretation in clinical trials. Nat. Rev. Genet., 2004, 5, 229-237.
23. Kendall, M. G.: Rank Correlation Methods. 4th Ed. Griffin. 1976.
24. Ladányi A., Sipos F., Szoke D. és mtsai: Laser microdissection in translational and clinical research. Cytometry A., 2006, 69, 947-960.
25. Sipos F, Szoke D., Galamb O. és mtsai: A lézer-mikrodisszekció jelentosége és gyakorlati alkalmazása a klinikai kutatásban és a diagnosztikai módszerfejlesztésben. Orv. Hetil., 2004, 145, 1355-1361.